CCL

Összesen 5 találat.
#/oldal:
Részletezés:
Rendezés:

1.

001-es BibID:BIBFORM062130
Első szerző:Mahdi, Mohamed (orvos, tudományos segédmunkatárs)
Cím:Inhibition Profiling of Retroviral Protease Inhibitors Using an HIV-2 Modular System / Mohamed Mahdi, Zsófia Szojka, János András Mótyán, József Tőzsér
Dátum:2015
ISSN:1999-4915
Tárgyszavak:Orvostudományok Elméleti orvostudományok idegen nyelvű folyóiratközlemény külföldi lapban
HIV-2
protease
susceptibility
protease inhibitors
modular system
Megjelenés:Viruses. - 7 : 12 (2015), p. 6152-6162. -
További szerzők:Szojka Zsófia (1991-) (molekuláris biológus) Mótyán János András (1981-) (biokémikus, molekuláris biológus) Tőzsér József (1959-) (molekuláris biológus, biokémikus, vegyész)
Pályázati támogatás:TÁMOP-4.2.2.D-15/1/KONV-2015-0016
TÁMOP
TÁMOP 4.2.2.A-11/1/KONV-2012-0023 "VÉD-ELEM"
TÁMOP
Internet cím:Szerző által megadott URL
DOI
Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
Borító:

2.

001-es BibID:BIBFORM095389
Első szerző:Miczi Márió
Cím:Development of a Bio-Layer Interferometry-Based Protease Assay Using HIV-1 Protease as a Model / Márió Miczi, Ádám Diós, Beáta Bozóki, József Tőzsér, János András Mótyán
Dátum:2021
ISSN:1999-4915 1999-4915
Megjegyzések:first_page settings Open AccessArticle Development of a Bio-Layer Interferometry-Based Protease Assay Using HIV-1 Protease as a Model by Márió Miczi 1,2, Ádám Diós 2,3, Beáta Bozóki 1, József Tőzsér 1 [OrcID] and János András Mótyán 1,* [OrcID] 1 Department of Biochemistry and Molecular Biology, Faculty of Medicine, University of Debrecen, 4032 Debrecen, Hungary 2 Doctoral School of Molecular Cell and Immune Biology, University of Debrecen, 4032 Debrecen, Hungary 3 Department of Pediatrics, Faculty of Medicine, University of Debrecen, 4032 Debrecen, Hungary * Author to whom correspondence should be addressed. Academic Editor: Alan Rein Viruses 2021, 13(6), 1183; https://doi.org/10.3390/v13061183 (registering DOI) Received: 30 April 2021 / Revised: 9 June 2021 / Accepted: 19 June 2021 / Published: 21 June 2021 (This article belongs to the Special Issue In Memory of Stephen Oroszlan) Download PDF Browse Figures Citation Export Abstract Proteolytic enzymes have great significance in medicine and the pharmaceutical industry and are applied in multiple fields of life sciences. Therefore, cost-efficient, reliable and sensitive real-time monitoring methods are highly desirable to measure protease activity. In this paper, we describe the development of a new experimental approach for investigation of proteolytic enzymes. The method was designed by the combination of recombinant fusion protein substrates and bio-layer interferometry (BLI). The protease (PR) of human immunodeficiency virus type 1 (HIV-1) was applied as model enzyme to set up and test the method. The principle of the assay is that the recombinant protein substrates immobilized to the surface of biosensor are specifically cleaved by the PR, and the substrate processing can be followed by measuring change in the layer thickness by optical measurement. We successfully used this method to detect the HIV-1 PR activity in real time, and the initial rate of the signal decrease was found to be proportional to the enzyme activity. Substrates representing wild-type and modified cleavage sites were designed to study HIV-1 PR's specificity, and the BLI-based measurements showed differential cleavage efficiency of the substrates, which was proven by enzyme kinetic measurements. We applied this BLI-based assay to experimentally confirm the existence of extended binding sites at the surface of HIV-1 PR. We found the measurements may be performed using lysates of cells expressing the fusion protein, without primary purification of the substrate. The designed BLI-based protease assay is high-throughput-compatible and enables real-time and small-volume measurements, thus providing a new and versatile approach to study proteolytic enzymes.
Tárgyszavak:Orvostudományok Elméleti orvostudományok idegen nyelvű folyóiratközlemény külföldi lapban
folyóiratcikk
protease assay
protease
HIV-1
BLItz
human immunodeficiency virus
bio-layer interferometry
recombinant fluorescent protein substrate
specificity
substrate specificity
recombinant protein
Megjelenés:Viruses-Basel. - 13 : 6 (2021), p. 1-20. -
További szerzők:Diós Ádám (1994-) (molekuláris biológus) Bozóki Beáta (1986-) (molekuláris biológus) Tőzsér József (1959-) (molekuláris biológus, biokémikus, vegyész) Mótyán János András (1981-) (biokémikus, molekuláris biológus)
Pályázati támogatás:TKP2020-IKA-04
Egyéb
EFOP-3.6.3-VEKOP-16-2017-00009
EFOP
GINOP-2.3.2-15-2016-00044
GINOP
GINOP-2.3.2-15-2016-00015
GINOP
Internet cím:Szerző által megadott URL
DOI
Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
Borító:

3.

001-es BibID:BIBFORM103432
035-os BibID:(cikkazonosító)1888 (WOS)000856936200001 (Scopus)85138336056
Első szerző:Mótyán János András (biokémikus, molekuláris biológus)
Cím:Different Mutation Tolerance of Lentiviral (HIV-1) and Deltaretroviral (BLV and HTLV) Protease Precursors / Mótyán János András, Kassay Norbert, Matúz Krisztina, Tőzsér József
Dátum:2022
ISSN:1999-4915
Megjegyzések:The bovine leukemia virus (BLV) and the human T-lymphothropic viruses (HTLVs) are members of the deltaretrovirus genus of Retroviridae family. An essential event of the retroviral life cycle is the processing of the polyproteins by the viral protease (PR); consequently, these enzymes became important therapeutic targets of the anti-retroviral drugs. As compared to human immunodeficiency viruses (HIVs), the deltaretroviruses have a different replication strategy, as they replicate predominantly in the DNA form, by forcing the infected cell to divide, unlike HIV-1, which replicates mainly by producing a vast number of progeny virions and by reinfection. Due to bypassing the error-prone reverse transcription step of replication, the PRs of deltaretroviruses did not undergo such extensive evolution as HIV PRs and remained more highly conserved. In this work, we studied the abilities of wild-type and modified BLV, HTLV (type 1, 2 and 3), and HIV-1 PRs (fused to an N-terminal MBP tag) for self-processing. We designed a cleavage site mutant MBP-fused BLV PR precursor as well, this recombinant enzyme was unable for self-proteolysis, the MBP fusion tag decreased its catalytic efficiency but showed an unusually low Ki for the IB-268 protease inhibitor. Our results show that the HTLV and BLV deltaretrovirus PRs exhibit lower mutation tolerance as compared to HIV-1 PR, and are less likely to retain their activity upon point mutations at various positions, indicating a higher flexibility of HIV-1 PR in tolerating mutations under selective pressure.
Tárgyszavak:Orvostudományok Elméleti orvostudományok idegen nyelvű folyóiratközlemény külföldi lapban
folyóiratcikk
human T-lymphotropic virus
HTLV
BLV
retroviral protease
autoproteolysis
retrovirus
human immunodeficiency virus
HIV-1
protease
bovine leukemia virus
Megjelenés:Viruses-Basel. - 14 : 9 (2022), p. 1-17. -
További szerzők:Kassay Norbert (1988-) (biotechnológus) Matúz Krisztina (1980-) (vegyész, biokémikus) Tőzsér József (1959-) (molekuláris biológus, biokémikus, vegyész)
Pályázati támogatás:TKP2021-EGA-20
Egyéb
Internet cím:Szerző által megadott URL
DOI
Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
Borító:

4.

001-es BibID:BIBFORM094951
Első szerző:Mótyán János András (biokémikus, molekuláris biológus)
Cím:Specificity of the HIV-1 Protease on Substrates Representing the Cleavage Site in the Proximal Zinc-Finger of HIV-1 Nucleocapsid Protein / Mótyán János András, Miczi Márió, Stephen Oroszlan, Tőzsér József
Dátum:2021
ISSN:1999-4915 1999-4915
Megjegyzések:o explore the sequence context-dependent nature of the human immunodeficiency virus type 1 (HIV-1) protease's specificity and to provide a rationale for viral mutagenesis to study the potential role of the nucleocapsid (NC) processing in HIV-1 replication, synthetic oligopeptide substrates representing the wild-type and modified versions of the proximal cleavage site of HIV-1 NC were assayed as substrates of the HIV-1 protease (PR). The S1· substrate binding site of HIV-1 PR was studied by an in vitro assay using KIVKCF?NCGK decapeptides having amino acid substitutions of N17 residue of the cleavage site of the first zinc-finger domain, and in silico calculations were also performed to investigate amino acid preferences of S1· site. Second site substitutions have also been designed to produce "revertant" substrates and convert a non-hydrolysable sequence (having glycine in place of N17) to a substrate. The specificity constants obtained for peptides containing non-charged P1· substitutions correlated well with the residue volume, while the correlation with the calculated interaction energies showed the importance of hydrophobicity: interaction energies with polar residues were related to substantially lower specificity constants. Cleavable "revertants" showed one residue shift of cleavage position due to an alternative productive binding mode, and surprisingly, a double cleavage of a substrate was also observed. The results revealed the importance of alternative binding possibilities of substrates into the HIV-1 PR. The introduction of the "revertant" mutations into infectious virus clones may provide further insights into the potential role of NC processing in the early phase of the viral life-cycle.
Tárgyszavak:Orvostudományok Elméleti orvostudományok idegen nyelvű folyóiratközlemény külföldi lapban
folyóiratcikk
substrate specificity
retroviruses
nucleocapsid protein
nucleocapsid
viral proteins
specificity
viral proteases
human immunodeficiency virus
protease
HIV-1
Megjelenés:Viruses-Basel. - 13 : 6 (2021), p. 1-14. -
További szerzők:Miczi Márió Oroszlan, Stephen Tőzsér József (1959-) (molekuláris biológus, biokémikus, vegyész)
Pályázati támogatás:TKP2020-IKA-04
Egyéb
EFOP-3.6.3-VEKOP-16-2017-00009
EFOP
GINOP-2.3.2-15-2016-00044
GINOP
Internet cím:Szerző által megadott URL
DOI
Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
Borító:

5.

001-es BibID:BIBFORM012848
Első szerző:Tőzsér József (molekuláris biológus, biokémikus, vegyész)
Cím:Comparative Studies on Retroviral Proteases : Substrate Specificity / Tőzsér József
Dátum:2010
Tárgyszavak:Természettudományok Biológiai tudományok idegen nyelvű folyóiratközlemény külföldi lapban
Megjelenés:Viruses [electronic resource]. - 2 (2010), p. 147-165. -
Internet cím:Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
DOI
elektronikus változat
Borító:
Rekordok letöltése1