CCL

Összesen 6 találat.
#/oldal:
Részletezés:
Rendezés:

1.

001-es BibID:BIBFORM049213
Első szerző:Brázda Péter (biológus, angol-magyar szakfordító)
Cím:Ligand binding shifts highly mobile RXR to chromatin-bound state in a coactivator-dependent manner as revealed by single cell imaging / Peter Brazda, Jan Krieger, Bence Daniel, David Jonas, Tibor Szekeres, Jörg Langowski, Katalin Tóth, Laszlo Nagy, György Vámosi
Dátum:2014
ISSN:0270-7306
Megjegyzések:Retinoid X Receptor (RXR) is a promiscuous nuclear receptor forming heterodimers with several other receptors, which activate different sets of genes. Upon agonist treatment the occupancy of its genomic binding regions increased, but only a modest change in the number of sites was revealed by ChIP-Seq, suggesting a rather static behavior. However, such genome-wide and biochemical approaches do not take into account the dynamic behavior of a transcription factor. Therefore we characterized the nuclear dynamics of RXR during activation in single cells on the sub-second scale using live-cell imaging. By applying FRAP and fluorescence correlation spectroscopy (FCS), techniques with different temporal and spatial resolution, a highly dynamic behavior could be uncovered, which is best described by a two-state model of receptor mobility. In the unliganded state most RXRs belonged to the fast population, leaving ~15% for the slow, chromatin bound fraction. Upon agonist treatment, this ratio increased to ~43% as a result of an immediate and reversible redistribution. Coactivator binding appears to be indispensable for redistribution and has a major contribution to chromatin association. A nuclear mobility map recorded by light sheet microscopy-FCS shows that the ligand-induced transition from the fast to the slow population occurs throughout the nucleus. Our results support a model in which RXR has a distinct, highly dynamic nuclear behavior and follows hit-and-run kinetics upon activation.
Tárgyszavak:Orvostudományok Elméleti orvostudományok idegen nyelvű folyóiratközlemény külföldi lapban
RXR
dynamics
nuclear receptor
diffusion
transcription
Megjelenés:Molecular and Cellular Biology. - 34 : 7 (2014), p. 1234-1245. -
További szerzők:Krieger, Jan W. Dániel Bence (1987-) (molekuláris biológus) Jonás Dávid Szekeres Tibor (1984-) (molekuláris biológus) Langowski, Jörg Tóth Katalin Ágnes (1977-) (biokémikus, molekuláris biológus) Nagy László (1966-) (molekuláris sejtbiológus, biokémikus) Vámosi György (1967-) (biofizikus)
Internet cím:Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
DOI
Borító:

2.

001-es BibID:BIBFORM036875
035-os BibID:(WoS)000307356300048 (Scopus)84864588401
Első szerző:Buchholz, Jan
Cím:FPGA implementation of a 32x32 autocorrelator array for analysis of fast image series / Jan Buchholz, Jan W. Krieger, Mocsár Gábor, Kreith Balázs, Eduardo Charbon, Vámosi György, Udo Kebschull, Jörg Langowski
Dátum:2012
ISSN:1094-4087
Megjegyzések:With the evolving technology in CMOS integration, new classes of 2D-imaging detectors have recently become available. In particular, single photon avalanche diode (SPAD) arrays allow detection of single photons at high acquisition rates (? 100kfps), which is about two orders of magnitude higher than with currently available cameras. Here we demonstrate the use of a SPAD array for imaging fluorescence correlation spectroscopy (imFCS), a tool to create 2D maps of the dynamics of fluorescent molecules inside living cells. Time-dependent fluorescence fluctuations, due to fluorophores entering and leaving the observed pixels, are evaluated by means of autocorrelation analysis. The multi-? correlation algorithm is an appropriate choice, as it does not rely on the full data set to be held in memory. Thus, this algorithm can be efficiently implemented in custom logic. We describe a new implementation for massively parallel multi-? correlation hardware. Our current implementation can calculate 1024 correlation functions at a resolution of 10 ?s in real-time and therefore correlate real-time image streams from high speed single photon cameras with thousands of pixels.
Tárgyszavak:Természettudományok Biológiai tudományok idegen nyelvű folyóiratközlemény külföldi lapban
folyóiratcikk
FPGA
hardware correlator
correlation function
Molekuláris Medicina
egyetemen (Magyarországon) készült közlemény
Megjelenés:Optics Express. - 20 : 16 (2012), p. 17767-17782. -
További szerzők:Krieger, Jan W. Mocsár Gábor (1981-) (biofizikus) Kreith Balázs (1984-) (informatikus) Charbon, Eduardo Vámosi György (1967-) (biofizikus) Kebschull, Udo Langowski, Jörg
Pályázati támogatás:TÁMOP-4.2.1/B-09/1/KONV-2010-0007
TÁMOP
Fehérje-fehérje kölcsönhatások limfociták membránjában és a sejtmagban
K77600
OTKA
K103965
OTKA
Internet cím:Szerző által megadott URL
DOI
Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
Borító:

3.

001-es BibID:BIBFORM036874
035-os BibID:(cikkazonosító)046101 (WoS)000303415300080 (Scopus)84860554152
Első szerző:Mocsár Gábor (biofizikus)
Cím:Multiplexed multiple-tau auto- and cross-correlators on a single field programmable gate array / G. Mocsár, B. Kreith, J. Buchholz, J. W. Krieger, J. Langowski, G. Vámosi
Dátum:2012
ISSN:0034-6748
Megjegyzések:We introduce a new multiple-tau hardware correlator design for computing fluorescence correlation functions (CFs) in real time. Use of hardware resources is minimized by scheduling the computation of different segments of the CFs on a single correlator block. Simultaneous calculation of two multiple-tau autocorrelation (ACFs) and two cross-correlation functions (CCFs) is implemented in LabVIEW on a National Instruments field programmable gate array (FPGA) card with a minimal sampling time of 400 ns. Raw data are stored with a time resolution of 50 ns. The design can be easily adapted to other FPGA cards and extended to more inputs.
Tárgyszavak:Természettudományok Fizikai tudományok idegen nyelvű folyóiratközlemény külföldi lapban
folyóiratcikk
FPGA
FCS
fluorescence correlation spectroscopy
hardware correlator
correlation function
Molekuláris Medicina
egyetemen (Magyarországon) készült közlemény
Megjelenés:Review of Scientific Instruments. - 83 : 4 (2012), p. 1-3. -
További szerzők:Kreith Balázs (1984-) (informatikus) Buchholz, Jan Krieger, Jan W. Langowski, Jörg Vámosi György (1967-) (biofizikus)
Pályázati támogatás:TÁMOP-4.2.1/B-09/1/KONV-2010-0007
TÁMOP
Fehérje-fehérje kölcsönhatások limfociták membránjában és a sejtmagban
Internet cím:Szerző által megadott URL
DOI
Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
Borító:

4.

001-es BibID:BIBFORM046092
Első szerző:Vámosi György (biofizikus)
Cím:IL-2 and IL-15 receptor [alfa]-subunits are coexpressed in a supramolecular receptor cluster in lipid rafts of T cells / Vamosi G., Bodnar A., Vereb G., Jenei A., Goldman C. K., Langowski J., Toth K., Matyus L., Szollosi J., Waldmann T. A., Damjanovich S.
Dátum:2004
ISSN:0027-8424
Megjegyzések:The private alpha-chains of IL-2 and IL-15 receptors (IL-2R and IL-15R) share the signaling beta- and gamma(c)-subunits, resulting in both common and contrasting roles of IL-2 and IL-15 in T cell function. Knowledge of the cytokine-dependent subunit assembly is indispensable for understanding the paradox of distinct signaling capacities. By using fluorescence resonance energy transfer and confocal microscopy, we have shown that IL-2R alpha, IL-15R alpha, IL-2/15R beta and gamma(c)-subunits, as well as MHC class I and II glycoproteins formed supramolecular receptor clusters in lipid rafts of the T lymphoma line Kit 225 FT7.10. Fluorescence crosscorrelation microscopy demonstrated the comobility of IL-15R alpha with IL-2R alpha and MHC class I. A model was generated for subunit switching between IL-2R alpha and IL-15R alpha upon the binding of the appropriate cytokine resulting in the formation of high-affinity heterotrimeric receptors. This model suggests a direct role for the alpha-subunits, to which no definite function has been assigned so far, in tuning cellular responses to IL-2 or IL-15. In addition, both alpha-chains were at least partially homodimerized/oligomerized, which could be the basis of distinct signaling pathways by the two cytokines.
Tárgyszavak:Orvostudományok Elméleti orvostudományok idegen nyelvű folyóiratközlemény külföldi lapban
Megjelenés:Proceedings Of The National Academy Of Sciences Of The United States Of America. - 101 : 30 (2004), p. 11082-11087. -
További szerzők:Dóczy-Bodnár Andrea (1970-) (biofizikus) Vereb György (1965-) (biofizikus, orvos) Jenei Attila (1966-) (biofizikus) Goldman, Caroline K. Langowski, Jörg Tóth Katalin (biofizikus) Mátyus László (1956-) (biofizikus) Szöllősi János (1953-) (biofizikus) Waldmann, Thomas A. Damjanovich Sándor (1936-2017) (biofizikus)
Internet cím:Szerző által megadott URL
DOI
Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
Borító:

5.

001-es BibID:BIBFORM065088
035-os BibID:(Cikkazonosító)33022 (WOS)000382917700001 (Scopus)85047916061
Első szerző:Vámosi György (biofizikus)
Cím:EGFP oligomers as natural fluorescence and hydrodynamic standards / György Vámosi, Norbert Mücke, Gabriele Müller, Jan Wolfgang Krieger, Ute Curth, Jörg Langowski, Katalin Tóth
Dátum:2016
ISSN:2045-2322
Megjegyzések:EGFP oligomers are convenient standards for experiments on fluorescent protein-taggedbiomolecules. In this study, we characterized their hydrodynamic and fluorescence properties.Diffusion coefficients D of EGFP1-4 were determined by analytical ultracentrifugation withfluorescence detection and by fluorescence correlation spectroscopy (FCS), yielding83.4?48.2 ?m2/s and 97.3?54.8 ?m2/s from monomer to tetramer. A "barrels standing in arow" model agreed best with the sedimentation data. Oligomerization red-shifted EGFPemission spectra without any shift in absorption. Fluorescence anisotropy increased,indicating homoFRET between the subunits. Fluorescence lifetime decreased only slightly(4%) indicating insignificant quenching by FRET to subunits in non-emitting states. FCSmeasuredD, particle number and molecular brightness depended on dark states and lightinducedprocesses in distinct subunits, resulting in a dependence on illumination powerdifferent for monomers and oligomers. Since subunits may be in "on" (bright) or "off" (dark)states, FCS-determined apparent brightness is not proportional to that of the monomer. Fromits dependence on the number of subunits, the probability of the "on" state for a subunit wasdetermined to 96% at pH8 and 77% at pH6.38, i.e., protonation increases the dark state. Thesefluorescence properties of EGFP oligomeric standards can assist interpreting results fromoligomerized EGFP fusion proteins of biological interest.
Tárgyszavak:Orvostudományok Elméleti orvostudományok idegen nyelvű folyóiratközlemény külföldi lapban
folyóiratcikk
oligo-EGFP
FP photophysics
diffusion coefficient
molecular brightness
protein oligomerization
Megjelenés:Scientific Reports. - 6 (2016), p. 1-12. -
További szerzők:Mücke, Norbert Müller, Gabriele Krieger, Jan Wolfgang Curth, Ute Langowski, Jörg Tóth Katalin (Heidelberg)
Internet cím:Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
Borító:

6.

001-es BibID:BIBFORM003912
Első szerző:Vámosi György (biofizikus)
Cím:Conformation of the c-Fos/c-Jun complex in vivo : a combined FRET, FCCS, and MD-modeling study / Vámosi Gy., Baudendistel N., von der Lieth C.W., Szalóki N., Mocsár G., Müller G., Brázda P., Waldeck W., Damjanovich S.,Langowski J., Tóth K.
Dátum:2008
Tárgyszavak:Orvostudományok Elméleti orvostudományok idegen nyelvű folyóiratközlemény külföldi lapban
Megjelenés:Biophysical Journal 94 : 7 (2008), p. 2859-2868. -
További szerzők:Baudendistel, Nina von der Lieth, Claus-Wilhelm Szalóki Nikoletta (1981-) (biológus) Mocsár Gábor (1981-) (biofizikus) Müller, Gabriele Brázda Péter (1980-) (biológus, angol-magyar szakfordító) Waldeck, Waldemar Damjanovich Sándor (1936-2017) (biofizikus) Langowski, Jörg Tóth Katalin (biofizikus)
Internet cím:elektronikus változat
DOI
Borító:
Rekordok letöltése1 
Corvina könyvtári katalógus v8.2.27 © 2023 Monguz kft. Minden jog fenntartva.