CCL

Összesen 8 találat.
#/oldal:
Részletezés:
Rendezés:

1.

001-es BibID:BIBFORM055844
Első szerző:Cuaranta-Monroy, Ixchelt (Ph.D. hallgató)
Cím:Highly efficient differentiation of embryonic stem cells into adipocytes by ascorbic acid / Ixchelt Cuaranta-Monroy, Zoltan Simandi, Zsuzsanna Kolostyak, Quang-Minh Doan-Xuan, Szilard Poliska, Attila Horvath, Gergely Nagy, Zsolt Bacso, Laszlo Nagy
Dátum:2014
ISSN:1873-5061
Tárgyszavak:Orvostudományok Klinikai orvostudományok idegen nyelvű folyóiratközlemény külföldi lapban
Megjelenés:Stem Cell Research. - 13 : 1 (2014), p. 88-97. -
További szerzők:Simándi Zoltán (1984-) (Ph.D. hallgató, molekuláris biológus) Kolostyák Zsuzsanna Doan-Xuan, Quang-Minh (1986-) (biofizikus) Póliska Szilárd (1978-) (biológus) Horváth Attila (1988-) (programtervező informatikus) Nagy Gergely (1986-) (molekuláris biológus) Bacsó Zsolt (1963-) (biofizikus) Nagy László (1966-) (molekuláris sejtbiológus, biokémikus)
Internet cím:Szerző által megadott URL
DOI
Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
Borító:

2.

001-es BibID:BIBFORM072110
035-os BibID:(WoS)000422751600012 (Scopus)85044680054 (PubMed)29343442
Első szerző:Czimmerer Zsolt (molekuláris biológus)
Cím:The Transcription Factor STAT6 Mediates Direct Repression of Inflammatory Enhancers and Limits Activation of Alternatively Polarized Macrophages / Czimmerer Zsolt, Daniel Bence, Horvath Attila, Rückerl Dominik, Nagy Gergely, Kiss Mate, Peloquin Matthew, Budai Marietta M., Cuaranta-Monroy Ixchelt, Simandi Zoltan, Steiner Laszlo, Nagy Bela, Poliska Szilard, Banko Csaba, Bacso Zsolt, Schulman Ira G., Sauer Sascha, Deleuze Jean-Francois, Allen Judith E., Benko Szilvia, Nagy Laszlo
Dátum:2018
ISSN:1074-7613
Tárgyszavak:Orvostudományok Elméleti orvostudományok idegen nyelvű folyóiratközlemény külföldi lapban
folyóiratcikk
Megjelenés:Immunity. - 48 : 1 (2018), p. 75-90. -
További szerzők:Dániel Bence (1987-) (molekuláris biológus) Horváth Attila (1988-) (programtervező informatikus) Rückerl, Dominik Nagy Gergely (1986-) (molekuláris biológus) Kiss Máté Peloquin, Matthew Budai Marietta Margit (1985-) (molekuláris biológus) Cuaranta-Monroy, Ixchelt (1979-) (Ph.D. hallgató) Simándi Zoltán (1984-) (Ph.D. hallgató, molekuláris biológus) Steiner László Nagy Béla Jr. (1980-) (labordiagnosztikai szakorvos) Póliska Szilárd (1978-) (biológus) Bankó Csaba (1989-) (molekuláris biológus) Bacsó Zsolt (1963-) (biofizikus) Schulman, Ira G. Sauer, Sascha Deleuze, Jean-Francois Allen, Judith E. Benkő Szilvia (1973-) (molekuláris biológus) Nagy László (1966-) (molekuláris sejtbiológus, biokémikus)
Pályázati támogatás:K100196
OTKA
K111941
OTKA
K116855
OTKA
K109429
OTKA
TÁMOP 4.2.4. A/2-11-1-2012-0001
TÁMOP
Internet cím:DOI
Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
Borító:

3.

001-es BibID:BIBFORM072111
035-os BibID:(WoS)000423645700002 (Scopus)85034832211
Első szerző:Czimmerer Zsolt (molekuláris biológus)
Cím:Dynamic transcriptional control of macrophage miRNA signature via inflammation responsive enhancers revealed using a combination of next generation sequencing-based approaches / Czimmerer Zsolt, Horvath Attila, Daniel Bence, Nagy Gergely, Cuaranta-Monroy Ixchelt, Kiss Mate, Kolostyak Zsuzsanna, Poliska Szilard, Steiner Laszlo, Giannakis Nikolas, Varga Tamas, Nagy Laszlo
Dátum:2018
ISSN:1874-9399
Tárgyszavak:Orvostudományok Elméleti orvostudományok idegen nyelvű folyóiratközlemény külföldi lapban
folyóiratcikk
Megjelenés:Biochimica et Biophysica Acta (BBA). Gene Regulatory Mechanisms. - 1861 : 1 (2018), p. 14-28. -
További szerzők:Horváth Attila (1988-) (programtervező informatikus) Dániel Bence (1987-) (molekuláris biológus) Nagy Gergely (1986-) (molekuláris biológus) Cuaranta-Monroy, Ixchelt (1979-) (Ph.D. hallgató) Kiss Máté Kolostyák Zsuzsanna Póliska Szilárd (1978-) (biológus) Steiner László Giannakis, Nikolas Varga Tamás (1971-) (biológus) Nagy László (1966-) (molekuláris sejtbiológus, biokémikus)
Internet cím:Szerző által megadott URL
DOI
Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
Borító:

4.

001-es BibID:BIBFORM076312
035-os BibID:(WoS)000433056900015 (Scopus)85054167767
Első szerző:Dániel Bence (molekuláris biológus)
Cím:The IL-4/STAT6/PPAR[gamma] signaling axis is driving the expansion of the RXR heterodimer cistrome, providing complex ligand responsiveness in macrophages / Daniel Bence, Nagy Gergely, Horvath Attila, Czimmerer Zsolt, Cuaranta-Monroy Ixchelt, Poliska Szilard, Hays Tristan T., Sauer Sascha, Francois-Deleuze Jean, Nagy Laszlo
Dátum:2018
ISSN:0305-1048 1362-4962
Tárgyszavak:Orvostudományok Elméleti orvostudományok idegen nyelvű folyóiratközlemény külföldi lapban
folyóiratcikk
Megjelenés:Nucleic Acids Research. - 46 : 9 (2018), p. 4425-4439. -
További szerzők:Nagy Gergely (1986-) (molekuláris biológus) Horváth Attila (1988-) (programtervező informatikus) Czimmerer Zsolt (1981-) (molekuláris biológus) Cuaranta-Monroy, Ixchelt (1979-) (Ph.D. hallgató) Póliska Szilárd (1978-) (biológus) Hays, Tristan T. Sauer, Sascha Francois-Deleuze, Jean Nagy László (1966-) (molekuláris sejtbiológus, biokémikus)
Pályázati támogatás:PD124843
OTKA
K124298
OTKA
K126885
OTKA
K116855
OTKA
Internet cím:Szerző által megadott URL
DOI
Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
Borító:

5.

001-es BibID:BIBFORM075746
035-os BibID:(WoS)000447386700009 (Scopus)85054182103
Első szerző:Dániel Bence (molekuláris biológus)
Cím:The Nuclear Receptor PPAR[gamma] Controls Progressive Macrophage Polarization as a Ligand-Insensitive Epigenomic Ratchet of Transcriptional Memory / Daniel Bence, Nagy Gergely, Czimmerer Zsolt, Horvath Attila, Hammers David W., Cuaranta-Monroy Ixchelt, Poliska Szilard, Tzerpos Petros, Kolostyak Zsuzsanna, Hays Tristan T., Patsalos Andreas, Houtman René, Sauer Sascha, Francois-Deleuze Jean, Rastinejad Fraydoon, Balint Balint L., Sweeney H. Lee, Nagy Laszlo
Dátum:2018
ISSN:1074-7613
Tárgyszavak:idegen nyelvű folyóiratközlemény külföldi lapban
folyóiratcikk
Megjelenés:Immunity. - 49 : 4 (2018), p. 615-626. -
További szerzők:Nagy Gergely (1986-) (molekuláris biológus) Czimmerer Zsolt (1981-) (molekuláris biológus) Horváth Attila (1988-) (programtervező informatikus) Hammers, David W. Cuaranta-Monroy, Ixchelt (1979-) (Ph.D. hallgató) Póliska Szilárd (1978-) (biológus) Tzerpos, Petros (1982-) (molekuláris biológus) Kolostyák Zsuzsanna Hays, Tristan T. Patsalos, Andreas Houtman, René Sauer, Sascha Francois-Deleuze, Jean Rastinejad, Fraydoon Bálint Bálint László (1971-) (kutató orvos) Sweeney, H. Lee Nagy László (1966-) (molekuláris sejtbiológus, biokémikus)
Pályázati támogatás:K124298
OTKA
K126885
OTKA
K116855
OTKA
PD124843
OTKA
GINOP-2.3.2-15-2016-00006
GINOP
Internet cím:DOI
Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
Borító:

6.

001-es BibID:BIBFORM077627
035-os BibID:(WoS)000467964800013 (Scopus)85064477457
Első szerző:Horváth Attila (programtervező informatikus)
Cím:Labelled regulatory elements are pervasive features of the macrophage genome and are dynamically utilized by classical and alternative polarization signals / Attila Horvath, Bence Daniel, Lajos Szeles, Ixchelt Cuaranta-Monroy, Zsolt Czimmerer, Lilla Ozgyin, Laszlo Steiner, Mate Kiss, Zoltan Simandi, Szilard Poliska, Nikolas Giannakis, Emanuele Raineri, Ivo G. Gut, Benedek Nagy, Laszlo Nagy
Dátum:2019
ISSN:0305-1048 1362-4962
Megjegyzések:The concept of tissue-specific gene expression posits that lineage-determining transcription factors (LDTFs) determine the open chromatin profile of a cell via collaborative binding, providing molecular beacons to signal-dependent transcription factors (SDTFs). However, the guiding principles of LDTF binding, chromatin accessibility and enhancer activity have not yet been systematically evaluated. We sought to study these features of the macrophage genome by the combination of experimental (ChIP-seq, ATAC-seq and GRO-seq) and computational approaches. We show that Random Forest and Support Vector Regression machine learning methods can accurately predict chromatin accessibility using the binding patterns of the LDTF PU.1 and four other key TFs of macrophages (IRF8, JUNB, CEBPA and RUNX1). Any of these TFs alone were not sufficient to predict open chromatin, indicating that TF binding is widespread at closed or weakly opened chromatin regions. Analysis of the PU.1 cistrome revealed that two-thirds of PU.1 binding occurs at low accessible chromatin. We termed these sites labelled regulatory elements (LREs), which may represent a dormant state of a future enhancer and contribute to macrophage cellular plasticity. Collectively, our work demonstrates the existence of LREs occupied by various key TFs, regulating specific gene expression programs triggered by divergent macrophage polarizing stimuli.
Tárgyszavak:Orvostudományok Elméleti orvostudományok idegen nyelvű folyóiratközlemény külföldi lapban
folyóiratcikk
Megjelenés:Nucleic Acids Research. - 47 : 6 (2019), p. 2778-2792. -
További szerzők:Dániel Bence (1987-) (molekuláris biológus) Széles Lajos (1971-) (molekuláris biológus) Cuaranta-Monroy, Ixchelt (1979-) (Ph.D. hallgató) Czimmerer Zsolt (1981-) (molekuláris biológus) Ozgyin Lilla (1989-) (molekuláris biológus) Steiner László Kiss Máté Simándi Zoltán (1984-) (Ph.D. hallgató, molekuláris biológus) Póliska Szilárd (1978-) (biológus) Giannakis, Nikolas Raineri, Emanuele Gut, Ivo G. Nagy Benedek (1973-) (informatikus, matematikus) Nagy László (1966-) (molekuláris sejtbiológus, biokémikus)
Pályázati támogatás:NKFIH K116855
NKFIH
NKFIH K124298
NKFIH
NKFIH KH126885
NKFIH
GINOP-2.3.2-15-2016-00006
GINOP
GINOP-2.1.7-15-2016-01487
GINOP
Internet cím:Szerző által megadott URL
DOI
Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
Borító:

7.

001-es BibID:BIBFORM075086
Első szerző:Simándi Zoltán (Ph.D. hallgató, molekuláris biológus)
Cím:RXR heterodimers orchestrate transcriptional control of neurogenesis and cell fate specification / Simandi Zoltan, Horvath Attila, Cuaranta-Monroy Ixchelt, Sauer Sascha, Deleuze Jean-Francois, Nagy Laszlo
Dátum:2018
ISSN:0303-7207
Tárgyszavak:Orvostudományok Elméleti orvostudományok idegen nyelvű folyóiratközlemény külföldi lapban
Megjelenés:Molecular And Cellular Endocrinology. - 471 (2018), p. 51-62. -
További szerzők:Horváth Attila (1988-) (programtervező informatikus) Cuaranta-Monroy, Ixchelt (1979-) (Ph.D. hallgató) Sauer, Sascha Deleuze, Jean-Francois Nagy László (1966-) (molekuláris sejtbiológus, biokémikus)
Pályázati támogatás:OTKA-K100196
OTKA
OTKA-111941
OTKA
OTKA-K116855
OTKA
TAMOP 422_2012_0023 VÉD-ELEM
TÁMOP
Internet cím:Szerző által megadott URL
DOI
Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
Borító:

8.

001-es BibID:BIBFORM069702
Első szerző:Simándi Zoltán (Ph.D. hallgató, molekuláris biológus)
Cím:OCT4 Acts as an Integrator of Pluripotency and Signal-Induced Differentiation / Zoltan Simandi, Attila Horvath, Lyndsey C. Wright, Ixchelt Cuaranta-Monroy, Isabella De Luca, Katalin Karolyi, Sascha Sauer, Jean-Francois Deleuze, Lorraine J. Gudas, Shaun M. Cowley, Laszlo Nagy
Dátum:2016
ISSN:1097-2765
Tárgyszavak:Orvostudományok Elméleti orvostudományok idegen nyelvű folyóiratközlemény külföldi lapban
Megjelenés:Molecular Cell. - 63 : 4 (2016), p. 647-661. -
További szerzők:Horváth Attila (1988-) (programtervező informatikus) Wright, Lyndsey C. Cuaranta-Monroy, Ixchelt (1979-) (Ph.D. hallgató) De Luca, Isabella Károlyi Katalin Sauer, Sascha Deleuze, Jean-Francois Gudas, Lorraine J. Cowley, Shaun M. Nagy László (1966-) (molekuláris sejtbiológus, biokémikus)
Pályázati támogatás:K100196
OTKA
OTKA-111941
OTKA
OTKA-116855
OTKA
KTIA_13_NAP-A-I/9
Egyéb
Internet cím:Szerző által megadott URL
DOI
Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
Borító:
Rekordok letöltése1