Találati lista | Tudóstér

001-es BibID:	BIBFORM069667
Első szerző:	Hetey Szabolcs
Cím:	Biophysical characterization of histone H3.3 K27M point mutation / Hetey Szabolcs, Boros-Oláh Beáta, Kuik-Rózsa Tímea, Li Qiuzhen, Karányi Zsolt, Szabó Zoltán, Roszik Jason, Szalóki Nikoletta, Vámosi György, Tóth Katalin, Székvölgyi Lóránt
Dátum:	2017
ISSN:	0006-291X
Tárgyszavak:	Orvostudományok Elméleti orvostudományok idegen nyelvű folyóiratközlemény külföldi lapban
Megjelenés:	Biochemical And Biophysical Research Communications. - 490 : 3 (2017), p. 868-875. -
További szerzők:	Boros-Oláh Beáta (1989-) (molekuláris biológus) Kuik-Rózsa Tímea Li, Qiuzhen Karányi Zsolt (1961-) (biostatisztikus, bioinformatikus) Szabó Zoltán (1973-) (belgyógyász, kardiológus) Roszik, Jason Szalóki Nikoletta (1981-) (biológus) Vámosi György (1967-) (biofizikus) Tóth Katalin Ágnes (1977-) (biokémikus, molekuláris biológus) Székvölgyi Lóránt (1977-) (biofizikus, biokémikus, sejtbiológus)
Pályázati támogatás:	LP2015-9/2015 Egyéb NKFIH-117670 NKFIH K103965 OTKA GINOP-2.3.2-15-2016-00024 GINOP GINOP-2.3.2-15-2016-00026 GINOP GINOP-2.3.2-15-2016-00030 GINOP
Internet cím:	Szerző által megadott URL DOI Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
Borító:
Saját polcon:

001-es BibID:	BIBFORM103379
035-os BibID:	(cikkazonosító)5058 (WoS)000846449200018 (Scopus)85137080090
Első szerző:	Karányi Zsolt (biostatisztikus, bioinformatikus)
Cím:	NODULIN HOMEOBOX is required for heterochromatin homeostasis in Arabidopsis / Zsolt Karányi, Ágnes Mosolygó-L., Orsolya Feró, Adrienn Horváth, Beáta Boros-Oláh, Éva Nagy, Szabolcs Hetey, Imre Holb, Henrik Szaker, Marton Miskei, Tibor Csorba, Lóránt Székvölgyi
Dátum:	2022
ISSN:	2041-1723
Megjegyzések:	Arabidopsis NODULIN HOMEOBOX (NDX) is a nuclear protein described as a regulator of specific euchromatic genes within transcriptionally active chromosome arms. Here we show that NDX is primarily a heterochromatin regulator that functions in pericentromeric regions to control siRNA production and non-CG methylation. Most NDX binding sites coincide with pericentromeric het-siRNA loci that mediate transposon silencing, and are antagonistic with R-loop structures that are prevalent in euchromatic chromosomal arms. Inactivation of NDX leads to differential siRNA accumulation and DNA methylation, of which CHH/CHG hypomethylation colocalizes with NDX binding sites. Hi-C analysis shows significant chromatin structural changes in the ndx mutant, with decreased intrachromosomal interactions at pericentromeres where NDX is enriched in wild-type plants, and increased interchromosomal contacts between KNOT-forming regions, similar to those observed in DNA methylation mutants. We conclude that NDX is a key regulator of heterochromatin that is functionally coupled to het-siRNA loci and non-CG DNA methylation pathways.
Tárgyszavak:	Természettudományok Biológiai tudományok idegen nyelvű folyóiratközlemény külföldi lapban folyóiratcikk
Megjelenés:	Nature Communications. - 13 (2022), p. 1-20. -
További szerzők:	Mosolygó Ágnes (1986-) (biológus) Feró Orsolya Horváth Adrienn Boros-Oláh Beáta (1989-) (molekuláris biológus) Nagy Éva (1980-) (molekuláris biológus) Hetey Szabolcs Holb Imre (1973-) (agrármérnök) Szaker Henrik Miskei Márton (1978-) (molekuláris biológus, genetikus) Csorba Tibor Székvölgyi Lóránt (1977-) (biofizikus, biokémikus, sejtbiológus)
Pályázati támogatás:	MTA-DE Lendület MTA Élettudományok - Biológiai tudományok GINOP-2.3.2-15-2016-00024 GINOP NNE-130913 OTKA 137678 OTKA TKP2021-EGA-18 Egyéb
Internet cím:	Szerző által megadott URL DOI Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
Borító:
Saját polcon:

001-es BibID:	BIBFORM074369
035-os BibID:	(WoS)000446007700011 (Scopus)85054070208
Első szerző:	Karányi Zsolt (biostatisztikus, bioinformatikus)
Cím:	Nuclear dynamics of the Set1C subunit Spp1 prepares meiotic recombination sites for break formation / Zsolt Karányi, László Halász, Laurent Acquaviva, Dávid Jónás, Szabolcs Hetey, Beáta Boros-Oláh, Feng Peng, Doris Chen, Franz Klein, Vincent Géli, Lóránt Székvölgyi
Dátum:	2018
ISSN:	0021-9525
Megjegyzések:	Spp1 is the H3K4me3 reader subunit of the Set1 complex (COMPASS/Set1C) that contributes to the mechanism by which meiotic DNA break sites (DSBs) are mechanistically selected. We previously proposed a model in which Spp1 interacts with H3K4me3 and the chromosome axis protein Mer2 that leads to DSB formation. Here we show that spatial interactions of Spp1 and Mer2 occur independently of Set1C. Spp1 exhibits dynamic chromatin binding features during meiosis with many de novo appearing and disappearing binding sites. Spp1 chromatin binding dynamics depends on its PHD finger and Mer2-interacting domain, and on modifiable histone residues (H3R2/K4). Remarkably, association of Spp1 with Mer2 axial sites reduces the effective turnover rate and diffusion coefficient of Spp1 upon chromatin binding, compared to other Set1C subunits. Our results indicate that "chromosomal turnover rate" is a major molecular determinant of Spp1 function in the framework of meiotic chromatin structure that prepares recombination initiation sites for break formation.
Tárgyszavak:	Természettudományok Biológiai tudományok idegen nyelvű folyóiratközlemény külföldi lapban folyóiratcikk recombination meiosis COMPASS/Set1C ChIP chromatin structure
Megjelenés:	Journal of Cell Biology. - 217 : 10 (2018), p. 3398-3415. -
További szerzők:	Halász László (1989-) (molekuláris biológus) Acquaviva, Laurent Jonás Dávid Hetey Szabolcs Boros-Oláh Beáta (1989-) (molekuláris biológus) Peng, Feng Chen, Doris Klein, Franz Géli, Vincent Székvölgyi Lóránt (1977-) (biofizikus, biokémikus, sejtbiológus)
Pályázati támogatás:	NKFIH-ERC-HU-117670 NKFIH GINOP-2.3.2-15-2016-00024 GINOP
Internet cím:	Szerző által megadott URL Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat DOI
Borító:
Saját polcon: