Találati lista | Tudóstér

001-es BibID:	BIBFORM106021
035-os BibID:	(Scopus)85145377605 (WoS)001030113900001
Első szerző:	Dániel Bence (molekuláris biológus)
Cím:	Macrophage inflammatory and regenerative response periodicity is programmed by cell cycle and chromatin state / Daniel Bence, Belk Julia A., Meier Stefanie L., Chen Andy Y., Sandor Katalin, Czimmerer Zsolt, Varga Zsofia, Bene Krisztian, Buquicchio Frank A., Qi Yanyan, Kitano Hugo, Wheeler Joshua R., Foster Deshka S., Januszyk Michael, Longaker Michael T., Chang Howard Y., Satpathy Ansuman T.
Dátum:	2023
ISSN:	1097-2765 1097-4164
Tárgyszavak:	Orvostudományok Elméleti orvostudományok idegen nyelvű folyóiratközlemény külföldi lapban folyóiratcikk
Megjelenés:	Molecular Cell. - 83 : 1 (2023), p. 121-138.e7. -
További szerzők:	Belk, Julia A. Meier, Stefanie L. Chen, Andy Y. Sándor Katalin (1987-) (molekuláris biológus, biokémikus-genomikus) Czimmerer Zsolt (1981-) (molekuláris biológus) Varga Zsófia (1992-) (molekuláris biológus) Bene Krisztián (1986-) (Biológus) Buquicchio, Frank A. Qi, Yanyan Kitano, Hugo Wheeler, Joshua R. Foster, Deshka S. Januszyk, Michael Longaker, Michael T. Chang, Howard Y. Satpathy, Ansuman T.
Internet cím:	Szerző által megadott URL DOI Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
Borító:
Saját polcon:

001-es BibID:	BIBFORM066227
035-os BibID:	(WoS)000384016500018 (PM)27568546 (Scopus)84990851590
Első szerző:	Roqueta-Rivera, Manuel
Cím:	SETDB2 Links Glucocorticoid to Lipid Metabolism through Insig2a Regulation / Manuel Roqueta-Rivera, Ryan M. Esquejo, Peter E. Phelan, Katalin Sandor, Bence Daniel, Fabienne Foufelle, Jun Ding, Xiaoman Li, Sepideh Khorasanizadeh, Timothy F. Osborne
Dátum:	2016
ISSN:	1550-4131
Megjegyzések:	Transcriptional and chromatin regulations mediate the liver response to nutrient availability. The role of chromatin factors involved in hormonal regulation in response to fasting is not fully understood. We have identified SETDB2, a glucocorticoid-induced putative epigenetic modifier, as a positive regulator of GR-mediated gene activation in liver. Insig2a increases during fasting to limit lipid synthesis, but the mechanism of induction is unknown. We show Insig2a induction is GR-SETDB2 dependent. SETDB2 facilitates GR chromatin enrichment and is key to glucocorticoid-dependent enhancer-promoter interactions. INSIG2 is a negative regulator of SREBP, and acute glucocorticoid treatment decreased active SREBP during refeeding or in livers of Ob/Ob mice, both systems of elevated SREBP-1c-driven lipogenesis. Knockdown of SETDB2 or INSIG2 reversed the inhibition of SREBP processing. Overall, these studies identify a GR-SETDB2 regulatory axis of hepatic transcriptional reprogramming and identify SETDB2 as a potential target for metabolic disorders with aberrant glucocorticoid actions.
Tárgyszavak:	Természettudományok Biológiai tudományok idegen nyelvű folyóiratközlemény külföldi lapban SETDB2 SREBP fasting liver glucocorticoid receptor insig2
Megjelenés:	Cell Metabolism 24 : 3 (2016), p. 474-484. -
További szerzők:	Esquejo, Ryan M. Phelan, Peter E. Sándor Katalin (1987-) (molekuláris biológus, biokémikus-genomikus) Dániel Bence (1987-) (molekuláris biológus) Foufelle, Fabienne Ding, Jun Li, Xiaoman Khorasanizadeh, Sepideh Osborne, Timothy F.
Internet cím:	Szerző által megadott URL DOI Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
Borító:
Saját polcon:

001-es BibID:	BIBFORM063958
Első szerző:	Sándor Katalin (molekuláris biológus, biokémikus-genomikus)
Cím:	Transcriptional control of transglutaminase 2 expression in mouse apoptotic thymocytes / Katalin Sándor, Bence Dániel, Bea Kiss, Fruzsina Kovács, Zsuzsa Szondy
Dátum:	2016
ISSN:	1874-9399
Megjegyzések:	Transglutaminase 2 (TGM2) is a ubiquitously expressed multifunctional protein, which participates in various biological processes including thymocyte apoptosis. As a result, the transcriptional regulation of the gene is complex and must depend on the cell type. Previous studies from our laboratory have shown that in dying thymocytes the expression of TGM2 is induced by external signals derived from engulfing macrophages, such as retinoids, transforming growth factor (TGF)-β and adenosine, the latter triggering the adenylate cyclase signaling pathway. The existence of TGF-β and retinoid responsive elements in the promoter region of Tgm2 has already been reported, but the intergenic regulatory elements participating in the regulation of Tgm2 have not yet been identified. Here we used publicly available results from DNase I hypersensitivity analysis followed by deep sequencing and chromatin immunoprecipitation followed by deep sequencing against CCCTC-binding factor, H3K4me3, H3K4me1 and H3K27ac to map a putative regulatory element set for Tgm2 in thymocytes. By measuring eRNA expressions of these putative enhancers in retinoid, rTGF-β or dibutiryl cAMP-exposed thymocytes we determined which of them are functional. By applying ChIP-qPCR against SMAD4, retinoic acid receptor, retinoid X receptor, cAMP response element binding protein, P300 and H3K27ac under the same conditions, we identified two enhancers of Tgm2, which seem to act as integrators of the TGF-β, retinoid and adenylate cyclase signaling pathways in dying thymocytes. Our study describes a novel strategy to identify and characterize the signal specific functional enhancer set of a gene by integrating genome-wide datasets and measuring the production of enhancer specific RNA molecules
Tárgyszavak:	Természettudományok Biológiai tudományok idegen nyelvű folyóiratközlemény külföldi lapban T cell Apoptosis gene regulation enhancer RNA transglutaminase 2 chip-seq
Megjelenés:	Biochimica et Biophysica Acta (BBA). Gene Regulatory Mechanisms. - 1859 : 8 (2016), p. 964-974. -
További szerzők:	Dániel Bence (1987-) (molekuláris biológus) Kiss Beáta (1984-) (biokémikus, molekuláris biológus) Kovács Fruzsina (2000-) (molekuláris biológus, biotechnológus) Szondy Zsuzsanna (1959-) (molekuláris sejtbiológus, biokémikus)
Pályázati támogatás:	K104228 OTKA NK 105046 OTKA 4.2.2.A-11/1/KONV-2012-0023 TÁMOP
Internet cím:	Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat DOI Szerző által megadott URL
Borító:
Saját polcon: