CCL

Összesen 9 találat.
#/oldal:
Részletezés:
Rendezés:

1.

001-es BibID:BIBFORM089749
035-os BibID:(cikkazonosító)8172 (scopus)85094855183 (wos)000588924400001
Első szerző:Alvarado, Gerardo
Cím:Heme-Induced Oxidation of Cysteine Groups of Myofilament Proteins Leads to Contractile Dysfunction of Permeabilized Human Skeletal Muscle Fibres / Alvarado Gerardo, Tóth Attila, Csősz Éva, Kalló Gergő, Dankó Katalin, Csernátony Zoltán, Smith Ann, Gram Magnus, Akerström Bo, Édes István, Balla György, Papp Zoltán, Balla József
Dátum:2020
ISSN:1661-6596 1422-0067
Megjegyzések:Heme released from red blood cells targets a number of cell components including the cytoskeleton. The purpose of the present study was to determine the impact of free heme (20?300 ?M) on human skeletal muscle fibres made available during orthopedic surgery. Isometric force production and oxidative protein modifications were monitored in permeabilized skeletal muscle fibre segments. A single heme exposure (20 ?M) to muscle fibres decreased Ca2+-activated maximal (active) force (Fo) by about 50% and evoked an approximately 3-fold increase in Ca2+-independent (passive) force (Fpassive). Oxidation of sulfhydryl (SH) groups was detected in structural proteins (e.g., nebulin, ?-actinin, meromyosin 2) and in contractile proteins (e.g., myosin heavy chain and myosin-binding protein C) as well as in titin in the presence of 300 ?M heme. This SH oxidation was not reversed by dithiothreitol (50 mM). Sulfenic acid (SOH) formation was also detected in the structural proteins (nebulin, ?-actinin, meromyosin). Heme effects on SH oxidation and SOH formation were prevented by hemopexin (Hpx) and ?1-microglobulin (A1M). These data suggest that free heme has a significant impact on human skeletal muscle fibres, whereby oxidative alterations in structural and contractile proteins limit contractile function. This may explain and or contribute to the weakness and increase of skeletal muscle stiffness in chronic heart failure, rhabdomyolysis, and other hemolytic diseases. Therefore, therapeutic use of Hpx and A1M supplementation might be effective in preventing heme-induced skeletal muscle alterations.
Tárgyszavak:Orvostudományok Elméleti orvostudományok idegen nyelvű folyóiratközlemény külföldi lapban
folyóiratcikk
skeletal muscle fibre
contractile dysfunction
heme
sulfhydryl groups
sulfenic acid formation
chronic heart failure
oxidation; hemopexin
[alfa]1-microglobulin
skeletal muscle myopathy
Megjelenés:International Journal Of Molecular Sciences. - 21 : 21 (2020), p. 1-17. -
További szerzők:Tóth Attila (1971-) (biológus) Csősz Éva (1977-) (biokémikus, molekuláris biológus) Kalló Gergő (1989-) (molekuláris biológus) Dankó Katalin (1952-2021) (belgyógyász, allergológus és klinikai immunológus) Csernátony Zoltán (1959-2023) (ortopéd sebész, traumatológus) Smith, Ann Gram, Magnus Akerström, Bo Édes István (1952-) (kardiológus) Balla György (1953-) (csecsemő és gyermekgyógyász, neonatológus) Papp Zoltán (1965-) (kardiológus, élettanász) Balla József (1959-) (belgyógyász, nephrológus)
Pályázati támogatás:EFOP-3.6.2-16-2017-00006
EFOP
OTKA-K-132828
OTKA
K-84300
OTKA
K-109083
OTKA
GINOP-2.3.2-15-2016-00043
GINOP
Internet cím:Szerző által megadott URL
DOI
Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
Borító:

2.

001-es BibID:BIBFORM091513
035-os BibID:(cikkazonosító)1648 (scopus)85100462177 (wos)000623909700001
Első szerző:Borbély Adina
Cím:Structural Characterization of Daunomycin-Peptide Conjugates by Various Tandem Mass Spectrometric Techniques / Adina Borbély, Lilla Pethő, Ildikó Szabó, Mohammed Al-Majidi, Arnold Steckel, Tibor Nagy, Sándor Kéki, Gergő Kalló, Éva Csősz, Gábor Mező, Gitta Schlosser
Dátum:2021
ISSN:1661-6596 1422-0067
Megjegyzések:The use of peptide-drug conjugates has generated wide interest as targeted antitumor therapeutics. The anthracycline antibiotic, daunomycin, is a widely used anticancer agent and it is often conjugated to different tumor homing peptides. However, comprehensive analytical characterization of these conjugates via tandem mass spectrometry (MS/MS) is challenging due to the lability of the O-glycosidic bond and the appearance of MS/MS fragment ions with little structural information. Therefore, we aimed to investigate the optimal fragmentation conditions that suppress the prevalent dissociation of the anthracycline drug and provide good sequence coverage. In this study, we comprehensively compared the performance of common fragmentation techniques, such as higher energy collisional dissociation (HCD), electron transfer dissociation (ETD), electron-transfer higher energy collisional dissociation (EThcD) and matrix-assisted laser desorption/ionization-tandem time-of-flight (MALDI-TOF/TOF) activation methods for the structural identification of synthetic daunomycin-peptide conjugates by high-resolution tandem mass spectrometry. Our results showed that peptide backbone fragmentation was inhibited by applying electron-based dissociation methods to conjugates, most possibly due to the "electron predator" effect of the daunomycin. We found that efficient HCD fragmentation was largely influenced by several factors, such as amino acid sequences, charge states and HCD energy. High energy HCD and MALDI-TOF/TOF combined with collision induced dissociation (CID) mode are the methods of choice to unambiguously assign the sequence, localize different conjugation sites and differentiate conjugate isomers.
Tárgyszavak:Természettudományok Kémiai tudományok idegen nyelvű folyóiratközlemény külföldi lapban
folyóiratcikk
MALDI
anthracyclines
bioconjugates
collision-induced dissociation
electron predator
high resolution mass spectrometry
Megjelenés:International Journal Of Molecular Sciences. - 22 : 4 (2021), p. 1-15. -
További szerzők:Pethő Lilla Szabó Ildikó Al-Majidi, Mohammed Steckel Arnold Nagy Tibor (1988-) (vegyész) Kéki Sándor (1964-) (polimer kémikus) Kalló Gergő (1989-) (molekuláris biológus) Csősz Éva (1977-) (biokémikus, molekuláris biológus) Mező Gábor (1959-) (vegyész) Schlosser Gitta
Pályázati támogatás:NVKP_16-1-2016-0036
Egyéb
Lendület Momentum Program
Egyéb
VEKOP- 387 2.3.3-15-2017-00020
Egyéb
GINOP-2.3.3-15-2016-00020
GINOP
GINOP-2.3.3-15-2016-00021
GINOP
Internet cím:Szerző által megadott URL
DOI
Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
Borító:

3.

001-es BibID:BIBFORM112899
035-os BibID:(cikkazonosító)10627 (WoS)001028301900001 (Scopus)85164971145
Első szerző:Gellén Gabriella (Gyógyszerész)
Cím:Cross-Linking Mass Spectrometry on P-Glycoprotein / Gellen Gabriella, Klement Eva, Biwott Kipchumba, Schlosser Gitta, Kalló Gergő, Csősz Éva, Medzihradszky Katalin F., Bacso Zsolt
Dátum:2023
ISSN:1422-0067
Megjegyzések:The ABC transporter P-glycoprotein (Pgp) has been found to be involved in multidrug resistance in tumor cells. Lipids and cholesterol have a pivotal role in Pgp's conformations; however, it is often difficult to investigate it with conventional structural biology techniques. Here, we applied robust approaches coupled with cross-linking mass spectrometry (XL-MS), where the natural lipid envi-ronment remains quasi-intact. Two experimental approaches were carried out using different cross-linkers (i) on living cells, followed by membrane preparation and immunoprecipitation en-richment of Pgp, and (ii) on-bead, subsequent to membrane preparation and immunoprecipitation. Pgp-containing complexes were enriched employing extracellular monoclonal anti-Pgp antibodies on magnetic beads, followed by on-bead enzymatic digestion. The LC-MS/MS results revealed mono-links on Pgp's solvent-accessible residues, while intraprotein cross-links confirmed a com-plex interplay between extracellular, transmembrane, and intracellular segments of the protein, of which several have been reported to be connected to cholesterol. Harnessing the MS results and those of molecular docking, we suggest an epitope for the 15D3 cholesterol-dependent mouse monoclonal antibody. Additionally, enriched neighbors of Pgp prove the strong connection of Pgp to the cytoskeleton and other cholesterol-regulated proteins. These findings suggest that XL-MS may be utilized for protein structure and network analyses in such convoluted systems as mem-brane proteins.
Tárgyszavak:Természettudományok Biológiai tudományok idegen nyelvű folyóiratközlemény külföldi lapban
folyóiratcikk
keresztkötéses tömegspektrometria
P-glikoprotein
membránfehérje
koleszterin
multidrog rezisztencia
membrán
Megjelenés:International Journal Of Molecular Sciences. - 24 : 13 (2023), p. 1-24. -
További szerzők:Klement Éva Biwott, Kipchumba Schlosser Gitta Kalló Gergő (1989-) (molekuláris biológus) Csősz Éva (1977-) (biokémikus, molekuláris biológus) Medzihradszky-Fölkl Katalin Bacsó Zsolt (1963-) (biofizikus)
Internet cím:Szerző által megadott URL
DOI
Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
Borító:

4.

001-es BibID:BIBFORM093534
035-os BibID:(cikkazonosító)4233 (scopus)85104383649 (wos)000644381300001
Első szerző:Jenei Adrienn (biológus, kémikus)
Cím:Detection of Antimicrobial Peptides in Stratum Corneum by Mass Spectrometry / Adrienn Jenei, Gergő Kalló, Zsolt Dajnoki, Krisztián Gáspár, Andrea Szegedi, Anikó Kapitány, Éva Csősz
Dátum:2021
ISSN:1661-6596 1422-0067
Megjegyzések:Antimicrobial and immunomodulatory peptides (AMPs) are considered as the key players in the maintenance of skin barrier functions. Here, we developed a novel approach for the examination of AMPs in the outermost layer of the epidermis, namely stratum corneum (SC). The SC sample collection by tape stripping was coupled with detection by highly specific and sensitive parallel reaction monitoring (PRM)-based mass spectrometry. We found that hexane-free processing of SC samples produced higher protein yield compared to hexane-based extraction. Of the 18 investigated peptides, 9 could be detected either in healthy or in inflamed skin specimens. Regarding the amount of S100A8, LCN2, LACRT and LYZ significant topographical differences were described among gland poor (GP), sebaceous gland rich (SGR) and apocrine gland rich (AGR) healthy skin regions. We applied a minimally invasive, reproducible approach for sampling, which can be assessed for research and diagnostic purposes. and for monitoring the effectiveness of therapies in skin diseases.
Tárgyszavak:Orvostudományok Klinikai orvostudományok idegen nyelvű folyóiratközlemény külföldi lapban
folyóiratcikk
Megjelenés:International Journal of Molecular Sciences. - 22 (2021), p. 1-15. -
További szerzők:Kalló Gergő (1989-) (molekuláris biológus) Dajnoki Zsolt (1985-) (molekuláris biológus) Gáspár Krisztián (1974-) (bőrgyógyász) Szegedi Andrea (1964-) (bőrgyógyász) Kapitány Anikó (1979-) (molekuláris biológus) Csősz Éva (1977-) (biokémikus, molekuláris biológus)
Internet cím:Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
DOI
Borító:

5.

001-es BibID:BIBFORM114402
035-os BibID:(cikkazonosító)13657 (scopus)85170347560 (wos)001061114800001
Első szerző:Kalló Gergő (molekuláris biológus)
Cím:Salivary Chemical Barrier Proteins in Oral Squamous Cell Carcinoma-Alterations in the Defense Mechanism of the Oral Cavity / Kalló Gergő, Bertalan Petra Magdolna, Márton Ildikó, Kiss Csongor, Csősz Éva
Dátum:2023
ISSN:1422-0067
Megjegyzések:Oral squamous cell carcinoma (OSCC) is one of the most frequent types of head and neck cancer. Despite the genetic and environmental risk factors, OSCC is also associated with microbial infections and/or dysbiosis. The secreted saliva serves as the chemical barrier of the oral cavity and, since OSCC can alter the protein composition of saliva, our aim was to analyze the effect of OSCC on the salivary chemical barrier proteins. Publicly available datasets regarding the analysis of salivary proteins from patients with OSCC and controls were collected and examined in order to identify differentially expressed chemical barrier proteins. Network analysis and gene ontology (GO) classification of the differentially expressed chemical barrier proteins were performed as well. One hundred and twenty-seven proteins showing different expression pattern between the OSCC and control groups were found. Protein?protein interaction networks of up- and down-regulated proteins were constructed and analyzed. The main hub proteins (IL-6, IL-1B, IL-8, TNF, APOA1, APOA2, APOB, APOC3, APOE, and HP) were identified and the enriched GO terms were examined. Our study highlighted the importance of the chemical barrier of saliva in the development of OSCC.
Tárgyszavak:Orvostudományok Elméleti orvostudományok idegen nyelvű folyóiratközlemény külföldi lapban
folyóiratcikk
oral squamous cell carcinoma
OSCC
antimicrobial and immunomodulatory proteins
AMP
Saliva
Chemical barrier
Megjelenés:International Journal Of Molecular Sciences. - 24 : 17 (2023), p. 1-20. -
További szerzők:Bertalan Petra Magdolna (1996-) (klinikai laboratóriumi kutató, PhD hallgató) Márton Ildikó (1954-) (fogszakorvos) Kiss Csongor (1956-) (hematológus, onkológus) Csősz Éva (1977-) (biokémikus, molekuláris biológus)
Pályázati támogatás:GINOP-2.3.3-15-2016-00020
GINOP
NKFIH K143021
Egyéb
Internet cím:Szerző által megadott URL
DOI
Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
Borító:

6.

001-es BibID:BIBFORM090159
035-os BibID:(cikkazonosító)9547 (scopus)85098229319 (wos)000602951800001
Első szerző:Kalló Gergő (molekuláris biológus)
Cím:Compounds with Antiviral, Anti-Inflammatory and Anticancer Activity Identified in Wine from Hungary's Tokaj Region via High Resolution Mass Spectrometry and Bioinformatics Analyses / Kalló Gergő, Kunkli Balázs, Győri Zoltán, Szilvássy Zoltán, Csősz Éva, Tőzsér József
Dátum:2020
ISSN:1661-6596 1422-0067
Megjegyzések:(1) Background: Wine contains a variety of molecules with potential beneficial effects on human health. Our aim was to examine the wine components with high-resolution mass spectrometry including high-resolution tandem mass spectrometry in two wine types made from grapes with or without the fungus Botrytis cinerea, or "noble rot". (2) For LC-MS/MS analysis, 12 wine samples (7 without and 5 with noble rotting) from 4 different wineries were used and wine components were identified and quantified. (3) Results: 288 molecules were identified in the wines and the amount of 169 molecules was statistically significantly different between the two wine types. A database search was carried out to find the molecules, which were examined in functional studies so far, with high emphasis on molecules with antiviral, anti-inflammatory and anticancer activities. (4) Conclusions: A comprehensive functional dataset related to identified wine components is also provided highlighting the importance of components with potential health benefits.
Tárgyszavak:Természettudományok Kémiai tudományok idegen nyelvű folyóiratközlemény külföldi lapban
folyóiratcikk
metabolomics
wine
LC-MS
Functional food
high resolution mass spectrometry
Megjelenés:International Journal Of Molecular Sciences. - 21 : 24 (2020), p. 1-20. -
További szerzők:Kunkli Balázs Győri Zoltán (1948-) (vegyész) Szilvássy Zoltán (1957-) (belgyógyász, farmakológus, klinikai farmakológus) Csősz Éva (1977-) (biokémikus, molekuláris biológus) Tőzsér József (1959-) (molekuláris biológus, biokémikus, vegyész)
Pályázati támogatás:GINOP-2.3.3-15-2016-00020
GINOP
Mádi Borakadémia
Egyéb
Internet cím:Szerző által megadott URL
DOI
Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
Borító:

7.

001-es BibID:BIBFORM117816
035-os BibID:(cikkazonosító)380 (wos)001140375300001 (scopus)85181923454
Első szerző:Linkner Tamás Richárd
Cím:Comparative Analysis of Differential Cellular Transcriptome and Proteome Regulation by HIV-1 and HIV-2 Pseudovirions in the Early Phase of Infection / Linkner Tamás Richárd, Ambrus Viktor, Kunkli Balázs, Szojka Zsófia Ilona, Kalló Gergő, Csősz Éva, Kumar Ajneesh, Emri Miklós, Tőzsér József, Mahdi Mohamed
Dátum:2024
ISSN:1422-0067
Megjegyzések:In spite of the similar structural and genomic organization of human immunodeficiency viruses type 1 and 2 (HIV-1 and HIV-2), striking differences exist between them in terms of replication dynamics and clinical manifestation of infection. Although the pathomechanism of HIV-1 infection is well characterized, relatively few data are available regarding HIV-2 viral replication and its interaction with host-cell proteins during the early phase of infection. We utilized proteo-transcriptomic analyses to determine differential genome expression and proteomic changes induced by transduction with HIV-1/2 pseudovirions during 8, 12 and 26 h time-points in HEK-293T cells. We show that alteration in the cellular milieu was indeed different between the two pseudovirions. The significantly higher number of genes altered by HIV-2 in the first two time-points suggests a more diverse yet subtle effect on the host cell, preparing the infected cell for integration and latency. On the other hand, GO analysis showed that, while HIV-1 induced cellular oxidative stress and had a greater effect on cellular metabolism, HIV-2 mostly affected genes involved in cell adhesion, extracellular matrix organization or cellular differentiation. Proteomics analysis revealed that HIV-2 significantly downregulated the expression of proteins involved in mRNA processing and translation. Meanwhile, HIV-1 influenced the cellular level of translation initiation factors and chaperones. Our study provides insight into the understudied replication cycle of HIV-2 and enriches our knowledge about the use of HIV-based lentiviral vectors in general.
Tárgyszavak:Orvostudományok Elméleti orvostudományok idegen nyelvű folyóiratközlemény külföldi lapban
folyóiratcikk
Megjelenés:International Journal Of Molecular Sciences. - 25 : 1 (2024), p. 1-26. -
További szerzők:Ambrus Viktor Attila (1989-) (biotechnológus) Kunkli Balázs Szojka Zsófia (1991-) (molekuláris biológus) Kalló Gergő (1989-) (molekuláris biológus) Csősz Éva (1977-) (biokémikus, molekuláris biológus) Kumar, Ajneesh (1994-) (bioinformatikus) Emri Miklós (1962-) (fizikus) Tőzsér József (1959-) (molekuláris biológus, biokémikus, vegyész) Mahdi, Mohamed (1979-) (orvos, tudományos segédmunkatárs)
Pályázati támogatás:NKFI 125238
NKFIH
TKP2020-IKA-04
Egyéb
GINOP-2.3.3-15-2016-00020
GINOP
TKP2021-EGA-20
Egyéb
Internet cím:Szerző által megadott URL
DOI
Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
Borító:

8.

001-es BibID:BIBFORM108752
035-os BibID:(cikkazonosító)3236 (Scopus)85148962397 (WoS)000938549700001
Első szerző:Miltner Noémi (molekuláris biológus)
Cím:Identification of SARS-CoV-2 Main Protease (Mpro) Cleavage Sites Using Two-Dimensional Electrophoresis and In Silico Cleavage Site Prediction / Noémi Miltner, Gergő Kalló, Éva Csősz, Márió Miczi, Tibor Nagy, Mohamed Mahdi, János András Mótyán, József Tőzsér
Dátum:2023
ISSN:1422-0067
Megjegyzések:The main protease (Mpro) of severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 (SARS-CoV-2) plays a crucial role in its life cycle. The Mpro-mediated limited proteolysis of the viral polyproteins is necessary for the replication of the virus, and cleavage of the host proteins of the infected cells may also contribute to viral pathogenesis, such as evading the immune responses or triggering cell toxicity. Therefore, the identification of host substrates of the viral protease is of special interest. To identify cleavage sites in cellular substrates of SARS-CoV-2 Mpro, we determined changes in the HEK293T cellular proteome upon expression of the Mpro using two-dimensional gel electrophoresis. The candidate cellular substrates of Mpro were identified by mass spectrometry, and then potential cleavage sites were predicted in silico using NetCorona 1.0 and 3CLP web servers. The existence of the predicted cleavage sites was investigated by in vitro cleavage reactions using recombinant protein substrates containing the candidate target sequences, followed by the determination of cleavage positions using mass spectrometry. Unknown and previously described SARS-CoV-2 Mpro cleavage sites and cellular substrates were also identified. Identification of target sequences is important to understand the specificity of the enzyme, as well as aiding the improvement and development of computational methods for cleavage site prediction.
Tárgyszavak:Orvostudományok Elméleti orvostudományok idegen nyelvű folyóiratközlemény külföldi lapban
folyóiratcikk
coronavirus
SARS-CoV-2
main protease
Mpro
COVID-19
two-dimensional gel electrophoresis
cleavage site identification
cleavage site prediction
protease
host protein cleavage
specificity
Megjelenés:International Journal Of Molecular Sciences. - 24 : 4 (2023), p. 1-19. -
További szerzők:Kalló Gergő (1989-) (molekuláris biológus) Csősz Éva (1977-) (biokémikus, molekuláris biológus) Miczi Márió Nagy Tibor (1988-) (vegyész) Mahdi, Mohamed (1979-) (orvos, tudományos segédmunkatárs) Mótyán János András (1981-) (biokémikus, molekuláris biológus) Tőzsér József (1959-) (molekuláris biológus, biokémikus, vegyész)
Pályázati támogatás:GINOP-2.3.3-15-2016-00020
GINOP
GINOP-2.3.3-15-2016-00021
GINOP
Internet cím:Szerző által megadott URL
DOI
Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
Borító:

9.

001-es BibID:BIBFORM101477
035-os BibID:(cikkazonosító)4534 (scopus)85128344596 (wos)000795409300001
Első szerző:Nokhoijav, Erdenetsetseg (kutatóorvos)
Cím:Metabolomic Analysis of Serum and Tear Samples from Patients with Obesity and Type 2 Diabetes Mellitus / Erdenetsetseg Nokhoijav, Andrea Guba, Ajneesh Kumar, Balázs Kunkli, Gergő Kalló, Miklós Káplár, Sándor Somodi, Ildikó Garai, Adrienne Csutak, Noémi Tóth, Miklós Emri, József Tőzsér, Éva Csősz
Dátum:2022
ISSN:1661-6596 1422-0067
Tárgyszavak:Orvostudományok Klinikai orvostudományok idegen nyelvű folyóiratközlemény külföldi lapban
folyóiratcikk
Megjelenés:International Journal Of Molecular Sciences. - 23 (2022), p. 1-19. -
További szerzők:Guba Andrea (1975-) (Okleveles vegyész) Kumar, Ajneesh (1994-) (bioinformatikus) Kunkli Balázs Kalló Gergő (1989-) (molekuláris biológus) Káplár Miklós (1965-) (belgyógyász, diabetológus) Somodi Sándor (1977-) (belgyógyász) Garai Ildikó (1966-) (radiológus) Csutak Adrienne (1971-) (szemész) Tóth Noémi (1992-) (orvos) Emri Miklós (1962-) (fizikus) Tőzsér József (1959-) (molekuláris biológus, biokémikus, vegyész) Csősz Éva (1977-) (biokémikus, molekuláris biológus)
Pályázati támogatás:GINOP-2.3.4-15-2016-00002
GINOP
GINOP-2.3.3-15-2016-00020
GINOP
FK134605
Other
Internet cím:Szerző által megadott URL
DOI
Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
Borító:
Rekordok letöltése1