Találati lista | Tudóstér

001-es BibID:	BIBFORM049213
Első szerző:	Brázda Péter (biológus, angol-magyar szakfordító)
Cím:	Ligand binding shifts highly mobile RXR to chromatin-bound state in a coactivator-dependent manner as revealed by single cell imaging / Peter Brazda, Jan Krieger, Bence Daniel, David Jonas, Tibor Szekeres, Jörg Langowski, Katalin Tóth, Laszlo Nagy, György Vámosi
Dátum:	2014
ISSN:	0270-7306
Megjegyzések:	Retinoid X Receptor (RXR) is a promiscuous nuclear receptor forming heterodimers with several other receptors, which activate different sets of genes. Upon agonist treatment the occupancy of its genomic binding regions increased, but only a modest change in the number of sites was revealed by ChIP-Seq, suggesting a rather static behavior. However, such genome-wide and biochemical approaches do not take into account the dynamic behavior of a transcription factor. Therefore we characterized the nuclear dynamics of RXR during activation in single cells on the sub-second scale using live-cell imaging. By applying FRAP and fluorescence correlation spectroscopy (FCS), techniques with different temporal and spatial resolution, a highly dynamic behavior could be uncovered, which is best described by a two-state model of receptor mobility. In the unliganded state most RXRs belonged to the fast population, leaving ~15% for the slow, chromatin bound fraction. Upon agonist treatment, this ratio increased to ~43% as a result of an immediate and reversible redistribution. Coactivator binding appears to be indispensable for redistribution and has a major contribution to chromatin association. A nuclear mobility map recorded by light sheet microscopy-FCS shows that the ligand-induced transition from the fast to the slow population occurs throughout the nucleus. Our results support a model in which RXR has a distinct, highly dynamic nuclear behavior and follows hit-and-run kinetics upon activation.
Tárgyszavak:	Orvostudományok Elméleti orvostudományok idegen nyelvű folyóiratközlemény külföldi lapban RXR dynamics nuclear receptor diffusion transcription
Megjelenés:	Molecular and Cellular Biology. - 34 : 7 (2014), p. 1234-1245. -
További szerzők:	Krieger, Jan W. Dániel Bence (1987-) (molekuláris biológus) Jonás Dávid Szekeres Tibor (1984-) (molekuláris biológus) Langowski, Jörg Tóth Katalin Ágnes (1977-) (biokémikus, molekuláris biológus) Nagy László (1966-) (molekuláris sejtbiológus, biokémikus) Vámosi György (1967-) (biofizikus)
Internet cím:	Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat DOI
Borító:
Saját polcon:

001-es BibID:	BIBFORM071151
Első szerző:	Czimmerer Zsolt (molekuláris biológus)
Cím:	Extensive and functional overlap of the STAT6 and RXR cistromes in the active enhancer repertoire of human CD14+ monocyte derived differentiating macrophages / Zsolt Czimmerer, Zsuzsanna S. Nagy, Gergely Nagy, Attila Horvath, Timea Silye-Cseh, Agnes Kriston, David Jonas, Sascha Sauer, Laszlo Steiner, Bence Daniel, Jean-Francois Deleuze, Laszlo Nagy
Dátum:	2018
ISSN:	0303-7207
Tárgyszavak:	Orvostudományok Elméleti orvostudományok idegen nyelvű folyóiratközlemény külföldi lapban
Megjelenés:	Molecular and Cellular Endocrinology. - 471 (2018), p. 63-74. -
További szerzők:	Nagy Zsuzsanna S. Nagy Gergely (1986-) (molekuláris biológus) Horváth Attila (1988-) (programtervező informatikus) Silye-Cseh Timea (1985-) (Biológus) Kriston Ágnes Jonás Dávid Sauer, Sascha Steiner László Dániel Bence (1987-) (molekuláris biológus) Deleuze, Jean-Francois Nagy László (1966-) (molekuláris sejtbiológus, biokémikus)
Pályázati támogatás:	TAMOP 4.2.4. A/2-11-1-2012-0001 TÁMOP K100196 OTKA TAMOP-4.2.2/A-11/1/KONV-2012-0023 TÁMOP
Internet cím:	Szerző által megadott URL DOI Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
Borító:
Saját polcon:

001-es BibID:	BIBFORM106021
035-os BibID:	(Scopus)85145377605 (WoS)001030113900001
Első szerző:	Dániel Bence (molekuláris biológus)
Cím:	Macrophage inflammatory and regenerative response periodicity is programmed by cell cycle and chromatin state / Daniel Bence, Belk Julia A., Meier Stefanie L., Chen Andy Y., Sandor Katalin, Czimmerer Zsolt, Varga Zsofia, Bene Krisztian, Buquicchio Frank A., Qi Yanyan, Kitano Hugo, Wheeler Joshua R., Foster Deshka S., Januszyk Michael, Longaker Michael T., Chang Howard Y., Satpathy Ansuman T.
Dátum:	2023
ISSN:	1097-2765 1097-4164
Tárgyszavak:	Orvostudományok Elméleti orvostudományok idegen nyelvű folyóiratközlemény külföldi lapban folyóiratcikk
Megjelenés:	Molecular Cell. - 83 : 1 (2023), p. 121-138.e7. -
További szerzők:	Belk, Julia A. Meier, Stefanie L. Chen, Andy Y. Sándor Katalin (1987-) (molekuláris biológus, biokémikus-genomikus) Czimmerer Zsolt (1981-) (molekuláris biológus) Varga Zsófia (1992-) (molekuláris biológus) Bene Krisztián (1986-) (Biológus) Buquicchio, Frank A. Qi, Yanyan Kitano, Hugo Wheeler, Joshua R. Foster, Deshka S. Januszyk, Michael Longaker, Michael T. Chang, Howard Y. Satpathy, Ansuman T.
Internet cím:	Szerző által megadott URL DOI Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
Borító:
Saját polcon:

001-es BibID:	BIBFORM088319
035-os BibID:	(cikkazonosító)e00547-19
Első szerző:	Nagy Gergely (molekuláris biológus)
Cím:	Unraveling the Hierarchy of cis and trans Factors That Determine the DNA Binding by Peroxisome Proliferator-Activated Receptor γ / Gergely Nagy, Bence Daniel, Ixchelt Cuaranta-Monroy, Laszlo Nagy
Dátum:	2020
ISSN:	0270-7306
Tárgyszavak:	Orvostudományok Elméleti orvostudományok idegen nyelvű folyóiratközlemény külföldi lapban folyóiratcikk
Megjelenés:	Molecular And Cellular Biology. - 40 : 7 (2020), p. 1-20. -
További szerzők:	Dániel Bence (1987-) (molekuláris biológus) Cuaranta-Monroy, Ixchelt (1979-) (Ph.D. hallgató) Nagy László (1966-) (molekuláris sejtbiológus, biokémikus)
Pályázati támogatás:	OTKA K124298 OTKA OTKA K126885 OTKA OTKA K116855 OTKA OTKA PD124843 OTKA ÚNKP-19-4-DE-173 ÚNKP
Internet cím:	Szerző által megadott URL DOI Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
Borító:
Saját polcon: