Találati lista | Tudóstér

001-es BibID:	BIBFORM101136
035-os BibID:	(cikkazonosító)2494 (scopus)85125044439 (wos)000768200600001
Első szerző:	Hadháziné Raics Mária (vegyész)
Cím:	Investigation of the Molecular Details of the Interactions of Selenoglycosides and Human Galectin-3 / Mária Raics, Álex Kálmán Balogh, Chandan Kishor, István Timári, Francisco J. Medrano, Antonio Romero, Rob Marc Go, Helen Blanchard, László Szilágyi, Katalin E. Kövér, Krisztina Fehér
Dátum:	2022
ISSN:	1661-6596 1422-0067
Megjegyzések:	Human galectin-3 (hGal-3) is involved in a variety of biological processes and is implicated in wide range of diseases. As a result, targeting hGal-3 for clinical applications has become an intense area of research. As a step towards the development of novel hGal-3 inhibitors, we describe a study of the binding of two Se-containing hGal-3 inhibitors, specifically that of di(?-Dgalactopyranosyl)selenide (SeDG), in which two galactose rings are linked by one Se atom and a di(?-D-galactopyranosyl)diselenide (DSeDG) analogue with a diseleno bond between the two sugar units. The binding affinities of these derivatives to hGal-3 were determined by 15N-1H HSQC NMR spectroscopy and fluorescence anisotropy titrations in solution, indicating a slight decrease in the strength of interaction for SeDG compared to thiodigalactoside (TDG), a well-known inhibitor of hGal-3, while DSeDG displayed a much weaker interaction strength. NMR and FA measurements showed that both seleno derivatives bind to the canonical S face site of hGal-3 and stack against the conserved W181 residue also confirmed by X-ray crystallography, revealing canonical properties of the interaction. The interaction with DSeDG revealed two distinct binding modes in the crystal structure which are in fast exchange on the NMR time scale in solution, explaining a weaker interaction with hGal-3 than SeDG. Using molecular dynamics simulations, we have found that energetic contributions to the binding enthalpies mainly differ in the electrostatic interactions and in polar solvation terms and are responsible for weaker binding of DSeDG compared to SeDG. Selenium-containing carbohydrate inhibitors of hGal-3 showing canonical binding modes offer the potential of becoming novel hydrolytically stable scaffolds for a new class of hGal-3 inhibitors.
Tárgyszavak:	Természettudományok Kémiai tudományok idegen nyelvű folyóiratközlemény külföldi lapban folyóiratcikk lectin galectin-3 selenoglycosides NMR spectroscopy fluorescence anisotropy X-ray crystallography molecular dynamics
Megjelenés:	International Journal of Molecular Sciences. - 23 : 5 (2022), p. 1-17. -
További szerzők:	Balogh Álex Kálmán (1994-) (vegyész) Kishor, Chandan Timári István (1989-) (vegyész) Medrano, Francisco J. Romero, Antonio Go, Rob Marc Blanchard, Helen Szilágyi László (1941-) (vegyész) Kövér Katalin, E. (1956-2023) (vegyész) Fehér Krisztina (1974-) (vegyész)
Pályázati támogatás:	NN 128368 OTKA PD 135034 OTKA GINOP-2.3.3-15-2016-00004 GINOP GINOP-2.3.2-15-2016-00008 GINOP BO/00372/20/7 Egyéb ÚNKP-21-5-DE-471 Egyéb BO/004333/18/7 Egyéb ÚNKP-21-4-DE-165 Egyéb
Internet cím:	Szerző által megadott URL DOI Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
Borító:
Saját polcon:

001-es BibID:	BIBFORM118500
035-os BibID:	(cikkazonosító)1742 (WoS)001152827800001 (Scopus)85184693133
Első szerző:	Hőgye Fanni
Cím:	Saturation Transfer Difference NMR and Molecular DockingInteraction Study of Aralkyl-Thiodigalactosides as Potential Inhibitors of the Human-Galectin-3 Protein / Fanni Hőgye, László Bence Farkas, Álex Kálmán Balogh, László Szilágyi, Samar Alnukari, István Bajza, Anikó Borbás, Krisztina Fehér, Tünde Zita Illyés, István Timár
Dátum:	2024
ISSN:	1422-0067
Megjegyzések:	Human Galectin-3 (hGal-3) is a protein that selectively binds to ?-galactosides and holds diverse roles in both normal and pathological circumstances. Therefore, targeting hGal-3 has become a vibrant area of research in the pharmaceutical chemistry. As a step towards the development of novel hGal-3 inhibitors, we synthesized and investigated derivatives of thiodigalactoside (TDG) modified with different aromatic substituents. Specifically, we describe a high-yielding synthetic route of thiodigalactoside (TDG); an optimized procedure for the synthesis of the novel 3,3·-di-O-(quinoline- 2-yl)methyl)-TDG and three other known, symmetric 3,3·-di-O-TDG derivatives ((naphthalene- 2yl)methyl, benzyl, (7-methoxy-2H-1-benzopyran-2-on-4-yl)methyl). In the present study, using competition Saturation Transfer Difference (STD) NMR spectroscopy, we determined the dissociation constant (Kd) of the former three TDG derivatives produced to characterize the strength of the interaction with the target protein (hGal-3). Based on the Kd values determined, the (naphthalen-2- yl)methyl, the (quinolin-2-yl)methyl and the benzyl derivatives bind to hGal-3 94, 30 and 24 times more strongly than TDG. Then, we studied the binding modes of the derivatives in silico by molecular docking calculations. Docking poses similar to the canonical binding modes of well-known hGal-3 inhibitors have been found. However, additional binding forces, cation?? interactions between the arginine residues in the binding pocket of the protein and the aromatic groups of the ligands, have been established as significant features. Our results offer a molecular-level understanding of the varying affinities observed among the synthesized thiodigalactoside derivatives, which can be a key aspect in the future development of more effective ligands of hGal-3.
Tárgyszavak:	Természettudományok Kémiai tudományok idegen nyelvű folyóiratközlemény külföldi lapban folyóiratcikk lectin galectin-3 thiodigalactosides NMR spectroscopy STD NMR molecular docking
Megjelenés:	International Journal Of Molecular Sciences. - 25 : 3 (2024), p. 1-18. -
További szerzők:	Farkas László Bence (1993-) (vegyész) Balogh Álex Kálmán (1994-) (vegyész) Szilágyi László (1941-) (vegyész) Samar Alnukari (1998-) (vegyész) Bajza István (1971-) (vegyész) Borbás Anikó (1965-) (vegyész) Fehér Krisztina (1974-) (vegyész) Illyés Tünde Zita (1970-) (kémia-fizika szakos tanár) Timári István (1989-) (vegyész)
Pályázati támogatás:	NN 128368 OTKA PD 135034 OTKA KDP-2021 Egyéb KDP-2023 Egyéb BO/00372/20/7 Egyéb
Internet cím:	Szerző által megadott URL DOI Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
Borító:
Saját polcon:

001-es BibID:	BIBFORM099884
035-os BibID:	(cikkazonosító)1037 (scopus)85122862338 (wos)000754896600001
Első szerző:	Kiss Mariann (vegyész)
Cím:	2-Acetamido-2-deoxy-d-glucono-1,5-lactone Sulfonylhydrazones: Synthesis and Evaluation as Inhibitors of Human OGA and HexB Enzymes / Mariann Kiss, István Timári, Teréz Barna, Zuzana Mészáros, Kristýna Slámová, Pavla Bojarová, Vladimír Křen, Joseph M. Hayes, László Somsák
Dátum:	2022
ISSN:	1661-6596 1422-0067
Megjegyzések:	Inhibition of the human O-linked ?-N-acetylglucosaminidase (hOGA, GH84) enzyme is pharmacologically relevant in several diseases such as neurodegenerative and cardiovascular disorders, type 2 diabetes, and cancer. Human lysosomal hexosaminidases (hHexA and hHexB, GH20) are mechanistically related enzymes; therefore, selective inhibition of these enzymes is crucial in terms of potential applications. In order to extend the structure?activity relationships of OGA inhibitors, a series of 2-acetamido-2-deoxy-D-glucono-1,5-lactone sulfonylhydrazones was prepared from D-glucosamine. The synthetic sequence involved condensation of N-acetyl-3,4,6-tri-O-acetylD-glucosamine with arenesulfonylhydrazines, followed by MnO2 oxidation to the corresponding glucono-1,5-lactone sulfonylhydrazones. Removal of the O-acetyl protecting groups by NH3/MeOH furnished the test compounds. Evaluation of these compounds by enzyme kinetic methods against hOGA and hHexB revealed potent nanomolar competitive inhibition of both enzymes, with no significant selectivity towards either. The most efficient inhibitor of hOGA was 2-acetamido-2-deoxyD-glucono-1,5-lactone 1-naphthalenesulfonylhydrazone (5f, Ki = 27 nM). This compound had a Ki of 6.8 nM towards hHexB. To assess the binding mode of these inhibitors to hOGA, computational studies (Prime protein?ligand refinement and QM/MM optimizations) were performed, which suggested the binding preference of the glucono-1,5-lactone sulfonylhydrazones in an s-cis conformation for all test compounds.
Tárgyszavak:	Természettudományok Kémiai tudományok idegen nyelvű folyóiratközlemény külföldi lapban folyóiratcikk hOGA hHexB inhibitor glyconolactone sulfonylhydrazone Prime refinement QM/MM optimization
Megjelenés:	International Journal of Molecular Sciences. - 23 : 3 (2022), p. 1-18. --
További szerzők:	Timári István (1989-) (vegyész) Barna Teréz (1963-) (vegyész) Mészáros, Zuzana Slámová, Kristýna Bojarová, Pavla Křen, Vladimír Hayes, Joseph M. Somsák László (1954-) (vegyész)
Pályázati támogatás:	K109450 OTKA FK-125067 OTKA PD 135034 OTKA GINOP-2.3.2-15-2016-00008 GINOP GINOP-2.3.3-15-2016-00004 GINOP ÚNKP-21-5-DE-471 Egyéb
Internet cím:	Szerző által megadott URL DOI Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
Borító:
Saját polcon:

001-es BibID:	BIBFORM109255
035-os BibID:	(cikkazonosító)4789 (Scopus)85149828323 (WoS)000947663600001
Első szerző:	Kónya Zoltán (molekuláris biológus, biokémikus)
Cím:	Phosphorylated peptide derived from the myosin phosphatase target subunit is a novel inhibitor of protein phosphatase-1 / Kónya Z., Tamás I., Bécsi B., Lontay B., Raics M., Timári I., Kövér K. E., Erdődi F.
Dátum:	2023
ISSN:	1422-0067
Tárgyszavak:	Orvostudományok Elméleti orvostudományok idegen nyelvű folyóiratközlemény külföldi lapban folyóiratcikk
Megjelenés:	International Journal Of Molecular Sciences. - 24 : 5 (2023), p. 1-17. -
További szerzők:	Tamás István (1990-) (molekuláris biológus) Bécsi Bálint (1981-) (vegyészmérnök) Lontay Beáta (1975-) (biokémikus) Hadháziné Raics Mária (1991-) (vegyész) Timári István (1989-) (vegyész) Kövér Katalin, E. (1956-2023) (vegyész) Erdődi Ferenc (1953-) (biokémikus)
Pályázati támogatás:	K129104 OTKA NN128368 OTKA K143533 OTKA
Internet cím:	Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat DOI
Borító:
Saját polcon: