CCL

Összesen 8 találat.
#/oldal:
Részletezés:
Rendezés:

1.

001-es BibID:BIBFORM106835
035-os BibID:(Scopus)85138605879 (WoS)000856676100001
Első szerző:Filep Csenge Boróka (biomérnök)
Cím:Electromigration Dispersion in Sodium Dodecyl Sulfate Capillary Gel Electrophoresis of Proteins / Filep Csenge, Guttman András
Dátum:2022
ISSN:0003-2700
Megjegyzések:The electromigration dispersion of the light- and heavy-chain subunit peaks of the therapeutic monoclonal antibody omalizumab was investigated in sodium dodecyl sulfate capillary gel electrophoresis (SDS?CGE) using borate cross-linked dextran sieving matrices. Increasing boric acid content (340?640 mM) caused electromigration dispersion shifts for both low (2%)- and high (10%)-dextran-concentration gels in all gel?buffer compositions. In case of the heavy-chain fragment, elevated borate concentrations resulted in decreasing tailing and increasing fronting with the use of higher- and lower-dextranconcentration gels, respectively. The light-chain fragment, on the other hand, exhibited increased fronting with increasing borate concentration for both dextran concentrations examined in this study. Increase of the glycerol ingredient level in the gel?buffer system caused the same effect as the increasing borate concentration in both dextran concentrations. The detected electromigration dispersion was considered as the result of the formation of monomeric and dimeric glycerol-borate complexes as co-ionic constituents, migrating slower than that of the unconjugated tetrahydroxyborate. In addition, complexation of the tetrahydroxyborate anion with the glucose building blocks of the dextran polymer decreased its mobility to practically zero, contributing to further decrease in the resultant effective mobility of the co-ionic species. We suggest that the observed fronting and/or tailing peak shapes of the monoclonal antibody fragments in SDS?CGE at increasing boric acid concentrations can be considered as the result of multiple effects including changes in pH, sieving matrix pore size, viscosity, and the mobility variation of the co-ionic borate adducts with the gel?buffer ingredients. While electromigration dispersion-mediated band broadening, in general, can be minimized via matching the effective mobility of the co-ionic species to the analyte molecules of interest, in case of borate cross-linked dextran gels, optimization of the boric acid concentration required special consideration of its gel cross-linking function. For the light- and heavy-chain fragments of the IgG analyte, best peak shapes were attained with the use of 10% dextran/340 mM boric acid and 10% dextran/640 mM boric acid-containing gel?buffer systems, respectively. Based on this observation, here we introduce the concept of borate-gradient-mediated transient mobility matching in SDS?CGE of proteins. This novel approach resulted in close to optimal peak shapes for the distantly migrating IgG subunits within a single run, as well as unraveled the long-sought possible solution to perform capillary pore-size-gradient gel electrophoresis.
Tárgyszavak:Orvostudományok Elméleti orvostudományok idegen nyelvű folyóiratközlemény külföldi lapban
folyóiratcikk
Megjelenés:Analytical Chemistry. - 94 : 38 (2022), p. 13092-13099. -
További szerzők:Guttman András (1954-) (vegyészmérnök)
Pályázati támogatás:EFOP-3.6.3-VEKOP-16-2017-00009
EFOP
Internet cím:Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
DOI
Borító:

2.

001-es BibID:BIBFORM096236
Első szerző:Filep Csenge Boróka (biomérnök)
Cím:Capillary sodium dodecyl sulfate gel electrophoresis of proteins : introducing the three dimensional Ferguson method / Csenge Filep, András Guttman
Dátum:2021
ISSN:0003-2670
Megjegyzések:One of the most extensively utilized rapid characterization, release and stability testing methods of therapeutic proteins in the biopharmaceutical field today is capillary SDS gel electrophoresis using borate cross-linked high molecular weight dextran. In spite of its widespread use, however, the gel composition dependent separation characteristics of this very unique sieving matrix has not been investigated yet. Introduction of three dimensional (3D) Ferguson plots, based on simultaneous variation of the dextran (D) and borate (B) concentrations generating 16 different D/B ratio gels, allowed better understanding of the electromigration process of the SDS-protein complexes. As a result of this comprehensive study, non-linear 3D logarithmic mobility vs dextran and borate concentration surfaces were obtained. Both, the molecular weight protein standards and the new modality fusion protein etanercept resulted in concave 3D Ferguson plots. The interplay between the electroosmotic flow and the viscosity of the matrices played a key role in the resulting migration time and resolution. Selectivity values were defined and evaluated in 3D graph formats for the regular and de-N-glycosylated subunits of etanercept, as well as for the latter with the 10 kDa internal standard to understand both the dextran-borate complexation and sized based selectivities. KR plots of the retardation coefficients as the function of the logarithmic molecular weights were used to more precisely assess the Mw of the samples and to obtain information about the molecular characteristics of the electromigrating SDS-protein complexes.
Tárgyszavak:Orvostudományok Elméleti orvostudományok idegen nyelvű folyóiratközlemény külföldi lapban
folyóiratcikk
Megjelenés:Analytica Chimica Acta. - 1183 (2021), p. 1-9. -
További szerzők:Guttman András (1954-) (vegyészmérnök)
Pályázati támogatás:BIONANO
Egyéb
ÚNKP-20-3-II-DE-294
Egyéb
TKP2020-IKA-07
Egyéb
NKFIH
Egyéb
Internet cím:Szerző által megadott URL
DOI
Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
Borító:

3.

001-es BibID:BIBFORM095052
035-os BibID:(cikkazonosító)338492
Első szerző:Filep Csenge Boróka (biomérnök)
Cím:Multilevel capillary gel electrophoresis characterization of new antibody modalities / Csenge Filep, Marton Szigeti, Robert Farsang, Markus Haberger, Dietmar Reusch, Andras Guttman
Dátum:2021
ISSN:0003-2670
Tárgyszavak:Orvostudományok Klinikai orvostudományok idegen nyelvű folyóiratközlemény külföldi lapban
folyóiratcikk
New modalities
Monoclonal antibody
SDS-CGE
N-Glycan analysis
Trypsin digestion
Megjelenés:Analytica Chimica Acta. - 1166 (2021), p. 1-9. -
További szerzők:Szigeti Márton (1986-) (környezetmérnök) Farsang Róbert Haberger, Markus Reusch, Dietmar Guttman András (1954-) (vegyészmérnök)
Pályázati támogatás:2.3.2- 15-2016-00017
GINOP
2018-2.1.17-TÉT-KR-2018-00010
Egyéb
TKP2020-IKA-07
Egyéb
UNKP-20-5
Egyéb
Internet cím:Szerző által megadott URL
DOI
Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
Borító:

4.

001-es BibID:BIBFORM093742
035-os BibID:(WoS)000623041000027 (Scopus)85100632127
Első szerző:Filep Csenge Boróka (biomérnök)
Cím:Effect of the Monomer Cross-Linker Ratio on the Separation Selectivity of Monoclonal Antibody Subunits in Sodium Dodecyl Sulfate Capillary Gel Electrophoresis / Csenge Filep, András Guttman
Dátum:2021
ISSN:0003-2700
Tárgyszavak:Orvostudományok Elméleti orvostudományok idegen nyelvű folyóiratközlemény külföldi lapban
folyóiratcikk
Megjelenés:Analytical Chemistry. - 93 : 7 (2021), p. 3535-3541. -
További szerzők:Guttman András (1954-) (vegyészmérnök)
Pályázati támogatás:2.3.2-15-2016-00017
GINOP
NKFIH
Egyéb
ÚNKP-20-3-II-DE-294
Egyéb
2020-4.1.1-TKP2020
Egyéb
Internet cím:Szerző által megadott URL
DOI
Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
Borító:

5.

001-es BibID:BIBFORM083893
035-os BibID:(WoS)000518234700070 (Scopus)85080047360
Első szerző:Filep Csenge Boróka (biomérnök)
Cím:The Effect of Temperature in Sodium Dodecyl Sulfate Capillary Gel Electrophoresis of Protein Therapeutics / Filep Csenge, Guttman András
Dátum:2020
ISSN:0003-2700
Tárgyszavak:Orvostudományok Elméleti orvostudományok idegen nyelvű folyóiratközlemény külföldi lapban
folyóiratcikk
Megjelenés:Analytical Chemistry. - 92 : 5 (2020), p. 4023-4028. -
További szerzők:Guttman András (1954-) (vegyészmérnök)
Pályázati támogatás:2.3.2-15-2016-00017
GINOP
NKFIH NN 127062
Egyéb
Internet cím:Szerző által megadott URL
DOI
Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
Borító:

6.

001-es BibID:BIBFORM082495
035-os BibID:(cikkazonosító)112892
Első szerző:Filep Csenge Boróka (biomérnök)
Cím:N-glycosylation analysis of biopharmaceuticals by multicapillary gel electrophoresis : generation and application of a new glucose unit database / Csenge Filep, Beata Borza, Gabor Jarvas, Andras Guttman
Dátum:2020
ISSN:0731-7085
Tárgyszavak:Orvostudományok Elméleti orvostudományok idegen nyelvű folyóiratközlemény külföldi lapban
folyóiratcikk
Megjelenés:Journal of Pharmaceutical and Biomedical Analysis. - 178 (2020), p. 1-5. -
További szerzők:Borza Beáta (1990-) (biomérnök) Járvás Gábor (1982-) (vegyészmérnök) Guttman András (1954-) (vegyészmérnök)
Pályázati támogatás:NN127062
NKFIH
2018-2.1.17-TÉT-KR-2018-00010
Egyéb
GINOP-2.3.2-15-2016-00017
GINOP
EFOP-3.6.3-VEKOP16-2017-00009
EFOP
ÚNKP-19-3-I-DE-356
Egyéb
Internet cím:Szerző által megadott URL
DOI
Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
Borító:

7.

001-es BibID:BIBFORM096076
035-os BibID:(WoS)000672115800032 (Scopus)85110405663
Első szerző:Guttman András (vegyészmérnök)
Cím:Fundamentals of Capillary Electrophoretic Migration and Separation of SDS Proteins in Borate Cross-Linked Dextran Gels / András Guttman, Csenge Filep, Barry L. Karger
Dátum:2021
ISSN:0003-2700
Megjegyzések:Abstract Abstract Image Recent progress in the development and production of new, innovative protein therapeutics require rapid and adjustable high-resolution bioseparation techniques. Sodium dodecyl sulfate capillary gel electrophoresis (SDS-CGE) using a borate (B) cross-linked dextran (D) separation matrix is widely employed today for rapid consistency analysis of therapeutic proteins in manufacturing and release testing. Transient borate cross-linking of the semirigid dextran polymer chains leads to a high-resolution separation gel for SDS?protein complexes. To understand the migration and separation basis of the D/B gel, the present work explores various gel formulations of dextran monomer (2, 5, 7.5, and 10%) and borate cross-linker (2 and 4%) concentrations. Ferguson plots were analyzed for a mixture of protein standards with molecular weights ranging from 20 to 225 kDa, and the resulting nonlinear concave curves pointed to nonclassical sieving behavior. While the 2% D/4% B gel resulted in the fastest analysis time, the 10% D/2% B gel was found to produce the greatest separation window, even higher than with the 10% D/4% B gel, due to a significant increase in the electroosmotic flow of the former composition in the direction opposite to SDS?protein complex migration. The study then focused on SDS-CGE separation of a therapeutic monoclonal antibody and its subunits. A combination of molecular weight and shape selectivity as well as, to a lesser extent, surface charge density differences (due to glycosylation on the heavy chain) influenced migration. Greater molecular weight selectivity occurred for the higher monomer concentration gels, while improved glycoselectivity was obtained using a more dilute gel, even as low as 2% D/2% B. This latter gel took advantage of the dextran?borate?glycoprotein complexation. The study revealed that by modulating the dextran (monomer) and borate (cross-linker) concentration ratios of the sieving matrix, one can optimize the separation for specific biopharmaceutical modalities with excellent column-to-column, run-to-run, and gel-to-gel migration time reproducibilities (<0.96% relative standard deviation (RSD)). The widely used 10% dextran/4% borate gel represents a good screening option, which can then be followed by a modified composition, optimized for a specific separation as necessary.
Tárgyszavak:Orvostudományok Elméleti orvostudományok idegen nyelvű folyóiratközlemény külföldi lapban
folyóiratcikk
Megjelenés:Analytical Chemistry. - 93 : 26 (2021), p. 9267-9276. -
További szerzők:Filep Csenge Boróka (1993-) (biomérnök) Karger, Barry
Pályázati támogatás:2.3.2- 15-2016-00017
GINOP
NKFIH (NN 127062)
Egyéb
ÚNKP-20-3-II-DE-294
Egyéb
2020-4.1.1-TKP2020
Egyéb
Internet cím:DOI
Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
Borító:

8.

001-es BibID:BIBFORM099310
035-os BibID:(cikkazonosító)114483
Első szerző:Szabó Miklós (tüdőgyógyász)
Cím:N-glycosylation structure - function characterization of omalizumab, an anti-asthma biotherapeutic product / Miklos Szabo, Csenge Filep, Mate Nagy, Daniel Sarkozy, Marton Szigeti, Edit Sperling, Eszter Csanky, Andras Guttman
Dátum:2022
ISSN:0731-7085
Megjegyzések:Omalizumab, a glycoprotein based biotherapeutics, is one of the most frequently used targeted antibody biopharmaceutical to reduce asthma exacerbations, improve lung function and reduce oral corticosteroid use. The effector function and clearance time of such glycoprotein drugs is affected by their N-glycosylation, that defines the required administration frequency to improve the quality of life in appropriately selected patients. Therefore, the glycosylation of biologics is an important critical quality attribute (CQA). The profile of asparagine linked carbohydrates is greatly dependent on the manufacturing process. Even a small deviation may have a major effect on the structure and therefore the function of the biotherapeutic product. For this reason, comprehensive N-glycosylation analysis is of high importance during production and release. Capillary electrophoresis (CE) is one of the frequently used tools to characterize protein therapeutics and utilized by the biopharmaceutical industry for protein and glycan level analysis, which are key parts both for drug development and quality control. To reveal important structure ? function relationships, characterization of omalizumab is presented using capillary SDS gel electrophoresis with UV detection at the protein level and capillary gel electrophoresis with laser induced fluorescent detection at the N-linked carbohydrate level. This latter technique was also used for oligosaccharide sequencing for glycan structure validation. The results suggested no ADCC function ? structure relationship due to the mostly core fucosylated biantennary glycans found. However, the presence of the high mannose structures probably affects the clearance rate of the drug.
Tárgyszavak:Orvostudományok Elméleti orvostudományok idegen nyelvű folyóiratközlemény külföldi lapban
folyóiratcikk
mAb karakterizálás
kapilláris gélelektroforézis
Megjelenés:Journal of Pharmaceutical and Biomedical Analysis. - 209 (2022), p. 1-5. -
További szerzők:Filep Csenge Boróka (1993-) (biomérnök) Nagy Máté Sárközy Dániel (1993-) (PhD hallgató) Szigeti Márton (1986-) (környezetmérnök) Sperling Edit Csánky Eszter (1959-) (tüdőgyógyász, klinikai immunológus, allergológus) Guttman András (1954-) (vegyészmérnök)
Pályázati támogatás:BIONANO_GINOP-2.3.2-15-2016-00017
GINOP
NN 127062
NKFIH
TKP2020-IKA-07
Egyéb
2020-4.1.1-TKP2020
Egyéb
Internet cím:Szerző által megadott URL
DOI
Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
Borító:
Rekordok letöltése1