Találati lista | Tudóstér

001-es BibID:	BIBFORM089444
035-os BibID:	(cikkazonosító)190 (WOS)000595728400003 (Scopus)85096570971
Első szerző:	Mahdi, Mohamed (orvos, tudományos segédmunkatárs)
Cím:	Analysis of the efficacy of HIV protease inhibitors against SARS-CoV-2·s main protease / Mahdi Mohamed, Mótyán János András, Szojka Zsófia Ilona, Golda Mária, Miczi Márió, Tőzsér József
Dátum:	2020
ISSN:	1743-422X
Megjegyzések:	Background: The pandemic caused by severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 (SARS-CoV-2) has resulted in millions of infections worldwide. While the search for an effective antiviral is still ongoing, experimental therapies based on repurposing of available antivirals is being attempted, of which HIV protease inhibitors (PIs) have gained considerable interest. Inhibition profiling of the PIs directly against the viral protease has never been attempted in vitro, and while few studies reported an efficacy of lopinavir and ritonavir in SARS-CoV-2 context, the mechanism of action of the drugs remains to be validated. Methods We carried out an in-depth analysis of the efficacy of HIV PIs against the main protease of SARS-CoV-2 (Mpro) in cell culture and in vitro enzymatic assays, using a methodology that enabled us to focus solely on any potential inhibitory effects of the inhibitors against the viral protease. For cell culture experiments a dark-to-bright GFP reporter substrate system was designed. Results Lopinavir, ritonavir, darunavir, saquinavir, and atazanavir were able to inhibit the viral protease in cell culture, albeit in concentrations much higher than their achievable plasma levels, given their current drug formulations. While inhibition by lopinavir was attributed to its cytotoxicity, ritonavir was the most effective of the panel, with IC50 of 13.7 ?M. None of the inhibitors showed significant inhibition of SARS-CoV-2 Mpro in our in vitro enzymatic assays up to 100 ?M concentration. Conclusion Targeting of SARS-CoV-2 Mpro by some of the HIV PIs might be of limited clinical potential, given the high concentration of the drugs required to achieve significant inhibition. Therefore, given their weak inhibition of the viral protease, any potential beneficial effect of the PIs in COVID-19 context might perhaps be attributed to acting on other molecular target(s), rather than SARS-CoV-2 Mpro.
Tárgyszavak:	Orvostudományok Elméleti orvostudományok idegen nyelvű folyóiratközlemény külföldi lapban folyóiratcikk SARS-CoV-2 Inhibition profling In vitro assay HIV protease inhibitors Protease
Megjelenés:	Virology Journal. - 17 : 1 (2020), p. 1-8. -
További szerzők:	Mótyán János András (1981-) (biokémikus, molekuláris biológus) Szojka Zsófia (1991-) (molekuláris biológus) Golda Mária (1986-) (molekuláris biológus) Miczi Márió Tőzsér József (1959-) (molekuláris biológus, biokémikus, vegyész)
Pályázati támogatás:	NKFIH-1150?6/2019 Egyéb NKFI 125238 Egyéb
Internet cím:	Szerző által megadott URL DOI Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
Borító:
Saját polcon:

001-es BibID:	BIBFORM108752
035-os BibID:	(cikkazonosító)3236 (Scopus)85148962397 (WoS)000938549700001
Első szerző:	Miltner Noémi (molekuláris biológus)
Cím:	Identification of SARS-CoV-2 Main Protease (Mpro) Cleavage Sites Using Two-Dimensional Electrophoresis and In Silico Cleavage Site Prediction / Noémi Miltner, Gergő Kalló, Éva Csősz, Márió Miczi, Tibor Nagy, Mohamed Mahdi, János András Mótyán, József Tőzsér
Dátum:	2023
ISSN:	1422-0067
Megjegyzések:	The main protease (Mpro) of severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 (SARS-CoV-2) plays a crucial role in its life cycle. The Mpro-mediated limited proteolysis of the viral polyproteins is necessary for the replication of the virus, and cleavage of the host proteins of the infected cells may also contribute to viral pathogenesis, such as evading the immune responses or triggering cell toxicity. Therefore, the identification of host substrates of the viral protease is of special interest. To identify cleavage sites in cellular substrates of SARS-CoV-2 Mpro, we determined changes in the HEK293T cellular proteome upon expression of the Mpro using two-dimensional gel electrophoresis. The candidate cellular substrates of Mpro were identified by mass spectrometry, and then potential cleavage sites were predicted in silico using NetCorona 1.0 and 3CLP web servers. The existence of the predicted cleavage sites was investigated by in vitro cleavage reactions using recombinant protein substrates containing the candidate target sequences, followed by the determination of cleavage positions using mass spectrometry. Unknown and previously described SARS-CoV-2 Mpro cleavage sites and cellular substrates were also identified. Identification of target sequences is important to understand the specificity of the enzyme, as well as aiding the improvement and development of computational methods for cleavage site prediction.
Tárgyszavak:	Orvostudományok Elméleti orvostudományok idegen nyelvű folyóiratközlemény külföldi lapban folyóiratcikk coronavirus SARS-CoV-2 main protease Mpro COVID-19 two-dimensional gel electrophoresis cleavage site identification cleavage site prediction protease host protein cleavage specificity
Megjelenés:	International Journal Of Molecular Sciences. - 24 : 4 (2023), p. 1-19. -
További szerzők:	Kalló Gergő (1989-) (molekuláris biológus) Csősz Éva (1977-) (biokémikus, molekuláris biológus) Miczi Márió Nagy Tibor (1988-) (vegyész) Mahdi, Mohamed (1979-) (orvos, tudományos segédmunkatárs) Mótyán János András (1981-) (biokémikus, molekuláris biológus) Tőzsér József (1959-) (molekuláris biológus, biokémikus, vegyész)
Pályázati támogatás:	GINOP-2.3.3-15-2016-00020 GINOP GINOP-2.3.3-15-2016-00021 GINOP
Internet cím:	Szerző által megadott URL DOI Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
Borító:
Saját polcon:

001-es BibID:	BIBFORM087577
035-os BibID:	(cikkazonosító)5907 (scopus)85089663597 (wos)000565075500001
Első szerző:	Szojka Zsófia (molekuláris biológus)
Cím:	Y44A Mutation in the Acidic Domain of HIV-2 Tat Impairs Viral Reverse Transcription and LTR-Transactivation / Szojka Zsófia, Mótyán János András, Miczi Márió, Mahdi Mohamed, Tőzsér József
Dátum:	2020
ISSN:	1661-6596 1422-0067
Tárgyszavak:	Orvostudományok Elméleti orvostudományok idegen nyelvű folyóiratközlemény külföldi lapban folyóiratcikk human immunodeficiency virus HIV-2 Tat stability analysis reverse transcriptase activity transactivator protein mutation design
Megjelenés:	International Journal Of Molecular Sciences. - 21 : 16 (2020), p. 1-17. -
További szerzők:	Mótyán János András (1981-) (biokémikus, molekuláris biológus) Miczi Márió Mahdi, Mohamed (1979-) (orvos, tudományos segédmunkatárs) Tőzsér József (1959-) (molekuláris biológus, biokémikus, vegyész)
Internet cím:	Szerző által megadott URL DOI Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
Borító:
Saját polcon: