Találati lista | Tudóstér

001-es BibID:	BIBFORM088874
035-os BibID:	(cikkazonosító)e1009016 (WoS)000581778600004 (Scopus)85092684596
Első szerző:	Goda Katalin (biofizikus)
Cím:	Human ABCB1 with an ABCB11-like degenerate nucleotide binding site maintains transport activity by avoiding nucleotide occlusion / Goda Katalin, Dönmez-Cakil Yaprak, Tarapcsák Szabolcs, Szalóki Gábor, Szöllősi Dániel, Parveen Zahida, Türk Dóra, Szakács Gergely, Chiba Peter, Stockner Thomas
Dátum:	2020
ISSN:	1553-7390 1553-7404
Megjegyzések:	Several ABC exporters carry a degenerate nucleotide binding site (NBS) that is unable to hydrolyze ATP at a rate sufficient for sustaining transport activity. A hallmark of a degenerate NBS is the lack of the catalytic glutamate in the Walker B motif in the nucleotide binding domain (NBD). The multidrug resistance transporter ABCB1 (P-glycoprotein) has two canonical NBSs, and mutation of the catalytic glutamate E556 in NBS1 renders ABCB1 transport-incompetent. In contrast, the closely related bile salt export pump ABCB11 (BSEP), which shares 49% sequence identity with ABCB1, naturally contains a methionine in place of the catalytic glutamate. The NBD-NBD interfaces of ABCB1 and ABCB11 differ only in four residues, all within NBS1. Mutation of the catalytic glutamate in ABCB1 results in the occlusion of ATP in NBS1, leading to the arrest of the transport cycle. Here we show that despite the catalytic glutamate mutation (E556M), ABCB1 regains its ATP-dependent transport activity, when three additional diverging residues are also replaced. Molecular dynamics simulations revealed that the rescue of ATPase activity is due to the modified geometry of NBS1, resulting in a weaker interaction with ATP, which allows the quadruple mutant to evade the conformationally locked pre-hydrolytic state to proceed to ATP-driven transport. In summary, we show that ABCB1 can be transformed into an active transporter with only one functional catalytic site by preventing the formation of the ATP-locked pre-hydrolytic state in the non-canonical site.
Tárgyszavak:	Orvostudományok Elméleti orvostudományok idegen nyelvű folyóiratközlemény külföldi lapban folyóiratcikk Human ABCB1 transport nucleotide binding
Megjelenés:	Plos Genetics. - 16 : 10 (2020), p. 1-21. -
További szerzők:	Dönmez-Cakil, Yaprak Tarapcsák Szabolcs (1989-) (Molekuláris biológus) Szalóki Gábor (1986-) (molekuláris biológus) Szöllősi Dániel Parveen, Zahida Türk Dóra Szakács Gergely Chiba, Peter Stockner, Thomas
Pályázati támogatás:	K124815 NKFIH
Internet cím:	Szerző által megadott URL DOI Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
Borító:
Saját polcon:

001-es BibID:	BIBFORM109031
035-os BibID:	(cikkazonosító)e83976 (WoS)000932846100001 (Scopus)85147892491
Első szerző:	Gyöngy Zsuzsanna (molekuláris biológus)
Cím:	Nucleotide binding is the critical regulator of ABCG2 conformational transitions / Gyöngy Zsuzsanna, Mocsár Gábor, Hegedűs Éva, Stockner Thomas, Ritter Zsuzsanna, Homolya László, Schamberger Anita, Orbán Tamás I., Remenyik Judit, Szakacs Gergely, Goda Katalin
Dátum:	2023
ISSN:	2050-084X
Megjegyzések:	ABCG2 is an exporter-type ABC protein that can expel numerous chemically unrelated xeno- and endobiotics from cells. When expressed in tumor cells or tumor stem cells, ABCG2 confers multidrug resistance, contributing to the failure of chemotherapy. Molecular details orchestrating substrate translocation and ATP hydrolysis remain elusive. Here, we present methods to concomitantly investigate substrate and nucleotide binding by ABCG2 in cells. Using the conformation-sensitive antibody 5D3, we show that the switch from the inward-facing (IF) to the outward-facing (OF) conformation of ABCG2 is induced by nucleotide binding. IF-OF transition is facilitated by substrates, and hindered by the inhibitor Ko143. Direct measurements of 5D3 and substrate binding to ABCG2 indicate that the high-to-low affinity switch of the drug binding site coincides with the transition from the IF to the OF conformation. Low substrate binding persists in the post-hydrolysis state, supporting that dissociation of the ATP hydrolysis products is required to reset the high substrate affinity IF conformation of ABCG2.
Tárgyszavak:	Természettudományok Biológiai tudományok idegen nyelvű folyóiratközlemény külföldi lapban folyóiratcikk
Megjelenés:	eLife. - 12 (2023), p. 1-24. -
További szerzők:	Mocsár Gábor (1981-) (biofizikus) Hegedűs Éva (1978-) (biofizikus) Stockner, Thomas Ritter Zsuzsanna Homolya László Schamberger Anita Orbán Tamás I. Gálné Remenyik Judit (1965-) (kémia tanár, okleveles vegyész) Szakács Gergely Goda Katalin (1969-) (biofizikus)
Pályázati támogatás:	K124815 OTKA GINOP-2.2.1-15-2017-00079 GINOP HunProtEx 2018?1.2.1-NKP- 2018?00005 Egyéb RRF-2.3.1-21-2022-00015 Egyéb
Internet cím:	Szerző által megadott URL DOI Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
Borító:
Saját polcon: