CCL

Összesen 6 találat.
#/oldal:
Részletezés:
Rendezés:

1.

001-es BibID:BIBFORM079818
035-os BibID:(cikkazonosító)102642 (Scopus)85068486502 (PMID)31300387
Első szerző:Boros-Oláh Beáta (molekuláris biológus)
Cím:Drugging the R-loop interactome : RNA-DNA hybrid binding proteins as targets for cancer therapy / Beáta Boros-Oláh, Nikoletta Dobos, Lilla Hornyák, Zoltán Szabó, Zsolt Karányi, Gábor Halmos, Jason Roszik, Lóránt Székvölgyi
Dátum:2019
ISSN:1568-7864
Megjegyzések:Unravelling the origin of genetic alterations from point mutations to chromosomal rearrangements was greatly enhanced by the discovery of RNA-DNA hybrids (R-loops) that behave as hotspots of genomic instability in a variety of organisms. Current models suggest that uncontrolled R-loops are a hazard to genome integrity, therefore, identifying proteins that are involved in recognising and signalling R-loop structures are of key importance. Herein we analysed key RNA-DNA hybrid binding proteins in humans taking advantage of large-scale gene expression, survival rate, and drug-sensitivity data from cancer genomics databases. We show that ex- pression of RNA-DNA hybrid binding proteins in various cancer types is associated with survival and may have contrasting outcomes in responding to therapeutic treatments. Based on the revealed pharmacogenomic land- scape of human RNA-DNA hybrid binding proteins, we propose that R-loops and R-loop binding proteins are potentially relevant new epigenetic markers and therapeutic targets in multiple cancers
Tárgyszavak:Orvostudományok Klinikai orvostudományok idegen nyelvű folyóiratközlemény külföldi lapban
folyóiratcikk
Cancer diagnostics and therapy
Chemotherapy
Clinical trial
Drug sensitivity
R-loop
RNA-DNA hybrid
Survival association
Megjelenés:DNA Repair. - 84 (2019), p. 1-10. -
További szerzők:Dobos Nikoletta (1981-) (biológus) Hornyák Lilla Szabó Zoltán (1973-) (belgyógyász, kardiológus) Karányi Zsolt (1961-) (biostatisztikus, bioinformatikus) Halmos Gábor (1962-) (gyógyszerész, receptorfarmakológus, experimentális onkológus) Roszik, Jason Székvölgyi Lóránt (1977-) (biofizikus, biokémikus, sejtbiológus)
Pályázati támogatás:GINOP-2.3.2-15-2016-00024
GINOP
GINOP-2.3.2-15-2016-00043
GINOP
GINOP-2.3.2-15-2016-00062
GINOP
Lendület program LP2015-9/2015
egyéb
20428-3/2018/FEKUTSTRAT
egyéb
Internet cím:Szerző által megadott URL
DOI
Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
Borító:

2.

001-es BibID:BIBFORM103523
Első szerző:Halász László (molekuláris biológus)
Cím:Corrigendum: RNA-DNA hybrid (R-loop) immunoprecipitation mapping: an analytical workflow to evaluate inherent biases / László Halász, Zsolt Karányi, Beáta Boros-Oláh, Tímea Kuik-Rózsa, Éva Sipos, Éva Nagy, Ágnes Mosolygó-L, Anett Mázló, Éva Rajnavölgyi, Gábor Halmos, Lóránt Székvölgyi
Dátum:2019
ISSN:1088-9051
Tárgyszavak:Orvostudományok Klinikai orvostudományok hozzászólás
folyóiratcikk
Megjelenés:Genome Research. - 29 : 1 (2019), p. 157-157. -
További szerzők:Karányi Zsolt (1961-) (biostatisztikus, bioinformatikus) Boros-Oláh Beáta (1989-) (molekuláris biológus) Kuik-Rózsa Tímea Sipos Éva (1989-) (gyógyszerész) Nagy Éva Mosolygó Ágnes (1986-) (biológus) Türk-Mázló Anett (1989-) (molekuláris biológus) Rajnavölgyi Éva (1950-) (immunológus) Halmos Gábor (1962-) (gyógyszerész, receptorfarmakológus, experimentális onkológus) Székvölgyi Lóránt (1977-) (biofizikus, biokémikus, sejtbiológus)
Internet cím:Szerző által megadott URL
DOI
Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
Borító:

3.

001-es BibID:BIBFORM068037
Első szerző:Halász László (molekuláris biológus)
Cím:RNA-DNA hybrid (R-loop) immunoprecipitation mapping : an analytical workflow to evaluate inherent biases / Halász László, Karányi Zsolt, Boros-Oláh Beáta, Kuik-Rózsa Tímea, Sipos Éva, Nagy Éva, Mosolygó-Lukács Ágnes, Mázló Anett, Rajnavölgyi Éva, Halmos Gábor, Székvölgyi Lóránt
Dátum:2017
ISSN:1088-9051
Tárgyszavak:Orvostudományok Elméleti orvostudományok idegen nyelvű folyóiratközlemény külföldi lapban
Megjelenés:Genome Research. - 27 :6 (2017), p. 1063-1073. -
További szerzők:Karányi Zsolt (1961-) (biostatisztikus, bioinformatikus) Boros-Oláh Beáta (1989-) (molekuláris biológus) Kuik-Rózsa Tímea Sipos Éva (1989-) (gyógyszerész) Nagy Éva (1980-) (molekuláris biológus) Mosolygó Ágnes (1986-) (biológus) Türk-Mázló Anett (1989-) (molekuláris biológus) Rajnavölgyi Éva (1950-) (immunológus) Halmos Gábor (1962-) (gyógyszerész, receptorfarmakológus, experimentális onkológus) Székvölgyi Lóránt (1977-) (biofizikus, biokémikus, sejtbiológus)
Pályázati támogatás:H2020/NKFIH
NKFIH
GINOP-2.3.2-15-2016-00024
GINOP
Internet cím:Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
DOI
Borító:

4.

001-es BibID:BIBFORM069667
Első szerző:Hetey Szabolcs
Cím:Biophysical characterization of histone H3.3 K27M point mutation / Hetey Szabolcs, Boros-Oláh Beáta, Kuik-Rózsa Tímea, Li Qiuzhen, Karányi Zsolt, Szabó Zoltán, Roszik Jason, Szalóki Nikoletta, Vámosi György, Tóth Katalin, Székvölgyi Lóránt
Dátum:2017
ISSN:0006-291X
Tárgyszavak:Orvostudományok Elméleti orvostudományok idegen nyelvű folyóiratközlemény külföldi lapban
Megjelenés:Biochemical And Biophysical Research Communications. - 490 : 3 (2017), p. 868-875. -
További szerzők:Boros-Oláh Beáta (1989-) (molekuláris biológus) Kuik-Rózsa Tímea Li, Qiuzhen Karányi Zsolt (1961-) (biostatisztikus, bioinformatikus) Szabó Zoltán (1973-) (belgyógyász, kardiológus) Roszik, Jason Szalóki Nikoletta (1981-) (biológus) Vámosi György (1967-) (biofizikus) Tóth Katalin Ágnes (1977-) (biokémikus, molekuláris biológus) Székvölgyi Lóránt (1977-) (biofizikus, biokémikus, sejtbiológus)
Pályázati támogatás:LP2015-9/2015
Egyéb
NKFIH-117670
NKFIH
K103965
OTKA
GINOP-2.3.2-15-2016-00024
GINOP
GINOP-2.3.2-15-2016-00026
GINOP
GINOP-2.3.2-15-2016-00030
GINOP
Internet cím:Szerző által megadott URL
DOI
Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
Borító:

5.

001-es BibID:BIBFORM103379
035-os BibID:(cikkazonosító)5058 (WoS)000846449200018 (Scopus)85137080090
Első szerző:Karányi Zsolt (biostatisztikus, bioinformatikus)
Cím:NODULIN HOMEOBOX is required for heterochromatin homeostasis in Arabidopsis / Zsolt Karányi, Ágnes Mosolygó-L., Orsolya Feró, Adrienn Horváth, Beáta Boros-Oláh, Éva Nagy, Szabolcs Hetey, Imre Holb, Henrik Szaker, Marton Miskei, Tibor Csorba, Lóránt Székvölgyi
Dátum:2022
ISSN:2041-1723
Megjegyzések:Arabidopsis NODULIN HOMEOBOX (NDX) is a nuclear protein described as a regulator of specific euchromatic genes within transcriptionally active chromosome arms. Here we show that NDX is primarily a heterochromatin regulator that functions in pericentromeric regions to control siRNA production and non-CG methylation. Most NDX binding sites coincide with pericentromeric het-siRNA loci that mediate transposon silencing, and are antagonistic with R-loop structures that are prevalent in euchromatic chromosomal arms. Inactivation of NDX leads to differential siRNA accumulation and DNA methylation, of which CHH/CHG hypomethylation colocalizes with NDX binding sites. Hi-C analysis shows significant chromatin structural changes in the ndx mutant, with decreased intrachromosomal interactions at pericentromeres where NDX is enriched in wild-type plants, and increased interchromosomal contacts between KNOT-forming regions, similar to those observed in DNA methylation mutants. We conclude that NDX is a key regulator of heterochromatin that is functionally coupled to het-siRNA loci and non-CG DNA methylation pathways.
Tárgyszavak:Természettudományok Biológiai tudományok idegen nyelvű folyóiratközlemény külföldi lapban
folyóiratcikk
Megjelenés:Nature Communications. - 13 (2022), p. 1-20. -
További szerzők:Mosolygó Ágnes (1986-) (biológus) Feró Orsolya Horváth Adrienn Boros-Oláh Beáta (1989-) (molekuláris biológus) Nagy Éva (1980-) (molekuláris biológus) Hetey Szabolcs Holb Imre (1973-) (agrármérnök) Szaker Henrik Miskei Márton (1978-) (molekuláris biológus, genetikus) Csorba Tibor Székvölgyi Lóránt (1977-) (biofizikus, biokémikus, sejtbiológus)
Pályázati támogatás:MTA-DE Lendület
MTA
Élettudományok - Biológiai tudományok
GINOP-2.3.2-15-2016-00024
GINOP
NNE-130913
OTKA
137678
OTKA
TKP2021-EGA-18
Egyéb
Internet cím:Szerző által megadott URL
DOI
Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
Borító:

6.

001-es BibID:BIBFORM074369
035-os BibID:(WoS)000446007700011 (Scopus)85054070208
Első szerző:Karányi Zsolt (biostatisztikus, bioinformatikus)
Cím:Nuclear dynamics of the Set1C subunit Spp1 prepares meiotic recombination sites for break formation / Zsolt Karányi, László Halász, Laurent Acquaviva, Dávid Jónás, Szabolcs Hetey, Beáta Boros-Oláh, Feng Peng, Doris Chen, Franz Klein, Vincent Géli, Lóránt Székvölgyi
Dátum:2018
ISSN:0021-9525
Megjegyzések:Spp1 is the H3K4me3 reader subunit of the Set1 complex (COMPASS/Set1C) that contributes to the mechanism by which meiotic DNA break sites (DSBs) are mechanistically selected. We previously proposed a model in which Spp1 interacts with H3K4me3 and the chromosome axis protein Mer2 that leads to DSB formation. Here we show that spatial interactions of Spp1 and Mer2 occur independently of Set1C. Spp1 exhibits dynamic chromatin binding features during meiosis with many de novo appearing and disappearing binding sites. Spp1 chromatin binding dynamics depends on its PHD finger and Mer2-interacting domain, and on modifiable histone residues (H3R2/K4). Remarkably, association of Spp1 with Mer2 axial sites reduces the effective turnover rate and diffusion coefficient of Spp1 upon chromatin binding, compared to other Set1C subunits. Our results indicate that "chromosomal turnover rate" is a major molecular determinant of Spp1 function in the framework of meiotic chromatin structure that prepares recombination initiation sites for break formation.
Tárgyszavak:Természettudományok Biológiai tudományok idegen nyelvű folyóiratközlemény külföldi lapban
folyóiratcikk
recombination
meiosis
COMPASS/Set1C
ChIP
chromatin structure
Megjelenés:Journal of Cell Biology. - 217 : 10 (2018), p. 3398-3415. -
További szerzők:Halász László (1989-) (molekuláris biológus) Acquaviva, Laurent Jonás Dávid Hetey Szabolcs Boros-Oláh Beáta (1989-) (molekuláris biológus) Peng, Feng Chen, Doris Klein, Franz Géli, Vincent Székvölgyi Lóránt (1977-) (biofizikus, biokémikus, sejtbiológus)
Pályázati támogatás:NKFIH-ERC-HU-117670
NKFIH
GINOP-2.3.2-15-2016-00024
GINOP
Internet cím:Szerző által megadott URL
Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
DOI
Borító:
Rekordok letöltése1 
Corvina könyvtári katalógus v8.2.27 © 2023 Monguz kft. Minden jog fenntartva.