CCL

Összesen 21 találat.
#/oldal:
Részletezés:
Rendezés:

1.

001-es BibID:BIBFORM037999
Első szerző:Antunovics Zsuzsa (molekuláris biológus, genetikus)
Cím:Gradual genome stabilisation by progressive reduction of the Saccharo myces uvarum genome in an interspecific hybrid with Saccharomyces cerev isiae / Antunovics, Zs., Nguyen, H-V., Gaillardin C., Sipiczki M.
Dátum:2005
Tárgyszavak:Természettudományok Biológiai tudományok idegen nyelvű folyóiratközlemény külföldi lapban
Megjelenés:FEMS Yeast Research. - 12 : 5 (2005), p. 1141-1150. -
További szerzők:Nguyen, Huu-Vang Gaillardin, Claude Sipiczki Mátyás (1948-) (biológus)
Internet cím:Szerző által megadott URL
DOI
Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
Borító:

2.

001-es BibID:BIBFORM007753
Első szerző:Batta Gyula (biológus)
Cím:The involvement of the Schizosaccharomyces pombe sep9/spt8+ gene in the regulation of septum cleavage / Batta G., Szilagyi Z., Laczik M., Sipiczki M.
Dátum:2009
Tárgyszavak:Természettudományok Biológiai tudományok idegen nyelvű folyóiratközlemény külföldi lapban
Megjelenés:FEMS Yeast Research. - 9 (2009), p. 757-767. -
További szerzők:Szilágyi Zsolt (1975-) (biológus) Laczik Miklós (1985-) (bioinformatikus/molekuláris biológus) Sipiczki Mátyás (1948-) (biológus)
Internet cím:elektronikus változat
Borító:

3.

001-es BibID:BIBFORM081363
035-os BibID:(cikkazonosító)fow037
Első szerző:Bellasio, Martina
Cím:Complete genome sequence and transcriptome regulation of the pentose utilizing yeast Sugiyamaella lignohabitans / Martina Bellasio, Armin Peymann, Matthias G. Steiger, Minoska Valli, Matthias Sipiczki, Michael Sauer, Alexandra B. Graf, Hans Marx, Diethard Mattanovich
Dátum:2016
ISSN:1567-1356 1567-1364
Megjegyzések:Efficient conversion of hexoses and pentoses into value-added chemicals represents one core step for establishing economically feasible biorefineries from lignocellulosic material. While extensive research efforts have recently provided advances in the overall process performance, the quest for new microbial cell factories and novel enzymes sources is still open. As demonstrated recently the yeast Sugiyamaella lignohabitans (formerly Candida lignohabitans) represents a promising microbial cell factory for the production of organic acids from lignocellulosic hydrolysates. We report here the de novo genome assembly of S. lignohabitans using the Single Molecule Real-Time platform, with gene prediction refined by using RNA-seq. The sequencing revealed a 15.98 Mb genome, subdivided into four chromosomes. By phylogenetic analysis, Blastobotrys (Arxula) adeninivorans and Yarrowia lipolytica were found to be close relatives of S. lignohabitans. Differential gene expression was evaluated in typical growth conditions on glucose and xylose and allowed a first insight into the transcriptional response of S. lignohabitans to different carbon sources and different oxygenation conditions. Novel sequences for enzymes and transporters involved in the central carbon metabolism, and therefore of potential biotechnological interest, were identified. These data open the way for a better understanding of the metabolism of S. lignohabitans and provide resources for further metabolic engineering.
Tárgyszavak:Természettudományok Kémiai tudományok idegen nyelvű folyóiratközlemény külföldi lapban
folyóiratcikk
Sugiyamaella lignohabitans
complete genome sequence
RNA-Seq
SMRT sequencing
microbial cell factory
Megjelenés:FEMS Yeast Research. - 16 : 4 (2016), p. 1-14. -
További szerzők:Peymann, Armin Steiger, Matthias G. Valli, Minoska Sipiczki Mátyás (1948-) (biológus) Sauer, Michael Graf, Alexandra B. Marx, Hans Mattanovich, Diethard
Internet cím:Szerző által megadott URL
DOI
Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
Borító:

4.

001-es BibID:KLTEbibl002823
Első szerző:Benkő Zsigmond (molekuláris biológus, genetikus)
Cím:Pleiotropic caffeine resistant mutants / Benkő Zsigmond, Sipiczky Mátyás Mátyás
Dátum:1992
ISSN:0749-503X 1097-0061
Tárgyszavak:idegen nyelvű folyóiratközlemény külföldi lapban
Genetika
Megjelenés:Yeast. - 8 (1992), p. 317. -
További szerzők:Sipiczki Mátyás (1948-) (biológus)
Borító:

5.

001-es BibID:BIBFORM105800
035-os BibID:(WoS)000175122400002 (Scopus)0036224981
Első szerző:Bozsik Anikó
Cím:Marker construction and cloning of acut1-like sequence with ARS activity in the fission yeastSchizosaccharomyces japonicus / Aniko Bozsik, Z. Szilagyi, Z. Benko, M. Sipiczki
Dátum:2002
ISSN:0749-503X
Megjegyzések:The dimorphic fission yeast Schizosaccharomyces japonicus has proved to be an excellent experimental model for the investigation of the eukaryotic cell. Here we show that it has a haplontic life cycle, in which the diploid phase is confined to the zygote. To make it amenable to genetic and molecular analysis, we generated genetic markers and cloned a genomic sequence which acts as ars when integrated into a plasmid. Diploids suitable for testing complementation and recombination between markers can be formed by protoplast fusion. The complementation tests and the recombination frequencies determined in octads of spores identified 28 non-allelic groups (genes) of mutations of the auxotrophic and mycelium-negative mutants. Two groups of linked markers were also identified. The cloned fragment, which expresses ars activity, encodes a putative amino acid sequence highly similar to a conserved domain of proteins Cut1 (Schizosaccharomyces pombe), BimB (Aspergillus nidulans) and Esp1 (Saccharomyces cerevisiae).
Tárgyszavak:Természettudományok Biológiai tudományok idegen nyelvű folyóiratközlemény külföldi lapban
folyóiratcikk
fission yeast
dimorphism
auxotrophy
protoplast
octad
transformation
ars: Cut1
Megjelenés:Yeast. - 19 : 6 (2002), p. 485-498. -
További szerzők:Szilágyi Zsolt (1975-) (biológus) Benkő Zsigmond (1961-) (molekuláris biológus, genetikus) Sipiczki Mátyás (1948-) (biológus)
Internet cím:Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
DOI
Borító:

6.

001-es BibID:BIBFORM119607
035-os BibID:(Scopus)85187168868
Első szerző:Brysch-Herzberg, Michael
Cím:Reinstatement of the fission yeast speciesSchizosaccharomyces versatilisWickerham et Duprat,a sibling species ofSchizosaccharomyces japonicus / Michael Brysch-Herzberg, Guo-Song Jia, Matthias Sipiczki, Martin Seidel, Wen-Cai Zhang, Li-Lin Du
Dátum:2024
ISSN:0749-503X
Megjegyzések:Schizosaccharomyces japonicus Yukawa et Maki (1931) and Schizosaccharomyces versatilis Wickerham et Duprat (1945) have been treated as varieties of S. japonicus or as conspecific, based on various approaches including mating trials and nDNA/nDNA optical reassociation studies. However, the type strains of S. japonicus and S. versatilis differ by five substitutions (99.15% identity) and one 1-bp indel in the sequences of the D1/D2 domain of the 26S rRNA gene, and 23 substitutions (96.3% identity) and 31-bp indels in the sequences of internal transcribed spacer (ITS) of rRNA, suggesting that they may not be conspecific. To reassess their taxonomic status, we conducted mating trials and whole-genome analyses. Mating trials using the type strains showed a strong but incomplete prezygotic sterility barrier, yielding interspecies mating products at two orders of magnitude lower efficiency than intraspecies matings. These mating products, which were exclusively allodiploid hybrids, were unable to undergo the haplontic life cycle of the parents. We generated chromosome-level gap-less genome assemblies for both type strains. Whole genome sequences yielded an average nucleotide identity (ANI) of 86.4%, indicating clear separation of S. japonicus and S. versatilis. Based on these findings, we propose the reinstatement of S. versatilis as a distinct species (holotype strain: CBS 103T and ex-types: NRRL Y-1026, NBRC 1607, ATCC 9987, PYCC 7100; Mycobank no.: 847838).
Tárgyszavak:Természettudományok Biológiai tudományok idegen nyelvű folyóiratközlemény külföldi lapban
folyóiratcikk
genomic rearrangements
reproductive incompatibility
Schizosaccharomyces versatilis
species delimitation
Megjelenés:Yeast. - 41 : 3 (2024), p. 108-127. -
További szerzők:Jia, Guo-Song Sipiczki Mátyás (1948-) (biológus) Seidel, Martin Zhang, Wen-Cai Du, Li-Lin
Internet cím:Szerző által megadott URL
DOI
Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
Borító:

7.

001-es BibID:BIBFORM113641
035-os BibID:(Scopus)85160928751 (Wos)000994022100001
Első szerző:Brysch-Herzberg, Michael
Cím:Schizosaccharomyces lindneri sp. nov., a fission yeast occurring in honey / Michael Brysch?Herzberg, Guo?Song Jia, Matthias Sipiczki, Martin Seidel, Wen Li, Imen Assali, Li?Lin Du
Dátum:2023
ISSN:0749-503X
Megjegyzések:Two strains of fission yeast were isolated from honey. They differ from the type strain of Schizosaccharomyces octosporus by three substitutions in the D1/D2 domain of the nuclear 26S large subunit ribosomal RNA (rRNA) gene sequence, resulting in a 99.5% identity. In the internal transcribed spacer (ITS) region (consisting of ITS1, 5.8S rDNA, and ITS2), the strains differ from S. octosporus by 16 gaps and 91 substitutions, which is equivalent to an identity of 88.1%. Genome sequencing on one of the new strains revealed that the average nucleotide identity (ANI) between its genome and the reference genome of S. octosporus is 90.43% and there exist major genome rearrangements between the two genomes. Mating analysis revealed that S. octosporus and one of the new strains are completely reproductively separated. A strong prezygotic barrier exists and the few mating products consist of diploid hybrids that do not form recombinant ascospores. In the new strains, asci are either zygotic, arising from conjugation, or they develop without conjugation from asexual cells (azygotic). Compared to the currently recognized Schizosaccharomyces species, the spectrum of nutrients that are assimilated by the new strains is restricted. Of the 43 carbohydrates that were included in the physiological standard tests, only 7 were assimilated. According to the results of the genome sequence analysis, the mating trials, and the phenotypic characterization, the new species Schizosaccharomyces lindneri is described to accommodate the two strains (holotype: CBS 18203T and ex-type: MUCL 58363; MycoBank no.: MB 847838).
Tárgyszavak:Természettudományok Biológiai tudományok idegen nyelvű folyóiratközlemény külföldi lapban
folyóiratcikk
genomic rearrangements
hybridization
Schizosaccharomyces lindneri
taxogenomics
Megjelenés:Yeast. - 40 : 7 (2023), p. 237-253. -
További szerzők:Guo-Song, Jia Sipiczki Mátyás (1948-) (biológus) Seidel, Martin Li, Wen Assali, Imen Du, Li-Lin
Internet cím:Szerző által megadott URL
DOI
Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
Borító:

8.

001-es BibID:BIBFORM078528
035-os BibID:(cikkazonosító)foy021
Első szerző:Csoma Hajnalka (biológus, szőlész-borász)
Cím:Application of different markers and data-analysis tools to the examination of biodiversity can lead to different results : a case study with Starmerella bacillaris (synonym Candida zemplinina) strains / Hajnalka Csoma, Lajos Ács-Szabó, László Attila Papp, Matthias Sipiczki
Dátum:2018
ISSN:1567-1364
Megjegyzések:Starmerella bacillaris (Candida zemplinina) is a genetically heterogeneous species. In this work, the diversity of 41 strains of various origins is examined and compared by the analysis of the length polymorphism of nuclear microsatellites and the RFLP of mitochondrial genomes. The band patterns are analysed with UPGMA, neighbor joining, neighbor net, minimum spanning tree and non-metric MDS algorithms. The results and their comparison to previous analyses demonstrate that different markers and different clustering methods can result in very different groupings of the same strains. The observed differences between the topologies of the dendrograms also indicate that the positions of the strains do not necessarily reflect their real genetic relationships and origins. The possibilities that the differences might be partially due to different sensitivity of the markers to environmental factors (selection pressure) and partially to the different grouping criteria of the algorithms are also discussed.
Tárgyszavak:Természettudományok Biológiai tudományok idegen nyelvű folyóiratközlemény külföldi lapban
folyóiratcikk
Candida zemplinina
mtDNA
microsatellite markers
strain biodiversity
RFLP-mtDNA
Megjelenés:FEMS Yeast Research. - 18 : 5 (2018), p. 1-12. -
További szerzők:Ács-Szabó Lajos (1985-) (biológus) Papp László Attila (1986-) (genetikus) Sipiczki Mátyás (1948-) (biológus)
Internet cím:Szerző által megadott URL
DOI
Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
Borító:

9.

001-es BibID:BIBFORM007750
Első szerző:Csoma Hajnalka (biológus, szőlész-borász)
Cím:Taxonomic reclassification of Candida stellata strains reveals frequent occurrence of Candida zemplinina in wine fermentation / Csoma H., Sipiczki M.
Dátum:2008
Tárgyszavak:Természettudományok Biológiai tudományok idegen nyelvű folyóiratközlemény külföldi lapban
Megjelenés:FEMS Yeast Research. - 8 (2008), p. 328-336. -
További szerzők:Sipiczki Mátyás (1948-) (biológus)
Internet cím:elektronikus változat
Borító:

10.

001-es BibID:BIBFORM007752
Első szerző:Farkas Vladimir
Cím:Secondary cell wall formation in Cryptococcus neoformans as a rescue mechanism against acid-induced autolysis / Farkas V., Takeo K., Mecekova D., Ohkusu M., Yoshida S., Sipiczki M.
Dátum:2009
Tárgyszavak:Természettudományok Biológiai tudományok idegen nyelvű folyóiratközlemény külföldi lapban
Megjelenés:FEMS Yeast Research. - 9 (2009), p. 311-320. -
További szerzők:Takeo Kanji Mecekova, Danka Ohkusu Misako Yoshida, Soichi Sipiczki Mátyás (1948-) (biológus)
Internet cím:elektronikus változat
Borító:

11.

001-es BibID:BIBFORM040305
Első szerző:Grallert Ágnes (genetikus)
Cím:Eleven novelsep genes ofSchizosaccharomyces pombe required for efficient cell separation and sexual differentiation / A. Grallert, B. Grallert, E. Zilahi, Z. Szilagyi, M. Sipiczki
Dátum:1999
ISSN:0749-503X
Tárgyszavak:Természettudományok Biológiai tudományok idegen nyelvű folyóiratközlemény külföldi lapban
Megjelenés:Yeast. - 15 : 8 (1999), p. 669-686. -
További szerzők:Grallert Beáta Zilahi Erika (1964-) (molekuláris biológus) Szilagyi Z. Sipiczki Mátyás (1948-) (biológus)
Internet cím:Szerző által megadott URL
DOI
Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
Borító:

12.

001-es BibID:BIBFORM085691
Első szerző:Miklós Ida (biológus)
Cím:Analysis of transcriptional profiles of S. pombe sep10 and sep15 mutant strains, which encode subunits of the Mediator complex / Ida Miklos, Zsolt Szilagyi, Zsigmond Benko, Klara Enczi, Gyula Batta, Matthias Sipiczki, Jurg Bahler
Dátum:2005
ISSN:0749-503X
Tárgyszavak:Természettudományok Biológiai tudományok idézhető absztrakt
folyóiratcikk
Megjelenés:Yeast. - 22 : 11 (2005), p. S152. -
További szerzők:Szilágyi Zsolt (1975-) (biológus) Benkő Zsigmond (1961-) (molekuláris biológus, genetikus) Enczi Klára Batta Gyula (1979-) (biológus) Sipiczki Mátyás (1948-) (biológus) Bähler, Jürg
Internet cím:Szerző által megadott URL
Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
Borító:
Rekordok letöltése1 2