CCL

Összesen 8 találat.
#/oldal:
Részletezés:
Rendezés:

1.

001-es BibID:BIBFORM120552
Első szerző:Bodnár Veronika
Cím:Aspergillus nidulans gfdB, Encoding the Hyperosmotic Stress Protein Glycerol-3-phosphate Dehydrogenase, Disrupts Osmoadaptation in Aspergillus wentii / Veronika Bodnár, Károly Antal, Ronald P. de Vries, István Pócsi,Tamás Emri
Dátum:2024
ISSN:2309-608X
Megjegyzések:The genome of the osmophilic Aspergillus wentii, unlike that of the osmotolerant Aspergillus nidulans, contains only the gfdA, but not the gfdB, glycerol 3-phosphate dehydrogenase gene. Here, we studied transcriptomic changes of A. nidulans (reference strain and ?gfdB gene deletion mutant) and A. wentii (reference strain and An-gfdB expressing mutant) elicited by high osmolarity. A. nidulans showed a canonic hyperosmotic stress response characterized by the upregulation of the trehalose and glycerol metabolism genes (including gfdB), as well as the genes of the high-osmolarity glycerol (HOG) map kinase pathway. The deletion of gfdB caused only negligible alterations in the transcriptome, suggesting that the glycerol metabolism was flexible enough to compensate for the missing GfdB activity in this species. A. wentii responded differently to increased osmolarity than did A. nidulans, e.g., the bulk upregulation of the glycerol and trehalose metabolism genes, along with the HOG pathway genes, was not detected. The expression of An-gfdB in A. wentii did not abolish osmophily, but it reduced growth and caused much bigger alterations in the transcriptome than did the missing gfdB gene in A. nidulans. Flexible glycerol metabolism and hence, two differently regulated gfd genes, may be more beneficial for osmotolerant (living under changing osmolarity) than for osmophilic (living under constantly high osmolarity) species.
Tárgyszavak:Természettudományok Biológiai tudományok idegen nyelvű folyóiratközlemény külföldi lapban
folyóiratcikk
Aspergillus nidulans
Aspergillus wentii
glycerol-3-phosphate dehydrogenase
hyperosmotic stress
RNA sequencing
Megjelenés:Journal of Fungi. - 10 : 4 (2024), p. 1-23. -
További szerzők:Antal Károly (1956-) (kémikus) De Vries, Ronald P. Pócsi István (1961-) (vegyész) Emri Tamás (1969-) (biológus)
Pályázati támogatás:NN125671
Egyéb
K131767
Egyéb
TKP2021-EGA-20
Egyéb
Internet cím:Szerző által megadott URL
DOI
Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
Borító:

2.

001-es BibID:BIBFORM108968
035-os BibID:(Scopus)85149207862 (WoS)000936466300001
Első szerző:Bodnár Veronika
Cím:Species-specifc effects of the introduction of Aspergillus nidulans gfdB in osmophilic aspergilli / Veronika Bodnár, Anita Király, Erzsébet Orosz, Márton Miskei, Tamás Emri, Zsolt Karányi, Éva Leiter, Ronald P. de Vries, István Pócsi
Dátum:2023
ISSN:0175-7598 1432-0614
Megjegyzések:Industrial fungi need a strong environmental stress tolerance to ensure acceptable efciency and yields. Previous studies shed light on the important role that Aspergillus nidulans gfdB, putatively encoding a NAD+-dependent glycerol-3-phosphate dehydrogenase, plays in the oxidative and cell wall integrity stress tolerance of this flamentous fungus model organism. The insertion of A. nidulans gfdB into the genome of Aspergillus glaucus strengthened the environmental stress tolerance of this xerophilic/osmophilic fungus, which may facilitate the involvement of this fungus in various industrial and environmental biotechnological processes. On the other hand, the transfer of A. nidulans gfdB to Aspergillus wentii, another promising industrial xerophilic/osmophilic fungus, resulted only in minor and sporadic improvement in environmental stress tolerance and meanwhile partially reversed osmophily. Because A. glaucus and A. wentii are phylogenetically closely related species and both fungi lack a gfdB ortholog, these results warn us that any disturbance of the stress response system of the aspergilli may elicit rather complex and even unforeseeable, species-specifc physiological changes. This should be taken into consideration in any future targeted industrial strain development projects aiming at the fortifcation of the general stress tolerance of these fungi.
Tárgyszavak:Természettudományok Biológiai tudományok idegen nyelvű folyóiratközlemény külföldi lapban
folyóiratcikk
Aspergillus nidulans
Aspergillus wentii
Aspergillus glaucus
Osmophily
Environmental stress
Oxidative stress tolerance
Megjelenés:Applied Microbiology And Biotechnology. - 107 : (2023), p. 2423-2436. -
További szerzők:Király Anita (1988-) (biológus) Orosz Erzsébet (1988-) (biológus) Miskei Márton (1978-) (molekuláris biológus, genetikus) Emri Tamás (1969-) (biológus) Karányi Zsolt (1961-) (biostatisztikus, bioinformatikus) Leiter Éva (1976-) (biológus) De Vries, Ronald P. Pócsi István (1961-) (vegyész)
Pályázati támogatás:EFOP-3.6.1-16-2016-00022
EFOP
NN125671
Egyéb
K131767
NKFIH
TKP2021-EGA-20
Egyéb
Internet cím:Szerző által megadott URL
DOI
Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
Borító:

3.

001-es BibID:BIBFORM067436
Első szerző:De Vries, Ronald P.
Cím:Comparative genomics reveals high biological diversity and specific adaptations in the industrially and medically important fungal genus Aspergillus / Ronald P. de Vries, Robert Riley, Ad Wiebenga, Guillermo Aguilar-Osorio, Sotiris Amillis, Cristiane Akemi Uchima, Gregor Anderluh, Mojtaba Asadollahi, Marion Askin, Kerrie Barry, Evy Battaglia, Özgür Bayram, Tiziano Benocci, Susanna A. Braus-Stromeyer, Camila Caldana, David Cánovas, Gustavo C. Cerqueira, Fusheng Chen, Wanping Chen, Cindy Choi, Alicia Clum, Renato Augusto Corrêa dos Santos, André Ricardo de Lima Damásio, George Diallinas, Tamás Emri, Erzsébet Fekete, Michel Flipphi, Susanne Freyberg, Antonia Gallo, Christos Gournas, Rob Habgood, Matthieu Hainaut, María Laura Harispe, Bernard Henrissat, Kristiina S. Hildén, Ryan Hope, Abeer Hossain, Eugenia Karabika, Levente Karaffa, Zsolt Karányi, Nada Kraševec, Alan Kuo, Harald Kusch, Kurt LaButti, Ellen L. Lagendijk, Alla Lapidus, Anthony Levasseur, Erika Lindquist, Anna Lipzen, Antonio F. Logrieco, Andrew MacCabe, Miia R. Mäkelä, Iran Malavazi, Petter Melin, Vera Meyer, Natalia Mielnichuk, Márton Miskei, Ákos P. Molnár, Giuseppina Mulé, Chew Yee Ngan, Margarita Orejas, Erzsébet Orosz, Jean Paul Ouedraogo, Karin M. Overkamp, Hee-Soo Park, Giancarlo Perrone, Francois Piumi, Peter J. Punt, Arthur F. J. Ram, Ana Ramón, Stefan Rauscher, Eric Record, Diego Mauricio Riaño-Pachón, Vincent Robert, Julian Röhrig, Roberto Ruller, Asaf Salamov, Nadhira S. Salih, Rob A. Samson, Erzsébet Sándor, Manuel Sanguinetti, Tabea Schütze, Kristina Sepčić, Ekaterina Shelest, Gavin Sherlock, Vicky Sophianopoulou, Fabio M. Squina, Hui Sun, Antonia Susca, Richard B. Todd, Adrian Tsang, Shiela E. Unkles, Nathalie van de Wiele, Diana van Rossen-Uffink, Juliana Velasco de Castro Oliveira, Tammi C. Vesth, Jaap Visser, Jae-Hyuk Yu, Miaomiao Zhou, Mikael R. Andersen, David B. Archer, Scott E. Baker, Isabelle Benoit, Axel A. Brakhage, Gerhard H. Braus, Reinhard Fischer, Jens C. Frisvad, Gustavo H. Goldman, Jos Houbraken, Berl Oakley, István Pócsi, Claudio Scazzocchio, Bernhard Seiboth, Patricia A. van Kuyk, Jennifer Wortman, Paul S. Dyer, Igor V. Grigoriev
Dátum:2017
ISSN:1474-760X
Tárgyszavak:Természettudományok Biológiai tudományok idegen nyelvű folyóiratközlemény külföldi lapban
folyóiratcikk
biological diversity
Megjelenés:Genome Biology. - 18 : 28 (2017), p. 1-45. -
További szerzők:Riley, Robert Wiebenga, Ad Aguilar-Osorio, Guillermo Amillis, Sotiris Akemi Uchima, Cristiane Anderluh, Gregor Asadollahi, Mojtaba Askin, Marion Barry, Kerrie Battaglia, Evy Bayram, Özgür Benocci, Tiziano Braus-Stromeyer, Susanna A. Caldana, Camila Cánovas, David Cerqueira, Gustavo C. Chen, Fusheng Chen, Wanping Choi, Cindy Clum, Alicia Corrêa dos Santos, Renato Augusto Lima Damásio, André Ricardo de Diallinas, George Emri Tamás (1969-) (biológus) Fekete Erzsébet (1975-) (biotechnológus, egyetemi tanár) Flipphi, Michel (1964-) Freyberg, Suzanne Gallo, Antonia Gournas, Christos Habgood, Rob Hainaut, Matthieu Harispe, María Laura Henrissat, Bernard Hildén, Kristiina S. Hope, Ryan Hossain, Abeer Karabika, Eugenia Karaffa Levente (1971-) (biotechnológus, egyetemi tanár) Karányi Zsolt (1961-) (biostatisztikus, bioinformatikus) Kraševec, Nada Kuo, Alan Kusch, Harald LaButti, Kurt Lagendijk, Ellen L. Lapidus, Alla Levasseur, Anthony Lindquist, Erika Lipzen, Anna Logrieco, Antonio F. MacCabe, Andrew Mäkelä, Miia R. Malavazi, Iran Melin, Petter Meyer, Vera Mielnichuk, Natalia Miskei Márton (1978-) (molekuláris biológus, genetikus) Molnár Ákos Péter (1988-) (okleveles biomérnök) Mulé, Giuseppina Ngan, Chew Yee Orejas, Margarita Orosz Erzsébet (1988-) (biológus) Ouedraogo, Jean Paul Overkamp, Karin M. Park, Hee-Soo Perrone, Giancarlo Piumi, Francois Punt, Peter J. Ram, Arthur F.J. Ramón, Ana Rauscher, Stefan Record, Eric Riaño-Pachón, Diego Mauricio Robert, Vincent Röhrig, Julian Ruller, Roberto Salamov, Asaf Salih, Nadhira S. Samson, Robert A. Karaffa Erzsébet Mónika (1972-) (mikrobiológus, egyetemi tanár) Sanguinetti, Manuel Schütze, Tabea Sepčić, Kristina Shelest, Ekaterina Sherlock, Gavin Sophianopoulou, Vicky Squina, Fabio M. Sun, Hui Susca, Antonia Todd, Richard B. Tsang, Adrian Unkles, Shiela E. Wiele, Nathalie van de Rossen-Uffink, Diana van Velasco de Castro Oliveira, Juliana Vesth, Tammi C. Visser, Jaap Yu Jae-Hyuk Zhou, Miaomiao Andersen, Mikael R. Archer, David Baker, Scott E. Benoit, Isabelle Brakhage, Axel A. Braus, Gerhard Fischer, Reinhard Frisvad, Jens Christian Goldman, Gustavo Houbraken, Jos Oakley, Berl R. Pócsi István (1961-) (vegyész) Scazzocchio, Claudio Seiboth, Bernhard Kuyk, Patricia A. van Wortman, Jennifer Russo Dyer, Paul S. Grigoriev, Igor V.
Pályázati támogatás:OTKA-K100464
OTKA
TÁMOP 4.2.1./B-09/1/KONV-2010-0007
TÁMOP
SROP-4.2.2.B-15/1/KONV-2015-0001
Egyéb
Internet cím:DOI
Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
Borító:

4.

001-es BibID:BIBFORM075758
035-os BibID:(WoS)000453040700002 (Scopus)85056237684
Első szerző:Emri Tamás (biológus)
Cím:Duplications and losses of genes encoding known elements of the stress defence system of the Aspergilli contribute to the evolution of these filamentous fungi but do not directly influence their environmental stress tolerance / T. Emri, K. Antal, R. Riley, Z. Karányi, M. Miskei, E. Orosz, S. E. Baker, A. Wiebenga, R. P. de Vries, I. Pócsi
Dátum:2018
ISSN:0166-0616
Tárgyszavak:Természettudományok Biológiai tudományok idegen nyelvű folyóiratközlemény külföldi lapban
folyóiratcikk
Megjelenés:Studies In Mycology. - 91 (2018), p. 23-36. -
További szerzők:Antal Károly (neurobiológus) Riley, Robert Karányi Zsolt (1961-) (biostatisztikus, bioinformatikus) Miskei Márton (1978-) (molekuláris biológus, genetikus) Orosz Erzsébet (1988-) (biológus) Baker, Scott E. Wiebenga, Ad De Vries, Ronald P. Pócsi István (1961-) (vegyész)
Pályázati támogatás:EFOP-3.6.1-16-2016-00022
EFOP
Internet cím:Szerző által megadott URL
DOI
Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
Borító:

5.

001-es BibID:BIBFORM076302
Első szerző:Kurucz Vivien (gyógyszerész)
Cím:Physiological background of the remarkably high Cd2+ tolerance of the Aspergillus fumigatus Af293 strain / Vivien Kurucz, Beáta Kiss, Zsuzsa M. Szigeti, Gábor Nagy, Erzsébet Orosz, Zoltán Hargitai, Sándor Harangi, Ad Wiebenga, Ronald P. de Vries, István Pócsi, Tamás Emri
Dátum:2018
ISSN:0233-111X
Tárgyszavak:Természettudományok Biológiai tudományok idegen nyelvű folyóiratközlemény külföldi lapban
Megjelenés:Journal Of Basic Microbiology. - 58 : 11 (2018), p. 957-967. -
További szerzők:Kiss Beáta (1984-) (biokémikus, molekuláris biológus) Máthéné Szigeti Zsuzsa (1976-) (biológus-ökológus) Szemán-Nagy Gábor (1975-) (biológia tanár-molekuláris biológus) Orosz Erzsébet (1988-) (biológus) Hargitai Zoltán Harangi Sándor (1987-) (vegyész) Wiebenga, Ad De Vries, Ronald P. Pócsi István (1961-) (vegyész) Emri Tamás (1969-) (biológus)
Pályázati támogatás:OTKA-112181
OTKA
119494
OTKA
TÁMOP-4.2.2.A-11/1/KONV-2012-0045
TÁMOP
Élettan Kutatócsoport
EFOP-3.6.1-16-2016-00022
EFOP
Internet cím:Szerző által megadott URL
DOI
Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
Borító:

6.

001-es BibID:BIBFORM072076
035-os BibID:(cikkazonosító)bay009 (WoS)000427197800001 (Scopus)85047302367
Első szerző:Orosz Erzsébet (biológus)
Cím:Fungal Stress Database (FSD) - a repository of fungal stress physiological data / Erzsébet Orosz, Nathalie van de Wiele, Tamás Emri, Miaomiao Zhou, Vincent Robert, Ronald P. de Vries, István Pócsi
Dátum:2018
ISSN:1758-0463
Megjegyzések:The construction of the Fungal Stress Database (FSD; http://www.fung-stress.org/) wasinitiated and fueled by two major goals. At first, some outstandingly important groups offilamentous fungi including the aspergilli possess remarkable capabilities to adapt to a widespectrum of environmental stress conditions but the underlying mechanisms of this stresstolerance have remained yet to be elucidated. Furthermore, the lack of any satisfactoryinterlaboratory standardization of stress assays, e.g. the widely used stress agar plateexperiments, often hinders the direct comparison and discussion of stress physiological datagained for various fungal species by different research groups. In order to overcome thesedifficulties and to promote multilevel, e.g. combined comparative physiology-based andcomparative genomics-based, stress research in filamentous fungi, we constructed FSD,which currently stores 1412 photos taken on Aspergillus colonies grown under preciselydefined stress conditions. This study involved altogether 18 Aspergillus strains representing17 species with two different strains for Aspergillus niger and covered six different stressconditions. Stress treatments were selected considering the frequency of various stresstolerance studies published in the last decade in the aspergilli and included oxidative (H2O2,menadione sodium bisulphite), high-osmolarity (NaCl, sorbitol), cell wall integrity (CongoRed) and heavy metal (CdCl2) stress exposures. In the future, we would like to expand thisdatabase to accommodate further fungal species and stress treatments.
Tárgyszavak:Természettudományok Biológiai tudományok idegen nyelvű folyóiratközlemény külföldi lapban
folyóiratcikk
stress database
aspergilli
oxidative stress
osmotic stress
cell wall integrity stress
heavy metal stress
Egészség- és Környezettudomány
Megjelenés:Database Online. - 2018 (2018), p. 1-6. -
További szerzők:Wiele, Nathalie van de Emri Tamás (1969-) (biológus) Zhou, Miaomiao Robert, Vincent De Vries, Ronald P. Pócsi István (1961-) (vegyész)
Pályázati támogatás:NKFIH K100464
Egyéb
NKFIH K119494
Egyéb
TÁMOP-4.2.1/B-09/1/KONV-2010-0007
TÁMOP
Mikrobiális genetika és genomika
Internet cím:Szerző által megadott URL
Szerző által megadott URL
DOI
Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
Borító:

7.

001-es BibID:BIBFORM089403
Első szerző:Pócsi István (vegyész)
Cím:The Aspergillus fumigatus Af293 strain has an unusually high cadmium tolerance among the Aspergilli / Pócsi István, Kurucz Vivien, Harangi Sándor, Ad Wiebenga, Ronald P. de Vries, Emri Tamás
Dátum:2018
Tárgyszavak:Természettudományok Biológiai tudományok előadáskivonat
könyvrészlet
Megjelenés:17th Symposium on remediation Abstract Book / Kothe E., Mertem D., Schäfer T. - p. 37
További szerzők:Kurucz Vivien (1987-) (gyógyszerész) Harangi Sándor (1987-) (vegyész) Wiebenga, Ad De Vries, Ronald P. Emri Tamás (1969-) (biológus)
Pályázati támogatás:NKFIH K112181
Egyéb
NKFIH K119494
Egyéb
Internet cím:Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
Borító:

8.

001-es BibID:BIBFORM018754
Első szerző:Wortman, Jennifer Russo
Cím:The 2008 update of the Aspergillus nidulans genome annotation : A community effort / Jennifer Russo Wortman, Jane Mabey Gilsenan, Vinita Joardar, Jennifer Deegan, John Clutterbuck, Mikael R. Andersen, David Archer, Mojca Bencina, Gerhard Braus, Pedro Coutinho, Hans von Döhren, John Doonan, Arnold J.M. Driessen, Pawel Durek, Eduardo Espeso, Erzsébet Fekete, Michel Flipphi, Carlos Garcia Estrada, Steven Geysens, Gustavo Goldman, Piet W.J. de Groot, Kim Hansen, Steven D. Harris, Thorsten Heinekamp, Kerstin Helmstaedt, Bernard Henrissat, Gerald Hofmann, Tim Homan, Tetsuya Horio, Hiroyuki Horiuchi, Steve James, Meriel Jones, Levente Karaffa, Zsolt Karányi, Masashi Kato, Nancy Keller, Diane E. Kelly, Jan A.K.W. Kiel, Jung-Mi Kim, Ida J. van der Klei, Frans M. Klis, Andriy Kovalchuk, Nada Kraševec, Christian P. Kubicek, Bo Liu, Andrew MacCabe, Vera Meyer, Pete Mirabito, Márton Miskei, Magdalena Mos, Jonathan Mullins, David R. Nelson, Jens Nielsen, Berl R. Oakley, Stephen A. Osmani, Tiina Pakula, Andrzej Paszewski, Ian Paulsen, Sebastian Pilsyk, István Pócsi, Peter J. Punt, F.J. Ram, Qinghu Ren, Xavier Robellet, Geoff Robson, Bernhard Seiboth, Piet van Solingen, Thomas Specht, Jibin Sun, Naimeh Taheri-Talesh, Norio Takeshita, Dave Ussery, Patricia A. van Kuyk, Hans Visser, Peter J.I. van de Vondervoort, Ronald P. de Vries, Jonathan Walton, Xin Xiang, Yi Xiong, An Ping Zeng, Bernd W. Brandt, Michael J. Cornell, Cees A.M.J.J. van den Hondely, Jacob Visser, Stephen G. Oliver, Geoffrey Turner
Dátum:2009
ISSN:1087-1845
Tárgyszavak:Természettudományok Biológiai tudományok idegen nyelvű folyóiratközlemény külföldi lapban
folyóiratcikk
Megjelenés:Fungal Genetics And Biology. - 46 : 1 (2009), p. 2-13. -
További szerzők:Gilsenan, Jane Mabey Joardar, Vinita Deegan, Jennifer Clutterbuck, John Andersen, Mikael R. Archer, David Bencina, Mojca Braus, Gerhard Coutinho, Pedro M. Döhren, Hans Von Doonan, John Driessen, Arnold J. M. Durek, Pawel Espeso, Eduardo Fekete Erzsébet (1975-) (biotechnológus, egyetemi tanár) Flipphi, Michel (1964-) Estrada, Carlos Garcia Geysens, Steven Goldman, Gustavo Groot, Piet W. J. de Hansen, Kim Harris, Steven D. Heinekamp, Thorsten Helmstaedt, Kerstin Henrissat, Bernard Hofmann, Gerald Homan, Tim Horio, Tetsuya Horiuchi, Hiroyuki James, Steve Jones, Meriel Karaffa Levente (1971-) (biotechnológus, egyetemi tanár) Karányi Zsolt (1961-) (biostatisztikus, bioinformatikus) Kato, Masashi Keller, Nancy Kelly, Diane E. Kiel, Jan A.K.W. Kim, Jung-Mi Klei, Ida J. van der Klis, Frans M. Kovalchuk, Andriy Kraševec, Nada Kubicek, Christian P. Liu, Bo MacCabe, Andrew Meyer, Vera Mirabito, Pete Miskei Márton (1978-) (molekuláris biológus, genetikus) Mos, Magdalena Mullins, Jonathan Nelson, David R. Nielsen, Jens Oakley, Berl R. Osmani, Stephen A. Pakula, Tiina Paszewski, Andrzej Paulsen, Ian Pilsyk, Sebastian Pócsi István (1961-) (vegyész) Punt, Peter J. Ram, Arthur F.J. Ren, Qinghu Robellet, Xavier Robson, Geoff Seiboth, Bernhard Solingen, Piet van Specht, Thomas Sun, Jibin Taheri-Talesh, Naimeh Takeshita, Norio Ussery, Dave Kuyk, Patricia A. van Visser, Hans Vondervoort, Peter J. I. van de De Vries, Ronald P. Walton, Jonathan Xiang, Xin Xiong, Yi Zeng, An Ping Brandt, Bernd W. Cornell, Michael J. Hondely, Cees A.M.J.J. van den Visser, Jacob Oliver, Stephen G. Turner, Geoffrey
Internet cím:DOI
Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
Borító:
Rekordok letöltése1