CCL

Összesen 2 találat.
#/oldal:
Részletezés:
Rendezés:

1.

001-es BibID:BIBFORM091336
Első szerző:Dini, Paolo
Cím:Further Analysis of Cellular Pathways / Paolo Dini, Fariba Karimi, Chrystopher L. Nehaniv, Ágnes Bonivárt, Gábor Horváth, Zoltán Muzsnay, Ágota Figula, Tamás Milkovszki, Alastair J. Munro, Ferenc Ruzsnavszky
Dátum:2016
Megjelenés:[s.l.] : Biological and Mathematical Basis of InteractionComputing, 2016
Terjedelem:98 p.
Tárgyszavak:Természettudományok Matematika- és számítástudományok szakkönyv
könyv
További szerzők:Karimi, Fariba Nehaniv, Chrystopher L. (1963-) Bonivárt Ágnes Horváth Gábor (1981-) (matematikus) Muzsnay Zoltán (1968-) (matematikus) Figula Ágota (1976-) (matematikus) Milkovszki Tamás (1985-) (matematikus) Munro, Alastair J. Ruzsnavszky Ferenc (1984-) (élettanász)
Pályázati támogatás:BIOMICS Grant Nr: 318202
Egyéb
Internet cím:Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
Borító:

2.

001-es BibID:BIBFORM063098
Első szerző:Nehaniv, Chrystopher L.
Cím:Symmetry structure in discrete models of biochemical systems : natural subsystems and the weak control hierarchy in a new model of computation driven by interactions / Chrystopher L. Nehaniv, John Rhodes, Attila Egri-Nagy, Paolo Dini, Eric Rothstein Morris, Gábor Horváth, Fariba Karimi, Daniel Schreckling, Maria J. Schilstra
Dátum:2015
ISSN:1364-503X
Megjegyzések:Interaction computing is inspired by the observation that cell metabolic/regulatory systems construct order dynamically, through constrained interactions between their components and based on a wide range of possible inputs and environmental conditions. The goals of this work are to (i) identify and understand mathematically the natural subsystems and hierarchical relations in natural systems enabling this and (ii) use the resulting insights to define a new model of computation based on interactions that is useful for both biology and computation. The dynamical characteristics of the cellular pathways studied in systems biology relate, mathematically, to the computational characteristics of automata derived from them, and their internal symmetry structures to computational power. Finite discrete automata models of biological systems such as the lac operon, the Krebs cycle and p53-mdm2 genetic regulation constructed from systems biology models have canonically associated algebraic structures (their transformation semigroups). These contain permutation groups (local substructures exhibiting symmetry) that correspond to 'pools of reversibility'. These natural subsystems are related to one another in a hierarchical manner by the notion of "weak control'. We present natural subsystems arising from several biological examples and their weak control hierarchies in detail. Finite simple non-Abelian groups are found in biological examples and can be harnessed to realize finitary universal computation. This allows ensembles of cells to achieve any desired finitary computational transformation, depending on external inputs, via suitably constrained interactions. Based on this, interaction machines that grow and change their structure recursively are introduced and applied, providing a natural model of computation driven by interactions
Tárgyszavak:Természettudományok Matematika- és számítástudományok idegen nyelvű folyóiratközlemény külföldi lapban
interaction computing
algebraic automata theory
systems biology
automata networks
Megjelenés:Philosophical Transactions Of The Royal Society A-Mathematical Physical And Engineering Sciences. - 373 : 2046 (2015), p. 20140223-. -
További szerzők:Rhodes, John Egri-Nagy, Attila Dini, Paolo Morris, Eric Rothstein Horváth Gábor (1981-) (matematikus) Karimi, Fariba Schreckling, Daniel Schilstra, Maria J.
Pályázati támogatás:K109185
OTKA
FP7/2007-2013/BIOMICS/318202
FP7
Bolyai Ösztöndíj
Egyéb
Internet cím:Szerző által megadott URL
DOI
Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
Borító:
Rekordok letöltése1