Összesen 1 találat.
#/oldal:
Részletezés:
Rendezés:

1.

001-es BibID:BIBFORM122102
035-os BibID:(Scopus)85197267890 (WoS)001256491000001
Első szerző:Mándi Attila (vegyész, német szakfordító)
Cím:Testing the Simplified Molecular Dynamics Approach to Improve the Reproduction of ECD Spectra and Monitor Aggregation / Attila Mándi, Aliz Rimóczi, Andrea Vasas, Judit Hohmann, Mahadeva M. M. Swamy, Kenji Monde, Roland A. Barta, MátéKicsák, István Komáromi, Krisztina Fehér, Tibor Kurtán
Dátum:2024
ISSN:1422-0067
Megjegyzések:A simplified molecular-dynamics-based electronic circular dichroism (ECD) approach was tested on three condensed derivatives with limited conformational flexibility and an isochroman-2H-chromene hybrid, the ECD spectra of which could not be precisely reproduced by the conventional ECD calculation protocol. Application of explicit solvent molecules at the molecular mechanics (MD) level in the dynamics simulations and subsequent TDDFT-ECD calculation for the unoptimized MD structures was able to improve the agreements between experimental and computed spectra. Since enhancements were achieved even for molecules with limited conformational flexibility, deformations caused by the solvent molecules and multitudes of conformers produced with unoptimized geometries seem to be key factors for better agreement. The MD approach could confirm that aggregation of the phenanthrene natural product luzulin A had a significant contribution to a specific wavelength range of the experimental ECD. The MD approach has proved that dimer formation occurred in solution and this was responsible for the anomalous ECD spectrum. The scope and limitations of the method have also been discussed.
Tárgyszavak:Természettudományok Kémiai tudományok idegen nyelvű folyóiratközlemény külföldi lapban
folyóiratcikk
electronic circular dichroism
molecular mechanics
enhancement of agreement
aggregation
Megjelenés:International Journal Of Molecular Sciences. - 25 : 12 (2024), p. 1-18. -
További szerzők:Rimóczi Aliz Vasas Andrea Hohmann Judit Swamy, Mahadeva M. M. Monde, Kenji Barta Roland A. Kicsák Máté (1990-) (gyógyszerész) Komáromi István (1957-) (vegyész, molekuláris biológus, biokémikus) Fehér Krisztina (1974-) (vegyész) Kurtán Tibor (1973-) (vegyész, angol szakfordító)
Pályázati támogatás:K 138672
OTKA
FK 134653
OTKA
NN 128368
OTKA
Internet cím:Szerző által megadott URL
DOI
Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
Borító:
Rekordok letöltése1