Találati lista | Tudóstér

001-es BibID:	BIBFORM056763
Első szerző:	Begum, Jaida
Cím:	Computationally motivated synthesis and enzyme kinetic evaluation of N-([beta]-D-glucopyranosyl)-1,2,4-triazolecarboxamides as glycogen phosphorylase inhibitors / Jaida Begum, Gergely Varga, Tibor Docsa, Pal Gergely, Joseph M. Hayes, Laszló Juhász, Laszló Somsák
Dátum:	2015
ISSN:	2040-2503 2040-2511
Megjegyzések:	Following our recent study of N-(b-D-glucopyranosyl)oxadiazolecarboxamides (Polyák et al., Biorg. Med. Chem. 2013, 21, 5738) revealed as moderate inhibitors of glycogen phosphorylase (GP), in silico docking calculations using Glide have been performed on N-(?-D-glucopyranosyl)-1,2,4-triazolecarboxamides with different aryl substituents predicting more favorable binding at GP. The ligands were subsequently synthesized in moderate yields using N-(2,3,4,6-tetra-O-acetyl-?-D-glucopyranosyl)-tetrazole-5-carboxamide as starting material. Kinetics experiments against rabbit muscle glycogen phosphorylase b (RMGPb) revealed the ligands to be low mM GP inhibitors; the phenyl analogue (Ki =1 mM) is one of the most potent N-(?-D-glucopyranosyl)-heteroaryl-carboxamide-type inhibitors of the GP catalytic site discovered to date. Based on QM and QM/MM calculations, the potency of the ligands is predicted to arise from favorable intra- and intermolecular hydrogen bonds formed by the most stable solution phase tautomeric (t2) state of the 1,2,4-triazole in a conformationally dynamic system. ADMET property predictions revealed the compounds to have promising pharmacokinetic properties without any toxicity. This study highlights the benefits of a computationally led approach to GP inhibitor design.
Tárgyszavak:	Természettudományok Kémiai tudományok idegen nyelvű folyóiratközlemény külföldi lapban Doktori iskola
Megjelenés:	MedChemComm. - 6 : 1 (2015), p. 80-89. -
További szerzők:	Varga Gergely (1982-) (vegyész) Docsa Tibor (1975-) (vegyész, biokémikus) Gergely Pál (1947-) (biokémikus) Hayes, Joseph M. Juhász László (1973-) (vegyész) Somsák László (1954-) (vegyész)
Pályázati támogatás:	77712 OTKA 109450 OTKA TÁMOP-4.2.2-08/1-2008-0014 TÁMOP TÁMOP-4.2.2/B-10/1-2010-0024 TÁMOP Kémiai Tudományok Doktori Iskola BAROSS REG_EA_09-1-2009-0028-LCMS_TAN Egyéb
Internet cím:	Szerző által megadott URL DOI Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
Borító:
Saját polcon:

001-es BibID:	BIBFORM072396
Első szerző:	Kun Sándor (vegyész)
Cím:	A multidisciplinary study of 3-(β-D-glucopyranosyl)-5-substituted-1,2,4-triazole derivatives as glycogen phosphorylase inhibitors : computation, synthesis, crystallography and kinetics reveal new potent inhibitors / Sandor Kun, Jaida Begum, Efthimios Kyriakis, Evgenia C. V. Stamati, Thomas A. Barkas, Eszter Szennyes, Eva Bokor, Katalin E. Szabo, George A. Stravodimos, Adam Sipos, Tibor Docsa, Pal Gergely, Colin Moffatt, Myrto S. Patraskaki, Maria C. Kokolaki, Alkistis Gkerdi, Vassiliki T. Skamnaki, Demetres D. Leonidas, Laszló Somsák, Joseph M. Hayes
Dátum:	2018
ISSN:	0223-5234
Megjegyzések:	3-(β-D-Glucopyranosyl)-5-substituted-1,2,4-triazoles have been revealed as an effective scaffold for the development of potent glycogen phosphorylase (GP) inhibitors but with the potency very sensitive to the nature of the alkyl/aryl 5-substituent (Kun et al., Eur. J. Med. Chem. 2014, 76, 567). For a training set of these ligands, quantum mechanics-polarized ligand docking (QM-PLD) demonstrated good potential to identify larger differences in potencies (predictive index PI = 0.82) and potent inhibitors with Ki's < 10 ?M (AU-ROC = 0.86). Accordingly, in silico screening of 2335 new analogues exploiting the ZINC docking database was performed and nine predicted candidates selected for synthesis. The compounds were prepared in O-perbenzoylated forms by either ring transformation of 5-?-D-glucopyranosyl tetrazole by N-benzyl-arenecarboximidoyl chlorides, ring closure of C-(?-D-glucopyranosyl)formamidrazone with aroyl chlorides, or that of N-(?-D-glucopyranosylcarbonyl)arenethiocarboxamides by hydrazine, followed by deprotections. Kinetics experiments against rabbit muscle GPb (rmGPb) and human liver GPa (hlGPa) revealed five compounds as potent low ?M inhibitors with three of these on the submicromolar range for rmGPa. X-ray crystallographic analysis sourced the potency to a combination of favorable interactions from the 1,2,4-triazole and suitable aryl substituents in the GP catalytic site. The compounds also revealed promising calculated pharmacokinetic profiles.
Tárgyszavak:	Orvostudományok Elméleti orvostudományok idegen nyelvű folyóiratközlemény külföldi lapban 1,2,4-Triazole C-[beta]-D-glucopyranosyl derivatives Glycogen phosphorylase inhibitors QM/MM docking Kinetics X-ray crystallography
Megjelenés:	European Journal of Medicinal Chemistry 147 (2018), p. 266-278. -
További szerzők:	Begum, Jaida Kyriakis, Efthimios Stamati, Evgenia C. V. Barkas, Thomas A. Szennyes Eszter (1989-) (vegyész) Bokor Éva (1982-) (vegyész) Szabó Erzsébet Katalin (1989-) (vegyész) Stravodimos, George A. Sipos Ádám (1992-) (gyógyszerész) Docsa Tibor (1975-) (vegyész, biokémikus) Gergely Pál (1947-) (biokémikus) Moffatt, Colin Patraskaki, Myrto S. Kokolaki, Maria C. Gkerdi, Alkistis Skamnaki, Vassiliki T. Leonidas, Demetres D. Somsák László (1954-) (vegyész) Hayes, Joseph M.
Pályázati támogatás:	PD 105808 OTKA PD 121406 OTKA GINOP-2.3.2-15-2016-00008 GINOP
Internet cím:	Szerző által megadott URL DOI Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
Borító:
Saját polcon:

001-es BibID:	BIBFORM047544
035-os BibID:	PMID:23938052
Első szerző:	Polyák Mária
Cím:	Synthesis, enzyme kinetics and computational evaluation of N-(β-d-glucopyranosyl) oxadiazolecarboxamides as glycogen phosphorylase inhibitors / Mária Polyák, Gergely Varga, Bence Szilágyi, László Juhász, Tibor Docsa, Pál Gergely, Jaida Begum, Joseph M. Hayes, László Somsák
Dátum:	2013
ISSN:	0968-0896
Megjegyzések:	All possible isomers of N-β-d-glucopyranosyl aryl-substituted oxadiazolecarboxamides were synthesised. O-Peracetylated N-cyanocarbonyl-β-d-glucopyranosylamine was transformed into the corresponding N-glucosyl tetrazole-5-carboxamide, which upon acylation gave N-glucosyl 5-aryl-1,3,4-oxadiazole-2-carboxamides. The nitrile group of the N-cyanocarbonyl derivative was converted to amidoxime which was ring closed by acylation to N-glucosyl 5-aryl-1,2,4-oxadiazole-3-carboxamides. A one-pot reaction of protected β-d-glucopyranosylamine with oxalyl chloride and then with arenecarboxamidoximes furnished N-glucosyl 3-aryl-1,2,4-oxadiazole-5-carboxamides. Removal of the O-acetyl protecting groups by the Zemplén method produced test compounds which were evaluated as inhibitors of glycogen phosphorylase. Best inhibitors of these series were N-(β-d-glucopyranosyl) 5-(naphth-1-yl)-1,2,4-oxadiazol-3-carboxamide (Ki=30M), N-(β-d-glucopyranosyl) 5-(naphth-2-yl)-1,3,4-oxadiazol-2-carboxamide (Ki=33M), and N-(β-d-glucopyranosyl) 3-phenyl-1,2,4-oxadiazol-5-carboxamide (Ki=104M). ADMET property predictions revealed these compounds to have promising oral drug-like properties without any toxicity. Copyright © 2013 Elsevier Ltd. All rights reserved.
Tárgyszavak:	Orvostudományok Elméleti orvostudományok idegen nyelvű folyóiratközlemény külföldi lapban 1,2,4-Oxadiazole ADMET Glycogen phosphorylas Inhibitor β-d-Glucopyranosyl derivatives Molekuláris Medicina Doktori iskola
Megjelenés:	Bioorganic & Medicinal Chemistry. - 21 : 18 (2013), p. 5738-5747. -
További szerzők:	Varga Gergely (1982-) (vegyész) Szilágyi Bence Juhász László (1973-) (vegyész) Docsa Tibor (1975-) (vegyész, biokémikus) Gergely Pál (1947-) (biokémikus) Begum, Jaida Hayes, Joseph M. Somsák László (1954-) (vegyész)
Pályázati támogatás:	TÁMOP-4.2.2-08/1-2008-0014 TÁMOP TÁMOP-4.2.1/B-09/1/KONV-2010-0007 TÁMOP I. Protein foszfatázok szerepe az in vitro porcdifferenciációban és a mechano-transzdukcióban II. Hypoglykaemiás szerek tervezése a glikogén foszforilázra (foszforilációval és defoszforilációval szabályozott kulcsenzim) ható molekulákkal TÁMOP-4.2.2/B-10/1-2010-0024 TÁMOP Molekuláris Orvostudomány Doktori Iskola TÁMOP-4.2.4.A/2-11-1-2012-0001 TÁMOP CK77712 OTKA CNK80709 OTKA
Internet cím:	Szerző által megadott URL DOI Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
Borító:
Saját polcon: