CCL

Összesen 13 találat.
#/oldal:
Részletezés:
Rendezés:

1.

001-es BibID:BIBFORM111540
035-os BibID:(cikkazonosító)550 (Scopus)85160562825 (WoS)000997913000001
Első szerző:Ács-Szabó Lajos (biológus)
Cím:Disruption of the Schizosaccharomyces japonicus lig4 Disturbs Several Cellular Processes and Leads to a Pleiotropic Phenotype / Lajos Acs-Szabo, Laszlo Attila Papp, Szonja Takacs, Ida Miklos
Dátum:2023
ISSN:2309-608X
Megjegyzések:Gene targeting is a commonly used method to reveal the function of genes. Although it is an attractive tool for molecular studies, it can frequently be a challenge because its efficiency can be low and it requires the screening of a large number of transformants. Generally, these problems originate from the elevated level of ectopic integration caused by non-homologous DNA end joining (NHEJ). To eliminate this problem, NHEJ-related genes are frequently deleted or disrupted. Although these manipulations can improve gene targeting, the phenotype of the mutant strains raised the question of whether mutations have side effects. The aim of this study was to disrupt the lig4 gene in the dimorphic fission yeast, S. japonicus, and investigate the phenotypic changes of the mutant strain. The mutant cells have shown various phenotypic changes, such as increased sporulation on complete medium, decreased hyphal growth, faster chronological aging, and higher sensitivity to heat shock, UV light, and caffeine. In addition, higher flocculation capacity has been observed, especially at lower sugar concentrations. These changes were supported by transcriptional profiling. Many genes belonging to metabolic and transport processes, cell division, or signaling had altered mRNA levels compared to the control strain. Although the disruption improved the gene targeting, we assume that the lig4 inactivation can cause unexpected physiological side effects, and we have to be very careful with the manipulations of the NHEJ-related genes. To reveal the exact mechanisms behind these changes, further investigations are required.
Tárgyszavak:Természettudományok Biológiai tudományok idegen nyelvű folyóiratközlemény külföldi lapban
folyóiratcikk
Megjelenés:Journal of Fungi. - 9 : 5 (2023), p. 1-16. -
További szerzők:Papp László Attila (1986-) (genetikus) Takács Szonja Miklós Ida (1962-) (biológus)
Pályázati támogatás:OTKA-106172
OTKA
EFOP-3.6.1-16-2016-00022
EFOP
Internet cím:Szerző által megadott URL
DOI
Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
Borító:

2.

001-es BibID:BIBFORM105492
035-os BibID:(cikkazonosító)1023 (WoS)000901230500001 (Scopus)85144728412
Első szerző:Ács-Szabó Lajos (biológus)
Cím:New Strain of Cyphellophora olivacea Exhibits Striking Tolerance to Sodium Bicarbonate / Lajos Acs-Szabo, Laszlo Attila Papp, Hajnalka Csoma, Ida Miklos, Matthias Sipiczki
Dátum:2022
ISSN:1424-2818
Megjegyzések:The cyanobacterium strain Synechococcus cedrorum SAG 88.79 stock culture has fungal contamination stated by the Sammlung von Algenkulturen der Universität Göttingen itself. In this recent work, this particular fungal strain was isolated, identified, and morphologically characterised. The fungal strain AGSC12 belongs to the species Cyphellophora olivacea, with respect to the sequence similarity, phylogeny, and morphology of the strain. Colony morphology and growth capability were examined on SMA, EMMA, PDA, MEA, YEA, and YPA plates. Growth of the colonies was the most successful on YPA plates, followed by PDA and MEA containing plates. Surprisingly, the AGSC12 strain showed extreme tolerance to NaHCO3 , albeit it, is is considered a general fungistatic compound. Moreover, positive association between the AGSC12 and SAG 88.79 strains was revealed, as the SAG 88.79 strain always attained higher cell density in co-cultures with the fungus than in mono-cultures. Besides, a taxonomic note on the SAG 88.79 strain itself was also stated.
Tárgyszavak:Természettudományok Biológiai tudományok idegen nyelvű folyóiratközlemény külföldi lapban
folyóiratcikk
Cyphellophora
Cyanobacterium
Synechococcus
fungal phylogeny
sodium bicarbonate
microbial interaction
Megjelenés:Diversity. - 14 : 12 (2022), p. 1-17. -
További szerzők:Papp László Attila (1986-) (genetikus) Csoma Hajnalka (1979-) (biológus, szőlész-borász) Miklós Ida (1962-) (biológus) Sipiczki Mátyás (1948-) (biológus)
Pályázati támogatás:K-124417
OTKA
GINOP-2.2.1-15-2016-00029
GINOP
EFOP-3.6.1-16-2016-00022
EFOP
20428-3/2018
FIKP
2019-1.1.1-PIACI-KFI-2019-00228
Egyéb
Internet cím:Szerző által megadott URL
DOI
Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
Borító:

3.

001-es BibID:BIBFORM097369
035-os BibID:(cikkazonosító)864 (WoS)000715414500001 (Scopus)85118167505
Első szerző:Ács-Szabó Lajos (biológus)
Cím:Genome Comparisons of the Fission Yeasts Reveal Ancient Collinear Loci Maintained by Natural Selection / Acs-Szabo Lajos, Papp Laszlo Attila, Sipiczki Matthias, Miklos Ida
Dátum:2021
ISSN:2309-608X
Tárgyszavak:Természettudományok Biológiai tudományok idegen nyelvű folyóiratközlemény külföldi lapban
folyóiratcikk
Megjelenés:Journal of Fungi. - 7 : 10 (2021), p. 1-26. -
További szerzők:Papp László Attila (1986-) (genetikus) Sipiczki Mátyás (1948-) (biológus) Miklós Ida (1962-) (biológus)
Pályázati támogatás:EFOP-3.6.1-16-2016-00022
EFOP
20428-3/2018
FIKP
TKP2020-IKA-04
Egyéb
Internet cím:Szerző által megadott URL
DOI
Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
Borító:

4.

001-es BibID:BIBFORM076280
035-os BibID:(cikkazonosító)14629 (WOS)000446034000030 (Scopus)85054179467
Első szerző:Ács-Szabó Lajos (biológus)
Cím:Assembly of Schizosaccharomyces cryophilus chromosomes and their comparative genomic analyses revealed principles of genome evolution of the haploid fission yeasts / Ács-Szabó Lajos, Papp László Attila, Antunovics Zsuzsa, Sipiczki Matthias, Miklós Ida
Dátum:2018
ISSN:2045-2322
Megjegyzések:The fission yeast clade, which has a distinct life history from other yeasts, can provide important clues about evolutionary changes. To reveal these changes the large S. cryophilus supercontigs were assembled into chromosomes using synteny relationships and the conserved pericentromeric, subtelomeric genes. Togetherness of the supercontigs was confirmed by PCR. Investigation of the gene order revealed localisation of the rDNA arrays, more than 300 new conserved orthologues and proved that S. cryophilus supercontigs were mosaics of collinear blocks. PFGE analysis showed that size of the S. cryophilus chromosomes differ from the S. pombe chromosomes. Comparative genomic analyses of the newly assembled chromosomes confirmed that the closest relative of S. cryophilus was S. octosporus not just in sequence similarity but also in a structural way, and revealed that preservation of the conserved regions did not arise from the lower number of chromosomal rearrangements. Translocations were more typical in the closely related species, while the number of inversions increased with the phylogenetic distances. Our data suggested that sites of the chromosomal rearrangements were not random and often associated with repetitive sequences, structural- and nucleotide evolution might correlate. Chromosomal rearrangements of the fission yeasts compared to other lineages were also discussed.
Tárgyszavak:Természettudományok Biológiai tudományok idegen nyelvű folyóiratközlemény külföldi lapban
folyóiratcikk
Megjelenés:Scientific Reports. - 8 : 1 (2018), p. 1-12. -
További szerzők:Papp László Attila (1986-) (genetikus) Antunovics Zsuzsa (1978-) (molekuláris biológus, genetikus) Sipiczki Mátyás (1948-) (biológus) Miklós Ida (1962-) (biológus)
Pályázati támogatás:EFOP-3.6.1-16-2016-00022
EFOP
Internet cím:Szerző által megadott URL
DOI
Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
Borító:

5.

001-es BibID:BIBFORM110207
035-os BibID:(cikkazonosító)852 (Scopus)85156240803 (WoS)000978247400001
Első szerző:Csoma Hajnalka (biológus, szőlész-borász)
Cím:Characterization of Zygosaccharomyces lentus Yeast in Hungarian Botrytized Wines / Hajnalka Csoma, Lajos Acs-Szabo, László Attila Papp, Zoltán Kállai, Ida Miklós, Matthias Sipiczki
Dátum:2023
ISSN:2076-2607
Megjegyzések:Tokaj botrytized sweet wines are traditionally aged for several years in wood barrels or bottles. As they have significant residual sugar content, they are exposed to microbial contamination during ageing. Osmotolerant wine-spoilage yeasts are most commonly found in the Tokaj winegrowing region in the species Starmerella spp. and Zygosaccharomyces spp. For the first time, Z. lentus yeasts were isolated from post-fermented botrytized wines. Our physiological studies confirmed that these yeast strains are osmotolerant, with high sulphur tolerance and 8% v/v alcohol tolerance, and that they grow well at cellar temperature in acidic conditions. Low β-glucosidase and sulphite reductase activities were observed, whereas protease, cellulase, and α-arabinofuranosidase extracellular enzyme activities were not detected. Molecular biology analyses carried out by RFLP analysis of mtDNA revealed no remarkable differences between strains, while microsatellite-primed-PCR fingerprinting of the (GTG)5 microsatellite and examination of chromosomal pattern revealed considerable diversity. The fermentative vigour of the tested Z. lentus strains was found to be significantly lower compared to the control Saccharomyces cerevisiae (Lalvin EC1118). It can be concluded that Z. lentus is a potential spoilage yeast in oenology which may be responsible for the initiation of secondary fermentation of wines during ageing.
Tárgyszavak:Természettudományok Biológiai tudományok idegen nyelvű folyóiratközlemény külföldi lapban
folyóiratcikk
Zygosaccharomyces
spoilage yeast
botrytized wine
post-fermentation
Megjelenés:Microorganisms. - 11 : 4 (2023), p. 1-17. -
További szerzők:Ács-Szabó Lajos (1985-) (biológus) Papp László Attila (1986-) (genetikus) Kállai Zoltán (1986-) (biológus) Miklós Ida (1962-) (biológus) Sipiczki Mátyás (1948-) (biológus)
Pályázati támogatás:K-124417
NKFIH
Internet cím:Szerző által megadott URL
DOI
Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
Borító:

6.

001-es BibID:BIBFORM099493
035-os BibID:(cikkazonosító)1291 (WOS)000735291900001 (Scopus)85121586013
Első szerző:Papp László Attila (genetikus)
Cím:Insight into Yeast-Mycotoxin Relations / Papp László Attila, Horváth Enikő, Peles Ferenc, Pócsi István, Miklós Ida
Dátum:2021
ISSN:2077-0472
Tárgyszavak:Természettudományok Biológiai tudományok idegen nyelvű folyóiratközlemény külföldi lapban
folyóiratcikk
Fusarium
mycotoxin
yeast
Megjelenés:Agriculture-Basel. - 11 : 12 (2021), p. 1-13. -
További szerzők:Horváth Enikő (1987-) (biológus) Peles Ferenc (1979-) (mikrobiológia, élelmiszer-mikrobiológia, minőségügy) Pócsi István (1961-) (vegyész) Miklós Ida (1962-) (biológus)
Internet cím:Szerző által megadott URL
DOI
Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
Borító:

7.

001-es BibID:BIBFORM096053
Első szerző:Papp László Attila (genetikus)
Cím:Molecular and comparative genomic analyses reveal evolutionarily conserved and unique features of the Schizosaccharomyces japonicus mycelial growth and the underlying genomic changes / Papp László Attila, Ács-Szabó Lajos, Batta Gyula, Miklós Ida
Dátum:2021
ISSN:0172-8083
Megjegyzések:Fungal pathogens, from phytopathogenic fungus to human pathogens, are able to alternate between the yeast-like form and filamentous forms. This morphological transition (dimorphism) is in close connection with their pathogenic lifestyles and with their responses to changing environmental conditions. The mechanisms governing these morphogenetic conversions are still not fully understood. Therefore, we studied the filamentous growth of the less-known, non-pathogenic dimorphic fission yeast, S. japonicus, which belongs to an ancient and early evolved branch of the Ascomycota. Its RNA sequencing revealed that several hundred genes were up- or down-regulated in the hyphae compared to the yeast-phase cells. These genes belonged to different GO categories, confirming that mycelial growth is a rather complex process. The genes of transport- and metabolic processes appeared especially in high numbers among them. High expression of genes involved in glycolysis and ethanol production was found in the hyphae, while other results pointed to the regulatory role of the protein kinase A (PKA) pathway. The homologues of 49 S. japonicus filament-associated genes were found by sequence alignments also in seven distantly related dimorphic and filamentous species. The comparative genomic analyses between S. japonicus and the closely related but non-dimorphic S. pombe shed some light on the differences in their genomes. All these data can contribute to a better understanding of hyphal growth and those genomic rearrangements that underlie it.
Tárgyszavak:Természettudományok Biológiai tudományok idegen nyelvű folyóiratközlemény külföldi lapban
folyóiratcikk
Bioinformatic analysis
Dimorphism
Hyphae
Mycelial growth
Schizosaccharomyces japonicus
Transcriptional profiling
Megjelenés:Current Genetics. - 67 : 6 (2021), p. 953-968. -
További szerzők:Ács-Szabó Lajos (1985-) (biológus) Batta Gyula (1979-) (biológus) Miklós Ida (1962-) (biológus)
Pályázati támogatás:EFOP-3.6.1-16-2016-00022
EFOP
20428-3/2018
FIKP
K10172
OTKA
Internet cím:Szerző által megadott URL
DOI
Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
Borító:

8.

001-es BibID:BIBFORM093840
Első szerző:Papp László Attila (genetikus)
Cím:A modified culture medium and hyphae isolation method can increase quality of the RNA extracted from mycelia of a dimorphic fungal species / Papp László Attila, Ács-Szabó Lajos, Póliska Szilárd, Miklós Ida
Dátum:2021
ISSN:0172-8083
Tárgyszavak:Természettudományok Biológiai tudományok idegen nyelvű folyóiratközlemény külföldi lapban
folyóiratcikk
Megjelenés:Current Genetics. - 67 : 5 (2021), p. 823-830. -
További szerzők:Ács-Szabó Lajos (1985-) (biológus) Póliska Szilárd (1978-) (biológus) Miklós Ida (1962-) (biológus)
Pályázati támogatás:OTKA-106172
OTKA
EFOP-3.6.1-16-2016-00022
EFOP
20428-3/2018
FIKP
Internet cím:Szerző által megadott URL
DOI
Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
Borító:

9.

001-es BibID:BIBFORM081302
Első szerző:Papp László Attila (genetikus)
Cím:Expression pattern and phenotypic characterization of the mutant strain reveals target genes and processes regulated by pka1 in the dimorphic fission yeast Schizosaccharomyces japonicus / László Papp, Matthias Sipiczki, Ida Miklós
Dátum:2017
ISSN:0172-8083
Megjegyzések:The cAMP cascade plays an important role in several biological processes. Thus, study of its molecular details can contribute to a better understanding of these processes, treatment of diseases, or even finding antifungal drug targets. To gain further information about the PKA pathway, and its evolutionarily conserved and species-specific features, the central regulator pka1 gene, which encodes the cAMP-dependent protein kinase catalytic subunit, was studied in the less known haplontic, dimorphic fission yeast Schizosaccharomyces japonicus. Namely, this species belongs to a highly divergent phylogenetic branch of fungi. Furthermore, S. japonicus had only a single copy pka1 gene in contrast to the budding yeasts. Therefore, the pka1 deleted mutant was created, whose RNA sequencing and phenotypic studies revealed that the Pka1 regulated at least 373 genes, among them further kinases, phosphatases and transcriptional regulators. It regulated elongation of hyphae, cell size, aging and stress response. Furthermore, half of the pka1 target genes seemed to be conserved in Schizosaccharomyces pombe and S. japonicus. However, there were oppositely regulated genes in the two closely related species. The target genes suggest that this single gene must be able to fulfill all the functions of TPK1-3 of Saccharomyces cerevisiae. Thus, our results shed light on certain similarities and differences of the PKA pathway of S. japonicus compared to the budding yeasts and confirmed the multifunctionality of the pka1 gene, but further experiments are needed to prove its involvement in the metabolic processes and transport.
Tárgyszavak:Természettudományok Biológiai tudományok idegen nyelvű folyóiratközlemény külföldi lapban
folyóiratcikk
pka1
cAMP cascade
Protein kinase
RNA sequencing
Dimorphism
Schizosaccharomyces japonicus
Megjelenés:Current Genetics. - 63 : 3 (2017), p. 487-497. -
További szerzők:Sipiczki Mátyás (1948-) (biológus) Miklós Ida (1962-) (biológus)
Pályázati támogatás:OTKA K106172
OTKA
SROP-4.2.2.B-15/1/KONV-2015-0001
Egyéb
Internet cím:Szerző által megadott URL
DOI
Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
Borító:

10.

001-es BibID:BIBFORM060997
035-os BibID:(WOS)000345980600003 (Scopus)84913614417
Első szerző:Papp László Attila (genetikus)
Cím:Optimal conditions for mycelial growth of Schizosaccharomyces japonicus cells in liquid medium : it enables the molecular investigation of dimorphism / László Papp, Matthias Sipiczki, Imre J. Holb, Ida Miklós
Dátum:2014
ISSN:0749-503X
Megjegyzések:The non-pathogenic dimorphic fission yeast, Schizosaccharomyces japonicus, could be a suitable model organism for investigation of the genetic background of mycelial growth, as it has a haploid chromosome set and its genome is sequenced. Since earlier results have suggested that its morphological transition required solid substrates, but molecular biological experiments would require hyphae production in a liquid medium, we wanted to find circumstances which would enable hyphae production in liquid media. Several external conditions were investigated, but the strongest inducer was fetal bovine serum (FBS). Its positive effect could be hampered by heat and was dependent on pH, temperature and concentration of the serum. Other protein-containing compounds, such as peptone and bovine serum albumin or amino acids, proved to be ineffective or weak. Generally, the uninduced and induced mycelial growth of Sz. japonicus could be improved by lower external pH and higher temperature.
Tárgyszavak:Természettudományok Biológiai tudományok idegen nyelvű folyóiratközlemény külföldi lapban
folyóiratcikk
Schizosaccharomyces japonicus
Megjelenés:Yeast. - 31 : 12 (2014), 475-482. -
További szerzők:Sipiczki Mátyás (1948-) (biológus) Holb Imre (1973-) (agrármérnök) Miklós Ida (1962-) (biológus)
Internet cím:Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
DOI
Szerző által megadott URL
Borító:

11.

001-es BibID:BIBFORM054529
035-os BibID:(PMID)24699070
Első szerző:Sipiczki Mátyás (biológus)
Cím:Phylogenetic and comparative functional analysis of the cell-separation [alpha]-glucanase Agn1p in Schizosaccharomyces / Matthias Sipiczki, Anita Balazs, Aniko Monus, Laszlo Papp, Anna Horvath, Akos Sveiczer, Ida Miklos
Dátum:2014
ISSN:1350-0872 1465-2080
Tárgyszavak:Természettudományok Biológiai tudományok idegen nyelvű folyóiratközlemény külföldi lapban
Megjelenés:Microbiology (Reading, England). - 160 : 6 (2014), p. 1063-1074. -
További szerzők:Balázs Anita (1984-) (molekuláris biológus) Mónus Anikó Papp László Attila (1986-) (genetikus) Horváth Anna Sveiczer Ákos Miklós Ida (1962-) (biológus)
Internet cím:Szerző által megadott URL
DOI
Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
Borító:

12.

001-es BibID:BIBFORM106446
Első szerző:Vig Ildikó (biológus, molekuláris biológus)
Cím:The Schizosaccharomyces pombe cwf14 gene is evolutionarily conserved and involved in the TOR pathway / Ildikó Vig, Lajos Ács-Szabó, Zsigmond Benkő, László Attila Papp, Matthias Sipiczki, Ida Miklós
Dátum:2022
ISBN:978-963-490-468-7
Tárgyszavak:Természettudományok Biológiai tudományok előadáskivonat
könyvrészlet
Megjelenés:Biotechnology at the University of Debr ecen - 2022 International Symposium : Abstract Book. - p. 45. -
További szerzők:Ács-Szabó Lajos (1985-) (biológus) Benkő Zsigmond (1961-) (molekuláris biológus, genetikus) Papp László Attila (1986-) (genetikus) Sipiczki Mátyás (1948-) (biológus) Miklós Ida (1962-) (biológus)
Internet cím:Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
Borító:
Rekordok letöltése1 2 
Corvina könyvtári katalógus v8.2.27 © 2023 Monguz kft. Minden jog fenntartva.