CCL

Összesen 2 találat.
#/oldal:
Részletezés:
Rendezés:

1.

001-es BibID:BIBFORM079797
035-os BibID:(cikkazonosító)398 (WoS)000475910500002 (Scopus)85069472612
Első szerző:Csősz Éva (biokémikus, molekuláris biológus)
Cím:Analysis of networks of host proteins in the early time points following HIV transduction / Éva Csősz, Ferenc Tóth, Mohamed Mahdi, George Tsaprailis, Miklós Emri, József Tőzsér
Dátum:2019
ISSN:1471-2105
Megjegyzések:Background: Utilization of quantitative proteomics data on the network level is still a challenge in proteomics data analysis. Currently existing models use sophisticated, sometimes hard to implement analysis techniques. Our aim was to generate a relatively simple strategy for quantitative proteomics data analysis in order to utilize as much of the data generated in a proteomics experiment as possible. Results: In this study, we applied label-free proteomics, and generated a network model utilizing both qualitative, and quantitative data, in order to examine the early host response to Human Immunodeficiency Virus type 1 (HIV-1). A weighted network model was generated based on the amount of proteins measured by mass spectrometry, and analysis of weighted networks and functional sub-networks revealed upregulation of proteins involved in translation, transcription, and DNA condensation in the early phase of the viral life-cycle. Conclusion: A relatively simple strategy for network analysis was created and applied to examine the effect of HIV-1 on host cellular proteome. We believe that our model may prove beneficial in creating algorithms, allowing for both quantitative and qualitative studies of proteome change in various biological and pathological processes by quantitative mass spectrometry.
Tárgyszavak:Természettudományok Biológiai tudományok idegen nyelvű folyóiratközlemény külföldi lapban
folyóiratcikk
weighted network
quantitative proteomics
host response
HIV-1
Megjelenés:Bmc Bioinformatics. - 20 (2019), p. 1-18. -
További szerzők:Tóth Ferenc (1980-) (molekuláris biológus) Mahdi, Mohamed (1979-) (orvos, tudományos segédmunkatárs) Tsaprailis, George Emri Miklós (1962-) (fizikus) Tőzsér József (1959-) (molekuláris biológus, biokémikus, vegyész)
Pályázati támogatás:GINOP-2.3.3-15-2016-00020
GINOP
Bolyai János Kutatói Ösztöndíj
MTA
Felsőoktatási Intézményi Kiválósági Program
Egyéb
NKFI-6, 125238
Egyéb
NIEHS - ES06694
Egyéb
NIH/NCI - CA023074
Egyéb
NIH/NCRR - 1S10 RR028868-01
Egyéb
Internet cím:Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
DOI
Borító:

2.

001-es BibID:BIBFORM056379
035-os BibID:Article ID: e113221
Első szerző:Mahdi, Mohamed (orvos, tudományos segédmunkatárs)
Cím:A Modular System to Evaluate the Efficacy of Protease Inhibitors against HIV-2 / Mohamed Mahdi, Krisztina Matúz, Ferenc Tóth, József Tőzsér
Dátum:2014
ISSN:1932-6203
Megjegyzések:The human immunodeficiency virus (HIV) protease is a homodimeric aspartyl protease that is crucial for the viral life-cycle, cleaving proviral polyproteins, hence creating mature protein components that are required for the formation of an infectious virus. With diagnostic measures and clinically used protease inhibitors focusing on HIV-1, due to its higher virulence and prevalence, studies of the efficacy of those inhibitors on HIV-2 protease remain widely lacking. Utilizing a wild-type HIV-2 vector backbone and cloning techniques we have developed a cassette system where the efficacy of clinically used protease inhibitors can be studied for various serotypes of HIV-2 protease both in enzymatic and cell culture assays. In our experiments, optimization of the expression protocol led to a relatively stable enzyme, for cell culture assays, the efficiency of transfection and transduction capability of the modified vector was tested and was not found to differ from that of the wild-type, moreover, a 2nd generation protease inhibitor was used to demonstrate the usefulness of the system. The combination of assays performed with our cassette system is expected to provide an accurate measure of the efficacy of currently used; as well as experimental protease inhibitors on HIV-2.
Tárgyszavak:Orvostudományok Elméleti orvostudományok idegen nyelvű folyóiratközlemény külföldi lapban
HIV-2
Megjelenés:Plos One. - 9 : 11 (2014), p. 1-13. -
További szerzők:Matúz Krisztina (1980-) (vegyész, biokémikus) Tóth Ferenc (1980-) (molekuláris biológus) Tőzsér József (1959-) (molekuláris biológus, biokémikus, vegyész)
Internet cím:Szerző által megadott URL
DOI
Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
Borító:
Rekordok letöltése1