CCL

Összesen 14 találat.
#/oldal:
Részletezés:
Rendezés:

1.

001-es BibID:BIBFORM084562
035-os BibID:(Scopus)84961282078 (WOS)000379133500002
Első szerző:Bodnár Judit
Cím:Enzymatic removal of N-glycans by PNGase F coated magnetic microparticles / Bodnar Judit, Szekrenyes Akos, Szigeti Marton, Jarvas Gabor, Krenkova Jana, Foret Frantisek, Guttman Andras
Dátum:2016
ISSN:0173-0835 1522-2683
Megjegyzések:Investigation of protein glycosylation is an important area in biomarker discovery and biopharmaceutical research. Alterations in protein N-glycosylation can be an indication of changes in pathological conditions in the medical field or production parameters of biotherapeutics. Rapid development of these disciplines calls for fast, high-throughput, and reproducible methods to analyze protein N-glycosylation. Currently used methods require either long deglycosylation times or large excess of enzymes. In this paper, we report on the use of PNGase F immobilization onto the surface of magnetic microparticles and their use in rapid and efficient removal of N-glycans from glycoproteins. The use of immobilized PNGase F also allowed reusability of the enzyme-coated beads as the magnetic microparticles can be readily partitioned from the sample by a magnet after each deglycosylation reaction. The efficiency and activity of the PNGase F coated magnetic beads was compared with in-solution enzyme reactions using standard glycoproteins possessing the major N-glycan types of neutral, high mannose, and highly sialylated carbohydrates. The PNGase F coated magnetic beads offered comparable deglycosylation level to the conventional in-solution based method in 10-min reaction times for the model glycoproteins of immunoglobulin G (mostly neutral carbohydrates), ribonuclease B (high mannose type sugars), and fetuin (highly sialylated oligosaccharides) with the special features of easy removal of the enzyme from the reaction mixture and reusability.
Tárgyszavak:Orvostudományok Elméleti orvostudományok idegen nyelvű folyóiratközlemény külföldi lapban
folyóiratcikk
Deglycosylation
Enzyme immobilization
Magnetic microparticles
PNGase F
Megjelenés:Electrophoresis. - 37 : 10 (2016), p. 1264-1269. -
További szerzők:Szekrényes Ákos (1983-) (vegyészmérnök) Szigeti Márton (1986-) (környezetmérnök) Járvás Gábor (1982-) (vegyészmérnök) Krenkova, Jana Foret, František Guttman András (1954-) (vegyészmérnök)
Pályázati támogatás:K116263
NKFIH
Internet cím:Szerző által megadott URL
DOI
Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
Borító:

2.

001-es BibID:BIBFORM071246
Első szerző:Döncző Boglárka (biológiatanár-földrajztanár)
Cím:Glikomika a modern orvostudományban : transzlációs aspektusok / Döncző Boglárka, Bodnár Judit, Szigeti Márton, Járvás Gábor, Hajba László, Guttman András
Dátum:2015
Tárgyszavak:Orvostudományok Elméleti orvostudományok ismeretterjesztő, népszerűsítő cikk
Megjelenés:Interdiszciplináris Magyar Egészségügy 14 : 6 (2015), p. 24-28. -
További szerzők:Bodnár Judit Szigeti Márton (1986-) (környezetmérnök) Járvás Gábor (1982-) (vegyészmérnök) Hajba László Guttman András (1954-) (vegyészmérnök)
Internet cím:Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
Borító:

3.

001-es BibID:BIBFORM092956
Első szerző:Fonslow, Bryan
Cím:Multilevel Characterization of Antibody-Ligand Conjugates by CESI-MS / Bryan Fonslow, Gábor Jarvas, Marton Szigeti, András Guttman
Dátum:2020
ISSN:1566-5240
Megjegyzések:Aim: To demonstrate the capabilities of our new capillary electrophoresis mass spectrometry method, which facilitates highly accurate relative quantitation of modification site occupancy of antibody-ligand (e.g., antibody-drug) conjugates. Background: Antibody-drug conjugates play important roles in medical discovery for imaging and therapeutic intervention. The localization and stoichiometry of the conjugation can affect the orientation, selectivity, specificity, and strength of molecular interactions, influencing biochemical function. Objective: To demonstrate the option to analyze the localization and stoichiometry of antibody-ligand conjugates by using essentially the same method at all levels including ligand infusion, peptide mapping, as well as reduced and intact protein analysis. Materials and Methods: Capillary electrophoresis coupled with electrospray ionization mass spectrometry was used to analyze the antibody-ligand conjugates. Results: We identified three prevalent ligand conjugation sites with estimated stoichiometries of 73, 14, and 6% and an average ligand-antibody ratio of 1.37, illustrating the capabilities of CE-ESI-MS for rapid and efficient characterization of antibody-drug conjugates. Conclusion: The developed multilevel analytical method offers a comprehensive way to determine the localization and stoichiometry of antibody-drug conjugates for molecular medicinal applications. In addition, a significant advantage of the reported approach is the small, hydrophilic, unmodified peptides well separated from the neutrals, which is not common with other liquid phase separation methods such as LC.
Tárgyszavak:Orvostudományok Elméleti orvostudományok idegen nyelvű folyóiratközlemény külföldi lapban
folyóiratcikk
Megjelenés:Current Molecular Medicine. - 20 : 10 (2020), p. 789-797. -
További szerzők:Járvás Gábor (1982-) (vegyészmérnök) Szigeti Márton (1986-) (környezetmérnök) Guttman András (1954-) (vegyészmérnök)
Internet cím:Szerző által megadott URL
DOI
Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
Borító:

4.

001-es BibID:BIBFORM106833
035-os BibID:(scopus)85127728050
Első szerző:Járvás Gábor (vegyészmérnök)
Cím:Database search assisted N-glycan structure identification / Jarvas Gabor, Szigeti Marton, Campbell Matthew P., Guttman Andras
Dátum:2021
ISBN:978 012 821 447 3
Tárgyszavak:Orvostudományok Elméleti orvostudományok könyvfejezet
könyvrészlet
Megjelenés:Carbohydrate Analysis by Modern Liquid Phase Separation Techniques / Ed. Ziad El Rassi. - p. 844-856. -
További szerzők:Szigeti Márton (1986-) (környezetmérnök) Campbell, Matthew P. Guttman András (1954-) (vegyészmérnök)
Pályázati támogatás:BIONANO_GINOP-2.3.2-15-2016-00017
GINOP
2018-2.1.17-TÉT-KR-2018-00010
GINOP
TKP2020-IKA-07
Egyéb
2020-4.1.1-TKP2020
Egyéb
UNKP-20-5
Egyéb
Internet cím:Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
DOI
Borító:

5.

001-es BibID:BIBFORM084499
035-os BibID:(WoS)000389556900019 (Scopus)85020945816
Első szerző:Járvás Gábor (vegyészmérnök)
Cím:Triple-Internal Standard Based Glycan Structural Assignment Method for Capillary Electrophoresis Analysis of Carbohydrates / Jarvas Gabor, Szigeti Marton, Chapman Jeff, Guttman Andras
Dátum:2016
ISSN:0003-2700
Megjegyzések:Despite the ever growing use of capillary electrophoresis in biomedical research and the biopharmaceutical industry, the development of data interpretation methods is lagging behind. In this paper we report the design and implementation of a coinjected triple-internal standard method to alleviate the need of an accompanying run of the maltooligosaccharide ladder for glucose unit (GU) calculation. Based on the migration times of the coinjected standards of maltose, maltotriose, and maltopentadecaose (bracketing the peaks of interest), a data processing approach was designed and developed to set up a virtual ladder that was used for GU calculation. The data processing was tested in terms of the calculated GU values of human IgG glycans, and the resulting relative standard deviation was ?1.07%. This approach readily supports high-throughput capillary electrophoresis systems by significantly speeding up the processing time for glycan structural assignment.
Tárgyszavak:Orvostudományok Klinikai orvostudományok idegen nyelvű folyóiratközlemény külföldi lapban
folyóiratcikk
Megjelenés:Analytical Chemistry. - 88 : 23 (2016), p. 11364-11367. -
További szerzők:Szigeti Márton (1986-) (környezetmérnök) Chapman, Jeff Guttman András (1954-) (vegyészmérnök)
Pályázati támogatás:NKFIH K116263
Egyéb
Internet cím:Szerző által megadott URL
DOI
Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
Borító:

6.

001-es BibID:BIBFORM083096
Első szerző:Járvás Gábor (vegyészmérnök)
Cím:Expanding the capillary electrophoresis-based glucose unit database of the GUcal app / Jarvas Gabor, Szigeti Marton, Campbell Matthew P., Guttman Andras
Dátum:2020
ISSN:1460-2423
Megjegyzések:GUcal is a standalone application for automatically calculating the glucose unit (GU) values for separated N-glycan components of interest in an electropherogram and suggests their tentative structures by utilizing an internal database. We have expanded the original database of GUcal by integrating all publicly available capillary electrophoresis (CE) data in the GlycoStore collection (https://www.glycostore.org) and with in-house measured GU values. The GUcal app is freely available online (https://www.gucal.hu) and readily facilitates CE-based high throughput GU value determination for first line structural elucidation.
Tárgyszavak:Orvostudományok Elméleti orvostudományok idegen nyelvű folyóiratközlemény külföldi lapban
folyóiratcikk
Megjelenés:Glycobiology. - 30 : 6 (2020), p. 362-364. -
További szerzők:Szigeti Márton (1986-) (környezetmérnök) Campbell, Matthew P. Guttman András (1954-) (vegyészmérnök)
Pályázati támogatás:BIONANO_GINOP-2.3.2-15-2016-00017
GINOP
NN127062
OTKA
ÚNKP-19-4
Egyéb
Internet cím:Szerző által megadott URL
DOI
Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
Borító:

7.

001-es BibID:BIBFORM077850
035-os BibID:(PMID)28714133 (Scopus)85041472118 (WOS)000424154000014
Első szerző:Járvás Gábor (vegyészmérnök)
Cím:Tilted pillar array fabrication by the combination of proton beam writing and soft lithography for microfluidic cell capture Part 2 : image sequence analysis based evaluation and biological application / Gábor Járvás, Tamás Varga, Márton Szigeti, László Hajba, Péter Fürjes, István Rajta, András Guttman
Dátum:2018
ISSN:0173-0835 1522-2683
Megjegyzések:As a continuation of our previously published work, this paper presents a detailed eval-uation of a microfabricated cell capture device utilizing a doubly tilted micropillar array.The device was fabricated using a novel hybrid technology based on the combination ofproton beam writing and conventional lithography techniques. Tilted pillars offer uniqueflow characteristics and support enhanced fluidic interaction for improved immunoaffin-ity based cell capture. The performance of the microdevice was evaluated by an imagesequence analysis based in-house developed single-cell tracking system. Individual celltracking allowed in-depth analysis of the cell?chip surface interaction mechanism fromhydrodynamic point of view. Simulation results were validated by using the hybrid deviceand the optimized surface functionalization procedure. Finally, the cell capture capabilityof this new generation microdevice was demonstrated by efficiently arresting cells from aHT29 cell-line suspension.
Tárgyszavak:Orvostudományok Elméleti orvostudományok idegen nyelvű folyóiratközlemény külföldi lapban
folyóiratcikk
Cell capture
Cell tracking
Image sequence analysis
Proton beam writing
Soft lithography
Megjelenés:Electrophoresis. - 39 : 3 (2018), p. 534-539. -
További szerzők:Varga Tamás Szigeti Márton (1986-) (környezetmérnök) Hajba László Fürjes Péter Rajta István (1970-) (fizikus) Guttman András (1954-) (vegyészmérnök)
Internet cím:Szerző által megadott URL
DOI
Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
Borító:

8.

001-es BibID:BIBFORM077849
035-os BibID:(PMID)29457870
Első szerző:Járvás Gábor (vegyészmérnök)
Cím:Effect of the flow profile on separation efficiency in pressure-assisted reversed-polarity capillary zone electrophoresis of anions : simulation and experimental evaluation / Gabor Jarvas, Marton Szigeti, Andras Guttman
Dátum:2018
ISSN:1615-9306
Megjegyzések:Capillary electrophoresis connected to electrospray ionization mass spectrometry is a promising combination to analyze complex biological samples. The use of sheathless electrospray ionization interfaces, such as a porous nanoelectrospray capillary emitter, requires the application of forward flow (either by pressure or electroosmosis) to maintain the electrospray process. The analysis of solute molecules with strong negative charges (e.g., aminopyrenetrisulfonate labeled glycans) necessitates a reversedpolarity capillary electrophoresis separation mode, in which case the electroosmotic flow is counter current, thus pressure assistance is necessary. In this study, we compared the effect of forced convection with and without counter electroosmotic flow on the resulting separation efficiency in capillary electrophoresis based on flow profile simulations by computational fluid dynamics technique and by actual experiments. The efficiencies of the detected peaks were calculated from the resulting electropherograms and found approximately 950 000 plates/m for electrophoresis with counter electroosmotic flow, 20 000 plates/m with pressure only (such as would be in open tubular liquid chromatography), and 480 000 plates/m for electrophoresis with simultaneous counter electroosmotic flow and forward pressure assistance, which validates the simulation data
Tárgyszavak:Orvostudományok Elméleti orvostudományok idegen nyelvű folyóiratközlemény külföldi lapban
capillary electrophoresis
electroosmotic flow
pressure-assisted flow
separation efficiency
Megjelenés:Journal of Separation Science. - 41 : 11 (2018), p. 2473-2478. -
További szerzők:Szigeti Márton (1986-) (környezetmérnök) Guttman András (1954-) (vegyészmérnök)
Pályázati támogatás:OTKA K 116263
OTKA
TÉT_15-1-2016-0041
Egyéb
BIONANO_GINOP-2.3.2-15-2016-00017
GINOP
Internet cím:Szerző által megadott URL
DOI
Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
Borító:

9.

001-es BibID:BIBFORM066036
Első szerző:Kun Renáta (biotechnológus)
Cím:Biobanking of patient samples for geno-glycomic lung disease biomarker studies / Renáta Kun, Eszter Canky, Miklos Szabo, Zsolt Ronai, Zsuzsanna Kovacs, Marton Szigeti, Gabor Jarvas, Laszlo Hajba, Boglarka Donczo, Andras Guttman
Dátum:2016
Tárgyszavak:Orvostudományok Elméleti orvostudományok előadáskivonat
Separation window dependent multiple injection
SWDMI
N-glikán
Tüdő tumor
haptoglobin
M-protein
kapilláris elektroforézis
myeloma multiplex
paraprotein
IgG
multiple myeloma
Capillary electrophoresis
N-glycans
biobank
lung cancer
glycomic
Megjelenés:CECE 2016 - 13 th International Interdisciplinary Meeting on Bioanalysis / Ed. František Foret, Jana Křenková, Iveta Drobníková, Karel Klepárník. - p. 171-172. -
További szerzők:Canky Eszter Szabó Miklós Rónai Zsolt Kovács Zsuzsanna (1989-) Szigeti Márton (1986-) (környezetmérnök) Járvás Gábor (1982-) (vegyészmérnök) Hajba László Döncző Boglárka (1987-) (biológiatanár-földrajztanár) Guttman András (1954-) (vegyészmérnök)
Internet cím:Szerző által megadott URL
Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
Borító:

10.

001-es BibID:BIBFORM083098
035-os BibID:(WoS)000509616900017 (Scopus)85076839168 (cikkazonosító)121913
Első szerző:Mészáros Brigitta (vegyészmérnök)
Cím:Comparative analysis of the human serum N-glycome in lung cancer, COPD and their comorbidity using capillary electrophoresis / Brigitta Mészáros, Gábor Járvás, Anna Farkas, Márton Szigeti, Zsuzsanna Kovács, Renáta Kun, Miklós Szabó, Eszter Csánky, András Guttman
Dátum:2020
ISSN:1570-0232
Megjegyzések:Lung cancer (LC) and chronic obstructive pulmonary disease (COPD) are prevalent ailments with a great challenge to distinguish them based on symptoms only. Since they require different treatments, it is important to find non-invasive methods capable to readily diagnose them. Moreover, COPD increases the risk of lung cancer development, leading to their comorbidity. In this pilot study the N-glycosylation profile of pooled human serum samples (90 patients each) from lung cancer, COPD and comorbidity (LC with COPD) patients were investigated in comparison to healthy individuals (control) by capillary gel electrophoresis with high sensitivity laser-induced fluorescence detection. Sample preparation was optimized for human serum samples introducing a new temperature adjusted denaturation protocol to prevent precipitation and increased endoglycosidase digestion time to assure complete removal of the N-linked carbohydrates. The reproducibility of the optimized method was<3.5%. Sixty-one N-glycan structures were identified in the pooled control human serum sample and the profile was compared to pooled lung cancer, COPD and comorbidity of COPD with lung cancer patient samples. One important finding was that no other sugar structures were detected in any of the patient groups, only quantitative differences were observed. Based on this comparative exercise, a panel of 13 N-glycan structures were identified as potential glycobiomarkers to reveal significant changes (> 33% in relative peak areas) between the pathological and control samples. In addition to N-glycan profile changes, alterations in the individual N-glycan subclasses, such as total fucosylation, degree of sialylation and branching may also hold important glycobiomarker values.
Tárgyszavak:Orvostudományok Elméleti orvostudományok idegen nyelvű folyóiratközlemény külföldi lapban
folyóiratcikk
Megjelenés:Journal of Chromatography B-Analytical Technologies In The Biomedical And Life Sciences. - 1137 (2020), p. 1-7. -
További szerzők:Járvás Gábor (1982-) (vegyészmérnök) Farkas Anna (1988-) (molekuláris biológus) Szigeti Márton (1986-) (környezetmérnök) Kovács Zsuzsanna (1989-) Kun Renáta (1986-) (biotechnológus) Szabó Miklós (1980-) (tüdőgyógyász) Csánky Eszter (1959-) (tüdőgyógyász, klinikai immunológus, allergológus) Guttman András (1954-) (vegyészmérnök)
Pályázati támogatás:K 116263
NKFIH
BIONANO_GINOP-2.3.2-15-2016-00017
GINOP
NN 127062
NKFIH
ÚNKP-18-3-I-DE-393
Egyéb
Internet cím:Szerző által megadott URL
DOI
Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
Borító:

11.

001-es BibID:BIBFORM073664
035-os BibID:(WoS)000424868700137 (Scopus)85037641879
Első szerző:Mészáros Brigitta (vegyészmérnök)
Cím:Quantitative characterization of plasma treated PDMS microfluidic substrates by inverse gas chromatography / Mészáros B., Járvás G., Hajba L., Szigeti M., Dallos A., Guttman A.
Dátum:2018
ISSN:0925-4005
Megjegyzések:The effect of air plasma exposure time on the surface energies and acid-base characteristics of polydimethylsiloxane (PDMS) particles was studied. Polymerized PDMS powder was radio frequency induced air plasma irradiated for 2?10 s with the power of 500 W. The efficiency of the plasma treatments was investigated by a new generation inverse gas chromatograph, a surface energy analyzer. The dispersive component of surface energy was determined by the Dorris-Gray method describing the van der Waals interactions, while the specific component of surface energy expressed the surface ability for Lewis acid-base interactions. It was demonstrated that the air plasma treatment did not affect the dispersive and acidic parts of the surface energy and the change of surface hydrophilicity was caused by the raise of the electron-donor ability of the PDMS surface, characterized by van Oss-Good-Chaudhury's base number. The optimal plasma treatment time was found to be 5 s. Analysis of the specific surface energy and acid-base characteristics with respect to exposure time showed that partial to complete hydrophobic recovery occurred within 38 h.
Tárgyszavak:Orvostudományok Elméleti orvostudományok idegen nyelvű folyóiratközlemény külföldi lapban
folyóiratcikk
Megjelenés:Sensors and actuators. B, Chemical. - 258 (2018), p. 1184-1190. -
További szerzők:Járvás Gábor (1982-) (vegyészmérnök) Hajba László Szigeti Márton (1986-) (környezetmérnök) Dallos Andrea Guttman András (1954-) (vegyészmérnök)
Pályázati támogatás:K116263
NKFIH
BIONANO GINOP-2.3.2-15-2016-00017
GINOP
Internet cím:Szerző által megadott URL
DOI
Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
Borító:

12.

001-es BibID:BIBFORM069064
035-os BibID:(Scopus)84957842874 (WOS)000369959400017
Első szerző:Rajta István (fizikus)
Cím:Tilted pillar array fabrication by the combination of proton beam writing and soft lithography for microfluidic cell capture: Part 1 Design and feasibility / Istvan Rajta, Robert Huszánk, Atilla T. T. Szabó, Gyula U. L. Nagy, Szabolcs Szilasi, Peter Fürjes, Eszter Holczer, Zoltan Fekete, Gabor Járvás, Marton Szigeti, Laszlo Hajba, Judit Bodnár, Andras Guttman
Dátum:2016
ISSN:0173-0835
Megjegyzések:Design, fabrication, integration, and feasibility test results of a novel microfluidic cell capture device is presented, exploiting the advantages of proton beam writing to make lithographic irradiations under multiple target tilting angles and UV lithography to easily reproduce large area structures. A cell capture device is demonstrated with a unique doubly tilted micropillar array design for cell manipulation in microfluidic applications. Tilting the pillars increased their functional surface, therefore, enhanced fluidic interaction when special bioaffinity coating was used, and improved fluid dynamic behavior regarding cell culture injection. The proposed microstructures were capable to support adequate distribution of body fluids, such as blood, spinal fluid, etc., between the inlet and outlet of the microfluidic sample reservoirs, offering advanced cell capture capability on the functionalized surfaces. The hydrodynamic characteristics of the microfluidic systems were tested with yeast cells (similar size as red blood cells) for efficient capture.
Tárgyszavak:Természettudományok Fizikai tudományok idegen nyelvű folyóiratközlemény külföldi lapban
folyóiratcikk
Cell capture
Proton beam writing
Soft lithography
Megjelenés:Electrophoresis. - 37 : 3 (2016), p. 498-503. -
További szerzők:Huszánk Róbert (vegyész kutató) Szabó Atilla T. T. Nagy Gyula (1986-) (környezetkutató fizikus) Szilasi Szabolcs Fürjes Péter Holczer Eszter Fekete Zoltán Járvás Gábor (1982-) (vegyészmérnök) Szigeti Márton (1986-) (környezetmérnök) Hajba László Bodnár Judit Guttman András (1954-) (vegyészmérnök)
Internet cím:DOI
Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
Borító:
Rekordok letöltése1 2