CCL

Összesen 7 találat.
#/oldal:
Részletezés:
Rendezés:

1.

001-es BibID:BIBFORM101421
035-os BibID:(cikkazonosító)4284 (scopus)85128130388 (wos)000785465100001
Első szerző:Buglyó Gergely (genetikus)
Cím:Liquid Biopsy as a Source of Nucleic Acid Biomarkers in the Diagnosis and Management of Lynch Syndrome / Gergely Buglyó, Jakub Styk, Ondrej Pös, Ádám Csók, Vanda Repiska, Beáta Soltész, Tomas Szemes, Bálint Nagy
Dátum:2022
ISSN:1661-6596 1422-0067
Megjegyzések:Lynch syndrome (LS) is an autosomal dominant inherited cancer predisposition disorder, which may manifest as colorectal cancer (CRC), endometrial cancer (EC) or other malignancies of the gastrointestinal and genitourinary tract as well as the skin and brain. Its genetic cause is a defect in one of the four key DNA mismatch repair (MMR) loci. Testing of patients at risk is currently based on the absence of MMR protein staining and detection of mutations in cancer tissue and the germline, microsatellite instability (MSI) and the hypermethylated state of the MLH1 promoter. If LS is shown to have caused CRC, lifetime follow-up with regular screening (most importantly, colonoscopy) is required. In recent years, DNA and RNA markers extracted from liquid biopsies have found some use in the clinical diagnosis of LS. They have the potential to greatly enhance the efficiency of the follow-up process by making it minimally invasive, reproducible, and time effective. Here, we review markers reported in the literature and their current clinical applications, and we comment on possible future directions.
Tárgyszavak:Orvostudományok Elméleti orvostudományok idegen nyelvű folyóiratközlemény külföldi lapban
folyóiratcikk
Lynch syndrome
colorectal cancer
screening
liquid biopsy
circulating nucleic acids
biomarker
Megjelenés:International Journal Of Molecular Sciences. - 23 : 8 (2022), p. 4284. -
További szerzők:Styk, Jakub Pös, Ondrej (1990-) (biológus) Csók Ádám (1994-) (biológus) Repiska Vanda Soltész Beáta (1987-) (molekuláris biológus) Szemes, Tomas (1980-) (biológus) Nagy Bálint (1956-) (molekuláris genetikus)
Internet cím:Szerző által megadott URL
DOI
Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
Borító:

2.

001-es BibID:BIBFORM113209
035-os BibID:(cikkazonosító)1904 (WoS)001039867600001 (Scopus)85166312107
Első szerző:Gombos Gréta
Cím:New Possible Ways to Use Exosomes in Diagnostics and Therapy via JAK/STAT Pathways / Gombos Gréta, Németh Nikolett, Pös Ondrej, Styk Jakub, Buglyó Gergely, Szemes Tomas, Danihel Ludovit, Nagy Bálint, Balogh István, Soltész Beáta
Dátum:2023
ISSN:1999-4923
Megjegyzések:Exosomes have the potential to be the future of personalized diagnostics and therapy. They are nano-sized particles between 30 and 100 nm flowing in the extracellular milieu, where they mediate cell-cell communication and participate in immune system regulation. Tumor-derived exosomes (TDEs) secreted from different types of cancer cells are the key regulators of the tumor microenvironment. With their immune suppressive cargo, TDEs prevent the antitumor immune response, leading to reduced effectiveness of cancer treatment by promoting a pro-tumorigenic microenvironment. Involved signaling pathways take part in the regulation of tumor proliferation, differentiation, apoptosis, and angiogenesis. Signal transducers and activators of transcription factors (STATs) and Janus kinase (JAK) signaling pathways are crucial in malignancies and autoimmune diseases alike, and their potential to be manipulated is currently the focus of interest. In this review, we aim to discuss exosomes, TDEs, and the JAK/STAT pathways, along with mediators like interleukins, tripartite motif proteins, and interferons.
Tárgyszavak:Orvostudományok Elméleti orvostudományok idegen nyelvű folyóiratközlemény külföldi lapban
folyóiratcikk
exosome
Megjelenés:Pharmaceutics. - 15 : 7 (2023), p. 1-17. -
További szerzők:Németh Nikolett (1995-) (biológus) Pös, Ondrej (1990-) (biológus) Styk, Jakub Buglyó Gergely (1980-) (genetikus) Szemes, Tomas (1980-) (biológus) Danihel, Ludovit Nagy Bálint (1956-) (molekuláris genetikus) Balogh István (1972-) (molekuláris biológus, genetikus) Soltész Beáta (1987-) (molekuláris biológus)
Internet cím:Szerző által megadott URL
DOI
Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
Borító:

3.

001-es BibID:BIBFORM112946
035-os BibID:(cikkazonosító)10520 (WoS)001030973400001 (Scopus)85164844125
Első szerző:Pös, Ondrej (biológus)
Cím:Cross-Kingdom Interaction of miRNAs and Gut Microbiota with Non-Invasive Diagnostic and Therapeutic Implications in Colorectal Cancer / Pös Ondrej, Styk Jakub, Buglyó Gergely, Zeman Michal, Lukyova Lydia, Bernatova Kamila, Hrckova Turnova Evelina, Rendek Tomas, Csók Ádám, Repiska Vanda, Nagy Bálint, Szemes Tomas
Dátum:2023
ISSN:1422-0067
Megjegyzések:Colorectal cancer (CRC) has one of the highest incidences among all types of malignant diseases, affecting millions of people worldwide. It shows slow progression, making it preventable. However, this is not the case due to shortcomings in its diagnostic and management procedure and a lack of effective non-invasive biomarkers for screening. Here, we discuss CRC-associated microRNAs (miRNAs) and gut microbial species with potential as CRC diagnostic and therapy biomarkers. We provide rich evidence of cross-kingdom miRNA-mediated interactions between the host and gut microbiome. miRNAs have emerged with the ability to shape the composition and dynamics of gut microbiota. Intestinal microbes can uptake miRNAs, which in turn influence microbial growth and provide the ability to regulate the abundance of various microbial species. In the context of CRC, targeting miRNAs could aid in manipulating the balance of the microbiota. Our findings suggest the need for correlation analysis between the composition of the gut microbiome and the miRNA expression profile.
Tárgyszavak:Orvostudományok Klinikai orvostudományok idegen nyelvű folyóiratközlemény külföldi lapban
folyóiratcikk
colorectal cancer
biomarker
gut microbiota
microRNA
Megjelenés:International Journal Of Molecular Sciences. - 24 : 13 (2023), p. 1-21. -
További szerzők:Styk, Jakub Buglyó Gergely (1980-) (genetikus) Zeman, Michal Lukyova, Lydia Bernatova, Kamila Hrckova Turnova, Evelina Rendek, Tomas Csók Ádám (1994-) (biológus) Repiska Vanda Nagy Bálint (1956-) (molekuláris genetikus) Szemes, Tomas (1980-) (biológus)
Internet cím:Szerző által megadott URL
DOI
Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
Borító:

4.

001-es BibID:BIBFORM090548
035-os BibID:(Scopus)85099826325 (WOS)000610904200001 (cikkazonosító)819
Első szerző:Pös, Ondrej (biológus)
Cím:Copy Number Variation : methods and Clinical Applications / Ondrej Pös, Jan Radvanszky, Jakub Styk, Zuzana Pös, Gergely Buglyó, Michal Kajsik, Jaroslav Budis, Bálint Nagy, Tomas Szemes
Dátum:2021
ISSN:2076-3417
Megjegyzések:Gains and losses of large segments of genomic DNA, known as copy number variants (CNVs) gained considerable interest in clinical diagnostics lately, as particular forms may lead to inherited genetic diseases. In recent decades, researchers developed a wide variety of cytogenetic and molecular methods with different detection capabilities to detect clinically relevant CNVs. In this review, we summarize methodological progress from conventional approaches to current state of the art techniques capable of detecting CNVs from a few bases up to several megabases. Although the recent rapid progress of sequencing methods has enabled precise detection of CNVs, determining their functional effect on cellular and whole-body physiology remains a challenge. Here, we provide a comprehensive list of databases and bioinformatics tools that may serve as useful assets for researchers, laboratory diagnosticians, and clinical geneticists facing the challenge of CNV detection and interpretation.
Tárgyszavak:Orvostudományok Elméleti orvostudományok idegen nyelvű folyóiratközlemény külföldi lapban
folyóiratcikk
copy number variants
CNV detection
CNV interpretation
bioinformatics tools
molecular methods
Megjelenés:Applied Sciences-Basel. - 11 : 2 (2021), p. 1-16. -
További szerzők:Radvanszky, Jan Styk, Jakub Pös, Zuzana Buglyó Gergely (1980-) (genetikus) Kajsik, Michal Budis, Jaroslav Nagy Bálint (1956-) (molekuláris genetikus) Szemes, Tomas (1980-) (biológus)
Internet cím:Szerző által megadott URL
DOI
Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
Borító:

5.

001-es BibID:BIBFORM105554
035-os BibID:(cikkazonosító)101875
Első szerző:Soltész Beáta (molekuláris biológus)
Cím:Mitochondrial DNA copy number changes, heteroplasmy, and mutations in plasma-derived exosomes and brain tissue of glioblastoma patients / Soltész Beáta, Pös Ondrej, Wlachovska Zuzana, Budis Jaroslav, Hekel Rastislav, Strieskova Lucia, Liptak Jana Bozenka, Krampl Werner, Styk Jakub, Németh Nikolett, Keserű Judit Sz., Jenei Adrienn, Buglyó Gergely, Klekner Álmos, Nagy Bálint, Szemes Tomas
Dátum:2022
ISSN:0890-8508
Tárgyszavak:Orvostudományok Klinikai orvostudományok idegen nyelvű folyóiratközlemény külföldi lapban
folyóiratcikk
Megjelenés:Molecular And Cellular Probes. - 66 (2022), p. 1-6. -
További szerzők:Pös, Ondrej (1990-) (biológus) Wlachovska, Zuzana Budis, Jaroslav Hekel, Rastislav Strieskova, Lucia Liptak, Jana Bozenka Krampl, Werner Styk, Jakub Németh Nikolett (1995-) (biológus) Keserű Judit (1976-) (molekuláris genetikus) Jenei Adrienn (1978-) (biológus, kémikus) Buglyó Gergely (1980-) (genetikus) Klekner Álmos (1970-) (idegsebész) Nagy Bálint (1956-) (molekuláris genetikus) Szemes, Tomas (1980-) (biológus)
Pályázati támogatás:2.0-2017-1.2.1-NKP-2017-00002
Egyéb
ITMS: 313011V446 (LISPER)
Egyéb
ITMS: 313011W428 (BIOMEDIRES II.)
Egyéb
Internet cím:Szerző által megadott URL
DOI
Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
Borító:

6.

001-es BibID:BIBFORM107654
035-os BibID:(Scopus)85146857319 (WoS)000920608400001
Első szerző:Styk, Jakub
Cím:Microsatellite instability assessment is instrumental for Predictive, Preventive and Personalised Medicine : status quo and outlook / Styk Jakub, Pös Zuzana, Pös Ondrej, Radvanszky Jan, Turnova Evelina Hrckova, Buglyó Gergely, Klimova Daniela, Budis Jaroslav, Repiska Vanda, Nagy Bálint, Szemes Tomas
Dátum:2023
ISSN:1878-5077 1878-5085
Megjegyzések:A form of genomic alteration called microsatellite instability (MSI) occurs in a class of tandem repeats (TRs) called microsatellites (MSs) or short tandem repeats (STRs) due to the failure of a post-replicative DNA mismatch repair (MMR) system. Traditionally, the strategies for determining MSI events have been low-throughput procedures that typically require assessment of tumours as well as healthy samples. On the other hand, recent large-scale pan-tumour studies have consistently highlighted the potential of massively parallel sequencing (MPS) on the MSI scale. As a result of recent innovations, minimally invasive methods show a high potential to be integrated into the clinical routine and delivery of adapted medical care to all patients. Along with advances in sequencing technologies and their ever-increasing cost-effectiveness, they may bring about a new era of Predictive, Preventive and Personalised Medicine (3PM). In this paper, we offered a comprehensive analysis of high-throughput strategies and computational tools for the calling and assessment of MSI events, including whole-genome, whole-exome and targeted sequencing approaches. We also discussed in detail the detection of MSI status by current MPS blood-based methods and we hypothesised how they may contribute to the shift from conventional medicine to predictive diagnosis, targeted prevention and personalised medical services. Increasing the efficacy of patient stratification based on MSI status is crucial for tailored decision-making. Contextually, this paper highlights drawbacks both at the technical level and those embedded deeper in cellular/molecular processes and future applications in routine clinical testing.
Tárgyszavak:Orvostudományok Elméleti orvostudományok idegen nyelvű folyóiratközlemény külföldi lapban
folyóiratcikk
Microsatellite instability
Cancer
Screening
Massively parallel sequencing
Liquid biopsy
Patient stratification
Predictive Preventive Personalised Medicine (PPPM / 3PM)
Megjelenés:EPMA Journal. - 14 : 1 (2023), p. 143-165. -
További szerzők:Pös, Zuzana Pös, Ondrej (1990-) (biológus) Radvanszky, Jan Turnova, Evelina Hrckova Buglyó Gergely (1980-) (genetikus) Klimova, Daniela Budis, Jaroslav Repiska Vanda Nagy Bálint (1956-) (molekuláris genetikus) Szemes, Tomas (1980-) (biológus)
Internet cím:Szerző által megadott URL
DOI
Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
Borító:

7.

001-es BibID:BIBFORM102993
035-os BibID:(cikkazonosító)3712 (WOS)000839249500001 (Scopus)85136586949
Első szerző:Styk, Jakub
Cím:Extracellular Nucleic Acids in the Diagnosis and Progression of Colorectal Cancer / Styk Jakub, Buglyó Gergely, Pös Ondrej, Csók Ádám, Soltész Beáta, Lukasz Peter, Repiská Vanda, Nagy Bálint, Szemes Tomás
Dátum:2022
ISSN:2072-6694
Megjegyzések:Colorectal cancer (CRC) is the 3rd most common malignant neoplasm worldwide, with more than two million new cases diagnosed yearly. Despite increasing efforts in screening, many cases are still diagnosed at a late stage, when mortality is high. This paper briefly reviews known genetic causes of CRC (distinguishing between sporadic and familial forms) and discusses potential and confirmed nucleic acid biomarkers obtainable from liquid biopsies, classified by their molecular features, focusing on clinical relevance. We comment on advantageous aspects such as better patient compliance due to blood sampling being minimally invasive, the possibility to monitor mutation characteristics of sporadic and hereditary CRC in a disease showing genetic heterogeneity, and using up- or down-regulated circulating RNA markers to reveal metastasis or disease recurrence. Current difficulties and thoughts on some possible future directions are also discussed. We explore current evidence in the field pointing towards the introduction of personalized CRC management.
Tárgyszavak:Orvostudományok Elméleti orvostudományok idegen nyelvű folyóiratközlemény külföldi lapban
folyóiratcikk
colorectal cancer
liquid biopsy
cell-free nucleic acids
biomarkers
non-invasive diagnosis
Megjelenés:Cancers. - 14 : 15 (2022), p. 1-20. -
További szerzők:Buglyó Gergely (1980-) (genetikus) Pös, Ondrej (1990-) (biológus) Csók Ádám (1994-) (biológus) Soltész Beáta (1987-) (molekuláris biológus) Lukasz, Peter Repiská, Vanda Nagy Bálint (1956-) (molekuláris genetikus) Szemes, Tomas (1980-) (biológus)
Internet cím:Szerző által megadott URL
DOI
Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
Borító:
Rekordok letöltése1