CCL

Összesen 6 találat.
#/oldal:
Részletezés:
Rendezés:

1.

001-es BibID:BIBFORM102528
035-os BibID:(cikkazonosító)1472 (WoS)000831948100001 (Scopus)85133187375
Első szerző:Kalló Gergő (molekuláris biológus)
Cím:Chemical Barrier Proteins in Human Body Fluids / Kalló Gergő, Kumar Ajneesh, Tőzsér József, Csősz Éva
Dátum:2022
ISSN:2227-9059
Megjegyzések:Chemical barriers are composed of those sites of the human body where potential pathogens can contact the host cells. A chemical barrier is made up by different proteins that are part of the antimicrobial and immunomodulatory protein/peptide (AMP) family. Proteins of the AMP family exert antibacterial, antiviral, and/or antifungal activity and can modulate the immune system. Besides these proteins, a wide range of proteases and protease inhibitors can also be found in the chemical barriers maintaining a proteolytic balance in the host and/or the pathogens. In this review, we aimed to identify the chemical barrier components in nine human body fluids. The interaction networks of the chemical barrier proteins in each examined body fluid were generated as well.
Tárgyszavak:Orvostudományok Elméleti orvostudományok idegen nyelvű folyóiratközlemény külföldi lapban
folyóiratcikk
body fluid
AMP
Interaction network
Chemical barrier
Megjelenés:Biomedicines. - 10 : 7 (2022), p. 1-26. -
További szerzők:Kumar, Ajneesh (1994-) (bioinformatikus) Tőzsér József (1959-) (molekuláris biológus, biokémikus, vegyész) Csősz Éva (1977-) (biokémikus, molekuláris biológus)
Pályázati támogatás:GINOP-2.3.3-15-2016-00020
GINOP
NKFIH FK134605
Egyéb
Internet cím:Szerző által megadott URL
DOI
Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
Borító:

2.

001-es BibID:BIBFORM092458
035-os BibID:(cikkazonosító)633050
Első szerző:Kumar, Ajneesh (bioinformatikus)
Cím:Construction of unified human antimicrobial and immunomodulatory peptide database and examination of antimicrobial and immunomodulatory peptides in Alzheimer's disease using network analysis of proteomics datasets / Ajneesh Kumar, Vo Minh Doan, Kunkli Balázs, Csősz Éva
Dátum:2021
ISSN:1664-8021
Megjegyzések:The reanalysis of genomics and proteomics datasets by bioinformatics approaches is an appealing way to examine large amount of reliable data. This can be especially true in cases such as Alzheimer's disease, where the access to biological samples, along with well-defined patient information can be challenging. Considering the inflammatory part of Alzheimer's disease, our aim was to examine the presence of antimicrobial and immunomodulatory peptides in human proteomic datasets deposited in the publicly available proteomics database ProteomeXchange (http://www.proteomexchange.org/). First a unified, comprehensive human antimicrobial and immunomodulatory peptide database, containing all known human antimicrobial and immunomodulatory peptides was constructed and used along with the datasets containing high quality proteomics data originating from the examination of Alzheimer's disease and control groups. A throughout network analysis was carried out and the enriched GO functions were examined. Less than 1% of all identified proteins in the brain were antimicrobial and immunomodulatory peptides but the alterations characteristic to Alzheimer's disease could be recapitulated with their analysis. Our data emphasize the key role of the innate immune system and blood clotting in the development of Alzheimer's disease. The central role of antimicrobial and immunomodulatory peptides suggests their utilization as potential targets for mechanistic studies and future therapies.
Tárgyszavak:Orvostudományok Elméleti orvostudományok idegen nyelvű folyóiratközlemény külföldi lapban
folyóiratcikk
Megjelenés:Frontiers in Genetics. - 12 (2021), p. 1-15. -
További szerzők:Doan-Xuan, Quang-Minh (1986-) (biofizikus) Kunkli Balázs Csősz Éva (1977-) (biokémikus, molekuláris biológus)
Pályázati támogatás:FK134605
Egyéb
Stipendium Hungaricum
Egyéb
GINOP-2.3.3-15-2016-00020
GINOP
Internet cím:Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
DOI
Borító:

3.

001-es BibID:BIBFORM117816
035-os BibID:(cikkazonosító)380 (wos)001140375300001 (scopus)85181923454
Első szerző:Linkner Tamás Richárd
Cím:Comparative Analysis of Differential Cellular Transcriptome and Proteome Regulation by HIV-1 and HIV-2 Pseudovirions in the Early Phase of Infection / Linkner Tamás Richárd, Ambrus Viktor, Kunkli Balázs, Szojka Zsófia Ilona, Kalló Gergő, Csősz Éva, Kumar Ajneesh, Emri Miklós, Tőzsér József, Mahdi Mohamed
Dátum:2024
ISSN:1422-0067
Megjegyzések:In spite of the similar structural and genomic organization of human immunodeficiency viruses type 1 and 2 (HIV-1 and HIV-2), striking differences exist between them in terms of replication dynamics and clinical manifestation of infection. Although the pathomechanism of HIV-1 infection is well characterized, relatively few data are available regarding HIV-2 viral replication and its interaction with host-cell proteins during the early phase of infection. We utilized proteo-transcriptomic analyses to determine differential genome expression and proteomic changes induced by transduction with HIV-1/2 pseudovirions during 8, 12 and 26 h time-points in HEK-293T cells. We show that alteration in the cellular milieu was indeed different between the two pseudovirions. The significantly higher number of genes altered by HIV-2 in the first two time-points suggests a more diverse yet subtle effect on the host cell, preparing the infected cell for integration and latency. On the other hand, GO analysis showed that, while HIV-1 induced cellular oxidative stress and had a greater effect on cellular metabolism, HIV-2 mostly affected genes involved in cell adhesion, extracellular matrix organization or cellular differentiation. Proteomics analysis revealed that HIV-2 significantly downregulated the expression of proteins involved in mRNA processing and translation. Meanwhile, HIV-1 influenced the cellular level of translation initiation factors and chaperones. Our study provides insight into the understudied replication cycle of HIV-2 and enriches our knowledge about the use of HIV-based lentiviral vectors in general.
Tárgyszavak:Orvostudományok Elméleti orvostudományok idegen nyelvű folyóiratközlemény külföldi lapban
folyóiratcikk
Megjelenés:International Journal Of Molecular Sciences. - 25 : 1 (2024), p. 1-26. -
További szerzők:Ambrus Viktor Attila (1989-) (biotechnológus) Kunkli Balázs Szojka Zsófia (1991-) (molekuláris biológus) Kalló Gergő (1989-) (molekuláris biológus) Csősz Éva (1977-) (biokémikus, molekuláris biológus) Kumar, Ajneesh (1994-) (bioinformatikus) Emri Miklós (1962-) (fizikus) Tőzsér József (1959-) (molekuláris biológus, biokémikus, vegyész) Mahdi, Mohamed (1979-) (orvos, tudományos segédmunkatárs)
Pályázati támogatás:NKFI 125238
NKFIH
TKP2020-IKA-04
Egyéb
GINOP-2.3.3-15-2016-00020
GINOP
TKP2021-EGA-20
Egyéb
Internet cím:Szerző által megadott URL
DOI
Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
Borító:

4.

001-es BibID:BIBFORM098287
035-os BibID:(cikkazonosító)2207 (WoS)000727558700001 (Scopus)85117590051
Első szerző:Linkner Tamás Richárd
Cím:Cellular Proteo-Transcriptomic Changes in the Immediate Early-Phase of Lentiviral Transduction / Linkner Tamás Richárd, Ambrus Viktor, Kunkli Balázs, Szojka Zsófia Ilona, Kalló Gergő, Csősz Éva, Kumar Ajneesh, Emri Miklós, Tőzsér József, Mahdi Mohamed
Dátum:2021
ISSN:2076-2607
Tárgyszavak:Orvostudományok Elméleti orvostudományok idegen nyelvű folyóiratközlemény külföldi lapban
folyóiratcikk
Megjelenés:Microorganisms. - 9 : 11 (2021), p. 1-21. -
További szerzők:Ambrus Viktor Attila (1989-) (biotechnológus) Kunkli Balázs Szojka Zsófia (1991-) (molekuláris biológus) Kalló Gergő (1989-) (molekuláris biológus) Csősz Éva (1977-) (biokémikus, molekuláris biológus) Kumar, Ajneesh (1994-) (bioinformatikus) Emri Miklós (1962-) (fizikus) Tőzsér József (1959-) (molekuláris biológus, biokémikus, vegyész) Mahdi, Mohamed (1979-) (orvos, tudományos segédmunkatárs)
Pályázati támogatás:GINOP-2.3.3-15-2016-00020
GINOP
TKP2020-IKA-04
Egyéb
NKFI 125238
NKFIH
Internet cím:Szerző által megadott URL
DOI
Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
Borító:

5.

001-es BibID:BIBFORM101477
035-os BibID:(cikkazonosító)4534 (scopus)85128344596 (wos)000795409300001
Első szerző:Nokhoijav, Erdenetsetseg (kutatóorvos)
Cím:Metabolomic Analysis of Serum and Tear Samples from Patients with Obesity and Type 2 Diabetes Mellitus / Erdenetsetseg Nokhoijav, Andrea Guba, Ajneesh Kumar, Balázs Kunkli, Gergő Kalló, Miklós Káplár, Sándor Somodi, Ildikó Garai, Adrienne Csutak, Noémi Tóth, Miklós Emri, József Tőzsér, Éva Csősz
Dátum:2022
ISSN:1661-6596 1422-0067
Tárgyszavak:Orvostudományok Klinikai orvostudományok idegen nyelvű folyóiratközlemény külföldi lapban
folyóiratcikk
Megjelenés:International Journal Of Molecular Sciences. - 23 (2022), p. 1-19. -
További szerzők:Guba Andrea (1975-) (Okleveles vegyész) Kumar, Ajneesh (1994-) (bioinformatikus) Kunkli Balázs Kalló Gergő (1989-) (molekuláris biológus) Káplár Miklós (1965-) (belgyógyász, diabetológus) Somodi Sándor (1977-) (belgyógyász) Garai Ildikó (1966-) (radiológus) Csutak Adrienne (1971-) (szemész) Tóth Noémi (1992-) (orvos) Emri Miklós (1962-) (fizikus) Tőzsér József (1959-) (molekuláris biológus, biokémikus, vegyész) Csősz Éva (1977-) (biokémikus, molekuláris biológus)
Pályázati támogatás:GINOP-2.3.4-15-2016-00002
GINOP
GINOP-2.3.3-15-2016-00020
GINOP
FK134605
Other
Internet cím:Szerző által megadott URL
DOI
Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
Borító:

6.

001-es BibID:BIBFORM090348
Első szerző:Scholtz Beáta (biokémikus, molekuláris biológus)
Cím:Examination of Oral Squamous Cell Carcinoma and Precancerous Lesions Using Proximity Extension Assay and Salivary RNA Quantification / Beáta Scholtz, Doan Vo Minh, Csongor Kiss, Ildikó Tar, Ajneesh Kumar, József Tőzsér, Éva Csősz, Ildikó Márton
Dátum:2020
ISSN:2227-9059
Megjegyzések:Saliva is an easy-to access body fluid with high diagnostic potential. The utilization of saliva for oral cancer diagnosis can be an attractive possibility. Besides the oral cancer, it is important to better understand the precancerous lesions such as oral lichen planus (OLP) and leukoplakia (OLK). In order to examine the changes of salivary proteins in controls, patients with oral cancer, and patients with precancerous conditions, proximity extension assay was utilized. Some proteins and functions were characteristic to the examined groups and can serve as a starting point for further biomarker studies. The different nature of OLK and OLP was demonstrated, showing the malignant transformation and the inflammation as the prominent biological processes in the OLK and OLP, respectively. The salivary level of IL6 was verified using quantitative ELISA and the mRNA level was also studied. Elevated IL6 levels could be detected in precancerous groups compared to controls.
Tárgyszavak:Orvostudományok Klinikai orvostudományok idegen nyelvű folyóiratközlemény külföldi lapban
folyóiratcikk
saliva
oral cancer
precancerous lesions
proximity extension assay
mRNA
Megjelenés:Biomedicines. - 8 : 12 (2020), p. 1-16. -
További szerzők:Vo Minh, Doan Kiss Csongor (1956-) (hematológus, onkológus) Tar Ildikó (1967-) (fogszakorvos) Kumar, Ajneesh (1994-) (bioinformatikus) Tőzsér József (1959-) (molekuláris biológus, biokémikus, vegyész) Csősz Éva (1977-) (biokémikus, molekuláris biológus) Márton Ildikó (1954-) (fogszakorvos)
Pályázati támogatás:OTKA-105034
OTKA
Internet cím:Szerző által megadott URL
DOI
Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
Borító:
Rekordok letöltése1