CCL

Összesen 9 találat.
#/oldal:
Részletezés:
Rendezés:

1.

001-es BibID:BIBFORM103565
035-os BibID:(Scopus)85137531133 (WoS)000849139400001
Első szerző:Aranyi Sándor Csaba (programtervező informatikus)
Cím:Topological dissimilarities of hierarchical resting networks in type 2 diabetes mellitus and obesity / Aranyi Sándor Csaba, Képes Zita, Nagy Marianna, Opposits Gábor, Garai Ildikó, Káplár Miklós, Emri Miklós
Dátum:2023
ISSN:0929-5313
Megjegyzések:Type 2 diabetes mellitus (T2DM) is reported to cause widespread changes in brain function, leading to cognitive impairments. Research using resting-state functional magnetic resonance imaging data already aims to understand functional changes in complex brain connectivity systems. However, no previous studies with dynamic causal modelling (DCM) tried to investigate large-scale effective connectivity in diabetes. We aimed to examine the differences in large-scale resting state networks in diabetic and obese patients using combined DCM and graph theory methodologies. With the participation of 70 subjects (43 diabetics, 27 obese), we used cross-spectra DCM to estimate connectivity between 36 regions, subdivided into seven resting networks (RSN) commonly recognized in the literature. We assessed group-wise connectivity of T2DM and obesity, as well as group differences, with parametric empirical Bayes and Bayesian model reduction techniques. We analyzed network connectivity globally, between RSNs, and regionally. We found that average connection strength was higher in T2DM globally and between RSNs, as well. On the network level, the salience network shows stronger total within-network connectivity in diabetes (8.07) than in the obese group (4.02). Regionally, we measured the most significant average decrease in the right middle temporal gyrus (-0.013 Hz) and the right inferior parietal lobule (-0.01 Hz) relative to the obese group. In comparison, connectivity increased most notably in the left anterior prefrontal cortex (0.01 Hz) and the medial dorsal thalamus (0.009 Hz). In conclusion, we find the usage of complex analysis of large-scale networks suitable for diabetes instead of focusing on specific changes in brain function.
Tárgyszavak:Orvostudományok Elméleti orvostudományok idegen nyelvű folyóiratközlemény külföldi lapban
folyóiratcikk
Type 2 diabetes mellitus
Obesity
Effective connectivity
Dynamic causal modelling
Graph theory
Megjelenés:Journal Of Computational Neuroscience. - 51 : 1 (2023), p. 71-86. -
További szerzők:Képes Zita (1991-) (orvos) Nagy Marianna (1987-) (orvosdiagnosztikai képalkotó) Opposits Gábor (1974-) (fizikus, szoftver fejlesztő) Garai Ildikó (1966-) (radiológus) Káplár Miklós (1965-) (belgyógyász, diabetológus) Emri Miklós (1962-) (fizikus)
Pályázati támogatás:2017-1.2.1-NKP-2017-00002
Egyéb
TKP2021-NKTA-34
Egyéb
GINOP-2.1.1-15-2015-00609
GINOP
Internet cím:Szerző által megadott URL
DOI
Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
Borító:

2.

001-es BibID:BIBFORM096526
Első szerző:Aranyi Sándor Csaba (programtervező informatikus)
Cím:Dynamic Causal Modeling Evaluation of Multidimensional Model Space Using High Performance Computing / Aranyi Sándor Csaba, Opposits Gábor, Nagy Marianna, Berényi Ervin, Emri Miklós
Dátum:2016
Tárgyszavak:Orvostudományok Elméleti orvostudományok előadáskivonat
könyvrészlet
orvosi képalkotás
neuroimaging
idegtudományok
agyi konnektivitás
Megjelenés:ESMRMB 33th Annual Scientific Meeting Abstract Book / ed. Cozzone, Patrick J.. - p. 99
További szerzők:Opposits Gábor (1974-) (fizikus, szoftver fejlesztő) Nagy Marianna (1987-) (orvosdiagnosztikai képalkotó) Berényi Ervin (1964-) (radiológus) Emri Miklós (1962-) (fizikus)
Internet cím:Szerző által megadott URL
Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
Borító:

3.

001-es BibID:BIBFORM095112
Első szerző:Aranyi Sándor Csaba (programtervező informatikus)
Cím:Characterizing Network Search Algorithms Developed for Dynamic Causal Modeling / Sándor Csaba Aranyi, Marianna Nagy, Gábor Opposits, Ervin Berényi, Miklós Emri
Dátum:2021
ISSN:1662-5196
Megjegyzések:Dynamic causal modeling (DCM) is a widely used tool to estimate the effective connectivity of specified models of a brain network. Finding the model explaining measured data is one of the most important outstanding problems in Bayesian modeling. Using heuristic model search algorithms enables us to find an optimal model without having to define a model set a priori. However, the development of such methods is cumbersome in the case of large model-spaces. We aimed to utilize commonly used graph theoretical search algorithms for DCM to create a framework for characterizing them, and to investigate relevance of such methods for single-subject and group-level studies. Because of the enormous computational demand of DCM calculations, we separated the model estimation procedure from the search algorithm by providing a database containing the parameters of all models in a full model-space. For test data a publicly available fMRI dataset of 60 subjects was used. First, we reimplemented the deterministic bilinear DCM algorithm in the ReDCM R package, increasing computational speed during model estimation. Then, three network search algorithms have been adapted for DCM, and we demonstrated how modifications to these methods, based on DCM posterior parameter estimates, can enhance search performance. Comparison of the results are based on model evidence, structural similarities and the number of model estimations needed during search. An analytical approach using Bayesian model reduction (BMR) for efficient network discovery is already available for DCM. Comparing model search methods we found that topological algorithms often outperform analytical methods for single-subject analysis and achieve similar results for recovering common network properties of the winning model family, or set of models, obtained by multi-subject family-wise analysis. However, network search methods show their limitations in higher level statistical analysis of parametric empirical Bayes. Optimizing such linear modeling schemes the BMR methods are still considered the recommended approach. We envision the freely available database of estimated model-spaces to help further studies of the DCM model-space, and the ReDCM package to be a useful contribution for Bayesian inference within and beyond the field of neuroscience.
Tárgyszavak:Orvostudományok Elméleti orvostudományok idegen nyelvű folyóiratközlemény külföldi lapban
folyóiratcikk
fMRI
dynamic causal modeling
search algorithm
network topology
model-space
Megjelenés:Frontiers in Neuroinformatics. - 15 (2021), p. 1-14. -
További szerzők:Nagy Marianna (1987-) (orvosdiagnosztikai képalkotó) Opposits Gábor (1974-) (fizikus, szoftver fejlesztő) Berényi Ervin (1964-) (radiológus) Emri Miklós (1962-) (fizikus)
Pályázati támogatás:2020-4.1.1-TKP2020
Egyéb
2017-1.2.1-NKP-2017-00002
Egyéb
Internet cím:Szerző által megadott URL
DOI
Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
Borító:

4.

001-es BibID:BIBFORM066041
Első szerző:Aranyi Sándor Csaba (programtervező informatikus)
Cím:Population-level Correction of Systematic Motion Artifacts in fMRI in Patients with Ischemic Stroke / Csaba Aranyi, Gábor Opposits, Marianna Nagy, Ervin Berényi, Csilla Vér, László Csiba, Péter Katona, Tamás Spisák, Miklós Emri
Dátum:2017
ISSN:1051-2284
Tárgyszavak:Orvostudományok Klinikai orvostudományok idegen nyelvű folyóiratközlemény külföldi lapban
motion correction
fMRI
Megjelenés:Journal of Neuroimaging. - 27 : 4 (2017), p. 397-408. -
További szerzők:Opposits Gábor (1974-) (fizikus, szoftver fejlesztő) Nagy Marianna (1987-) (orvosdiagnosztikai képalkotó) Berényi Ervin (1964-) (radiológus) Vér Csilla (1985-) (neurológus) Csiba László (1952-) (neurológus, pszichiáter) Katona Péter Spisák Tamás (1986-) (programtervező matematikus, informatikus) Emri Miklós (1962-) (fizikus)
Pályázati támogatás:KTIA_13_NAP-A-II/3
Egyéb
OTKA 109712
Egyéb
Internet cím:Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
Szerző által megadott
DOI
Borító:

5.

001-es BibID:BIBFORM103068
Első szerző:Nagy Marianna (orvosdiagnosztikai képalkotó)
Cím:Investigation of the applicabilityof brain atlas technique in patients with intracranial space occupying lesions / Nagy Marianna, Aranyi Csaba, Opposits Gábor, Spisák Tamás, Lánczi Levente István, Kovács Kázmér, Tarjányi Eszter, Berényi Ervin, Emri Miklós
Dátum:2016
Tárgyszavak:Orvostudományok Elméleti orvostudományok poszter
folyóiratcikk
Megjelenés:ESMRMB 33th Annual Scientific Meeting Abstract Book. - 2016 (2016), p. 102
További szerzők:Aranyi Sándor Csaba (1988-) (programtervező informatikus) Opposits Gábor (1974-) (fizikus, szoftver fejlesztő) Spisák Tamás (1986-) (programtervező matematikus, informatikus) Lánczi Levente (1990-) (általános orvos) Kovács Kázmér Tarjányi Eszter Berényi Ervin (1964-) (radiológus) Emri Miklós (1962-) (fizikus)
Internet cím:Szerző által megadott URL
Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
Borító:

6.

001-es BibID:BIBFORM086220
035-os BibID:(WoS)000535415100003 (Scopus)85091956719
Első szerző:Nagy Marianna (orvosdiagnosztikai képalkotó)
Cím:Effective connectivity differences in motor network during passive movement of paretic and non-paretic ankles in subacute stroke patients / Marianna Nagy, Csaba Aranyi, Gábor Opposits, Tamás Papp, Levente Lánczi, Ervin Berényi, Csilla Vér, László Csiba, Péter Katona, Tamás Spisák, Miklós Emri
Dátum:2020
ISSN:2167-8359
Tárgyszavak:Orvostudományok Elméleti orvostudományok idegen nyelvű folyóiratközlemény külföldi lapban
folyóiratcikk
Megjelenés:PeerJ. - 8 (2020), p. 1-22. -
További szerzők:Aranyi Sándor Csaba (1988-) (programtervező informatikus) Opposits Gábor (1974-) (fizikus, szoftver fejlesztő) Papp Tamás (1987-) (orvos) Lánczi Levente (1990-) (általános orvos) Berényi Ervin (1964-) (radiológus) Vér Csilla (1985-) (neurológus) Csiba László (1952-) (neurológus, pszichiáter) Katona Péter Spisák Tamás (1986-) (programtervező matematikus, informatikus) Emri Miklós (1962-) (fizikus)
Pályázati támogatás:2017-1.2.1-NKP-2017-00002
Egyéb
Internet cím:Szerző által megadott URL
DOI
Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
Borító:

7.

001-es BibID:BIBFORM095804
Első szerző:Opposits Gábor (fizikus, szoftver fejlesztő)
Cím:Automated procedure assessing the accuracy of HRCT-PET registration applied in functional virtual bronchoscopy / Gábor Opposits, Marianna Nagy, Zoltán Barta, Csaba Aranyi, Dániel Szabó, Attila Makai, Imre Varga, László Galuska, Lajos Trón, László Balkay, Miklós Emri
Dátum:2021
ISSN:2191-219X
Megjegyzések:Background: Bronchoscopy serves as direct visualisation of the airway. Virtual bronchoscopy provides similar visual information using a non-invasive imaging procedure(s). Early and accurate image-guided diagnosis requires the possible highest performance, which might be approximated by combining anatomical and functional imaging. This communication describes an advanced functional virtual bronchoscopic (fVB) method based on the registration of PET images to high-resolution diagnostic CT images instead of low-dose CT images of lower resolution obtained from PET/CT scans. PET/CT and diagnostic CT data were collected from 22 oncological patients to develop a computer-aided high-precision fVB. Registration of segmented images was performed using elastix. Results: For virtual bronchoscopy, we used an in-house developed segmentation method. The quality of low- and high-dose CT image registrations was characterised by expert's scoring the spatial distance of manually paired corresponding points and by eight voxel intensity-based (dis)similarity parameters. The distribution of (dis)similarity parameter correlating best with anatomic scoring was bootstrapped, and 95% confidence intervals were calculated separately for acceptable and insufficient registrations. We showed that mutual information (MI) of the eight investigated (dis)similarity parameters displayed the closest correlation with the anatomy-based distance metrics used to characterise the quality of image registrations. The 95% confidence intervals of the bootstrapped MI distribution were [0.15, 0.22] and [0.28, 0.37] for insufficient and acceptable registrations, respectively. In case of any new patient, a calculated MI value of registered low- and high-dose CT image pair within the [0.28, 0.37] or the [0.15, 0.22] interval would suggest acceptance or rejection, respectively, serving as an aid for the radiologist. Conclusion: A computer-aided solution was proposed in order to reduce reliance on radiologist's contribution for the approval of acceptable image registrations.
Tárgyszavak:Orvostudományok Elméleti orvostudományok idegen nyelvű folyóiratközlemény külföldi lapban
folyóiratcikk
Computed tomography
Diagnostics
Image registration
Image segmentation
Image-guided bronchoscopy
Megjelenés:EJNMMI Research. - 11 : 1 (2021), p. 1-13. -
További szerzők:Nagy Marianna (1987-) (orvosdiagnosztikai képalkotó) Barta Zoltán (1974-) (nukleáris medicina szakorvos) Aranyi Sándor Csaba (1988-) (programtervező informatikus) Szabó Dániel (1986-) (gépészmérnök) Makai Attila (1987-) (tüdőgyógyász szakorvos) Varga Imre (1960-) (tüdőgyógyász) Galuska László (1946-) (belgyógyász, izotópdiagnoszta) Trón Lajos (1941-) (biofizikus) Balkay László (1963-) (biofizikus) Emri Miklós (1962-) (fizikus)
Internet cím:Szerző által megadott URL
DOI
Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
Borító:

8.

001-es BibID:BIBFORM081500
Első szerző:Opposits Gábor (fizikus, szoftver fejlesztő)
Cím:Accuracy of Low Dose and Diagnostic CT Image Registration of Bronchial Tree for Virtual Bronchoscopy / G. Opposits, M. Nagy, Cs. Aranyi, M. Emri, L. Balkay
Dátum:2019
Megjegyzések:The aim of this study is to support medical experts to be able to make an order among large number of automatic registration. The experts could tackle with the most problematic cases due to the inaccuracy of automatic registration procedure in the vicinity of the bronchus to help virtual bronchoscopy (VB) systems. Functional images (e.g. PET) can be projected on the relevant part of the organ that is examined in VB systems. We collected cases where the difference between the time of low-dose (ldCT) and diagnostic CT (hdCT) was less than one year. Altogether 22 anonymous ldCT and hdCT studies were selected in this study. Based on the literature, a potential candidate for image registration was elastix. We applied a specific in-house developed application for image preprocessing, before the elastix registration. We tried to resolve the goodness of the entire registration process by visual judgment combining it with special numerical features. Numerical data include the mutual information, standardized mutual information, Kullback-Leibler entropy, cross correlation, L1norm, L2norm square. We found satisfying correlation between mutual information and visual judgment in the close vicintiy of airtree. We calculated confident intervals for MI of acceptable and rejected registrations about the mean values of it by bootstraping method: [0.27, 0.36], [0.13, 0.19].
Tárgyszavak:Orvostudományok Klinikai orvostudományok előadáskivonat
könyvrészlet
Megjelenés:2018 IEEE Nuclear Science Symposium and Medical Imaging Conference Proceedings (NSS/MIC). - p. 1-2. -
További szerzők:Nagy Marianna (1987-) (orvosdiagnosztikai képalkotó) Aranyi Sándor Csaba (1988-) (programtervező informatikus) Emri Miklós (1962-) (fizikus) Balkay László (1963-) (biofizikus)
Internet cím:Szerző által megadott URL
DOI
Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
Borító:

9.

001-es BibID:BIBFORM083375
Első szerző:Varga Zsófia (pszichiáter)
Cím:A Default Mode Network változásai az életkor függvényében / Varga Zsófia, Ferencz Ákos, Aranyi Sándor Csaba, Nagy Marianna, Opposits Gábor, Berényi Ervin, Emri Miklós, Schuller Péter, Szemán-Nagy Anita
Dátum:2016
ISBN:978-615-80241-2-9
Tárgyszavak:Bölcsészettudományok Pszichológiai tudományok előadáskivonat
könyvrészlet
DMN
alaphelyzeti hálózat
életkor és hálózati aktivitás
Megjelenés:Múlt és jelen összeér : A Magyar Pszichológiai Társaság XXV. Jubileumi Országos Tudományos Nagygyűlése : kivonatkötet / kiad. a Magyar Pszichológiai Társaság. - p. 97-98. -
További szerzők:Ferencz Ákos (1983-) (pszichiáter) Aranyi Sándor Csaba (1988-) (programtervező informatikus) Nagy Marianna (1987-) (orvosdiagnosztikai képalkotó) Opposits Gábor (1974-) (fizikus, szoftver fejlesztő) Berényi Ervin (1964-) (radiológus) Emri Miklós (1962-) (fizikus) Schuller Péter (1976-) (orvos) Szemán-Nagy Anita (1979-) (pszichológus, klinikai szakpszichológus)
Internet cím:Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
Borító:
Rekordok letöltése1