Magyar
Toggle navigation
Tudóstér
Magyar
Tudóstér
Keresés
Egyszerű keresés
Összetett keresés
CCL keresés
Egyszerű keresés
Összetett keresés
CCL keresés
Böngészés
Saját polc tartalma
(
0
)
Korábbi keresések
CCL parancs
CCL
Összesen 2 találat.
#/oldal:
12
36
60
120
Rövid
Hosszú
MARC
Részletezés:
Rendezés:
Szerző növekvő
Szerző csökkenő
Cím növekvő
Cím csökkenő
Dátum növekvő
Dátum csökkenő
1.
001-es BibID:
BIBFORM072111
035-os BibID:
(WoS)000423645700002 (Scopus)85034832211
Első szerző:
Czimmerer Zsolt (molekuláris biológus)
Cím:
Dynamic transcriptional control of macrophage miRNA signature via inflammation responsive enhancers revealed using a combination of next generation sequencing-based approaches / Czimmerer Zsolt, Horvath Attila, Daniel Bence, Nagy Gergely, Cuaranta-Monroy Ixchelt, Kiss Mate, Kolostyak Zsuzsanna, Poliska Szilard, Steiner Laszlo, Giannakis Nikolas, Varga Tamas, Nagy Laszlo
Dátum:
2018
ISSN:
1874-9399
Tárgyszavak:
Orvostudományok
Elméleti orvostudományok
idegen nyelvű folyóiratközlemény külföldi lapban
folyóiratcikk
Megjelenés:
Biochimica et Biophysica Acta (BBA). Gene Regulatory Mechanisms. - 1861 : 1 (2018), p. 14-28. -
További szerzők:
Horváth Attila (1988-) (programtervező informatikus)
Dániel Bence (1987-) (molekuláris biológus)
Nagy Gergely (1986-) (molekuláris biológus)
Cuaranta-Monroy, Ixchelt (1979-) (Ph.D. hallgató)
Kiss Máté
Kolostyák Zsuzsanna
Póliska Szilárd (1978-) (biológus)
Steiner László
Giannakis, Nikolas
Varga Tamás (1971-) (biológus)
Nagy László (1966-) (molekuláris sejtbiológus, biokémikus)
Internet cím:
Szerző által megadott URL
DOI
Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
Borító:
Saját polcon:
2.
001-es BibID:
BIBFORM063958
Első szerző:
Sándor Katalin (molekuláris biológus, biokémikus-genomikus)
Cím:
Transcriptional control of transglutaminase 2 expression in mouse apoptotic thymocytes / Katalin Sándor, Bence Dániel, Bea Kiss, Fruzsina Kovács, Zsuzsa Szondy
Dátum:
2016
ISSN:
1874-9399
Megjegyzések:
Transglutaminase 2 (TGM2) is a ubiquitously expressed multifunctional protein, which participates in various biological processes including thymocyte apoptosis. As a result, the transcriptional regulation of the gene is complex and must depend on the cell type. Previous studies from our laboratory have shown that in dying thymocytes the expression of TGM2 is induced by external signals derived from engulfing macrophages, such as retinoids, transforming growth factor (TGF)-β and adenosine, the latter triggering the adenylate cyclase signaling pathway. The existence of TGF-β and retinoid responsive elements in the promoter region of Tgm2 has already been reported, but the intergenic regulatory elements participating in the regulation of Tgm2 have not yet been identified. Here we used publicly available results from DNase I hypersensitivity analysis followed by deep sequencing and chromatin immunoprecipitation followed by deep sequencing against CCCTC-binding factor, H3K4me3, H3K4me1 and H3K27ac to map a putative regulatory element set for Tgm2 in thymocytes. By measuring eRNA expressions of these putative enhancers in retinoid, rTGF-β or dibutiryl cAMP-exposed thymocytes we determined which of them are functional. By applying ChIP-qPCR against SMAD4, retinoic acid receptor, retinoid X receptor, cAMP response element binding protein, P300 and H3K27ac under the same conditions, we identified two enhancers of Tgm2, which seem to act as integrators of the TGF-β, retinoid and adenylate cyclase signaling pathways in dying thymocytes. Our study describes a novel strategy to identify and characterize the signal specific functional enhancer set of a gene by integrating genome-wide datasets and measuring the production of enhancer specific RNA molecules
Tárgyszavak:
Természettudományok
Biológiai tudományok
idegen nyelvű folyóiratközlemény külföldi lapban
T cell
Apoptosis
gene regulation
enhancer RNA
transglutaminase 2
chip-seq
Megjelenés:
Biochimica et Biophysica Acta (BBA). Gene Regulatory Mechanisms. - 1859 : 8 (2016), p. 964-974. -
További szerzők:
Dániel Bence (1987-) (molekuláris biológus)
Kiss Beáta (1984-) (biokémikus, molekuláris biológus)
Kovács Fruzsina (2000-) (molekuláris biológus, biotechnológus)
Szondy Zsuzsanna (1959-) (molekuláris sejtbiológus, biokémikus)
Pályázati támogatás:
K104228
OTKA
NK 105046
OTKA
4.2.2.A-11/1/KONV-2012-0023
TÁMOP
Internet cím:
Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
DOI
Szerző által megadott URL
Borító:
Saját polcon:
Rekordok letöltése
1
Corvina könyvtári katalógus v8.2.27
© 2023
Monguz kft.
Minden jog fenntartva.