CCL

Összesen 8 találat.
#/oldal:
Részletezés:
Rendezés:

1.

001-es BibID:BIBFORM103835
035-os BibID:(scopus)85130054502 (wos)000796701700026 (cikkazonosító)8087
Első szerző:Bosire, Rosevalentine (biotechnológus)
Cím:Doxorubicin impacts chromatin binding of HMGB1, Histone H1 and retinoic acid receptor / Bosire Rosevalentine, Fadel Lina, Mocsár Gábor, Nánási Péter, Sen Pialy, Sharma Anshu Kumar, Naseem Muhammad Umair, Kovács Attila, Kugel Jennifer, Kroemer Guido, Vámosi György, Szabó Gábor
Dátum:2022
ISSN:2045-2322
Tárgyszavak:Orvostudományok Elméleti orvostudományok idegen nyelvű folyóiratközlemény külföldi lapban
folyóiratcikk
Megjelenés:Scientific Reports. - 12 : 1 (2022), p. 1-14. -
További szerzők:Fadel, Lina (1988-) (gyógyszerész) Mocsár Gábor (1981-) (biofizikus) Nánási Péter Pál ifj. (1987-) (sejtbiológus) Sen, Pialy Sharma, Anshu Kumar Naseem, Muhammad Umair (1993-) (biofizikus, molekuláris biológus) Kovács Attila (fizikus) Kugel, Jennifer Kroemer, Guido Vámosi György (1967-) (biofizikus) Szabó Gábor (1953-) (biofizikus)
Pályázati támogatás:GINOP-2.3.2-15-2016-00026
GINOP
NN129371
Egyéb
ANN135107
Egyéb
COST CA 15214
Egyéb
GINOP-2.3.2-15-2016-00044
GINOP
K128770
OTKA
Internet cím:Szerző által megadott URL
DOI
Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
Borító:

2.

001-es BibID:BIBFORM081867
035-os BibID:(cikkazonosító)e0224936 (WOS)000533881900018 (Scopus)85075250885
Első szerző:Bosire, Rosevalentine (biotechnológus)
Cím:Intercalation of small molecules into DNA in chromatin is primarily controlled by superhelical constraint / Rosevalentine Bosire, Péter Nánási Jr., László Imre, Beatrix Dienes, Árpád Szöőr, Anett Mázló, Attila Kovács, Ralf Seidel, György Vámosi, Gábor Szabó
Dátum:2019
ISSN:1932-6203
Megjegyzések:The restricted access of regulatory factors to their binding sites on DNA wrapped around the nucleosomes is generally interpreted in terms of molecular shielding exerted by nucleosomal structure and internucleosomal interactions. Binding of proteins to DNA often includes intercalation of hydrophobic amino acids into the DNA. To assess the role of constrained superhelicity in limiting these interactions, we studied the binding of small molecule intercalators to chromatin in close to native conditions by laser scanning cytometry. We demonstrate that the nucleosome-constrained superhelical configuration of DNA is the main barrier to intercalation. As a result, intercalating compounds are virtually excluded from the nucleosome-occupied regions of the chromatin. Binding of intercalators to extranucleosomal regions is limited to a smaller degree, in line with the existence of net supercoiling in the regions comprising linker and nucleosome free DNA. Its relaxation by inducing as few as a single nick per ~50 kb increases intercalation in the entire chromatin loop, demonstrating the possibility for long-distance effects of regulatory potential.
Tárgyszavak:Orvostudományok Elméleti orvostudományok idegen nyelvű folyóiratközlemény külföldi lapban
folyóiratcikk
Megjelenés:Plos One. - 14 : 11 (2019), p. e0224936. -
További szerzők:Nánási Péter Pál ifj. (1987-) (sejtbiológus) Imre László (1979-) (biológus) Dienes Beatrix (1972-) (élettanász, molekuláris biológus) Szöőr Árpád (1984-) (orvos) Türk-Mázló Anett (1989-) (molekuláris biológus) Kovács Attila (fizikus) Seidel, Ralf Vámosi György (1967-) (biofizikus) Szabó Gábor (1953-) (biofizikus)
Pályázati támogatás:GINOP-2.2.1-15-2017-00044
GINOP
K-128770
OTKA
COST-CA-1521
Egyéb
Stipendium Hungaricum
Egyéb
Internet cím:Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
DOI
Borító:

3.

001-es BibID:BIBFORM083358
035-os BibID:(Cikkazonosító)1107 (WOS)000562846500003 (Scopus)85078261936
Első szerző:Firouzi Niaki, Erfaneh
Cím:Interactions of Cisplatin and Daunorubicin at the Chromatin Level / Firouzi Niaki Erfaneh, Van Acker Thibaut, Imre László, Nánási Péter, Tarapcsák Szabolcs, Bacsó Zsolt, Vanhaecke Frank, Szabó Gábor
Dátum:2020
ISSN:2045-2322
Tárgyszavak:Orvostudományok Elméleti orvostudományok idegen nyelvű folyóiratközlemény külföldi lapban
folyóiratcikk
Megjelenés:Scientific Reports. - 10 : 1 (2020), p. 1-12. -
További szerzők:Van Acker, Thibaut Imre László (1979-) (biológus) Nánási Péter Pál ifj. (1987-) (sejtbiológus) Tarapcsák Szabolcs (1989-) (Molekuláris biológus) Bacsó Zsolt (1963-) (biofizikus) Vanhaecke, Frank Szabó Gábor (1953-) (biofizikus)
Pályázati támogatás:Richter Gedeon Talentum Fund
Egyéb
EFOP-3.6.3-VEKOP-16-2017-00009
EFOP
GINOP-2.3.2-15-2016-00044
GINOP
K128770
OTKA
COST CA 15214
Egyéb
Flemish Research Foundation FWO G017217N
Egyéb
Internet cím:Szerző által megadott URL
DOI
Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
Borító:

4.

001-es BibID:BIBFORM074760
035-os BibID:(WoS)000456709700016 (Scopus)85056716023
Első szerző:Hegedűs Éva (biofizikus)
Cím:Endogenous single-strand DNA breaks at RNA polymerase II promoters in Saccharomyces cerevisiae / Hegedűs Éva, Kókai Endre, Nánási Péter, Imre László, Halász László, Jossé Rozenn, Antunovics Zsuzsa, Webb Martin R., El Hage Aziz, Pommier Yves, Székvölgyi Lóránt, Dombrádi Viktor, Szabó Gábor
Dátum:2018
ISSN:0305-1048 1362-4962
Tárgyszavak:Orvostudományok Elméleti orvostudományok idegen nyelvű folyóiratközlemény külföldi lapban
folyóiratcikk
ssDNA breaks
Megjelenés:Nucleic Acids Research. - 46 : 20 (2018), p. 10649-10668. -
További szerzők:Kókai Endre (1971-) (biokémikus, biológus) Nánási Péter Pál ifj. (1987-) (sejtbiológus) Imre László (1979-) (biológus) Halász László (1989-) (molekuláris biológus) Jossé, Rozenn Antunovics Zsuzsa (1978-) (molekuláris biológus, genetikus) Webb, Martin R. El Hage, Aziz Pommier, Yves Székvölgyi Lóránt (1977-) (biofizikus, biokémikus, sejtbiológus) Dombrádi Viktor (1953-) (biokémikus) Szabó Gábor (1953-) (biofizikus)
Pályázati támogatás:K72762
OTKA
NK101337
OTKA
K128770
OTKA
4.2.2-08/1-2008-0015
TÁMOP
4.2.1/B09/1/KONV-2010-0007
TÁMOP
4.2.2.A-11/1/KONV2012-0023 "VÉD-ELEM"
TÁMOP
4.2.4. A/2-11-1-2012-0001
TÁMOP
GINOP-2.3.2-15-2016-00044
GINOP
GINOP-2.3.2-15-2016-00026
GINOP
NKFIH-ERC-HU-117670
NKFIH
GINOP-2.3.2-15-2016-00024
GINOP
Internet cím:Szerző által megadott URL
DOI
Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
Borító:

5.

001-es BibID:BIBFORM103651
035-os BibID:(cikkazonosító)109184 (scopus)85128192258 (wos)000793580100003
Első szerző:Imre László (biológus)
Cím:Nucleosome destabilization by polyamines / Imre Laszlo, Niaki Erfaneh Firouzi, Bosire Rosevalentine, Nanasi Peter Jr., Nagy Peter, Bacso Zsolt, Hamidova Nubar, Pommier Yves, Jordan Albert, Szabo Gabor
Dátum:2022
ISSN:0003-9861
Megjegyzések:The roles and molecular interactions of polyamines (PAs) in the nucleus are not fully understood. Here their effect on nucleosome stability, a key regulatory factor in eukaryotic gene control, is reported, as measured in agarose embedded nuclei of H2B-GFP expressor HeLa cells. Nucleosome stability was assessed by quantitative microscopy [1,2] in situ, in close to native state of chromatin, preserving the nucleosome constrained topology of the genomic DNA. A robust destabilizing effect was observed in the millimolar concentration range in the case of spermine, spermidine as well as putrescine, which was strongly pH and salt concentration-dependent, and remained significant also at neutral pH. The integrity of genomic DNA was not affected by PA treatment, excluding DNA break-elicited topological relaxation as a factor in destabilization. The binding of PAs to DNA was demonstrated by the displacement of ethidium bromide, both from deproteinized nuclear halos and from plasmid DNA. The possibility that DNA methylation patterns may be influenced by PA levels is contemplated in the context of gene expression and DNA methylation correlations identified in the NCI-60 panel-based CellMiner database: methylated loci in subsets of high-ODC1 cell lines and the dependence of PER3 DNA methylation on PA metabolism.
Tárgyszavak:Természettudományok Biológiai tudományok idegen nyelvű folyóiratközlemény külföldi lapban
folyóiratcikk
Megjelenés:Archives Of Biochemistry And Biophysics. - 722 (2022), p. 1-11. -
További szerzők:Niaki, Erfaneh Firouzi Bosire, Rosevalentine (1988-) (biotechnológus) Nánási Péter Pál ifj. (1987-) (sejtbiológus) Nagy Péter (1971-) (biofizikus) Bacsó Zsolt (1963-) (biofizikus) Hamidova, Nubar Pommier, Yves Jordan, Albert Szabó Gábor (1953-) (biofizikus)
Pályázati támogatás:K128770
OTKA
K138524
OTKA
COST
Egyéb
Internet cím:Szerző által megadott URL
DOI
Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
Borító:

6.

001-es BibID:BIBFORM072900
035-os BibID:(Cikkazonosító)12734 (WOS)000412491500006 (Scopus)85030764085
Első szerző:Imre László (biológus)
Cím:Nucleosome stability measured in situ by automated quantitative imaging / László Imre, Zoltán Simándi, Attila Horvath, György Fenyofalvi, Péter Nanasi Jr., Erfaneh Firouzi Niaki, Éva Hegedus, Zsolt Bacso, Urbain Weyemi, Rebekka Mauser, Juan Ausio, Albert Jeltsch, William Bonner, László Nagy, Hiroshi Kimura, Gábor Szabo
Dátum:2017
ISSN:2045-2322
Megjegyzések:Current approaches have limitations in providing insight into the functional properties of particular nucleosomes in their native molecular environment. Here we describe a simple and powerful method involving elution of histones using intercalators or salt, to assess stability features dependent on DNA superhelicity and relying mainly on electrostatic interactions, respectively, and measurement of the fraction of histones remaining chromatin-bound in the individual nuclei using histone type- or posttranslational modification- (PTM-) specific antibodies and automated, quantitative imaging. The method has been validated in H3K4me3 ChIP-seq experiments, by the quantitative assessment of chromatin loop relaxation required for nucleosomal destabilization, and by comparative analyses of the intercalator and salt induced release from the nucleosomes of different histones. The accuracy of the assay allowed us to observe examples of strict association between nucleosome stability and PTMs across cell types, differentiation state and throughout the cell-cycle in close to native chromatin context, and resolve ambiguities regarding the destabilizing effect of H2A.X phosphorylation. The advantages of the in situ measuring scenario are demonstrated via the marked effect of DNA nicking on histone eviction that underscores the powerful potential of topological relaxation in the epigenetic regulation of DNA accessibility.
Tárgyszavak:Orvostudományok Elméleti orvostudományok idegen nyelvű folyóiratközlemény külföldi lapban
folyóiratcikk
Fluorescence imaging
Nuclear organization
Epigenetics
Molekuláris Medicina
Megjelenés:Scientific Reports. - 7 : 1 (2017), p. 1-15. -
További szerzők:Simándi Zoltán (1984-) (Ph.D. hallgató, molekuláris biológus) Horváth Attila (1988-) (programtervező informatikus) Fenyőfalvi György Nánási Péter Pál ifj. (1987-) (sejtbiológus) Firouzi Niaki, Erfaneh Hegedűs Éva (1978-) (biofizikus) Bacsó Zsolt (1963-) (biofizikus) Weyemi, Urbain Mauser, Rebekka Ausio, Juan Jeltsch, Albert Bonner, William Nagy László (1966-) (molekuláris sejtbiológus, biokémikus) Kimura, Hiroshi Szabó Gábor (1953-) (biofizikus)
Pályázati támogatás:K72762
OTKA
NK101337
OTKA
TÁMOP-4.2.2-08/1-2008-0015
TÁMOP
TÁMOP-4.2.1/B-09/1/KONV-2010-0007
TÁMOP
I. ABC transzporterek; II. Magasabbrendű kromatinszerkezet
TÁMOP 4.2.2.A- 11/1/KONV-2012-0023 "VÉD-ELEM
TÁMOP
TÁMOP 4.2.4. A/2-11-1-2012-0001
TÁMOP
GINOP-2.3.2-15-2016-00044
GINOP
Internet cím:Szerző által megadott URL
DOI
Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
Borító:

7.

001-es BibID:BIBFORM085971
035-os BibID:(cikkazonosító)e0231223 (WOS)000536011400032 (Scopus)85083478527
Első szerző:Nánási Péter Pál ifj. (sejtbiológus)
Cím:Doxorubicin induces large-scale and differential H2A and H2B redistribution in live cells / Nánási Péter, Imre László, Firouzi Niaki Erfaneh, Bosire Rosevalentine, Mocsár Gábor, Türk-Mázló Anett, Ausio Juan, Szabó Gábor
Dátum:2020
ISSN:1932-6203
Megjegyzések:We observed prominent effects of doxorubicin (Dox), an anthracycline widely used in anticancer therapy, on the aggregation and intracellular distribution of both partners of the H2AH2B dimer, with marked differences between the two histones. Histone aggregation, assessed by Laser Scanning Cytometry via the retention of the aggregates in isolated nuclei, was observed in the case of H2A. The dominant effect of the anthracycline on H2B was its massive accumulation in the cytoplasm of the Jurkat leukemia cells concomitant with its disappearance from the nuclei, detected by confocal microscopy and mass spectrometry. A similar effect of the anthracycline was observed in primary human lymphoid cells, and also in monocyte-derived dendritic cells that harbor an unusually high amount of H2B in their cytoplasm even in the absence of Dox treatment. The nucleo-cytoplasmic translocation of H2B was not affected by inhibitors of major biochemical pathways or the nuclear export inhibitor leptomycin B, but it was completely diminished by PYR-41, an inhibitor with pleiotropic effects on protein degradation pathways. Dox and PYR-41 acted synergistically according to isobologram analyses of cytotoxicity. These large-scale effects were detected already at Dox concentrations that may be reached in the typical clinical settings, therefore they can contribute both to the anti-cancer mechanism and to the side-effects of this anthracycline.
Tárgyszavak:Orvostudományok Elméleti orvostudományok idegen nyelvű folyóiratközlemény külföldi lapban
folyóiratcikk
Megjelenés:Plos One. - 15 : 4 (2020), p. 1-23. -
További szerzők:Imre László (1979-) (biológus) Firouzi Niaki, Erfaneh Bosire, Rosevalentine (1988-) (biotechnológus) Mocsár Gábor (1981-) (biofizikus) Türk-Mázló Anett (1989-) (molekuláris biológus) Ausio, Juan Szabó Gábor (1953-) (biofizikus)
Pályázati támogatás:GINOP-2.3.3-15-2016-00020
GINOP
GINOP-2.3.2-15-2016-00044
GINOP
K128770
OTKA
COST EuroCellNet CA15214
Egyéb
Richter Gedeon Talentum Foundation
Egyéb
Stipendium Hungaricum, Tempus Public foundation
Egyéb
Internet cím:Szerző által megadott URL
DOI
Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
Borító:

8.

001-es BibID:BIBFORM085444
Első szerző:Nánási Péter Pál ifj. (sejtbiológus)
Cím:Breaking good : +1 nucleosome destabilizationby nicking / P. Nanasi, L. Imre, A. Horvath, L. Halasz, A. Szanto, H. Kimura, Székvölgyi Lóránt, L. Nagy, G. Szabo
Dátum:2017
ISSN:1742-464X
Tárgyszavak:Orvostudományok Klinikai orvostudományok idézhető absztrakt
folyóiratcikk
Megjelenés:Febs Journal. - 284 : Suppl. 1 (2017), p. 221. -
További szerzők:Imre László (1979-) (biológus) Horváth Attila (orvos) Halász László (1989-) (molekuláris biológus) Szántó Attila (1976-) (orvos, biokémikus) Kimura, Hiroshi Székvölgyi Lóránt (1977-) (biofizikus, biokémikus, sejtbiológus) Nagy László (1966-) (molekuláris sejtbiológus, biokémikus) Szabó Gábor (1953-) (biofizikus)
Pályázati támogatás:72762
OTKA
101337
OTKA
4.2.2.A-11/1/KONV-2012-0023
TÁMOP
4.2.4. A/2-11-1-2012-0001
TÁMOP
GINOP-2.3.2-15-2016-00044
GINOP
Internet cím:Szerző által megadott URL
DOI
Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
Borító:
Rekordok letöltése1 
Corvina könyvtári katalógus v8.2.27 © 2023 Monguz kft. Minden jog fenntartva.