CCL

Összesen 6 találat.
#/oldal:
Részletezés:
Rendezés:

1.

001-es BibID:BIBFORM019931
Első szerző:Kovalevsky, Andrey Yu
Cím:Susceptibility of Potent Antiviral Inhibitor to Highly Drug Resistant Mutations D30N, I50V and L90M of HIV-1 Protease / Kovalevsky Andrey Yu., Tie Yunfeng, Liu Fengling, Boross Peter I., Wang Yuan-Fang, Leshchenko Sofiya, Ghosh Arun K., Harrison Robert W., Weber Irene T.
Dátum:2006
ISSN:0022-2623
Megjegyzések:The potent new antiviral inhibitor TMC-114 (UIC-94017) of HIV-1 protease (PR) has been studied with three PR variants containing single mutations D30N, I50V, and L90M, which provide resistance to the major clinical inhibitors. The inhibition constants (K(i)) of TMC-114 for mutants PR(D30N), PR(I50V), and PR(L90M) were 30-, 9-, and 0.14-fold, respectively, relative to wild-type PR. The molecular basis for the inhibition was analyzed using high-resolution (1.22-1.45 A) crystal structures of PR mutant complexes with TMC-114. In PR(D30N), the inhibitor has a water-mediated interaction with the side chain of Asn30 rather than the direct interaction observed in PR, which is consistent with the relative inhibition. Similarly, in PR(I50V) the inhibitor loses favorable hydrophobic interactions with the side chain of Val50. TMC-114 has additional van der Waals contacts in PR(L90M) structure compared to the PR structure, leading to a tighter binding of the inhibitor. The observed changes in PR structure and activity are discussed in relation to the potential for development of resistant mutants on exposure to TMC-114.
Tárgyszavak:Orvostudományok Gyógyszerészeti tudományok idegen nyelvű folyóiratközlemény külföldi lapban
Megjelenés:Journal Of Medicinal Chemistry. - 49 : 4 (2006), p. 1379-1387. -
További szerzők:Tie, Yunfeng Liu, Fengling Boross Péter (1972-) (biokémikus, vegyész) Wang, Yuan-Fang Leschenko, Sofiya Ghosh, Arun K. Harrison, Robert W. Weber, Irene T.
Internet cím:Szerző által megadott URL
DOI
Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
Borító:

2.

001-es BibID:BIBFORM001484
Első szerző:Sperka Tamás (biokémikus, vegyész, biológia-kémia szakos tanár)
Cím:Bovine leukemia virus protease : comparison with human T-lymphotropic virus and human immunodeficiency virus protease / Sperka T., Miklóssy G., Tie Y., Bagossi P., Zahuczky G., Boross P., Matuz K., Harrison R. W., Weber I., Tőzsér J.
Dátum:2007
Tárgyszavak:Orvostudományok Elméleti orvostudományok idegen nyelvű folyóiratközlemény külföldi lapban
Megjelenés:The Journal of General Virology 88 : 7 (2007), p. 2052-2063. -
További szerzők:Miklóssy Gabriella (1979-) (biológus, vegyész) Tie, Yunfeng Bagossi Péter (1966-2011) (biokémikus, vegyész) Zahuczky Gábor (1975-) (molekuláris biológus, biokémikus, vegyész) Boross Péter (1972-) (biokémikus, vegyész) Matúz Krisztina (1980-) (vegyész, biokémikus) Harrison, Robert W. Weber, Irene T. Tőzsér József (1959-) (molekuláris biológus, biokémikus, vegyész)
Internet cím:elektronikus változat
DOI
Borító:

3.

001-es BibID:BIBFORM040679
Első szerző:Tie, Yunfeng
Cím:Critical differences in HIV-1 and HIV-2 protease specificity for clinical inhibitors / Tie Yunfeng, Wang Yuan-Fang, Boross Peter I., Chiu Ting-Yi, Ghosh Arun K., Tozser Jozsef, Louis John M., Harrison Robert W., Weber Irene T.
Dátum:2012
ISSN:0961-8368
Megjegyzések:Clinical inhibitor amprenavir (APV) is less effective on HIV-2 protease (PR₂) than on HIV-1 protease (PR₁). We solved the crystal structure of PR₂ with APV at 1.5 Å resolution to identify structural changes associated with the lowered inhibition. Furthermore, we analyzed the PR₁ mutant (PR(1M) ) with substitutions V32I, I47V, and V82I that mimic the inhibitor binding site of PR₂. PR(1M) more closely resembled PR₂ than PR₁ in catalytic efficiency on four substrate peptides and inhibition by APV, whereas few differences were seen for two other substrates and inhibition by saquinavir (SQV) and darunavir (DRV). High resolution crystal structures of PR(1M) with APV, DRV, and SQV were compared with available PR₁ and PR₂ complexes. Val/Ile32 and Ile/Val47 showed compensating interactions with SQV in PR(1M) and PR₁, however, Ile82 interacted with a second SQV bound in an extension of the active site cavity of PR(1M). Residues 32 and 82 maintained similar interactions with DRV and APV in all the enzymes, whereas Val47 and Ile47 had opposing effects in the two subunits. Significantly diminished interactions were seen for the aniline of APV bound in PR₁ (M) and PR₂ relative to the strong hydrogen bonds observed in PR₁, consistent with 15- and 19-fold weaker inhibition, respectively. Overall, PR(1M) partially replicates the specificity of PR₂ and gives insight into drug resistant mutations at residues 32, 47, and 82. Moreover, this analysis provides a structural explanation for the weaker antiviral effects of APV on HIV-2.
Tárgyszavak:Orvostudományok Elméleti orvostudományok idegen nyelvű folyóiratközlemény külföldi lapban
Megjelenés:Protein Science. - 21 : 3 (2012), p. 339-350. -
További szerzők:Wang, Yuan-Fang Boross Péter (1972-) (biokémikus, vegyész) Chiu, Ting-Yi Ghosh, Arun K. Tőzsér József (1959-) (molekuláris biológus, biokémikus, vegyész) Louis, John M. Harrison, Robert W. Weber, Irene T.
Internet cím:Szerző által megadott URL
DOI
Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
Borító:

4.

001-es BibID:BIBFORM040678
Első szerző:Tie, Yunfeng
Cím:Molecular basis for substrate recognition and drug resistance from 1.1 to 1.6 A angstroms resolution crystal structures of HIV-1 protease mutants with substrate analogs / Tie Yunfeng, Boross Peter I., Wang Yuan-Fang, Gaddis Laquasha, Liu Fengling, Chen Xianfeng, Tozser Jozsef, Harrison Robert W., Weber Irene T.
Dátum:2005
ISSN:1742-464X
Megjegyzések:HIV-1 protease (PR) and two drug-resistant variants--PR with the V82A mutation (PR(V82A)) and PR with the I84V mutation (PR(I84V))--were studied using reduced peptide analogs of five natural cleavage sites (CA-p2, p2-NC, p6pol-PR, p1-p6 and NC-p1) to understand the structural and kinetic changes. The common drug-resistant mutations V82A and I84V alter residues forming the substrate-binding site. Eight crystal structures were refined at resolutions of 1.10-1.60 A. Differences in the PR-analog interactions depended on the peptide sequence and were consistent with the relative inhibition. Analog p6(pol)-PR formed more hydrogen bonds of P2 Asn with PR and fewer van der Waals contacts at P1' Pro compared with those formed by CA-p2 or p2-NC in PR complexes. The P3 Gly in p1-p6 provided fewer van der Waals contacts and hydrogen bonds at P2-P3 and more water-mediated interactions. PR(I84V) showed reduced van der Waals interactions with inhibitor compared with PR, which was consistent with kinetic data. The structures suggest that the binding affinity for mutants is modulated by the conformational flexibility of the substrate analogs. The complexes of PR(V82A) showed smaller shifts of the main chain atoms of Ala82 relative to PR, but more movement of the peptide analog, compared to complexes with clinical inhibitors. PR(V82A) was able to compensate for the loss of interaction with inhibitor caused by mutation, in agreement with kinetic data, but substrate analogs have more flexibility than the drugs to accommodate the structural changes caused by mutation. Hence, these structures help to explain how HIV can develop drug resistance while retaining the ability of PR to hydrolyze natural substrates.
Tárgyszavak:Orvostudományok Elméleti orvostudományok idegen nyelvű folyóiratközlemény külföldi lapban
Megjelenés:Febs Journal. - 272 : 20 (2005), p. 5265-5277. -
További szerzők:Boross Péter (1972-) (biokémikus, vegyész) Wang, Yuan-Fang Gaddis, Laquasha Liu, Fengling Chen, Xianfeng Tőzsér József (1959-) (molekuláris biológus, biokémikus, vegyész) Harrison, Robert W. Weber, Irene T.
Internet cím:Szerző által megadott URL
DOI
Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
Borító:

5.

001-es BibID:BIBFORM001504
Első szerző:Tie, Yunfeng
Cím:Atomic resolution crystal structures of HIV-1 protease and mutants V82A and I84V with saquinavir / Tie Y., Kovalevsky A. Y., Boross P., Wang Y. F., Ghosh A. K., Tozser J., Harrison R. W., Weber I. T.
Dátum:2007
Tárgyszavak:Orvostudományok Elméleti orvostudományok idegen nyelvű folyóiratközlemény külföldi lapban
Megjelenés:Proteins 67 : 1 (2007), p. 232-242. -
További szerzők:Kovalevsky, Andrey Yu Boross Péter (1972-) (biokémikus, vegyész) Wang, Yuan-Fang Ghosh, Arun K. Tőzsér József (1959-) (molekuláris biológus, biokémikus, vegyész) Harrison, Robert W. Weber, Irene T.
Internet cím:elektronikus változat
DOI
Borító:

6.

001-es BibID:BIBFORM001533
Első szerző:Wang, Yuan-Fang
Cím:Potent new antiviral compound shows similar inhibition and structural interactions with drug resistant mutants and wild type HIV-1 protease / Wang, Y. F., Tie, Y., Boross P. I., Tőzsér J., Ghosh, A. K., Harrison, R. W., Weber, I. T.,
Dátum:2007
Tárgyszavak:Orvostudományok Elméleti orvostudományok idegen nyelvű folyóiratközlemény külföldi lapban
Megjelenés:Journal of Medicinal Chemistry 50 : 18 (2007), p. 4509-4515. -
További szerzők:Tie, Yunfeng Boross Péter (1972-) (biokémikus, vegyész) Tőzsér József (1959-) (molekuláris biológus, biokémikus, vegyész) Ghosh, Arun K. Harrison, Robert W. Weber, Irene T.
Internet cím:elektronikus változat
DOI
Borító:
Rekordok letöltése1 
Corvina könyvtári katalógus v8.2.27 © 2023 Monguz kft. Minden jog fenntartva.