CCL

Összesen 2 találat.
#/oldal:
Részletezés:
Rendezés:

1.

001-es BibID:BIBFORM079797
035-os BibID:(cikkazonosító)398 (WoS)000475910500002 (Scopus)85069472612
Első szerző:Csősz Éva (biokémikus, molekuláris biológus)
Cím:Analysis of networks of host proteins in the early time points following HIV transduction / Éva Csősz, Ferenc Tóth, Mohamed Mahdi, George Tsaprailis, Miklós Emri, József Tőzsér
Dátum:2019
ISSN:1471-2105
Megjegyzések:Background: Utilization of quantitative proteomics data on the network level is still a challenge in proteomics data analysis. Currently existing models use sophisticated, sometimes hard to implement analysis techniques. Our aim was to generate a relatively simple strategy for quantitative proteomics data analysis in order to utilize as much of the data generated in a proteomics experiment as possible. Results: In this study, we applied label-free proteomics, and generated a network model utilizing both qualitative, and quantitative data, in order to examine the early host response to Human Immunodeficiency Virus type 1 (HIV-1). A weighted network model was generated based on the amount of proteins measured by mass spectrometry, and analysis of weighted networks and functional sub-networks revealed upregulation of proteins involved in translation, transcription, and DNA condensation in the early phase of the viral life-cycle. Conclusion: A relatively simple strategy for network analysis was created and applied to examine the effect of HIV-1 on host cellular proteome. We believe that our model may prove beneficial in creating algorithms, allowing for both quantitative and qualitative studies of proteome change in various biological and pathological processes by quantitative mass spectrometry.
Tárgyszavak:Természettudományok Biológiai tudományok idegen nyelvű folyóiratközlemény külföldi lapban
folyóiratcikk
weighted network
quantitative proteomics
host response
HIV-1
Megjelenés:Bmc Bioinformatics. - 20 (2019), p. 1-18. -
További szerzők:Tóth Ferenc (1980-) (molekuláris biológus) Mahdi, Mohamed (1979-) (orvos, tudományos segédmunkatárs) Tsaprailis, George Emri Miklós (1962-) (fizikus) Tőzsér József (1959-) (molekuláris biológus, biokémikus, vegyész)
Pályázati támogatás:GINOP-2.3.3-15-2016-00020
GINOP
Bolyai János Kutatói Ösztöndíj
MTA
Felsőoktatási Intézményi Kiválósági Program
Egyéb
NKFI-6, 125238
Egyéb
NIEHS - ES06694
Egyéb
NIH/NCI - CA023074
Egyéb
NIH/NCRR - 1S10 RR028868-01
Egyéb
Internet cím:Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
DOI
Borító:

2.

001-es BibID:BIBFORM038499
035-os BibID:PMID:22300579
Első szerző:Csősz Éva (biokémikus, molekuláris biológus)
Cím:Quantitative analysis of proteins in the tear fluid of patients with diabetic retinopathy / Csősz Éva, Boross Péter, Csutak Adrienne, Berta András, Tóth Ferenc, Póliska Szilárd, Török Zsolt, Tőzsér József
Dátum:2012
ISSN:1874-3919
Megjegyzések:Diabetic retinopathy is the leading cause of new cases of legal blindness among adults in the developed countries. Approximately 40% of all people with diabetes have diabetic retinopathy and 5% of these have sight-threatening form. As the advanced stage, where there is a high risk for vision loss, can develop without any serious symptoms, sometimes it is hard to detect it. A non invasive method to detect biomarkers characteristic for diabetic retinopathy from the tear fluid was developed. Tear samples from diabetic patients with no retinopathy, non proliferative and proliferative stages of diabetic retinopathy were analyzed and the protein content of each sample was compared to the protein content of tear pool from healthy volunteers. The samples were labeled with iTRAQ fourplex labels and were analyzed with nanoHPLC coupled ESI-MS/MS mass spectrometry. The lipocalin 1, lactotransferrin, lacritin, lysozyme C, lipophilin A and immunoglobulin lambda chain were identified as possible biomarker candidates with significantly higher relative levels in the tear of patients with diabetic retinopathy.
Tárgyszavak:Orvostudományok Elméleti orvostudományok idegen nyelvű folyóiratközlemény külföldi lapban
Megjelenés:Journal of Proteomics. - 75 : 7 (2012), p. 2196-2204. -
További szerzők:Boross Péter (1972-) (biokémikus, vegyész) Csutak Adrienne (1971-) (szemész) Berta András (1955-) (szemész, gyermekszemész) Tóth Ferenc (1980-) (molekuláris biológus) Póliska Szilárd (1978-) (biológus) Török Zsolt (1975-) (orvos) Tőzsér József (1959-) (molekuláris biológus, biokémikus, vegyész)
Pályázati támogatás:K 101591
OTKA
EA_SPIN_06-DIABDIAG
EGYÉB
KMA 0149/3.0
EGYÉB
Internet cím:Szerző által megadott URL
DOI
Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
Borító:
Rekordok letöltése1