CCL

Összesen 3 találat.
#/oldal:
Részletezés:
Rendezés:

1.

001-es BibID:BIBFORM059157
035-os BibID:(cikkazonosító)e0131141
Első szerző:Boros Gábor (biokémikus, molekuláris biológus)
Cím:Identification of Cyclobutane Pyrimidine Dimer-Responsive Genes Using UVB-Irradiated Human Keratinocytes Transfected with In Vitro-Synthesized Photolyase mRNA / Gábor Boros, Edit Miko, Hiromi Muramatsu, Drew Weissman, Eszter Emri, Gijsbertus T. J. van der Horst, Andrea Szegedi, Irén Horkay, Gabriella Emri, Katalin Karikó, Éva Remenyik
Dátum:2015
ISSN:1932-6203
Megjegyzések:Major biological effects of UVB are attributed to cyclobutane pyrimidine dimers (CPDs), the most common photolesions formed on DNA. To investigate the contribution of CPDs to UVB-induced changes of gene expression, a model system was established by transfecting keratinocytes with pseudouridine-modified mRNA (?-mRNA) encoding CPD-photolyase. Microarray analyses of this model system demonstrated that more than 50% of the gene expression altered by UVB was mediated by CPD photolesions. Functional classification of the gene targets revealed strong effects of CPDs on the regulation of the cell cycle and transcriptional machineries. To confirm the microarray data, cell cycle-regulatory genes, CCNE1 and CDKN2B that were induced exclusively by CPDs were selected for further investigation. Following UVB irradiation, expression of these genes increased significantly at both mRNA and protein levels, but not in cells transfected with CPD-photolyase ?-mRNA and exposed to photoreactivating light. Treatment of cells with inhibitors of c-Jun N-terminal kinase (JNK) blocked the UVB-dependent upregulation of both genes suggesting a role for JNK in relaying the signal of UVB-induced CPDs into transcriptional responses. Thus, photolyase mRNA-based experimental platform demonstrates CPD-dependent and -independent events of UVB-induced cellular responses, and, as such, has the potential to identify novel molecular targets for treatment of UVB-mediated skin diseases.
Tárgyszavak:Orvostudományok Elméleti orvostudományok idegen nyelvű folyóiratközlemény külföldi lapban
Megjelenés:Plos One. - 10 : 6 (2015), p. 1-19. -
További szerzők:Mikó Edit (1980-) (biológus) Muramatsu, Hiromi Weissman, Drew Emri Eszter (1985-) (Ph.D hallgató) van der Horst, Gijsbertus T. J. Szegedi Andrea (1964-) (bőrgyógyász) Horkay Irén (1938-) (bőrgyógyász, labor szakorvos, kozmetológus) Emri Gabriella (1972-) (bőrgyógyász, allergológus, onkológus) Karikó Katalin (1955-) (biológus, biokémikus) Remenyik Éva (1956-) (bőrgyógyász)
Internet cím:Szerző által megadott URL
DOI
Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
Borító:

2.

001-es BibID:BIBFORM051295
Első szerző:Ecsedi Szilvia (molekuláris biológus, genetikus)
Cím:DNA methylation characteristics of primary melanomas with distinct biological behaviour / Szilvia Irina Ecsedi, Hector Hernandez-Vargas, Sheila Coelho Lima, Laura Vizkeleti, Reka Toth, Viktoria Lazar, Viktoria Koroknai, Timea Kiss, Gabriella Emri, Zdenko Herceg, Roza Adany, Margit Balazs
Dátum:2014
Tárgyszavak:Orvostudományok Egészségtudományok idegen nyelvű folyóiratközlemény külföldi lapban
primary melanoma
tumour progression
epigenetics
DNa methylation
hypermethylation
hypomethylation
copy number alteration
array CGH
BRAF mutation
Megjelenés:Plos One. - 9 : 5 (2014), p. e96612. -
További szerzők:Hernandez-Vargas, Hector Lima, Sheila Coelho Vízkeleti Laura (1984-) (molekuláris biológus, genetikus) Tóth Réka Lázár Viktória (1981-) (molekuláris biológus) Koroknai Viktória (1986-) (molekuláris biológus) Kiss Tímea (1986-) (molekuláris biológus) Emri Gabriella (1972-) (bőrgyógyász, allergológus, onkológus) Herceg Zdenko Ádány Róza (1952-) (megelőző orvostan és népegészségtan szakorvos) Balázs Margit (1952-) (sejtbiológus, molekuláris genetikus)
Pályázati támogatás:K75191
OTKA
TÁMOP 4.2.1/B-09/1/KONV-2010-0007
TÁMOP
Egészség- és Környezettudomány
TÁMOP 4.2.4.A/2-11-1-2012-0001
TÁMOP
TÁMOP-4.2.2.A-11/1/KONV-2012-0031
TÁMOP
Internet cím:Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
DOI
Borító:

3.

001-es BibID:BIBFORM041549
Első szerző:Rákosy Zsuzsa (sejtbiológus, molekuláris biológus, genetikus)
Cím:Integrative genomics identifies gene signature associated with melanoma ulceration / Zsuzsa Rakosy, Szilvia Ecsedi, Reka Toth, Laura Vizkeleti, Hector Herandez-Vargas, Viktoria Lazar, Gabriella Emri, Istvan Szatmari, Zdenko Herceg, Roza Adany, Margit Balazs
Dátum:2013
Megjegyzések:BACKGROUND:Despite the extensive research approaches applied to characterise malignant melanoma, no specific molecular markers are available that are clearly related to the progression of this disease. In this study, our aims were to define a gene expression signature associated with the clinical outcome of melanoma patients and to provide an integrative interpretation of the gene expression -, copy number alterations -, and promoter methylation patterns that contribute to clinically relevant molecular functional alterations.METHODS:Gene expression profiles were determined using the Affymetrix U133 Plus2.0 array. The NimbleGen Human CGH Whole-Genome Tiling array was used to define CNAs, and the Illumina GoldenGate Methylation platform was applied to characterise the methylation patterns of overlapping genes.RESULTS:WE IDENTIFIED TWO SUBCLASSES OF PRIMARY MELANOMA: one representing patients with better prognoses and the other being characteristic of patients with unfavourable outcomes. We assigned 1,080 genes as being significantly correlated with ulceration, 987 genes were downregulated and significantly enriched in the p53, Nf-kappaB, and WNT/beta-catenin pathways. Through integrated genome analysis, we defined 150 downregulated genes whose expression correlated with copy number losses in ulcerated samples. These genes were significantly enriched on chromosome 6q and 10q, which contained a total of 36 genes. Ten of these genes were downregulated and involved in cell-cell and cell-matrix adhesion or apoptosis. The expression and methylation patterns of additional genes exhibited an inverse correlation, suggesting that transcriptional silencing of these genes is driven by epigenetic events.CONCLUSION:Using an integrative genomic approach, we were able to identify functionally relevant molecular hotspots characterised by copy number losses and promoter hypermethylation in distinct molecular subtypes of melanoma that contribute to specific transcriptomic silencing and might indicate a poor clinical outcome of melanoma.
Tárgyszavak:Orvostudományok Egészségtudományok idegen nyelvű folyóiratközlemény külföldi lapban
egyetemen (Magyarországon) készült közlemény
Megjelenés:PLoS One. - 8 : 1 (2013), p. e54958. -
További szerzők:Ecsedi Szilvia (1982-) (molekuláris biológus, genetikus) Tóth Réka Vízkeleti Laura (1984-) (molekuláris biológus, genetikus) Hernandez-Vargas, Hector Lázár Viktória (1981-) (molekuláris biológus) Emri Gabriella (1972-) (bőrgyógyász, allergológus, onkológus) Szatmári István (1971-) (biológus) Herceg Zdenko Ádány Róza (1952-) (megelőző orvostan és népegészségtan szakorvos) Balázs Margit (1952-) (sejtbiológus, molekuláris genetikus)
Pályázati támogatás:OTKA K75191
OTKA
TÁMOP 4.2.1/B-09/1/KONV-2010-0007
TÁMOP
Egészség- és Környezettudomány
TÁMOP-4.2.2.A-11/1/KONV-2012-0031
TÁMOP
A legnagyobb súlyú népbetegségek genetikai meghatározottsága a magyar populációban
Internet cím:DOI
Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
Borító:
Rekordok letöltése1