CCL

Összesen 11 találat.
#/oldal:
Részletezés:
Rendezés:

1.

001-es BibID:BIBFORM079797
035-os BibID:(cikkazonosító)398 (WoS)000475910500002 (Scopus)85069472612
Első szerző:Csősz Éva (biokémikus, molekuláris biológus)
Cím:Analysis of networks of host proteins in the early time points following HIV transduction / Éva Csősz, Ferenc Tóth, Mohamed Mahdi, George Tsaprailis, Miklós Emri, József Tőzsér
Dátum:2019
ISSN:1471-2105
Megjegyzések:Background: Utilization of quantitative proteomics data on the network level is still a challenge in proteomics data analysis. Currently existing models use sophisticated, sometimes hard to implement analysis techniques. Our aim was to generate a relatively simple strategy for quantitative proteomics data analysis in order to utilize as much of the data generated in a proteomics experiment as possible. Results: In this study, we applied label-free proteomics, and generated a network model utilizing both qualitative, and quantitative data, in order to examine the early host response to Human Immunodeficiency Virus type 1 (HIV-1). A weighted network model was generated based on the amount of proteins measured by mass spectrometry, and analysis of weighted networks and functional sub-networks revealed upregulation of proteins involved in translation, transcription, and DNA condensation in the early phase of the viral life-cycle. Conclusion: A relatively simple strategy for network analysis was created and applied to examine the effect of HIV-1 on host cellular proteome. We believe that our model may prove beneficial in creating algorithms, allowing for both quantitative and qualitative studies of proteome change in various biological and pathological processes by quantitative mass spectrometry.
Tárgyszavak:Természettudományok Biológiai tudományok idegen nyelvű folyóiratközlemény külföldi lapban
folyóiratcikk
weighted network
quantitative proteomics
host response
HIV-1
Megjelenés:Bmc Bioinformatics. - 20 (2019), p. 1-18. -
További szerzők:Tóth Ferenc (1980-) (molekuláris biológus) Mahdi, Mohamed (1979-) (orvos, tudományos segédmunkatárs) Tsaprailis, George Emri Miklós (1962-) (fizikus) Tőzsér József (1959-) (molekuláris biológus, biokémikus, vegyész)
Pályázati támogatás:GINOP-2.3.3-15-2016-00020
GINOP
Bolyai János Kutatói Ösztöndíj
MTA
Felsőoktatási Intézményi Kiválósági Program
Egyéb
NKFI-6, 125238
Egyéb
NIEHS - ES06694
Egyéb
NIH/NCI - CA023074
Egyéb
NIH/NCRR - 1S10 RR028868-01
Egyéb
Internet cím:Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
DOI
Borító:

2.

001-es BibID:BIBFORM074272
Első szerző:Csősz Éva (biokémikus, molekuláris biológus)
Cím:Selected reaction monitoring as a versatile tool for biomarker discovery / Éva Csősz, Adrienne Csutak, Gergő Kalló, Miklós Emri, Péter Lábiscsák, Ildikó Márton, József Tőzsér
Dátum:2014
ISSN:0133-8455 2060-8152
Tárgyszavak:Orvostudományok Elméleti orvostudományok idézhető absztrakt
Megjelenés:Biokémia 38 : 3 (2014), p. 53. -
További szerzők:Csutak Adrienne (1971-) (szemész) Kalló Gergő (1989-) (molekuláris biológus) Emri Miklós (1962-) (fizikus) Lábiscsák Péter Márton Ildikó (1954-) (fogszakorvos) Tőzsér József (1959-) (molekuláris biológus, biokémikus, vegyész)
Pályázati támogatás:TÁMOP 4.2.4. A/2-11-1-2012-0001
TÁMOP
TÁMOP-4.2.2.A-11/1/KONV-2012-0045
TÁMOP
OTKA-105034
OTKA
Internet cím:Szerző által megadott URL
Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
Borító:

3.

001-es BibID:BIBFORM070452
035-os BibID:(cikkazonosító)e0177282 (WOS)000401672400034 (Scopus)85019396082
Első szerző:Csősz Éva (biokémikus, molekuláris biológus)
Cím:Proteomics investigation of OSCC-specific salivary biomarkers in a Hungarian population highlights the importance of identification of population-tailored biomarkers / Csősz Éva, Lábiscsák Péter, Kalló Gergő, Márkus Bernadett, Emri Miklós, Szabó Adrienn, Tar Ildikó, Tőzsér József, Kiss Csongor, Márton Ildikó
Dátum:2017
ISSN:1932-6203
Megjegyzések:Oral squamous cell carcinoma (OSCC) accounting for about 90% of malignant oral lesionsis the 6th most common malignancy worldwide. Diagnostic delay may contribute to dismalsurvival rate therefore, there is a need for developing specific and sensitive biomarkers toimprove early detection. Hungarian population occupies the top places of statistics regardingOSCC incidence and mortality figures therefore, we aimed at finding potential salivaryprotein biomarkers suitable for the Hungarian population. In this study we investigated 14proteins which were previously reported as significantly elevated in saliva of patients withOSCC. In case of IL-1?, IL-1?, IL-6, IL-8, TNF-? and VEGF a Luminex-based multiplex kitwas utilized and the salivary concentrations were determined. In case of catalase, profilin-1,S100A9, CD59, galectin-3-bindig protein, CD44, thioredoxin and keratin-19, SRM-basedtargeted proteomic method was developed and the relative amount of the proteins wasdetermined in the saliva of patients with OSCC and controls. After several rounds of optimizationand using stable isotope-containing peptides, we developed an SRM-based methodfor rapid salivary protein detection. The validation of the selected potential biomarkers byELISA revealed salivary protein S100A9 and IL-6 as useful protein biomarkers for OSCCdetection improving the diagnostic accuracy for OSCC in the Hungarian population.A noninvasivediagnostic method to detect biomarkers useful for the early diagnosis of OSCC wasdeveloped. This can be an attractive strategy in screening saliva samples collected in anation-wide multi-centric study in order to decrease morbidity, mortality, to enhance survivalrate and to improve quality of life. The heterogeneity of protein biomarkers found in differentethnic groups presented in the literature highlights the importance of identification of population-tailored protein biomarkers.
Tárgyszavak:Orvostudományok Klinikai orvostudományok idegen nyelvű folyóiratközlemény külföldi lapban
folyóiratcikk
OSCC
salivary biomarkers
Megjelenés:Plos One. - 12 : 5 (2017), p. 1-21. -
További szerzők:Lábiscsák Péter Kalló Gergő (1989-) (molekuláris biológus) Márkus Bernadett (1989-) (molekuláris biológus) Emri Miklós (1962-) (fizikus) Szabó Adrienn (1965-) (egyetemi tanársegéd, fogszakorvos) Tar Ildikó (1967-) (fogszakorvos) Tőzsér József (1959-) (molekuláris biológus, biokémikus, vegyész) Kiss Csongor (1956-) (hematológus, onkológus) Márton Ildikó (1954-) (fogszakorvos)
Pályázati támogatás:OTKA-105034
OTKA
4.2.2.D-15/1/KONV-2015-0016
TÁMOP
Internet cím:Szerző által megadott URL
DOI
Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
Borító:

4.

001-es BibID:BIBFORM095656
Első szerző:Kalló Gergő (molekuláris biológus)
Cím:Reduced Level of Tear Antimicrobial and Immunomodulatory Proteins as a Possible Reason for Higher Ocular Infections in Diabetic Patients / Gergő Kalló, Anita Katalin Varga, Judit Szabó, Miklós Emri, József Tőzsér, Adrienne Csutak, Éva Csősz
Dátum:2021
ISSN:2076-0817
Megjegyzések:(1) Background: Diabetes mellitus is one of the most common metabolic disorders and a risk factor for bacterial ocular infections. Our aim was to examine the antibacterial activity of tears from patients with diabetes mellitus with and without diabetic retinopathy and to link this activity to the level of tear proteins. (2) Methods: Non-stimulated basal tears were collected from 39 eyes of 35 subjects. The antibacterial activity of tear pools was tested against pathogenic Staphylococcus aureus ATCC 29213, Escherichia coli ATCC 26922 and Pseudomonas aeruginosa ATCC 27853 strains. The levels of 10 antimicrobial and immunomodulatory proteins were analyzed in the individual tear samples of the studied groups by SRM-based targeted mass spectrometry analysis. (3) Results: Disease stage-specific antimicrobial effect was observed in case of Staphylococcus aureus ATCC 29213 strain, and a non-disease specific inhibitory effect was observed in case of Pseudomonas aeruginosa ATCC 27853 strain. Changes in the levels of the studied antimicrobial and immunomodulatory proteins in the tears of the studied groups were also observed. (4) Conclusions: The higher ocular infection rate observed in diabetic patients may be the consequence of the decreased antimicrobial activity of tears possibly caused by the changes in the levels of antimicrobial and immunomodulatory proteins.
Tárgyszavak:Orvostudományok Elméleti orvostudományok idegen nyelvű folyóiratközlemény külföldi lapban
folyóiratcikk
tear
antimicrobial activity
diabetes mellitus
targeted mass spectrometry
ocular infection
antimicrobial and immunomodulatory protein
AMP
Megjelenés:Pathogens. - 10 : 7 (2021), p. 1-14. -
További szerzők:Varga Anita Katalin (1994-) (általános orvos) Szabó Judit (1963-) (szakorvos, klinikai mikrobiológus) Emri Miklós (1962-) (fizikus) Tőzsér József (1959-) (molekuláris biológus, biokémikus, vegyész) Csutak Adrienne (1971-) (szemész) Csősz Éva (1977-) (biokémikus, molekuláris biológus)
Pályázati támogatás:TÁMOP-4.2.2.A-11/1/KONV-2012-0045
TÁMOP
Proteomika, Szemészet Kutatócsoport
GINOP-2.3.3-15-2016-00020
GINOP
Internet cím:Szerző által megadott URL
DOI
Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
Borító:

5.

001-es BibID:BIBFORM075071
Első szerző:Kalló Gergő (molekuláris biológus)
Cím:Alterations in the chemical barrier components in tears of patients with Alzheimer's disease / Gergő Kalló, Miklós Emri, Zsófia Varga, József Tőzsér, Adrienne Csutak, Éva Csősz
Dátum:2015
ISBN:978 961 93879 1 7
Tárgyszavak:Orvostudományok Elméleti orvostudományok előadáskivonat
Megjelenés:Molecules of life : book of abstracts / ed. Janko Kos, Natasa Poklar Ulrih. - p. 259. -
További szerzők:Emri Miklós (1962-) (fizikus) Varga Zsófia (1970-) (pszichiáter) Tőzsér József (1959-) (molekuláris biológus, biokémikus, vegyész) Csutak Adrienne (1971-) (szemész) Csősz Éva (1977-) (biokémikus, molekuláris biológus)
Internet cím:Szerző által megadott URL
Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
Borító:

6.

001-es BibID:BIBFORM064300
035-os BibID:(cikkazonosító)e0158000 (WOS)000378212400066 (Scopus)84976863903
Első szerző:Kalló Gergő (molekuláris biológus)
Cím:Changes in the chemical barrier composition of tears in Alzheimer's disease reveal potential tear diagnostic biomarkers / Gergő Kalló, Miklós Emri, Zsófia Varga, Bernadett Ujhelyi, József Tőzsér, Adrienne Csutak, Éva Csősz
Dátum:2016
ISSN:1932-6203
Megjegyzések:Alzheimer's disease (AD) is one of the most common neurodegenerative diseases, with increasing prevalence affecting millions of people worldwide. Currently, only autopsy is able to confirm the diagnosis with a 100 % certainty, therefore, biomarkers from body fluids obtained by non-invasive means provide an attractive alternative for the diagnosis of Alzheimer`s disease. Global changes of the protein profile were examined by quantitative proteomics; firstly, electrophoresis and LC-MS/MS were used, thereafter, SRM-based targeted proteomics method was developed and applied to examine quantitative changes of tear proteins.Alterations in the tear flow rate, total tear protein concentration and composition of the chemical barrier specific to AD were demonstrated, and the combination of lipocalin-1, dermcidin, lysozyme-C and lacritin was shown to be a potential biomarker, with an 81 % sensitivity and 77 % specificity.
Tárgyszavak:Orvostudományok Elméleti orvostudományok idegen nyelvű folyóiratközlemény külföldi lapban
folyóiratcikk
chemical barrier
Alzheimer's disease
tear
proteomics
biomarker
quantitative mass spectrometry
SRM
Megjelenés:Plos One. - 11 : 6 (2016), p. 1-14. -
További szerzők:Emri Miklós (1962-) (fizikus) Varga Zsófia (1970-) (pszichiáter) Ujhelyi Bernadett (1981-) (szemész) Tőzsér József (1959-) (molekuláris biológus, biokémikus, vegyész) Csutak Adrienne (1971-) (szemész) Csősz Éva (1977-) (biokémikus, molekuláris biológus)
Pályázati támogatás:TÁMOP-4.2.2.A-11/1/KONV-2012-0045
TÁMOP
Proteomika, Szemészet Kutatócsoport
TÁMOP 4.2.4.A/2-11-1-2012-0001
TÁMOP
TÁMOP-4.2.2.D-15/1/KONV-2015-0016
TÁMOP
TÁMOP-4.2.2.B-15/1/KONV-2015-0001
TÁMOP
National Brain Research Program KTIA_13_NAP-A-II/3 ME
Egyéb
Astellas Pharma Ltd. Fellowship
Egyéb
Lajos Szodoray Postdoctoral Fellowship
Egyéb
Janos Bolyai Postdoctoral Fellowship
Egyéb
Internet cím:Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
DOI
Borító:

7.

001-es BibID:BIBFORM117816
035-os BibID:(cikkazonosító)380 (wos)001140375300001 (scopus)85181923454
Első szerző:Linkner Tamás Richárd
Cím:Comparative Analysis of Differential Cellular Transcriptome and Proteome Regulation by HIV-1 and HIV-2 Pseudovirions in the Early Phase of Infection / Linkner Tamás Richárd, Ambrus Viktor, Kunkli Balázs, Szojka Zsófia Ilona, Kalló Gergő, Csősz Éva, Kumar Ajneesh, Emri Miklós, Tőzsér József, Mahdi Mohamed
Dátum:2024
ISSN:1422-0067
Megjegyzések:In spite of the similar structural and genomic organization of human immunodeficiency viruses type 1 and 2 (HIV-1 and HIV-2), striking differences exist between them in terms of replication dynamics and clinical manifestation of infection. Although the pathomechanism of HIV-1 infection is well characterized, relatively few data are available regarding HIV-2 viral replication and its interaction with host-cell proteins during the early phase of infection. We utilized proteo-transcriptomic analyses to determine differential genome expression and proteomic changes induced by transduction with HIV-1/2 pseudovirions during 8, 12 and 26 h time-points in HEK-293T cells. We show that alteration in the cellular milieu was indeed different between the two pseudovirions. The significantly higher number of genes altered by HIV-2 in the first two time-points suggests a more diverse yet subtle effect on the host cell, preparing the infected cell for integration and latency. On the other hand, GO analysis showed that, while HIV-1 induced cellular oxidative stress and had a greater effect on cellular metabolism, HIV-2 mostly affected genes involved in cell adhesion, extracellular matrix organization or cellular differentiation. Proteomics analysis revealed that HIV-2 significantly downregulated the expression of proteins involved in mRNA processing and translation. Meanwhile, HIV-1 influenced the cellular level of translation initiation factors and chaperones. Our study provides insight into the understudied replication cycle of HIV-2 and enriches our knowledge about the use of HIV-based lentiviral vectors in general.
Tárgyszavak:Orvostudományok Elméleti orvostudományok idegen nyelvű folyóiratközlemény külföldi lapban
folyóiratcikk
Megjelenés:International Journal Of Molecular Sciences. - 25 : 1 (2024), p. 1-26. -
További szerzők:Ambrus Viktor Attila (1989-) (biotechnológus) Kunkli Balázs Szojka Zsófia (1991-) (molekuláris biológus) Kalló Gergő (1989-) (molekuláris biológus) Csősz Éva (1977-) (biokémikus, molekuláris biológus) Kumar, Ajneesh (1994-) (bioinformatikus) Emri Miklós (1962-) (fizikus) Tőzsér József (1959-) (molekuláris biológus, biokémikus, vegyész) Mahdi, Mohamed (1979-) (orvos, tudományos segédmunkatárs)
Pályázati támogatás:NKFI 125238
NKFIH
TKP2020-IKA-04
Egyéb
GINOP-2.3.3-15-2016-00020
GINOP
TKP2021-EGA-20
Egyéb
Internet cím:Szerző által megadott URL
DOI
Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
Borító:

8.

001-es BibID:BIBFORM098287
035-os BibID:(cikkazonosító)2207 (WoS)000727558700001 (Scopus)85117590051
Első szerző:Linkner Tamás Richárd
Cím:Cellular Proteo-Transcriptomic Changes in the Immediate Early-Phase of Lentiviral Transduction / Linkner Tamás Richárd, Ambrus Viktor, Kunkli Balázs, Szojka Zsófia Ilona, Kalló Gergő, Csősz Éva, Kumar Ajneesh, Emri Miklós, Tőzsér József, Mahdi Mohamed
Dátum:2021
ISSN:2076-2607
Tárgyszavak:Orvostudományok Elméleti orvostudományok idegen nyelvű folyóiratközlemény külföldi lapban
folyóiratcikk
Megjelenés:Microorganisms. - 9 : 11 (2021), p. 1-21. -
További szerzők:Ambrus Viktor Attila (1989-) (biotechnológus) Kunkli Balázs Szojka Zsófia (1991-) (molekuláris biológus) Kalló Gergő (1989-) (molekuláris biológus) Csősz Éva (1977-) (biokémikus, molekuláris biológus) Kumar, Ajneesh (1994-) (bioinformatikus) Emri Miklós (1962-) (fizikus) Tőzsér József (1959-) (molekuláris biológus, biokémikus, vegyész) Mahdi, Mohamed (1979-) (orvos, tudományos segédmunkatárs)
Pályázati támogatás:GINOP-2.3.3-15-2016-00020
GINOP
TKP2020-IKA-04
Egyéb
NKFI 125238
NKFIH
Internet cím:Szerző által megadott URL
DOI
Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
Borító:

9.

001-es BibID:BIBFORM064404
Első szerző:Márkus Bernadett (molekuláris biológus)
Cím:Fehérje alapú szájüregi laphámrák (OSCC) biomarkerek azonosítása az Észak-Alföldi régióban gyűjtött nyálmintákból / Jakob Bernadett, Csősz Éva, Tőzsér József, Emri Miklós, Szabó Adrienn, Redl Pál, Tar Ildikó, Kövér Zsanett, Olasz Lajos, Molnár Gyöngyi, Piffkó József, Barabás Péter, Barabás József, Márton Ildikó
Dátum:2016
Tárgyszavak:Orvostudományok Elméleti orvostudományok előadáskivonat
Megjelenés:17. Debreceni Fogászati Napok. - p. 98
További szerzők:Csősz Éva (1977-) (biokémikus, molekuláris biológus) Tőzsér József (1959-) (molekuláris biológus, biokémikus, vegyész) Emri Miklós (1962-) (fizikus) Szabó Adrienn (1965-) (egyetemi tanársegéd, fogszakorvos) Redl Pál (1953-) (szájsebész) Tar Ildikó (1967-) (fogszakorvos) Kövér Zsanett Olasz Lajos Molnár Gyöngyi Piffkó József Barabás Péter Barabás József Márton Ildikó (1954-) (fogszakorvos)
Internet cím:Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
Borító:

10.

001-es BibID:BIBFORM064407
Első szerző:Márkus Bernadett (molekuláris biológus)
Cím:A magyar populációban alkalmazható szájüregi laphámrák-specifikus nyál biomarkerek azonosítása tömegspektrometriás és immunológiai módszerek segítségével / Jakob Bernadett, Csősz Éva, Tőzsér József, Emri Miklós, Szabó Adrienn, Redl Pál, Tar Ildikó, Kövér Zsanett, Olasz Lajos, Molnár Gyöngyi, Piffkó József, Barabás Péter, Barabás József, Márton Ildikó
Dátum:2016
Tárgyszavak:Orvostudományok Elméleti orvostudományok előadáskivonat
Megjelenés:A Magyar Fogorvosok Egyesületének Árkövy Vándorgyűlése: Perspektívák a paro-implantológában és a komprehenzív fogászatban. - p. 66.
További szerzők:Csősz Éva (1977-) (biokémikus, molekuláris biológus) Tőzsér József (1959-) (molekuláris biológus, biokémikus, vegyész) Emri Miklós (1962-) (fizikus) Szabó Adrienn (1965-) (egyetemi tanársegéd, fogszakorvos) Redl Pál (1953-) (szájsebész) Tar Ildikó (1967-) (fogszakorvos) Kövér Zsanett Olasz Lajos Molnár Gyöngyi Piffkó József Barabás Péter Barabás József Márton Ildikó (1954-) (fogszakorvos)
Internet cím:Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
Borító:

11.

001-es BibID:BIBFORM101477
035-os BibID:(cikkazonosító)4534 (scopus)85128344596 (wos)000795409300001
Első szerző:Nokhoijav, Erdenetsetseg (kutatóorvos)
Cím:Metabolomic Analysis of Serum and Tear Samples from Patients with Obesity and Type 2 Diabetes Mellitus / Erdenetsetseg Nokhoijav, Andrea Guba, Ajneesh Kumar, Balázs Kunkli, Gergő Kalló, Miklós Káplár, Sándor Somodi, Ildikó Garai, Adrienne Csutak, Noémi Tóth, Miklós Emri, József Tőzsér, Éva Csősz
Dátum:2022
ISSN:1661-6596 1422-0067
Tárgyszavak:Orvostudományok Klinikai orvostudományok idegen nyelvű folyóiratközlemény külföldi lapban
folyóiratcikk
Megjelenés:International Journal Of Molecular Sciences. - 23 (2022), p. 1-19. -
További szerzők:Guba Andrea (1975-) (Okleveles vegyész) Kumar, Ajneesh (1994-) (bioinformatikus) Kunkli Balázs Kalló Gergő (1989-) (molekuláris biológus) Káplár Miklós (1965-) (belgyógyász, diabetológus) Somodi Sándor (1977-) (belgyógyász) Garai Ildikó (1966-) (radiológus) Csutak Adrienne (1971-) (szemész) Tóth Noémi (1992-) (orvos) Emri Miklós (1962-) (fizikus) Tőzsér József (1959-) (molekuláris biológus, biokémikus, vegyész) Csősz Éva (1977-) (biokémikus, molekuláris biológus)
Pályázati támogatás:GINOP-2.3.4-15-2016-00002
GINOP
GINOP-2.3.3-15-2016-00020
GINOP
FK134605
Other
Internet cím:Szerző által megadott URL
DOI
Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
Borító:
Rekordok letöltése1 
Corvina könyvtári katalógus v8.2.27 © 2023 Monguz kft. Minden jog fenntartva.