Találati lista | Tudóstér

001-es BibID:	BIBFORM117816
035-os BibID:	(cikkazonosító)380 (wos)001140375300001 (scopus)85181923454
Első szerző:	Linkner Tamás Richárd
Cím:	Comparative Analysis of Differential Cellular Transcriptome and Proteome Regulation by HIV-1 and HIV-2 Pseudovirions in the Early Phase of Infection / Linkner Tamás Richárd, Ambrus Viktor, Kunkli Balázs, Szojka Zsófia Ilona, Kalló Gergő, Csősz Éva, Kumar Ajneesh, Emri Miklós, Tőzsér József, Mahdi Mohamed
Dátum:	2024
ISSN:	1422-0067
Megjegyzések:	In spite of the similar structural and genomic organization of human immunodeficiency viruses type 1 and 2 (HIV-1 and HIV-2), striking differences exist between them in terms of replication dynamics and clinical manifestation of infection. Although the pathomechanism of HIV-1 infection is well characterized, relatively few data are available regarding HIV-2 viral replication and its interaction with host-cell proteins during the early phase of infection. We utilized proteo-transcriptomic analyses to determine differential genome expression and proteomic changes induced by transduction with HIV-1/2 pseudovirions during 8, 12 and 26 h time-points in HEK-293T cells. We show that alteration in the cellular milieu was indeed different between the two pseudovirions. The significantly higher number of genes altered by HIV-2 in the first two time-points suggests a more diverse yet subtle effect on the host cell, preparing the infected cell for integration and latency. On the other hand, GO analysis showed that, while HIV-1 induced cellular oxidative stress and had a greater effect on cellular metabolism, HIV-2 mostly affected genes involved in cell adhesion, extracellular matrix organization or cellular differentiation. Proteomics analysis revealed that HIV-2 significantly downregulated the expression of proteins involved in mRNA processing and translation. Meanwhile, HIV-1 influenced the cellular level of translation initiation factors and chaperones. Our study provides insight into the understudied replication cycle of HIV-2 and enriches our knowledge about the use of HIV-based lentiviral vectors in general.
Tárgyszavak:	Orvostudományok Elméleti orvostudományok idegen nyelvű folyóiratközlemény külföldi lapban folyóiratcikk
Megjelenés:	International Journal Of Molecular Sciences. - 25 : 1 (2024), p. 1-26. -
További szerzők:	Ambrus Viktor Attila (1989-) (biotechnológus) Kunkli Balázs Szojka Zsófia (1991-) (molekuláris biológus) Kalló Gergő (1989-) (molekuláris biológus) Csősz Éva (1977-) (biokémikus, molekuláris biológus) Kumar, Ajneesh (1994-) (bioinformatikus) Emri Miklós (1962-) (fizikus) Tőzsér József (1959-) (molekuláris biológus, biokémikus, vegyész) Mahdi, Mohamed (1979-) (orvos, tudományos segédmunkatárs)
Pályázati támogatás:	NKFI 125238 NKFIH TKP2020-IKA-04 Egyéb GINOP-2.3.3-15-2016-00020 GINOP TKP2021-EGA-20 Egyéb
Internet cím:	Szerző által megadott URL DOI Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
Borító:
Saját polcon:

001-es BibID:	BIBFORM098287
035-os BibID:	(cikkazonosító)2207 (WoS)000727558700001 (Scopus)85117590051
Első szerző:	Linkner Tamás Richárd
Cím:	Cellular Proteo-Transcriptomic Changes in the Immediate Early-Phase of Lentiviral Transduction / Linkner Tamás Richárd, Ambrus Viktor, Kunkli Balázs, Szojka Zsófia Ilona, Kalló Gergő, Csősz Éva, Kumar Ajneesh, Emri Miklós, Tőzsér József, Mahdi Mohamed
Dátum:	2021
ISSN:	2076-2607
Tárgyszavak:	Orvostudományok Elméleti orvostudományok idegen nyelvű folyóiratközlemény külföldi lapban folyóiratcikk
Megjelenés:	Microorganisms. - 9 : 11 (2021), p. 1-21. -
További szerzők:	Ambrus Viktor Attila (1989-) (biotechnológus) Kunkli Balázs Szojka Zsófia (1991-) (molekuláris biológus) Kalló Gergő (1989-) (molekuláris biológus) Csősz Éva (1977-) (biokémikus, molekuláris biológus) Kumar, Ajneesh (1994-) (bioinformatikus) Emri Miklós (1962-) (fizikus) Tőzsér József (1959-) (molekuláris biológus, biokémikus, vegyész) Mahdi, Mohamed (1979-) (orvos, tudományos segédmunkatárs)
Pályázati támogatás:	GINOP-2.3.3-15-2016-00020 GINOP TKP2020-IKA-04 Egyéb NKFI 125238 NKFIH
Internet cím:	Szerző által megadott URL DOI Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
Borító:
Saját polcon:

001-es BibID:	BIBFORM104263
035-os BibID:	(cikkazonosító)999233 (Scopus)85141175162 (WOS)000888173300001 (PubMed)36341352
Első szerző:	Miltner Noémi (molekuláris biológus)
Cím:	Early suppression of antiviral host response and protocadherins by SARS-CoV-2 Spike protein in THP-1-derived macrophage-like cells / Miltner Noémi, Linkner Tamás Richárd, Ambrus Viktor, Al-Muffti Aya S., Ahmad Hala, Mótyán János András, Benkő Szilvia, Tőzsér József, Mahdi Mohamed
Dátum:	2022
ISSN:	1664-3224
Megjegyzések:	The severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 (SARS-CoV-2) is the causative agent of coronavirus disease-19 (COVID-19). The spike protein (S) of SARS-CoV-2 plays a crucial role in mediating viral infectivity; hence, in an extensive effort to curb the pandemic, many urgently approved vaccines rely on the expression of the S protein, aiming to induce a humoral and cellular response to protect against the infection. Given the very limited information about the effects of intracellular expression of the S protein in host cells, we aimed to characterize the early cellular transcriptomic changes induced by expression of the S protein in THP-1-derived macrophage-like cells. Results showed that a wide variety of genes were differentially expressed, products of which are mainly involved in cell adhesion, homeostasis, and most notably, antiviral and immune responses, depicted by significant downregulation of protocadherins and type I alpha interferons (IFNAs). While initially, the levels of IFNAs were higher in the medium of S protein expressing cells, the downregulation observed on the transcriptomic level might have been reflected by no further increase of IFNA cytokines beyond the 5 h time-point, compared to the mock control. Our study highlights the intrinsic pathogenic role of the S protein and sheds some light on the potential drawbacks of its utilization in the context of vaccination strategies.
Tárgyszavak:	Orvostudományok Elméleti orvostudományok idegen nyelvű folyóiratközlemény külföldi lapban folyóiratcikk SARS-CoV-2 coronavirus COVID-19 spike protein transcriptomics virology
Megjelenés:	Frontiers in Immunology. - 13 (2022), p. 999233. -
További szerzők:	Linkner Tamás Richárd Ambrus Viktor Attila (1989-) (biotechnológus) Al-Muffti, Aya S. Ahmad, Hala Mótyán János András (1981-) (biokémikus, molekuláris biológus) Benkő Szilvia (1973-) (molekuláris biológus) Tőzsér József (1959-) (molekuláris biológus, biokémikus, vegyész) Mahdi, Mohamed (1979-) (orvos, tudományos segédmunkatárs)
Pályázati támogatás:	TKP2021-EGA-20 Egyéb POST-COVID2021-16 Egyéb K131844 OTKA
Internet cím:	Szerző által megadott URL DOI Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
Borító:
Saját polcon: