CCL

Összesen 11 találat.
#/oldal:
Részletezés:
Rendezés:

1.

001-es BibID:BIBFORM055844
Első szerző:Cuaranta-Monroy, Ixchelt (Ph.D. hallgató)
Cím:Highly efficient differentiation of embryonic stem cells into adipocytes by ascorbic acid / Ixchelt Cuaranta-Monroy, Zoltan Simandi, Zsuzsanna Kolostyak, Quang-Minh Doan-Xuan, Szilard Poliska, Attila Horvath, Gergely Nagy, Zsolt Bacso, Laszlo Nagy
Dátum:2014
ISSN:1873-5061
Tárgyszavak:Orvostudományok Klinikai orvostudományok idegen nyelvű folyóiratközlemény külföldi lapban
Megjelenés:Stem Cell Research. - 13 : 1 (2014), p. 88-97. -
További szerzők:Simándi Zoltán (1984-) (Ph.D. hallgató, molekuláris biológus) Kolostyák Zsuzsanna Doan-Xuan, Quang-Minh (1986-) (biofizikus) Póliska Szilárd (1978-) (biológus) Horváth Attila (1988-) (programtervező informatikus) Nagy Gergely (1986-) (molekuláris biológus) Bacsó Zsolt (1963-) (biofizikus) Nagy László (1966-) (molekuláris sejtbiológus, biokémikus)
Internet cím:Szerző által megadott URL
DOI
Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
Borító:

2.

001-es BibID:BIBFORM072110
035-os BibID:(WoS)000422751600012 (Scopus)85044680054 (PubMed)29343442
Első szerző:Czimmerer Zsolt (molekuláris biológus)
Cím:The Transcription Factor STAT6 Mediates Direct Repression of Inflammatory Enhancers and Limits Activation of Alternatively Polarized Macrophages / Czimmerer Zsolt, Daniel Bence, Horvath Attila, Rückerl Dominik, Nagy Gergely, Kiss Mate, Peloquin Matthew, Budai Marietta M., Cuaranta-Monroy Ixchelt, Simandi Zoltan, Steiner Laszlo, Nagy Bela, Poliska Szilard, Banko Csaba, Bacso Zsolt, Schulman Ira G., Sauer Sascha, Deleuze Jean-Francois, Allen Judith E., Benko Szilvia, Nagy Laszlo
Dátum:2018
ISSN:1074-7613
Tárgyszavak:Orvostudományok Elméleti orvostudományok idegen nyelvű folyóiratközlemény külföldi lapban
folyóiratcikk
Megjelenés:Immunity. - 48 : 1 (2018), p. 75-90. -
További szerzők:Dániel Bence (1987-) (molekuláris biológus) Horváth Attila (1988-) (programtervező informatikus) Rückerl, Dominik Nagy Gergely (1986-) (molekuláris biológus) Kiss Máté Peloquin, Matthew Budai Marietta Margit (1985-) (molekuláris biológus) Cuaranta-Monroy, Ixchelt (1979-) (Ph.D. hallgató) Simándi Zoltán (1984-) (Ph.D. hallgató, molekuláris biológus) Steiner László Nagy Béla Jr. (1980-) (labordiagnosztikai szakorvos) Póliska Szilárd (1978-) (biológus) Bankó Csaba (1989-) (molekuláris biológus) Bacsó Zsolt (1963-) (biofizikus) Schulman, Ira G. Sauer, Sascha Deleuze, Jean-Francois Allen, Judith E. Benkő Szilvia (1973-) (molekuláris biológus) Nagy László (1966-) (molekuláris sejtbiológus, biokémikus)
Pályázati támogatás:K100196
OTKA
K111941
OTKA
K116855
OTKA
K109429
OTKA
TÁMOP 4.2.4. A/2-11-1-2012-0001
TÁMOP
Internet cím:DOI
Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
Borító:

3.

001-es BibID:BIBFORM051501
035-os BibID:(cikkazonosító)e55168 (WoS)000314610600070 (Scopus)84873137070
Első szerző:Czimmerer Zsolt (molekuláris biológus)
Cím:A versatile method to design stem-loop primer-based quantitative PCR assays for detecting small regulatory RNA molecules / Zsolt Czimmerer, Julianna Hulvely, Zoltan Simandi, Eva Varallyay, Zoltan Havelda, Erzsebet Szabo, Attila Varga, Balazs Dezso, Maria Balogh, Attila Horvath, Balint Domokos, Zsolt Torok, Laszlo Nagy, Balint L. Balint
Dátum:2013
ISSN:1932-6203
Tárgyszavak:Orvostudományok Elméleti orvostudományok idegen nyelvű folyóiratközlemény külföldi lapban
folyóiratcikk
Megjelenés:PLoS One. - 8 : 1 (2013), p. 1-10. -
További szerzők:Hulvely Julianna Simándi Zoltán (1984-) (Ph.D. hallgató, molekuláris biológus) Varallyay Éva Havelda Zoltán Szabó Erzsébet (1973-) (molekuláris biológus) Varga Attila (Astrid Research Ltd. Debrecen) Dezső Balázs (1951-) (pathológus) Balogh Mária Horváth Attila (1988-) (programtervező informatikus) Domokos Bálint (1974-) (programtervező matematikus) Török Zsolt (1975-) (orvos) Nagy László (1966-) (molekuláris sejtbiológus, biokémikus) Bálint Bálint László (1971-) (kutató orvos)
Internet cím:Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
DOI
Borító:

4.

001-es BibID:BIBFORM077777
Első szerző:Horváth Attila (programtervező informatikus)
Cím:Commentaries on Viewpoint : Loopomics: a new functional approach to life / Horváth Attila, Simándi Zoltán, Nagy László
Dátum:2017
ISSN:8750-7587
Tárgyszavak:Orvostudományok Elméleti orvostudományok hozzászólás
Megjelenés:Journal Of Applied Physiology. - 123 : 4 (2017), p. 1014-1015. -
További szerzők:Simándi Zoltán (1984-) (Ph.D. hallgató, molekuláris biológus) Nagy László (1966-) (molekuláris sejtbiológus, biokémikus)
Internet cím:Szerző által megadott URL
DOI
Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
Borító:

5.

001-es BibID:BIBFORM077627
035-os BibID:(WoS)000467964800013 (Scopus)85064477457
Első szerző:Horváth Attila (programtervező informatikus)
Cím:Labelled regulatory elements are pervasive features of the macrophage genome and are dynamically utilized by classical and alternative polarization signals / Attila Horvath, Bence Daniel, Lajos Szeles, Ixchelt Cuaranta-Monroy, Zsolt Czimmerer, Lilla Ozgyin, Laszlo Steiner, Mate Kiss, Zoltan Simandi, Szilard Poliska, Nikolas Giannakis, Emanuele Raineri, Ivo G. Gut, Benedek Nagy, Laszlo Nagy
Dátum:2019
ISSN:0305-1048 1362-4962
Megjegyzések:The concept of tissue-specific gene expression posits that lineage-determining transcription factors (LDTFs) determine the open chromatin profile of a cell via collaborative binding, providing molecular beacons to signal-dependent transcription factors (SDTFs). However, the guiding principles of LDTF binding, chromatin accessibility and enhancer activity have not yet been systematically evaluated. We sought to study these features of the macrophage genome by the combination of experimental (ChIP-seq, ATAC-seq and GRO-seq) and computational approaches. We show that Random Forest and Support Vector Regression machine learning methods can accurately predict chromatin accessibility using the binding patterns of the LDTF PU.1 and four other key TFs of macrophages (IRF8, JUNB, CEBPA and RUNX1). Any of these TFs alone were not sufficient to predict open chromatin, indicating that TF binding is widespread at closed or weakly opened chromatin regions. Analysis of the PU.1 cistrome revealed that two-thirds of PU.1 binding occurs at low accessible chromatin. We termed these sites labelled regulatory elements (LREs), which may represent a dormant state of a future enhancer and contribute to macrophage cellular plasticity. Collectively, our work demonstrates the existence of LREs occupied by various key TFs, regulating specific gene expression programs triggered by divergent macrophage polarizing stimuli.
Tárgyszavak:Orvostudományok Elméleti orvostudományok idegen nyelvű folyóiratközlemény külföldi lapban
folyóiratcikk
Megjelenés:Nucleic Acids Research. - 47 : 6 (2019), p. 2778-2792. -
További szerzők:Dániel Bence (1987-) (molekuláris biológus) Széles Lajos (1971-) (molekuláris biológus) Cuaranta-Monroy, Ixchelt (1979-) (Ph.D. hallgató) Czimmerer Zsolt (1981-) (molekuláris biológus) Ozgyin Lilla (1989-) (molekuláris biológus) Steiner László Kiss Máté Simándi Zoltán (1984-) (Ph.D. hallgató, molekuláris biológus) Póliska Szilárd (1978-) (biológus) Giannakis, Nikolas Raineri, Emanuele Gut, Ivo G. Nagy Benedek (1973-) (informatikus, matematikus) Nagy László (1966-) (molekuláris sejtbiológus, biokémikus)
Pályázati támogatás:NKFIH K116855
NKFIH
NKFIH K124298
NKFIH
NKFIH KH126885
NKFIH
GINOP-2.3.2-15-2016-00006
GINOP
GINOP-2.1.7-15-2016-01487
GINOP
Internet cím:Szerző által megadott URL
DOI
Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
Borító:

6.

001-es BibID:BIBFORM072900
035-os BibID:(Cikkazonosító)12734 (WOS)000412491500006 (Scopus)85030764085
Első szerző:Imre László (biológus)
Cím:Nucleosome stability measured in situ by automated quantitative imaging / László Imre, Zoltán Simándi, Attila Horvath, György Fenyofalvi, Péter Nanasi Jr., Erfaneh Firouzi Niaki, Éva Hegedus, Zsolt Bacso, Urbain Weyemi, Rebekka Mauser, Juan Ausio, Albert Jeltsch, William Bonner, László Nagy, Hiroshi Kimura, Gábor Szabo
Dátum:2017
ISSN:2045-2322
Megjegyzések:Current approaches have limitations in providing insight into the functional properties of particular nucleosomes in their native molecular environment. Here we describe a simple and powerful method involving elution of histones using intercalators or salt, to assess stability features dependent on DNA superhelicity and relying mainly on electrostatic interactions, respectively, and measurement of the fraction of histones remaining chromatin-bound in the individual nuclei using histone type- or posttranslational modification- (PTM-) specific antibodies and automated, quantitative imaging. The method has been validated in H3K4me3 ChIP-seq experiments, by the quantitative assessment of chromatin loop relaxation required for nucleosomal destabilization, and by comparative analyses of the intercalator and salt induced release from the nucleosomes of different histones. The accuracy of the assay allowed us to observe examples of strict association between nucleosome stability and PTMs across cell types, differentiation state and throughout the cell-cycle in close to native chromatin context, and resolve ambiguities regarding the destabilizing effect of H2A.X phosphorylation. The advantages of the in situ measuring scenario are demonstrated via the marked effect of DNA nicking on histone eviction that underscores the powerful potential of topological relaxation in the epigenetic regulation of DNA accessibility.
Tárgyszavak:Orvostudományok Elméleti orvostudományok idegen nyelvű folyóiratközlemény külföldi lapban
folyóiratcikk
Fluorescence imaging
Nuclear organization
Epigenetics
Molekuláris Medicina
Megjelenés:Scientific Reports. - 7 : 1 (2017), p. 1-15. -
További szerzők:Simándi Zoltán (1984-) (Ph.D. hallgató, molekuláris biológus) Horváth Attila (1988-) (programtervező informatikus) Fenyőfalvi György Nánási Péter Pál ifj. (1987-) (sejtbiológus) Firouzi Niaki, Erfaneh Hegedűs Éva (1978-) (biofizikus) Bacsó Zsolt (1963-) (biofizikus) Weyemi, Urbain Mauser, Rebekka Ausio, Juan Jeltsch, Albert Bonner, William Nagy László (1966-) (molekuláris sejtbiológus, biokémikus) Kimura, Hiroshi Szabó Gábor (1953-) (biofizikus)
Pályázati támogatás:K72762
OTKA
NK101337
OTKA
TÁMOP-4.2.2-08/1-2008-0015
TÁMOP
TÁMOP-4.2.1/B-09/1/KONV-2010-0007
TÁMOP
I. ABC transzporterek; II. Magasabbrendű kromatinszerkezet
TÁMOP 4.2.2.A- 11/1/KONV-2012-0023 "VÉD-ELEM
TÁMOP
TÁMOP 4.2.4. A/2-11-1-2012-0001
TÁMOP
GINOP-2.3.2-15-2016-00044
GINOP
Internet cím:Szerző által megadott URL
DOI
Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
Borító:

7.

001-es BibID:BIBFORM075780
035-os BibID:(WoS)000442995700011 (Scopus)85052649921
Első szerző:Simándi Zoltán (Ph.D. hallgató, molekuláris biológus)
Cím:Arginine Methyltransferase PRMT8 Provides Cellular Stress Tolerance in Aging Motoneurons / Zoltan Simandi, Krisztian Pajer, Katalin Karolyi, Tatiana Sieler, Lu-Lin Jiang, Zsuzsanna Kolostyak, Zsanett Sari, Zoltan Fekecs, Attila Pap, Andreas Patsalos, Gerardo Alvarado Contreras, Balint Reho, Zoltan Papp, Xiufang Guo, Attila Horvath, Greta Kiss, Zsolt Keresztessy, György Vámosi, James Hickman, Huaxi Xu, Dorothee Dormann, Tibor Hortobagyi, Miklos Antal, Antal Nógrádi, Laszlo Nagy
Dátum:2018
Tárgyszavak:idegen nyelvű folyóiratközlemény külföldi lapban
folyóiratcikk
Megjelenés:The Journal of neuroscience. - 38 : 35 (2018), p. 7683-7700. -
További szerzők:Pájer Krisztián Károlyi Katalin Sieler, Tatiana Jiang, Lu-Lin Kolostyák Zsuzsanna Sári Zsanett (1991-) (klinikai laboratóriumi kutató) Fekecs Zoltán Pap Attila (1980-) (biológus) Patsalos, Andreas Contreras, Gerardo Alvarado (1978-) (orvos) Rehó Bálint (1992-) Papp Zoltán (1965-) (kardiológus, élettanász) Guo, Xiufang Horváth Attila (1988-) (programtervező informatikus) Kiss Gréta Keresztessy Zsolt Vámosi György (1967-) (biofizikus) Hickman, James Xu, Huaxi Dormann, Dorothee Hortobágyi Tibor (1965-) (patológus) Antal Miklós (1951-) (orvos, anatómus) Nógrádi Antal Nagy László (1966-) (molekuláris sejtbiológus, biokémikus)
Pályázati támogatás:GINOP-2.3.2-15-2016-00043
GINOP
116855
OTKA
124298
OTKA
126885
OTKA
TAMOP 422_2012_0023 VÉD-ELEM
TÁMOP
Internet cím:Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
Szerző által megadott URL
DOI
Borító:

8.

001-es BibID:BIBFORM075086
Első szerző:Simándi Zoltán (Ph.D. hallgató, molekuláris biológus)
Cím:RXR heterodimers orchestrate transcriptional control of neurogenesis and cell fate specification / Simandi Zoltan, Horvath Attila, Cuaranta-Monroy Ixchelt, Sauer Sascha, Deleuze Jean-Francois, Nagy Laszlo
Dátum:2018
ISSN:0303-7207
Tárgyszavak:Orvostudományok Elméleti orvostudományok idegen nyelvű folyóiratközlemény külföldi lapban
Megjelenés:Molecular And Cellular Endocrinology. - 471 (2018), p. 51-62. -
További szerzők:Horváth Attila (1988-) (programtervező informatikus) Cuaranta-Monroy, Ixchelt (1979-) (Ph.D. hallgató) Sauer, Sascha Deleuze, Jean-Francois Nagy László (1966-) (molekuláris sejtbiológus, biokémikus)
Pályázati támogatás:OTKA-K100196
OTKA
OTKA-111941
OTKA
OTKA-K116855
OTKA
TAMOP 422_2012_0023 VÉD-ELEM
TÁMOP
Internet cím:Szerző által megadott URL
DOI
Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
Borító:

9.

001-es BibID:BIBFORM069702
Első szerző:Simándi Zoltán (Ph.D. hallgató, molekuláris biológus)
Cím:OCT4 Acts as an Integrator of Pluripotency and Signal-Induced Differentiation / Zoltan Simandi, Attila Horvath, Lyndsey C. Wright, Ixchelt Cuaranta-Monroy, Isabella De Luca, Katalin Karolyi, Sascha Sauer, Jean-Francois Deleuze, Lorraine J. Gudas, Shaun M. Cowley, Laszlo Nagy
Dátum:2016
ISSN:1097-2765
Tárgyszavak:Orvostudományok Elméleti orvostudományok idegen nyelvű folyóiratközlemény külföldi lapban
Megjelenés:Molecular Cell. - 63 : 4 (2016), p. 647-661. -
További szerzők:Horváth Attila (1988-) (programtervező informatikus) Wright, Lyndsey C. Cuaranta-Monroy, Ixchelt (1979-) (Ph.D. hallgató) De Luca, Isabella Károlyi Katalin Sauer, Sascha Deleuze, Jean-Francois Gudas, Lorraine J. Cowley, Shaun M. Nagy László (1966-) (molekuláris sejtbiológus, biokémikus)
Pályázati támogatás:K100196
OTKA
OTKA-111941
OTKA
OTKA-116855
OTKA
KTIA_13_NAP-A-I/9
Egyéb
Internet cím:Szerző által megadott URL
DOI
Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
Borító:

10.

001-es BibID:BIBFORM065035
Első szerző:Simándi Zoltán (Ph.D. hallgató, molekuláris biológus)
Cím:Prediction and Validation of Gene Regulatory Elements Activated During Retinoic Acid Induced Embryonic Stem Cell Differentiation / Zoltan Simandi, Attila Horvath, Peter Gergely Nagy, Laszlo Nagy
Dátum:2016
ISSN:1940-087X
Tárgyszavak:Orvostudományok Elméleti orvostudományok idegen nyelvű folyóiratközlemény külföldi lapban
Megjelenés:Journal of Visualized Experiments. - 2016 : 112 (2016), p. e53978. -
További szerzők:Horváth Attila (1988-) (programtervező informatikus) Nagy Péter (1986-) (tudományos segédmunkatárs) Nagy László (1966-) (molekuláris sejtbiológus, biokémikus)
Pályázati támogatás:K100196
OTKA
K111941
OTKA
KTIA_13_NAP-A-I/9
Egyéb
Internet cím:Szerző által megadott URL
DOI
Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
Borító:

11.

001-es BibID:BIBFORM055639
035-os BibID:(scopus)84923228096 (wos)000349849000009
Első szerző:Simándi Zoltán (Ph.D. hallgató, molekuláris biológus)
Cím:PRMT1 and PRMT8 regulate retinoic acid-dependent neuronal differentiation with implications to neuropathology / Zoltan Simandi, Erik Czipa, Attila Horvath, Aron Koszeghy, Csilla Bordas, Szilárd Póliska, István Juhász, László Imre, Gábor Szabó, Balazs Dezso, Endre Barta, Sascha Sauer, Katalin Karolyi, Ilona Kovacs, Gábor Hutóczky, László Bognár, Álmos Klekner, Peter Szucs, Bálint L. Bálint, Laszlo Nagy
Dátum:2015
ISSN:1066-5099
Tárgyszavak:Orvostudományok Klinikai orvostudományok idegen nyelvű folyóiratközlemény külföldi lapban
folyóiratcikk
stem cells
neuronal differentiation
retinoic acid
PRMT1
PRMT8
Megjelenés:Stem Cells. - 33 : 3 (2015), p. 726-741. -
További szerzők:Czipa Erik (1990-) (molekuláris biológus, bioinformatikus) Horváth Attila (1988-) (programtervező informatikus) Kőszeghy Áron (1983-) (Ph.D hallgató, élettanász) Bordás Csilla Póliska Szilárd (1978-) (biológus) Juhász István (1956-) (bőrgyógyász, bőrsebész, kozmetológus, klinikai onkológus) Imre László (1979-) (biológus) Szabó Gábor (1953-) (biofizikus) Dezső Balázs (1951-) (pathológus) Barta Endre (1963-) (molekuláris biológus) Sauer, Sascha Károlyi Katalin Kovács Ilona (1965-) (patológus) Hutóczki Gábor (1983-) (Ph.D. hallgató) Bognár László (1958-) (idegsebész, gyermekidegsebész) Klekner Álmos (1970-) (idegsebész) Szűcs Péter (1974-) (kutatóorvos) Bálint Bálint László (1971-) (kutató orvos) Nagy László (1966-) (molekuláris sejtbiológus, biokémikus)
Pályázati támogatás:K100196
OTKA
TÁMOP-4.2.2/B-10/1-2010-0024
TÁMOP
Molekuláris Sejt- és Immunbiológiai Doktori Iskola
TÁMOP-4.2.4.A/2-11-1-2012-0001/A2-JADJ-13
TÁMOP
F68254
OTKA
TÁMOP-4.2.4.A/2-11-1-2012-0001
TÁMOP
Internet cím:Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
DOI
Borító:
Rekordok letöltése1 
Corvina könyvtári katalógus v8.2.27 © 2023 Monguz kft. Minden jog fenntartva.