CCL

Összesen 20 találat.
#/oldal:
Részletezés:
Rendezés:

1.

001-es BibID:BIBFORM049213
Első szerző:Brázda Péter (biológus, angol-magyar szakfordító)
Cím:Ligand binding shifts highly mobile RXR to chromatin-bound state in a coactivator-dependent manner as revealed by single cell imaging / Peter Brazda, Jan Krieger, Bence Daniel, David Jonas, Tibor Szekeres, Jörg Langowski, Katalin Tóth, Laszlo Nagy, György Vámosi
Dátum:2014
ISSN:0270-7306
Megjegyzések:Retinoid X Receptor (RXR) is a promiscuous nuclear receptor forming heterodimers with several other receptors, which activate different sets of genes. Upon agonist treatment the occupancy of its genomic binding regions increased, but only a modest change in the number of sites was revealed by ChIP-Seq, suggesting a rather static behavior. However, such genome-wide and biochemical approaches do not take into account the dynamic behavior of a transcription factor. Therefore we characterized the nuclear dynamics of RXR during activation in single cells on the sub-second scale using live-cell imaging. By applying FRAP and fluorescence correlation spectroscopy (FCS), techniques with different temporal and spatial resolution, a highly dynamic behavior could be uncovered, which is best described by a two-state model of receptor mobility. In the unliganded state most RXRs belonged to the fast population, leaving ~15% for the slow, chromatin bound fraction. Upon agonist treatment, this ratio increased to ~43% as a result of an immediate and reversible redistribution. Coactivator binding appears to be indispensable for redistribution and has a major contribution to chromatin association. A nuclear mobility map recorded by light sheet microscopy-FCS shows that the ligand-induced transition from the fast to the slow population occurs throughout the nucleus. Our results support a model in which RXR has a distinct, highly dynamic nuclear behavior and follows hit-and-run kinetics upon activation.
Tárgyszavak:Orvostudományok Elméleti orvostudományok idegen nyelvű folyóiratközlemény külföldi lapban
RXR
dynamics
nuclear receptor
diffusion
transcription
Megjelenés:Molecular and Cellular Biology. - 34 : 7 (2014), p. 1234-1245. -
További szerzők:Krieger, Jan W. Dániel Bence (1987-) (molekuláris biológus) Jonás Dávid Szekeres Tibor (1984-) (molekuláris biológus) Langowski, Jörg Tóth Katalin Ágnes (1977-) (biokémikus, molekuláris biológus) Nagy László (1966-) (molekuláris sejtbiológus, biokémikus) Vámosi György (1967-) (biofizikus)
Internet cím:Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
DOI
Borító:

2.

001-es BibID:BIBFORM054512
Első szerző:Brignull, Louise M.
Cím:Reprogramming of lysosomal gene expression by interleukin-4 and Stat6 / Louise M. Brignull, Zsolt Czimmerer, Hafida Saidi, Bence Daniel, Izabel Villela, Nathan W. Bartlett, Sebastian L. Johnston, Lisiane B. Meira, Laszlo Nagy, Axel Nohturfft
Dátum:2013
ISSN:1471-2164
Tárgyszavak:Orvostudományok Elméleti orvostudományok idegen nyelvű folyóiratközlemény külföldi lapban
Megjelenés:BMC Genomics [electronic resource]. - 14 : 1 (2013), p. 1-20. -
További szerzők:Czimmerer Zsolt (1981-) (molekuláris biológus) Saidi, Hafida Dániel Bence (1987-) (molekuláris biológus) Villela, Izabel Bartlett, Nathan W. Johnston, Sebastian L. Meira, Lisiane B. Nagy László (1966-) (molekuláris sejtbiológus, biokémikus) Nohturfft, Axel
Internet cím:Szerző által megadott URL
DOI
Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
Borító:

3.

001-es BibID:BIBFORM104605
035-os BibID:(WoS)000924581500008 (Scopus)85141332501
Első szerző:Czimmerer Zsolt (molekuláris biológus)
Cím:The epigenetic state of IL-4-polarized macrophages enables inflammatory cistromic expansion and extended synergistic response to TLR ligands / Czimmerer Zsolt, Halasz Laszlo, Daniel Bence, Varga Zsofia, Bene Krisztian, Domokos Apolka, Hoeksema Marten, Shen Zeyang, Berger Wilhelm K., Cseh Timea, Jambrovics Karoly, Kolostyak Zsuzsanna, Fenyvesi Ferenc, Varadi Judit, Poliska Szilard, Hajas Gyorgy, Szatmari Istvan, Glass Christopher K., Bacsi Attila, Nagy Laszlo
Dátum:2022
ISSN:1074-7613
Megjegyzések:Prior exposure to microenvironmental signals could fundamentally change the response of macrophages to subsequent stimuli. It is believed that T helper-2 (Th2)-cell-type cytokine interleukin-4 (IL-4) and Toll-like receptor (TLR) ligand-activated transcriptional programs mutually antagonize each other, and no remarkable convergence has been identified between them. In contrast, here, we show that IL-4-polarized macrophages established a hyperinflammatory gene expression program upon lipopolysaccharide (LPS) exposure. This phenomenon, which we termed extended synergy, was supported by IL-4-directed epigenomic remodeling, LPS-activated NF-?B-p65 cistrome expansion, and increased enhancer activity. The EGR2 transcription factor contributed to the extended synergy in a macrophage-subtype-specific manner. Consequently, the previously alternatively polarized macrophages produced increased amounts of immune-modulatory factors both in vitro and in vivo in a murine Th2 cell-type airway inflammation model upon LPS exposure. Our findings establish that IL-4-induced epigenetic reprogramming is responsible for the development of inflammatory hyperresponsiveness to TLR activation and contributes to lung pathologies.
Tárgyszavak:Orvostudományok Elméleti orvostudományok idegen nyelvű folyóiratközlemény külföldi lapban
folyóiratcikk
EGR2
IL-4
LPS
STAT6
Th2-type airway inflammation
epigenetic reprogramming
inflammation
macrophage
synergistic gene activation
Megjelenés:Immunity. - 55 : 11 (2022), p. 2006-2026.e6. -
További szerzők:Halász László (1989-) (molekuláris biológus) Dániel Bence (1987-) (molekuláris biológus) Varga Zsófia (1992-) (molekuláris biológus) Bene Krisztián (1986-) (Biológus) Domokos Apolka Hoeksema, Marten Shen, Zeyang Berger, Wilhelm K. Silye-Cseh Timea (1985-) (Biológus) Jambrovics Károly (1988-) (biológus, gyógyszer-biotechnológus) Kolostyák Zsuzsanna Fenyvesi Ferenc (1977-) (gyógyszerész, gyógyszertechnológus) Váradi Judit (1973-) (gyógyszerész, gyógyszertechnológus) Póliska Szilárd (1978-) (biológus) Hajas György (1970-) (biológus) Szatmári István (1971-) (biológus) Glass, Christopher K. Bácsi Attila (1967-) (immunológus) Nagy László (1966-) (molekuláris sejtbiológus, biokémikus)
Pályázati támogatás:R01DK115924
Egyéb
DK124782
Egyéb
KKP129909
Egyéb
FK132185
Egyéb
GINOP-2.3 2-15- 2016-0006
GINOP
GINOP-2.3.2-15-2016-00050
GINOP
K125337
NKFIH
Internet cím:Szerző által megadott URL
DOI
Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
Borító:

4.

001-es BibID:BIBFORM072110
035-os BibID:(WoS)000422751600012 (Scopus)85044680054 (PubMed)29343442
Első szerző:Czimmerer Zsolt (molekuláris biológus)
Cím:The Transcription Factor STAT6 Mediates Direct Repression of Inflammatory Enhancers and Limits Activation of Alternatively Polarized Macrophages / Czimmerer Zsolt, Daniel Bence, Horvath Attila, Rückerl Dominik, Nagy Gergely, Kiss Mate, Peloquin Matthew, Budai Marietta M., Cuaranta-Monroy Ixchelt, Simandi Zoltan, Steiner Laszlo, Nagy Bela, Poliska Szilard, Banko Csaba, Bacso Zsolt, Schulman Ira G., Sauer Sascha, Deleuze Jean-Francois, Allen Judith E., Benko Szilvia, Nagy Laszlo
Dátum:2018
ISSN:1074-7613
Tárgyszavak:Orvostudományok Elméleti orvostudományok idegen nyelvű folyóiratközlemény külföldi lapban
folyóiratcikk
Megjelenés:Immunity. - 48 : 1 (2018), p. 75-90. -
További szerzők:Dániel Bence (1987-) (molekuláris biológus) Horváth Attila (1988-) (programtervező informatikus) Rückerl, Dominik Nagy Gergely (1986-) (molekuláris biológus) Kiss Máté Peloquin, Matthew Budai Marietta Margit (1985-) (molekuláris biológus) Cuaranta-Monroy, Ixchelt (1979-) (Ph.D. hallgató) Simándi Zoltán (1984-) (Ph.D. hallgató, molekuláris biológus) Steiner László Nagy Béla Jr. (1980-) (labordiagnosztikai szakorvos) Póliska Szilárd (1978-) (biológus) Bankó Csaba (1989-) (molekuláris biológus) Bacsó Zsolt (1963-) (biofizikus) Schulman, Ira G. Sauer, Sascha Deleuze, Jean-Francois Allen, Judith E. Benkő Szilvia (1973-) (molekuláris biológus) Nagy László (1966-) (molekuláris sejtbiológus, biokémikus)
Pályázati támogatás:K100196
OTKA
K111941
OTKA
K116855
OTKA
K109429
OTKA
TÁMOP 4.2.4. A/2-11-1-2012-0001
TÁMOP
Internet cím:DOI
Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
Borító:

5.

001-es BibID:BIBFORM072111
035-os BibID:(WoS)000423645700002 (Scopus)85034832211
Első szerző:Czimmerer Zsolt (molekuláris biológus)
Cím:Dynamic transcriptional control of macrophage miRNA signature via inflammation responsive enhancers revealed using a combination of next generation sequencing-based approaches / Czimmerer Zsolt, Horvath Attila, Daniel Bence, Nagy Gergely, Cuaranta-Monroy Ixchelt, Kiss Mate, Kolostyak Zsuzsanna, Poliska Szilard, Steiner Laszlo, Giannakis Nikolas, Varga Tamas, Nagy Laszlo
Dátum:2018
ISSN:1874-9399
Tárgyszavak:Orvostudományok Elméleti orvostudományok idegen nyelvű folyóiratközlemény külföldi lapban
folyóiratcikk
Megjelenés:Biochimica et Biophysica Acta (BBA). Gene Regulatory Mechanisms. - 1861 : 1 (2018), p. 14-28. -
További szerzők:Horváth Attila (1988-) (programtervező informatikus) Dániel Bence (1987-) (molekuláris biológus) Nagy Gergely (1986-) (molekuláris biológus) Cuaranta-Monroy, Ixchelt (1979-) (Ph.D. hallgató) Kiss Máté Kolostyák Zsuzsanna Póliska Szilárd (1978-) (biológus) Steiner László Giannakis, Nikolas Varga Tamás (1971-) (biológus) Nagy László (1966-) (molekuláris sejtbiológus, biokémikus)
Internet cím:Szerző által megadott URL
DOI
Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
Borító:

6.

001-es BibID:BIBFORM071151
Első szerző:Czimmerer Zsolt (molekuláris biológus)
Cím:Extensive and functional overlap of the STAT6 and RXR cistromes in the active enhancer repertoire of human CD14+ monocyte derived differentiating macrophages / Zsolt Czimmerer, Zsuzsanna S. Nagy, Gergely Nagy, Attila Horvath, Timea Silye-Cseh, Agnes Kriston, David Jonas, Sascha Sauer, Laszlo Steiner, Bence Daniel, Jean-Francois Deleuze, Laszlo Nagy
Dátum:2018
ISSN:0303-7207
Tárgyszavak:Orvostudományok Elméleti orvostudományok idegen nyelvű folyóiratközlemény külföldi lapban
Megjelenés:Molecular and Cellular Endocrinology. - 471 (2018), p. 63-74. -
További szerzők:Nagy Zsuzsanna S. Nagy Gergely (1986-) (molekuláris biológus) Horváth Attila (1988-) (programtervező informatikus) Silye-Cseh Timea (1985-) (Biológus) Kriston Ágnes Jonás Dávid Sauer, Sascha Steiner László Dániel Bence (1987-) (molekuláris biológus) Deleuze, Jean-Francois Nagy László (1966-) (molekuláris sejtbiológus, biokémikus)
Pályázati támogatás:TAMOP 4.2.4. A/2-11-1-2012-0001
TÁMOP
K100196
OTKA
TAMOP-4.2.2/A-11/1/KONV-2012-0023
TÁMOP
Internet cím:Szerző által megadott URL
DOI
Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
Borító:

7.

001-es BibID:BIBFORM065040
Első szerző:Czimmerer Zsolt (molekuláris biológus)
Cím:The IL-4/STAT6 signaling axis establishes a conserved microRNA signature in human and mouse macrophages regulating cell survival via miR-342-3p / Zsolt Czimmerer, Tamas Varga, Mate Kiss, Cesaré Ovando Vázquez, Quang Minh Doan-Xuan, Dominik Rückerl, Sudhir Gopal Tattikota, Xin Yan, Zsuzsanna S. Nagy, Bence Daniel, Szilard Poliska, Attila Horvath, Gergely Nagy, Eva Varallyay, Matthew N. Poy, Judith E. Allen, Zsolt Bacso, Cei Abreu-Goodger, Laszlo Nagy
Dátum:2016
ISSN:1756-994X
Tárgyszavak:Orvostudományok Elméleti orvostudományok idegen nyelvű folyóiratközlemény külföldi lapban
Megjelenés:Genome Medicine. - 8 : 1 (2016), p. 1-22. -
További szerzők:Varga Tamás (1971-) (biológus) Kiss Máté Vázquez, Cesaré Ovando Doan-Xuan, Quang-Minh (1986-) (biofizikus) Rückerl, Dominik Tattikota, Sudhir Gopal Yan, Xin Nagy Zsuzsanna S. Dániel Bence (1987-) (molekuláris biológus) Póliska Szilárd (1978-) (biológus) Horváth Attila (1988-) (programtervező informatikus) Nagy Gergely (1986-) (molekuláris biológus) Varallyay Éva Poy, Matthew N. Allen, Judith E. Bacsó Zsolt (1963-) (biofizikus) Abreu-Goodger, Cei Nagy László (1966-) (molekuláris sejtbiológus, biokémikus)
Pályázati támogatás:K100196
OTKA
116855
OTKA
4.2.2.A-11/1/KONV-2012-0023
TÁMOP
4.2.4. A/2-11-1-2012-0001
TÁMOP
Internet cím:Szerző által megadott URL
DOI
Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
Borító:

8.

001-es BibID:BIBFORM090154
035-os BibID:(WoS)000585924300006 (Scopus)85095444133
Első szerző:Dániel Bence (molekuláris biológus)
Cím:The transcription factor EGR2 is the molecular linchpin connecting STAT6 activation to the late, stable epigenomic program of alternative macrophage polarization / Daniel Bence, Czimmerer Zsolt, Halasz Laszlo, Boto Pal, Kolostyak Zsuzsanna, Poliska Szilard, Berger Wilhelm K., Tzerpos Petros, Nagy Gergely, Horvath Attila, Hajas György, Cseh Timea, Nagy Aniko, Sauer Sascha, Francois-Deleuze Jean, Szatmari Istvan, Bacsi Attila, Nagy Laszlo
Dátum:2020
ISSN:0890-9369 1549-5477
Tárgyszavak:Orvostudományok Elméleti orvostudományok idegen nyelvű folyóiratközlemény külföldi lapban
folyóiratcikk
Megjelenés:Genes & Development. - 34 : 21-22 (2020), p. 1474-1492. -
További szerzők:Czimmerer Zsolt (1981-) (molekuláris biológus) Halász László (1989-) (molekuláris biológus) Botó Pál (1986-) (molekuláris biológus) Kolostyák Zsuzsanna Póliska Szilárd (1978-) (biológus) Berger, Wilhelm K. Tzerpos, Petros (1982-) (molekuláris biológus) Nagy Gergely (1986-) (molekuláris biológus) Horváth Attila (orvos) Hajas György (1970-) (biológus) Silye-Cseh Timea (1985-) (Biológus) Nagy Anikó (orvos) Sauer, Sascha Francois-Deleuze, Jean Szatmári István (1971-) (biológus) Bácsi Attila (1967-) (immunológus) Nagy László (1966-) (molekuláris sejtbiológus, biokémikus)
Pályázati támogatás:ÚNKP-19-4-DE-173
Egyéb
GINOP-2.3 2-15- 2016-0006
GINOP
KKP129909
OTKA
K124298
OTKA
PD124843
OTKA
FK132185
OTKA
K124890
OTKA
Internet cím:Szerző által megadott URL
DOI
Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
Borító:

9.

001-es BibID:BIBFORM076312
035-os BibID:(WoS)000433056900015 (Scopus)85054167767
Első szerző:Dániel Bence (molekuláris biológus)
Cím:The IL-4/STAT6/PPAR[gamma] signaling axis is driving the expansion of the RXR heterodimer cistrome, providing complex ligand responsiveness in macrophages / Daniel Bence, Nagy Gergely, Horvath Attila, Czimmerer Zsolt, Cuaranta-Monroy Ixchelt, Poliska Szilard, Hays Tristan T., Sauer Sascha, Francois-Deleuze Jean, Nagy Laszlo
Dátum:2018
ISSN:0305-1048 1362-4962
Tárgyszavak:Orvostudományok Elméleti orvostudományok idegen nyelvű folyóiratközlemény külföldi lapban
folyóiratcikk
Megjelenés:Nucleic Acids Research. - 46 : 9 (2018), p. 4425-4439. -
További szerzők:Nagy Gergely (1986-) (molekuláris biológus) Horváth Attila (1988-) (programtervező informatikus) Czimmerer Zsolt (1981-) (molekuláris biológus) Cuaranta-Monroy, Ixchelt (1979-) (Ph.D. hallgató) Póliska Szilárd (1978-) (biológus) Hays, Tristan T. Sauer, Sascha Francois-Deleuze, Jean Nagy László (1966-) (molekuláris sejtbiológus, biokémikus)
Pályázati támogatás:PD124843
OTKA
K124298
OTKA
K126885
OTKA
K116855
OTKA
Internet cím:Szerző által megadott URL
DOI
Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
Borító:

10.

001-es BibID:BIBFORM075746
035-os BibID:(WoS)000447386700009 (Scopus)85054182103
Első szerző:Dániel Bence (molekuláris biológus)
Cím:The Nuclear Receptor PPAR[gamma] Controls Progressive Macrophage Polarization as a Ligand-Insensitive Epigenomic Ratchet of Transcriptional Memory / Daniel Bence, Nagy Gergely, Czimmerer Zsolt, Horvath Attila, Hammers David W., Cuaranta-Monroy Ixchelt, Poliska Szilard, Tzerpos Petros, Kolostyak Zsuzsanna, Hays Tristan T., Patsalos Andreas, Houtman René, Sauer Sascha, Francois-Deleuze Jean, Rastinejad Fraydoon, Balint Balint L., Sweeney H. Lee, Nagy Laszlo
Dátum:2018
ISSN:1074-7613
Tárgyszavak:idegen nyelvű folyóiratközlemény külföldi lapban
folyóiratcikk
Megjelenés:Immunity. - 49 : 4 (2018), p. 615-626. -
További szerzők:Nagy Gergely (1986-) (molekuláris biológus) Czimmerer Zsolt (1981-) (molekuláris biológus) Horváth Attila (1988-) (programtervező informatikus) Hammers, David W. Cuaranta-Monroy, Ixchelt (1979-) (Ph.D. hallgató) Póliska Szilárd (1978-) (biológus) Tzerpos, Petros (1982-) (molekuláris biológus) Kolostyák Zsuzsanna Hays, Tristan T. Patsalos, Andreas Houtman, René Sauer, Sascha Francois-Deleuze, Jean Rastinejad, Fraydoon Bálint Bálint László (1971-) (kutató orvos) Sweeney, H. Lee Nagy László (1966-) (molekuláris sejtbiológus, biokémikus)
Pályázati támogatás:K124298
OTKA
K126885
OTKA
K116855
OTKA
PD124843
OTKA
GINOP-2.3.2-15-2016-00006
GINOP
Internet cím:DOI
Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
Borító:

11.

001-es BibID:BIBFORM054637
035-os BibID:PMID: 25182757
Első szerző:Dániel Bence (molekuláris biológus)
Cím:Mapping the genomic binding sites of the activated retinoid x receptor in murine bone marrow-derived macrophages using chromatin immunoprecipitation sequencing / Bence Daniel, Balint L. Balint, Zsuzsanna S. Nagy, Laszlo Nagy
Dátum:2014
Tárgyszavak:Orvostudományok Elméleti orvostudományok idegen nyelvű folyóiratközlemény külföldi lapban
Megjelenés:Methods in Molecular Biology. - 1204 (2014), p. 15-24. -
További szerzők:Bálint Bálint László (1971-) (kutató orvos) Nagy Zsuzsanna (1973-) (okleveles középiskolai kémia-fizika szakos tanár) Nagy László (1966-) (molekuláris sejtbiológus, biokémikus)
Internet cím:Szerző által megadott URL
DOI
Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
Borító:

12.

001-es BibID:BIBFORM054511
035-os BibID:PMID: 24945732
Első szerző:Dániel Bence (molekuláris biológus)
Cím:The intriguing complexities of mammalian gene regulation : how to link enhancers to regulated genes. Are we there yet? / Bence Daniel, Gergely Nagy, Laszlo Nagy
Dátum:2014
ISSN:0014-5793
Megjegyzések:The information encoded in genomes supports the differentiation and function of the more than 200 unique cell types, which exist in various mammalian species. The major mechanism driving cellular differentiation and specification is differential gene expression regulation. Cis-acting enhancers and silencers appear to have key roles in regulating the expression of mammalian genes. However, these cis-acting elements are often located very far away from the regulated gene. Therefore, it is hard to find all of them and link them to the regulated gene. An intriguing and unresolved issue of the field is to identify all of the enhancers of a particular gene and link these short regulatory sequences to the genes they regulate and thus, reliably identify gene regulatory enhancer networks. Recent advances in molecular biological methods coupled with Next-Generation Sequencing (NGS) technologies have opened up new possibilities in this area of genomics. In this review we summarize the technological advances, bioinformatics challenges and the potential molecular mechanisms allowing the construction of enhancer networks operating in specific cell types and/or activated by various signals.
Tárgyszavak:Orvostudományok Elméleti orvostudományok idegen nyelvű folyóiratközlemény külföldi lapban
Megjelenés:FEBS letters. - 588 : 15 (2014), p. 2379-2391. -
További szerzők:Nagy Gergely (1986-) (molekuláris biológus) Nagy László (1966-) (molekuláris sejtbiológus, biokémikus)
Internet cím:Szerző által megadott URL
DOI
Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
Borító:
Rekordok letöltése1 2 
Corvina könyvtári katalógus v8.2.27 © 2023 Monguz kft. Minden jog fenntartva.