Találati lista | Tudóstér

001-es BibID:	BIBFORM092949
035-os BibID:	(cikkazonosító)3700 (WoS)000601810900001 (Scopus)85098507561
Első szerző:	Mészáros Brigitta (vegyészmérnök)
Cím:	Machine Learning Based Analysis of Human Serum N-glycome Alterations to Follow up Lung Tumor Surgery / Brigitta Mészáros, Gábor Járvás, Renáta Kun, Miklós Szabó, Eszter Csánky, János Abonyi, András Guttman
Dátum:	2020
ISSN:	2072-6694
Megjegyzések:	The human serum N-glycome is a valuable source of biomarkers for malignant diseases, already utilized in multiple studies. In this paper, the N-glycosylation changes in human serum proteins were analyzed after surgical lung tumor resection. Seventeen lung cancer patients were involved in this study and the N-glycosylation pattern of their serum samples was analyzed before and after the surgery using capillary electrophoresis separation with laser-induced fluorescent detection. The relative peak areas of 21 N-glycans were evaluated from the acquired electropherograms using machine learning-based data analysis. Individual glycans as well as their subclasses were taken into account during the course of evaluation. For the data analysis, both discrete (e.g., smoker or not) and continuous (e.g., age of the patient) clinical parameters were compared against the alterations in these 21 N-linked carbohydrate structures. The classification tree analysis resulted in a panel of N-glycans, which could be used to follow up on the e ects of lung tumor surgical resection.
Tárgyszavak:	Orvostudományok Elméleti orvostudományok idegen nyelvű folyóiratközlemény külföldi lapban folyóiratcikk
Megjelenés:	Cancers. - 12 : 12 (2020), p. 1-13. -
További szerzők:	Járvás Gábor (1982-) (vegyészmérnök) Kun Renáta (1986-) (biotechnológus) Szabó Miklós (1980-) (tüdőgyógyász) Csánky Eszter (1959-) (tüdőgyógyász, klinikai immunológus, allergológus) Abonyi János Guttman András (1954-) (vegyészmérnök)
Pályázati támogatás:	BIONANO_GINOP-2.3.2-15-2016-00017 egyéb 2018-2.1.17-TÉT-KR-2018-00010 egyéb EFOP-3.6.3-VEKOP-16-2017-00009 EFOP UNKP-20-5 egyéb UNKP-19-3-I-DE-492 egyéb
Internet cím:	Szerző által megadott URL DOI Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
Borító:
Saját polcon:

001-es BibID:	BIBFORM083098
035-os BibID:	(WoS)000509616900017 (Scopus)85076839168 (cikkazonosító)121913
Első szerző:	Mészáros Brigitta (vegyészmérnök)
Cím:	Comparative analysis of the human serum N-glycome in lung cancer, COPD and their comorbidity using capillary electrophoresis / Brigitta Mészáros, Gábor Járvás, Anna Farkas, Márton Szigeti, Zsuzsanna Kovács, Renáta Kun, Miklós Szabó, Eszter Csánky, András Guttman
Dátum:	2020
ISSN:	1570-0232
Megjegyzések:	Lung cancer (LC) and chronic obstructive pulmonary disease (COPD) are prevalent ailments with a great challenge to distinguish them based on symptoms only. Since they require different treatments, it is important to find non-invasive methods capable to readily diagnose them. Moreover, COPD increases the risk of lung cancer development, leading to their comorbidity. In this pilot study the N-glycosylation profile of pooled human serum samples (90 patients each) from lung cancer, COPD and comorbidity (LC with COPD) patients were investigated in comparison to healthy individuals (control) by capillary gel electrophoresis with high sensitivity laser-induced fluorescence detection. Sample preparation was optimized for human serum samples introducing a new temperature adjusted denaturation protocol to prevent precipitation and increased endoglycosidase digestion time to assure complete removal of the N-linked carbohydrates. The reproducibility of the optimized method was<3.5%. Sixty-one N-glycan structures were identified in the pooled control human serum sample and the profile was compared to pooled lung cancer, COPD and comorbidity of COPD with lung cancer patient samples. One important finding was that no other sugar structures were detected in any of the patient groups, only quantitative differences were observed. Based on this comparative exercise, a panel of 13 N-glycan structures were identified as potential glycobiomarkers to reveal significant changes (> 33% in relative peak areas) between the pathological and control samples. In addition to N-glycan profile changes, alterations in the individual N-glycan subclasses, such as total fucosylation, degree of sialylation and branching may also hold important glycobiomarker values.
Tárgyszavak:	Orvostudományok Elméleti orvostudományok idegen nyelvű folyóiratközlemény külföldi lapban folyóiratcikk
Megjelenés:	Journal of Chromatography B-Analytical Technologies In The Biomedical And Life Sciences. - 1137 (2020), p. 1-7. -
További szerzők:	Járvás Gábor (1982-) (vegyészmérnök) Farkas Anna (1988-) (molekuláris biológus) Szigeti Márton (1986-) (környezetmérnök) Kovács Zsuzsanna (1989-) Kun Renáta (1986-) (biotechnológus) Szabó Miklós (1980-) (tüdőgyógyász) Csánky Eszter (1959-) (tüdőgyógyász, klinikai immunológus, allergológus) Guttman András (1954-) (vegyészmérnök)
Pályázati támogatás:	K 116263 NKFIH BIONANO_GINOP-2.3.2-15-2016-00017 GINOP NN 127062 NKFIH ÚNKP-18-3-I-DE-393 Egyéb
Internet cím:	Szerző által megadott URL DOI Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
Borító:
Saját polcon:

001-es BibID:	BIBFORM073664
035-os BibID:	(WoS)000424868700137 (Scopus)85037641879
Első szerző:	Mészáros Brigitta (vegyészmérnök)
Cím:	Quantitative characterization of plasma treated PDMS microfluidic substrates by inverse gas chromatography / Mészáros B., Járvás G., Hajba L., Szigeti M., Dallos A., Guttman A.
Dátum:	2018
ISSN:	0925-4005
Megjegyzések:	The effect of air plasma exposure time on the surface energies and acid-base characteristics of polydimethylsiloxane (PDMS) particles was studied. Polymerized PDMS powder was radio frequency induced air plasma irradiated for 2?10 s with the power of 500 W. The efficiency of the plasma treatments was investigated by a new generation inverse gas chromatograph, a surface energy analyzer. The dispersive component of surface energy was determined by the Dorris-Gray method describing the van der Waals interactions, while the specific component of surface energy expressed the surface ability for Lewis acid-base interactions. It was demonstrated that the air plasma treatment did not affect the dispersive and acidic parts of the surface energy and the change of surface hydrophilicity was caused by the raise of the electron-donor ability of the PDMS surface, characterized by van Oss-Good-Chaudhury's base number. The optimal plasma treatment time was found to be 5 s. Analysis of the specific surface energy and acid-base characteristics with respect to exposure time showed that partial to complete hydrophobic recovery occurred within 38 h.
Tárgyszavak:	Orvostudományok Elméleti orvostudományok idegen nyelvű folyóiratközlemény külföldi lapban folyóiratcikk
Megjelenés:	Sensors and actuators. B, Chemical. - 258 (2018), p. 1184-1190. -
További szerzők:	Járvás Gábor (1982-) (vegyészmérnök) Hajba László Szigeti Márton (1986-) (környezetmérnök) Dallos Andrea Guttman András (1954-) (vegyészmérnök)
Pályázati támogatás:	K116263 NKFIH BIONANO GINOP-2.3.2-15-2016-00017 GINOP
Internet cím:	Szerző által megadott URL DOI Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
Borító:
Saját polcon: