CCL

Összesen 14 találat.
#/oldal:
Részletezés:
Rendezés:

1.

001-es BibID:BIBFORM113196
035-os BibID:(Scopus)85164266455
Első szerző:Huang, Xufeng (fogorvos)
Cím:Brief literature review and comprehensive bioinformatics analytics unravel the potential mechanism of curcumin in the treatment of periodontitis / Xufeng Huang, Ying Liu, Qi Wang, Hafiz Muzzammel Rehman, Dorottya Horváth, Shujing Zhou, Rao Fu, Ling Zhang, Attila Gábor Szöllősi, Zhengrui Li
Dátum:2023
ISSN:1472-6831
Tárgyszavak:Orvostudományok Klinikai orvostudományok idegen nyelvű folyóiratközlemény külföldi lapban
folyóiratcikk
Megjelenés:BMC Oral Health. - 23 : 1 (2023), p. 1-13. -
További szerzők:Liu, Ying Wang, Qi Rehman, Hafiz Muzzammel Horváth Dorottya (1994-) (molekuláris biológus) Zhou, Shujing (1997-) Fu, Rao Zhang, Ling Szöllősi Attila Gábor (1982-) (élettanász) Li, Zhengrui
Internet cím:Szerző által megadott URL
DOI
Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
Borító:

2.

001-es BibID:BIBFORM103045
035-os BibID:(cikkazonosító)978865 (WoS)001023055700001 (Scopus)85137659869
Első szerző:Huang, Xufeng (fogorvos)
Cím:Cuproptosis-related gene index: a predictor for pancreatic cancer prognosis, immunotherapy efficacy, and chemosensitivity / Xufeng Huang, Shujing Zhou, Tóth János, Hajdu András
Dátum:2022
ISSN:1664-3224
Megjegyzések:Aim: The term "Cuproptosis" was coined to describe a novel type of cell death triggered by intracellular copper buildup that is fundamentally distinct from other recognized types such as autophagy, ferroptosis, and pyroptosis in recent days. As the underlying mechanism was newly identified, its potential connection to pancreatic adenocarcinoma (PAAD) is still an open issue. Methods: A set of machine learning algorithms was used to develop a Cuproptosis-related gene index (CRGI). Its immunological characteristics were studied by exploring its implications on the expression of the immunological checkpoints, prospective immunotherapy responses, etc. Moreover, the sensitivity to chemotherapeutic drugs was predicted. Unsupervised consensus clustering was performed to more precisely identify different CRGI-based molecular subtypes and investigate the immunotherapy and chemotherapy efficacy. The expression of DLAT, LIPT1 and LIAS were also investigated, through real-time quantitative polymerase chain reaction (RT-qPCR), western blot, and immunofluorescence staining (IFS). Results: A novel CRGI was identified and validated. Additionally, correlation analysis revealed major changes in tumor immunology across the high- and low-CRGI groups. Through an in-depth study of each medication, it was determined that the predictive chemotherapeutic efficacy of 32 regularly used anticancer drugs differed between high- and low-CRGI groups. The results of the molecular subtyping provided more support for such theories. Expressional assays performed at transcriptomic and proteomic levels suggested that the aforementioned Cuproptosis-related genes might serve as reliable diagnostic biomarkers in PAAD. Significance: This is, to the best of our knowledge, the first study to examine prognostic prediction in PAAD from the standpoint of Cuproptosis. These findings may benefit future immunotherapy and chemotherapeutic therapies.
Tárgyszavak:Orvostudományok Klinikai orvostudományok idegen nyelvű folyóiratközlemény külföldi lapban
folyóiratcikk
cuproptosis
machine learning
pancreatic cancer
tumor microenvironment
immunotherapy
chemotherapy
gene signature
Megjelenés:Frontiers in Immunology. - 13 (2022), p. 1-31. -
További szerzők:Zhou, Shujing (1997-) Tóth János (1984-) (programtervező matematikus) Hajdu András (1973-) (matematikus, informatikus)
Pályázati támogatás:TKP2021-NKTA-34
Egyéb
Internet cím:Szerző által megadott URL
DOI
Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
Borító:

3.

001-es BibID:BIBFORM102058
Első szerző:Huang, Xufeng (fogorvos)
Cím:Network Pharmacology-Based Approach Combined with Bioinformatic Analytics to Elucidate the Potential of Curcumol against Hepatocellular Carcinoma / Xufeng Huang, Hafiz Muzzammel Rehman, Attila Gábor Szöllősi, Shujing Zhou
Dátum:2022
ISSN:2073-4425
Megjegyzések:Purpose: Modern, open-source databases provide an unprecedented wealth of information to help drug development. By combining data available in these databases with the proper bioinformatical tools, we can elucidate the molecular targets of natural compounds. One such molecule is curcumol, a guaiane-type sesquiterpenoid hemiketal isolated from Rhizoma Curcumae, which is used for a broad range of diseases in traditional Chinese and Indian medicine. It has been reported to exert anti-tumor activity, but the intrinsic molecular mechanism in hepatocellular carcinoma (HCC) is unclear. Therefore, the present study was designed to reveal the predictive targets and biological mechanisms of curcumol against HCC via a network pharmacology-based approach combined with bioinformatic analytics and to provide proof of concept for further similar investigations. Methods: Data available from open-source databases (Traditional Chinese Medicine Systems Pharmacology, Comparative Toxicogenomic Database, The Cancer Genome Atlas, the Human Protein Atlas project) was processed with the help of a variety of open-source tools (SwissADME, SwissTargetPrediction, JVenn, Gene Ontology, Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes, GeneMANIA, Cytoscape). Results: In the present study, the potential of curcumol against HCC was unraveled by network pharmacology-based elucidation. It suggests that curcumol shows exciting druggability with 44 potent homo sapiens biotargets against HCC. The GO terms and KEGG pathways enrichment analyses, curcumol-targets-pathways-HCC network, PPI network, and corresponding in-depth topological analyses, as well as survival analysis, molecular docking simulation indicate that the potential mechanism of curcumol against HCC is complicated, as it may act in various ways, mainly by inducing apoptosis and modulating the inflammatory response, increasing presentation of HCC-specific protein. Conclusion: The present study highlights the potential of curcumol against HCC, giving reference to further experimental study. It also presents a roadmap that can be followed to conduct in silico prescreening of other compounds of interest.
Tárgyszavak:Orvostudományok Klinikai orvostudományok idegen nyelvű folyóiratközlemény külföldi lapban
folyóiratcikk
data integration
drug discovery
network modeling
Megjelenés:Genes. - 13 : 4 (2022), p. 1-20. -
További szerzők:Rehman, Hafiz Muzzammel Szöllősi Attila Gábor (1982-) (élettanász) Zhou, Shujing (1997-)
Internet cím:Szerző által megadott URL
DOI
Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
Borító:

4.

001-es BibID:BIBFORM108788
035-os BibID:(cikkazonosító)1113739 (scopus)85149565612 (wos)000941641100001
Első szerző:Li, Zhangzuo
Cím:Lactate in the tumor microenvironment : a rising star for targeted tumor therapy / Zhangzuo Li, Qi Wang, Xufeng Huang, Mengting Yang, Shujing Zhou, Zhengrui Li, Zhengzou Fang, Yidan Tang, Qian Chen, Hanjin Hou, Li Li, Fei Fei, Qiaowei Wang, Yuqing Wu, Aihua Gong
Dátum:2023
ISSN:2296-861X
Tárgyszavak:Orvostudományok Klinikai orvostudományok idegen nyelvű folyóiratközlemény külföldi lapban
folyóiratcikk
Megjelenés:Frontiers in Nutrition. - 10 (2023), p. 1-10. -
További szerzők:Wang, Qi Huang, Xufeng (1997-) (fogorvos) Yang, Mengting Zhou, Shujing (1997-) Li, Zhengrui Fang, Zhengzou Tang, Yidan Chen, Qian Hou, Hanjin Li, Li Fei, Fei Wang, Qiaowei Wu, Yuqing Gong, Aihua
Internet cím:Szerző által megadott URL
DOI
Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
Borító:

5.

001-es BibID:BIBFORM110398
035-os BibID:(cikkazonosító)1153106 (WoS)000969255200001 (Scopus)85152639331
Első szerző:Liu, Ying
Cím:Machine learning approach combined with causal relationship inferring unlocks the shared pathomechanism between COVID-19 and acute myocardial infarction / Ying Liu, Shujing Zhou, Longbin Wang, Ming Xu, Xufeng Huang, Zhengrui Li, Andras Hajdu, Ling Zhang
Dátum:2023
ISSN:1664-302X
Tárgyszavak:Orvostudományok Klinikai orvostudományok idegen nyelvű folyóiratközlemény külföldi lapban
folyóiratcikk
Megjelenés:Frontiers in Microbiology. - 14 (2023), p. 1-10. -
További szerzők:Zhou, Shujing (1997-) Wang, Longbin Xu, Ming Huang, Xufeng (1997-) (fogorvos) Li, Zhengrui Hajdu András (1973-) (matematikus, informatikus) Zhang, Ling
Internet cím:Szerző által megadott URL
DOI
Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
Borító:

6.

001-es BibID:BIBFORM102412
035-os BibID:(cikkazonosító)93 (scopus)85132080040 (wos)000811217000001
Első szerző:Liu, Ying
Cím:Mechanistic insight of the potential of geraniol against Alzheimer's disease / Ying Liu, Shujing Zhou, Xufeng Huang, Hafiz Muzzammel Rehman
Dátum:2022
ISSN:0949-2321 2047-783X
Tárgyszavak:Orvostudományok Elméleti orvostudományok idegen nyelvű folyóiratközlemény külföldi lapban
folyóiratcikk
Megjelenés:European Journal Of Medical Research. - 27 : 1 (2022), p. 1-10. -
További szerzők:Zhou, Shujing (1997-) Huang, Xufeng (1997-) (fogorvos) Rehman, Hafiz Muzzammel
Internet cím:Szerző által megadott URL
DOI
Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
Borító:

7.

001-es BibID:BIBFORM105657
035-os BibID:(cikkazonosító)2723264
Első szerző:Qi Wang
Cím:IL1RN and PRRX1 as a Prognostic Biomarker Correlated with Immune Infiltrates in Colorectal Cancer : evidence from Bioinformatic Analysis / Qi Wang, Xufeng Huang, Shujing Zhou, Yuntao Ding, Huizhi Wang, Weiye Jiang, Min Xu
Dátum:2022
Tárgyszavak:Orvostudományok Klinikai orvostudományok idegen nyelvű folyóiratközlemény külföldi lapban
folyóiratcikk
Megjelenés:International Journal of Genomics. - 2022 (2022), p. 1-24. -
További szerzők:Huang, Xufeng (1997-) (fogorvos) Zhou, Shujing (1997-) Ding, Yuntao Wang, Huizhi Jiang, Weiye Xu, Min
Internet cím:Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
DOI
Borító:

8.

001-es BibID:BIBFORM115810
035-os BibID:(Scopus)85178311743
Első szerző:Wang, Longbin
Cím:Capsaicin alleviates doxorubicin-induced acute myocardial injury by regulating iron homeostasis and PI3K-Akt signaling pathway / Longbin Wang, Ying Liu, Si Li, Zhijian Zha, Yu Chen, Qi Wang, Shujing Zhou, Xufeng Huang, Ming Xu
Dátum:2023
ISSN:1945-4589
Tárgyszavak:Orvostudományok Klinikai orvostudományok idegen nyelvű folyóiratközlemény külföldi lapban
folyóiratcikk
Megjelenés:Aging. - 15 : 21 (2023), p. 11845-11859. -
További szerzők:Liu, Ying Li, Si Zha, Zhijian Chen, Yu Wang, Qi Zhou, Shujing (1997-) Huang, Xufeng (1997-) (fogorvos) Xu, Ming
Internet cím:Szerző által megadott URL
DOI
Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
Borító:

9.

001-es BibID:BIBFORM117601
Első szerző:Wang, Qi
Cím:Interplay of Sphingolipid Metabolism in Predicting Prognosis of GBM Patients : towards Precision Immunotherapy / Qi Wang, Chuanhua Zheng, Hanjin Hou, Xin Bao, Huading Tai, Xufeng Huang, Zhengrui Li, Zhangzuo Li, Qiaowei Wang, Qi Pan, Longbin Wang, Shujing Zhou, Yanjie Bian, Qier Pan, Aihua Gong, Min Xu
Dátum:2024
ISSN:1837-9664
Tárgyszavak:Orvostudományok idegen nyelvű folyóiratközlemény külföldi lapban
folyóiratcikk
Megjelenés:Journal of Cancer. - 15 : 1 (2024), p. 275-292. -
További szerzők:Zheng, Chuanhua Hou, Hanjin Bao, Xin Tai, Huading Huang, Xufeng (1997-) (fogorvos) Li, Zhengrui Li, Zhangzuo Wang, Qiaowei Pan, Qi Wang, Longbin Zhou, Shujing (1997-) Bian, Yanjie Pan, Qier Gong, Aihua Xu, Min
Internet cím:Szerző által megadott URL
DOI
Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
Borító:

10.

001-es BibID:BIBFORM111624
035-os BibID:(cikkazonosító)1182277 (Scopus)85159798082 (WoS)000990535700001
Első szerző:Wang, Qi
Cím:Establishment of a novel lysosomal signature for the diagnosis of gastric cancer with in-vitro and in-situ validation / Qi Wang, Ying Liu, Zhangzuo Li, Yidan Tang, Weiguo Long, Huaiyu Xin, Xufeng Huang, Shujing Zhou, Longbin Wang, Bochuan Liang, Zhengrui Li, Min Xu
Dátum:2023
ISSN:1664-3224
Tárgyszavak:Orvostudományok Elméleti orvostudományok idegen nyelvű folyóiratközlemény külföldi lapban
folyóiratcikk
Megjelenés:Frontiers in Immunology. - 14 (2023), p. 1-14. -
További szerzők:Liu, Ying Li, Zhangzuo Tang, Yidan Long, Weiguo Xin, Huaiyu Huang, Xufeng (1997-) (fogorvos) Zhou, Shujing (1997-) Wang, Longbin Liang, Bochuan Li, Zhengrui Xu, Min
Internet cím:Szerző által megadott URL
DOI
Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
Borító:

11.

001-es BibID:BIBFORM107920
035-os BibID:(cikkazonosító)1097403 (Scopus)85147762684
Első szerző:Wang, Qi
Cím:NCAPG2 could be an immunological and prognostic biomarker : from pan-cancer analysis to pancreatic cancer validation / Qi Wang, Zhangzuo Li, Shujing Zhou, Zhengrui Li, Xufeng Huang, Yiwei He, Yuhan Zhang, Xiaoxian Zhao, Yidan Tang, Min Xu
Dátum:2023
ISSN:1664-3224
Tárgyszavak:Orvostudományok Klinikai orvostudományok idegen nyelvű folyóiratközlemény külföldi lapban
folyóiratcikk
Megjelenés:Frontiers in Immunology. - 14 (2023), p. 1-16. -
További szerzők:Li, Zhangzuo Zhou, Shujing (1997-) Li, Zhengrui Huang, Xufeng (1997-) (fogorvos) He, Yiwei Zhang, Yuhan Zhao, Xiaoxian Tang, Yidan Xu, Min
Internet cím:Szerző által megadott URL
DOI
Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
Borító:

12.

001-es BibID:BIBFORM114537
035-os BibID:(cikkazonosító)1220038 (Scopus)85169567398 (WOS)001055523200001
Első szerző:Zhang, Danfeng
Cím:GLS as a diagnostic biomarker in breast cancer : in-silico, in-situ, and in-vitro insights / Danfeng Zhang, Man Wang, Xufeng Huang, Longbin Wang, Ying Liu, Shujing Zhou, Yidan Tang, Qi Wang, Zhengrui Li, Geng Wang
Dátum:2023
ISSN:2234-943X
Megjegyzések:Background: Recently, a novel programmed cell death mechanism, Cuproptosis, has been discovered and found to play an important role in the development and progression of diverse tumors. In the present study, we comprehensively investigated the core gene of this mechanism, GLS, in breast cancer. Materials and methods: Bulk RNA sequencing data were curated from the TCGA repository to investigate the aberrant expression of GLS over diverse cancer types. Then, we examined its efficacy as a diagnostic biomarker in breast cancer by Area Under Curve (AUC) of the Receiver Operative Characteristic (ROC) curve. Furthermore, by applying siRNA technique, we knocked down the GLS expression level in cancerous cell lines, measuring the corresponding effects on cell proliferation and metastasis. Afterward, we explored the potential implications of GLS expression in the tumor immune microenvironment quantitatively by using several R packages and algorithms, including ESTIMATE, CIBERSORT, etc. Results: Pan-cancer analysis suggested that GLS was aberrantly over-expressed in many cancer types, with breast cancer being typical. More in-depth analyses revealed the expression of GLS exerted a high ROC-AUC value in breast cancer diagnosis. Through the knock-down of GLS expression, it was found that GLS expression was strongly relevant to the growth and metastasis of tumor. Furthermore, it was also found to be correlated with the immune tumor microenvironment. Conclusion: We highlighted that GLS expression might be applicable as a diagnostic biomarker in breast cancer and possess significant implications in the growth and metastasis of tumor and the immune tumor microenvironment, sharing new insights into ontological and personalized medicine.
Tárgyszavak:Orvostudományok Elméleti orvostudományok idegen nyelvű folyóiratközlemény külföldi lapban
folyóiratcikk
bioinformatics
biomarker
breast cancer
cuproptosis
EMT pathway
Megjelenés:Frontiers in Oncology. - 13 (2023), p. 1-8. -
További szerzők:Wang, Man Huang, Xufeng (1997-) (fogorvos) Wang, Longbin Liu, Ying Zhou, Shujing (1997-) Tang, Yidan Wang, Qi Li, Zhengrui Wang, Geng
Internet cím:Szerző által megadott URL
DOI
Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
Borító:
Rekordok letöltése1 2