Találati lista | Tudóstér

001-es BibID:	BIBFORM057863
Első szerző:	Bereczki Ilona (vegyész, antibiotikumkémikus)
Cím:	A few atoms make the difference: Synthetic, CD, NMR and computational studies on antiviral and antibacterial activities of glycopeptide antibiotic aglycon derivatives / Ilona Bereczki, Attila Mandi, Erzsebet Rőth, Aniko Borbás, Adám Fizil, Istvan Komáromi, Attila Sipos, Tibor Kurtán, Gyula Batta, Eszter Ostorhazi, Ferenc Rozgonyi, Evelien Vanderlinden, Lieve Naesens, Ferenc Sztaricskai, Pál Herczegh
Dátum:	2015
ISSN:	0223-5234
Megjegyzések:	Despite the close structural similarity between the heptapeptide cores of the glycopeptide antibiotics teicoplanin and ristocetin, synthetically modified derivatives of their aglycons show significantly different antibacterial and antiviral properties. The teicoplanin aglycon derivatives with one exception proved to be potent antibacterials but they did not exhibit anti-influenza virus activity. In contrast, the aglycoristocetin derivatives generally showed high anti-influenza virus activity and possessed moderate antibacterial activity. A systematic structure-activity relationship study has been carried out on ristocetin and teicoplanin aglycon derivatives, to explore which structural differences are responsible for these markedly different biological activities. According to electronic circular dichroism and in silico conformational studies, it was found that the differences in anti-influenza virus activity are mainly determined by the conformation of the heptapeptide core of the antibiotics controlled by the presence or absence of chloro substituents. Knowledge of the bioactive conformation will help to design new analogs with improved anti-influenza virus activity. For the teicoplanin derivatives, it was shown that derivatization to improve the antiviral efficacy was accompanied by a significant decrease in antibacterial activity.
Tárgyszavak:	Természettudományok Kémiai tudományok idegen nyelvű folyóiratközlemény külföldi lapban Teicoplanin aglycon Ristocetin aglycon Antibacterial Antiviral Conformation
Megjelenés:	European Journal of Medicinal Chemistry. - 94 (2015), p. 73-86. -
További szerzők:	Mándi Attila (1981-) (vegyész, német szakfordító) Rőth Erzsébet (1957-) (vegyész) Borbás Anikó (1965-) (vegyész) Fizil Ádám (1988-) (biológus) Komáromi István (1957-) (vegyész, molekuláris biológus, biokémikus) Sipos Attila (1977-) (vegyész, angol-magyar szakfordító) Kurtán Tibor (1973-) (vegyész, angol szakfordító) Batta Gyula (1953-) (molekula-szerkezet kutató) Ostorházi Eszter (1978-) (mikrobiológus) Rozgonyi Ferenc (1938-) (biológus, mikrobiológus) Vanderlinden, Evelien Naesens, Lieve (1965-) (kémikus) Sztaricskai Ferenc (1934-2012) (vegyész, antibiotikum-kémikus) Herczegh Pál (1947-) (vegyész, antibiotikumkémikus)
Pályázati támogatás:	K 109208, K105871 OTKA NIIFI 10038 Egyéb TÁMOP-4.2.4.A/2-11-1-2012-0001 TÁMOP
Internet cím:	Szerző által megadott URL DOI Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
Borító:
Saját polcon:

001-es BibID:	BIBFORM076180
035-os BibID:	(cikkazonosító)e0204825 (WOS)000447417900013 (Scopus)85055079512
Első szerző:	Fizil Ádám (biológus)
Cím:	Calcium binding of the antifungal protein PAF: Structure, dynamics and function aspects by NMR and MD simulations / Ádám Fizil, Christoph Sonderegger, András Czajlik, Attila Fekete, István Komáromi, Dorottya Hajdu, Florentine Marx, Gyula Batta
Dátum:	2018
ISSN:	1932-6203
Megjegyzések:	Calcium ions (Ca2+) play an important role in the toxicity of the cysteine-rich and cationic antifungal protein PAF from Penicillium chrysogenum: high extracellular Ca2+ levels reduce the toxicity of PAF in the sensitive model fungus Neurospora crassa in a concentration dependent way. However, little is known about the mechanistic details of the Ca2+ ion impact and the Ca2+ binding capabilities of PAF outside the fungal cell, which might be the reason for the activity loss. Using nuclear magnetic resonance (NMR), isothermal titration calorimetry and molecular dynamics (MD) simulations we demonstrated that PAF weakly, but specifically binds Ca2+ ions. MD simulations of PAF predicted one major Ca2+ binding site at the C-terminus involving Asp53 and Asp55, while Asp19 was considered as putative Ca2+ binding site. The exchange of Asp19 to serine had little impact on the Ca2+ binding, however caused the loss of antifungal activity, as was shown in our recent study. Now we replaced the C-terminal aspartates and expressed the serine variant PAF{D53S/D55S}. The specific Ca2+ binding affinity of PAF{D53S/D55S} decreased significantly if compared to PAF, whereas the antifungal activity was retained. To understand more details of Ca2+ interactions, we investigated the NMR and MD structure/dynamics of the free and Ca2+-bound PAF and PAF{D53S/D55S}. Though we found some differences between these protein variants and the Ca2+ complexes, these effects cannot explain the observed Ca2+ influence. In conclusion, PAF binds Ca2+ ions selectively at the C-terminus; however, this Ca2+ binding does not seem to play a direct role in the previously documented modulation of the antifungal activity of PAF.
Tárgyszavak:	Természettudományok Kémiai tudományok idegen nyelvű folyóiratközlemény külföldi lapban folyóiratcikk
Megjelenés:	Plos One. - 13 : 10 (2018), p. 1-19. -
További szerzők:	Sonderegger, Christoph Czajlik András (1975-) (gyógyszerész) Fekete Attila (1983-) (vegyész) Komáromi István (1957-) (vegyész, molekuláris biológus, biokémikus) Hajdu Dorottya (1987-) (biológus) Marx, Florentine Batta Gyula (1953-) (molekula-szerkezet kutató)
Pályázati támogatás:	ANN 110821 OTKA TÁMOP-4.2.1/B-09/1/KONV-2010-0007 TÁMOP GINOP-2.3.2-15-2016-00008 GINOP GINOP-2.3.3-15-2016-00004 GINOP
Internet cím:	Szerző által megadott URL DOI Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
Borító:
Saját polcon: