Találati lista | Tudóstér

001-es BibID:	BIBFORM087492
035-os BibID:	(WoS)000512705600001 (Scopus)85078709498
Első szerző:	Fejes Balázs
Cím:	The effects of external Mn2+ concentration on hyphal morphology and citric acid production are mediated primarily by the NRAMP-family transporter DmtA in Aspergillus niger / Balázs Fejes, Jean-Paul Ouedraogo, Erzsébet Fekete, Erzsébet Sándor, Michel Flipphi, Áron Soós, Ákos P. Molnár, Béla Kovács, Christian P. Kubicek, Adrian Tsang, Levente Karaffa
Dátum:	2020
ISSN:	1475-2859
Tárgyszavak:	Természettudományok Biológiai tudományok idegen nyelvű folyóiratközlemény külföldi lapban folyóiratcikk
Megjelenés:	Microbial Cell Factories. - 19 : 1 (2020), p. 1-11. -
További szerzők:	Ouedraogo, Jean Paul Fekete Erzsébet (1975-) (biotechnológus, egyetemi tanár) Karaffa Erzsébet Mónika (1972-) (mikrobiológus, egyetemi tanár) Flipphi, Michel (1964-) Soós Áron (1990-) (élelmiszerbiztonsági és -minőségi mérnök) Molnár Ákos Péter (1988-) (okleveles biomérnök) Kovács Béla (1963-) (okleveles vegyész, angol szakfordító) Kubicek, Christian P. Tsang, Adrian Karaffa Levente (1971-) (biotechnológus, egyetemi tanár)
Pályázati támogatás:	ÚNKP-19-3 Egyéb ÚNKP-19-4 Egyéb
Internet cím:	Szerző által megadott URL DOI Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
Borító:
Saját polcon:

001-es BibID:	BIBFORM125016
Első szerző:	Fekete Erzsébet (biotechnológus, egyetemi tanár)
Cím:	Transcriptomics identify the triggering of citrate export as the key event caused by manganese deficiency in / Erzsébet Fekete, Vivien Bíró, Alexandra Márton, István Bakondi-Kovács, Erzsébet Sándor, Béla Kovács, Nicholas Geoffrion, Adrian Tsang, Christian P. Kubicek, Levente Karaffa1
Dátum:	2024
ISSN:	2165-0497
Megjegyzések:	For over a century, the filamentous Ascomycete fungus Aspergillus niger has played a pivotal role in the industrial production of citric acid. A critical fermentation parameter that sustains high-yield citric acid accumulation is the suboptimal concentration of manganese(II) ions in the culture broth at the early stages of the process. However, the requirement for this deficiency has not been investigated on a functional genomics level. In this study, we compared the transcriptome of the citric acid hyper-producer A. niger NRRL2270 strain grown under citric acid-producing conditions in 6-L scale bioreactors at Mn2+ ion-deficient (5 ppb) and Mn2+ ion-sufficient (100 ppb) conditions at three early time points of cultivation. Of the 11,846 genes in the genome, 963 genes (8.1% of the total) were identified as significantly differentially expressed under these conditions. Disproportionately high number of differentially regulated genes encode predicted extracellular and membrane proteins. The most abundant gene group that was upregulated in Mn2+ ion deficiency condition encodes enzymes acting on polysaccharides. In contrast, six clusters of genes encoding secondary metabolites showed downregulation under manganese deficiency. Mn2+ deficiency also triggers upregulation of the cexA gene, which encodes the citrate exporter. We provide functional evidence that the upregulation of cexA is caused by the intracellular accumulation of citrate or acetyl-CoA and is a major factor in triggering citrate overflow. IMPORTANCE Citric acid is produced on industrial scale by batch fermentation of the filamentous fungus Aspergillus niger. High-yield citric acid production requires a low (<5 ppb) manganese(II) ion concentration in the culture broth. However, the requirement for this deficiency has not been investigated on a functional genomics level. Here, we compared the transcriptome of a citric acid hyper-producer A. niger strain grown under citric acid-producing conditions in 6-L scale bioreactors at Mn2+ ion-deficient (5 ppb) and Mn2+ ion-sufficient (100 ppb) conditions at three early time points of cultivation. We observed that Mn2+ deficiency triggers an upregulation of the citrate exporter gene cexA and provides functional evidence that this event is responsible for citrate overflow. In addition to the industrial relevance, this is the first study that examined the role of Mn2+ ion deficiency in a heterotrophic eukaryotic cell on a genome-wide scale.
Tárgyszavak:	Természettudományok Biológiai tudományok idegen nyelvű folyóiratközlemény külföldi lapban folyóiratcikk Aspergillus niger citric acid manganese ions citrate exporter cexA transcriptomics gene expression
Megjelenés:	Microbiology Spectrum. - - (2024), p.1-18. -
További szerzők:	Bíró Vivien (1994-)c(mikrobiológus) Márton Alexandra (1994-) (mikrobiológus) Bakondi-Kovács István (1963-) (mikrobiológus) Karaffa Erzsébet Mónika (1972-) (mikrobiológus, egyetemi tanár) Kovács Béla (1963-) (okleveles vegyész, angol szakfordító) Geoffrion, Nicholas Tsang, Adrian Kubicek, Christian P. Karaffa Levente (1971-) (biotechnológus, egyetemi tanár)
Internet cím:	Szerző által megadott URL DOI Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
Borító:
Saját polcon:

001-es BibID:	BIBFORM103023
035-os BibID:	(cikkazonosító)935902 (WoS)000843102800001 (Scopus)85136210735
Első szerző:	Fekete Erzsébet (biotechnológus, egyetemi tanár)
Cím:	Bioreactor as the root cause of the "manganese effect" during Aspergillus niger citric acid fermentations / Fekete Erzsébet, Bíró Vivien, Márton Alexandra, Bakondi-Kovács István, Németh Zoltán Sándor Erzsébet, Kovács Béla, Fábián István, Kubicek Christian P., Tsang Adrian, Karaffa Levente
Dátum:	2022
ISSN:	2296-4185
Megjegyzések:	High-yield citric acid production by the filamentous Ascomycete fungus Aspergillus niger requires a combination of extreme nutritional conditions, of which maintaining a low manganese (II) ion concentration (<5 ?g L?1 ) is a key feature. Technical-scale production of citric acid predominantly uses stainless- steel tank fermenters, but glass bioreactors used for strain improvement and manufacturing process development also contain stainless steel components, in which manganese is an essential alloying element. We show here that during citric acid fermentations manganese (II) ions were leaching from the bioreactor into the growth media, resulting in altered fungal physiology and morphology, and significant reduction of citric acid yields. The leaching of manganese (II) ions was dependent on the fermentation time, the acidity of the culture broth and the sterilization protocol applied. Manganese (II) ion leaching was partially mitigated by electrochemical polishing of stainless steel components of the bioreactor. High concentrations of manganese (II) ions during early cultivation led to a reduction in citric acid yield. However, the effect of manganese (II) ions on the reduction of citric acid yield diminished towards the second half of the fermentation. Since maintaining low concentrations of manganese (II) ions is costly, the results of this study can potentially be used to modify protocols to reduce the cost of citric acid production.
Tárgyszavak:	Természettudományok Biológiai tudományok idegen nyelvű folyóiratközlemény külföldi lapban folyóiratcikk Aspergillus niger manganese ions citric acid stainless steel metal ions leaching fungal morphology
Megjelenés:	Frontiers in Bioengineering and Biotechnology. - 10 (2022), p. 1-12. -
További szerzők:	Bíró Vivien (1994-)c(mikrobiológus) Márton Alexandra (1994-) (mikrobiológus) Bakondi-Kovács István (1963-) (mikrobiológus) Németh Zoltán (1987-) (biomérnök) Karaffa Erzsébet Mónika (1972-) (mikrobiológus, egyetemi tanár) Kovács Béla (1963-) (okleveles vegyész, angol szakfordító) Fábián István (1956-) (vegyész) Kubicek, Christian P. Tsang, Adrian Karaffa Levente (1971-) (biotechnológus, egyetemi tanár)
Internet cím:	Szerző által megadott URL DOI Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
Borító:
Saját polcon:

001-es BibID:	BIBFORM093531
035-os BibID:	(cikkazonosító)680420 (WOS)000657282100001 (Scopus)85107225932
Első szerző:	Karaffa Erzsébet Mónika (mikrobiológus, egyetemi tanár)
Cím:	Carbon-source dependent interplay of copper and manganese ions modulates the morphology and itaconic acid production in Aspergillus terreus / Erzsébet Sándor, István S. Kolláth, Erzsébet Fekete, Vivien Bíró, Michel Flipphi, Béla Kovács, Christian P. Kubicek, Levente Karaffa
Dátum:	2021
ISSN:	1664-302X
Megjegyzések:	The effects of the interplay of copper (II) and manganese (II) ions on growth, morphology and itaconic acid formation was investigated in a high-producing strain of Aspergillus terreus (NRRL1960), using carbon sources metabolized either mainly via glycolysis (D-glucose, D-fructose) or primarily via the pentose phosphate shunt (D-xylose, L-arabinose). Limiting Mn2+ concentration in the culture broth is indispensable to obtain high itaconic acid yields, while in the presence of higher Mn2+ concentrations yield decreases and biomass formation is favored. However, this low yield in the presence of high Mn2+ ion concentrations can be mitigated by increasing the Cu2+ concentration in the medium when D-glucose or D-fructose is the growth substrate, whereas this effect was at best modest during growth on D-xylose or -arabinose. A. terreus displays a high tolerance to Cu2+ which decreased when Mn2+ availability became increasingly limiting. Under such conditions biomass formation on D-glucose or D-fructose could be sustained at concentrations up to 250 mg L-1 Cu2+, while D-xylose- or L-arabinose supported growth was fully inhibited already at 100 mg L-1, while on D-xylose- or L-arabinose biomass formation was completely inhibited at 100 mg L-1. High (>75%) specific molar itaconic acid yields always coincided with an "overflow-associated" morphology, characterized by small compact pellets (<250 mm diameter) and short chains of "yeast-like" cells that exhibit increased diameters relative to the elongated cells in growing filamentous hyphae. At low concentrations (?1 mg L-1) of Cu2+ ions, manganese deficiency did not prevent filamentous growth. Mycelial- and cellular morphology progressively transformed into the typical overflow-associated one when external Cu2+ concentrations increased, irrespective of the available Mn2+. Our results indicate that copper ions are relevant for overflow metabolism and should be considered when optimizing itaconic acid fermentation in A. terreus.
Tárgyszavak:	Természettudományok Biológiai tudományok idegen nyelvű folyóiratközlemény külföldi lapban folyóiratcikk Aspergillus terreus Manganese(II) ions Copper(II) ions itaconic acid overflow Pentose, hexose Mycelial pellets divalent cation antagonism
Megjelenés:	Frontiers in Microbiology. - 12 (2021), p. 1-14. -
További szerzők:	Kolláth István Sándor (biomérnök) Fekete Erzsébet (1975-) (biotechnológus, egyetemi tanár) Bíró Vivien (1994-)c(mikrobiológus) Flipphi, Michel (1964-) Kovács Béla (1963-) (okleveles vegyész, angol szakfordító) Kubicek, Christian P. Karaffa Levente (1971-) (biotechnológus, egyetemi tanár)
Internet cím:	Szerző által megadott URL DOI Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
Borító:
Saját polcon:

001-es BibID:	BIBFORM079419
Első szerző:	Karaffa Levente (biotechnológus, egyetemi tanár)
Cím:	Aspergillus terreus itaconic acid fermentation technology reflects the physiological requirements of overflow metabolism / Levente Karaffa, Ákos P. Molnár, István Kolláth, Béla Kovács, Áron Soós, Christian P. Kubicek, Erzsébet Fekete
Dátum:	2018
Tárgyszavak:	Természettudományok Biológiai tudományok előadáskivonat
Megjelenés:	11th International Mycological Congress: Mycological Discoveries for a Better World : Abstract Book. - p. 355-356
További szerzők:	Molnár Ákos Péter (1988-) (okleveles biomérnök) Kolláth István Sándor (biomérnök) Kovács Béla (1963-) (okleveles vegyész, angol szakfordító) Soós Áron (1990-) (élelmiszerbiztonsági és -minőségi mérnök) Kubicek, Christian P. Fekete Erzsébet (1975-) (biotechnológus, egyetemi tanár)
Internet cím:	Szerző által megadott URL Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
Borító:
Saját polcon:

001-es BibID:	BIBFORM080572
Első szerző:	Kolláth István Sándor (biomérnök)
Cím:	Effect of copper (Il) ions on itaconic acid prodoction by Aspergilius terreus / István S. Kolláth, Erzsébet Fekete, Erzsébet Sándor, Áron Soós, Béla Kovács, Levente Karaffa
Dátum:	2018
ISBN:	978 963 429 210 4
Tárgyszavak:	Természettudományok Kémiai tudományok előadáskivonat könyvrészlet
Megjelenés:	VII. Interdiszciplináris Doktorandusz Konferencia 2018 absztraktkötet / szerk. Bódog Ferenc. - p. 74. -
További szerzők:	Fekete Erzsébet (1975-) (biotechnológus, egyetemi tanár) Karaffa Erzsébet Mónika (1972-) (mikrobiológus, egyetemi tanár) Soós Áron (1990-) (élelmiszerbiztonsági és -minőségi mérnök) Kovács Béla (1963-) (okleveles vegyész, angol szakfordító) Karaffa Levente (1971-) (biotechnológus, egyetemi tanár)
Pályázati támogatás:	GINOP-2.3.2-15-20 16-00008 GINOP
Internet cím:	Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
Borító:
Saját polcon:

001-es BibID:	BIBFORM079798
035-os BibID:	(cikkazonosító)1589 (WOS)000474482200002 (Scopus)85069454227
Első szerző:	Kolláth István Sándor (biomérnök)
Cím:	Manganese Deficiency Is Required for High Itaconic Acid Production From D-Xylose in Aspergillus terreus / István S. Kolláth, Ákos P. Molnár, Áron Soós, Erzsébet Fekete, Erzsébet Sándor, Béla Kovács, Christian P. Kubicek, Levente Karaffa
Dátum:	2019
ISSN:	1664-302X
Megjegyzések:	Itaconic acid is used as a bio-based, renewable building block in the polymer industry. It is produced by submerged fermentations of the filamentous fungus Aspergillus terreus from molasses or starch, but research over the efficient utilization of non-food, lignocellulosic plant biomass is soaring. The objective of this study was to test whether the application of two key cultivation parameters for obtaining itaconic acid from D-glucose in high yields ? Mn2+ ion deficiency and high concentration of the carbon source ? would also occur on D-xylose, the principal monomer of lignocellulose. To this end, a carbon and energy balance for itaconic acid formation was established, which is 0.83 moles/mole D-xylose. The effect of Mn2+ ions on itaconic acid formation was indeed similar to that on D-glucose and maximal yields were obtained below 3 ?g L?1 Mn2+ ions, which were, however, only 0.63 moles of itaconic acid per mole D-xylose. In contrast to the case on D-glucose, increasing D-xylose concentration over 50 g L?1 did not change the above yield. By-products such as xylitol and ?-ketoglutarate were found, but in total they remained below 2% of the concentration of D-xylose. Mass balance of the fermentation with 110 g L?1 D-xylose revealed that >95% of the carbon from D-xylose was accounted as biomass, itaconic acid, and the carbon dioxide released in the last step of itaconic acid biosynthesis. Our data show that the efficiency of biomass formation is the critical parameter for itaconic acid yield from D-xylose under otherwise optimal conditions.
Tárgyszavak:	Természettudományok Biológiai tudományok idegen nyelvű folyóiratközlemény külföldi lapban folyóiratcikk Aspergillus terreus D-xylose itaconic acid fermentation specific yield volumetric yield
Megjelenés:	Frontiers in Microbiology. - 10 (2019), p. 1-10. -
További szerzők:	Molnár Ákos Péter (1988-) (okleveles biomérnök) Soós Áron (1990-) (élelmiszerbiztonsági és -minőségi mérnök) Fekete Erzsébet (1975-) (biotechnológus, egyetemi tanár) Karaffa Erzsébet Mónika (1972-) (mikrobiológus, egyetemi tanár) Kovács Béla (1963-) (okleveles vegyész, angol szakfordító) Kubicek, Christian P. Karaffa Levente (1971-) (biotechnológus, egyetemi tanár)
Pályázati támogatás:	EFOP-3.6.1-16-2016-00022 EFOP GINOP-2.3.2-15-2016-00008 GINOP NKFIA-KH-129602 Egyéb NKFIA-NN-128867 Egyéb NKFIA-NN-116519 Egyéb
Internet cím:	Szerző által megadott URL DOI Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
Borító:
Saját polcon:

001-es BibID:

BIBFORM079434

Első szerző:

Kolláth István Sándor (biomérnök)

Cím:

Production of itaconic acid from D-xylose by Aspergillus terreus / István S. Kolláth, Ákos P. Molnár, Erzsébet Fekete, Erzsébet Sándor, Áron Soós, Béla Kovács, Christian P. Kubicek, Levente Karaffa

Dátum:

2017

Megjelenés:

Utánközlés / Párhuzamos közlés

Megjegyzések:

Kolláth István Sándor (biomérnök): Production of itaconic acid from D-xylose by Aspergillus terreus

Tárgyszavak:

Természettudományok Biológiai tudományok előadáskivonat

Megjelenés:

2nd Symposium on Plant Biomass Conversation by Fungi. - p. 25

További szerzők:

Molnár Ákos Péter (1988-) (okleveles biomérnök) Fekete Erzsébet (1975-) (biotechnológus, egyetemi tanár) Karaffa Erzsébet Mónika (1972-) (mikrobiológus, egyetemi tanár) Soós Áron (1990-) (élelmiszerbiztonsági és -minőségi mérnök) Kovács Béla (1963-) (okleveles vegyész, angol szakfordító) Kubicek, Christian P. Karaffa Levente (1971-) (biotechnológus, egyetemi tanár)

Internet cím:

Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat

Lásd még:

Utánközlés (1)

Borító:

Saját polcon:

001-es BibID:

BIBFORM079435

Első szerző:

Kolláth István Sándor (biomérnök)

Cím:

Dátum:

2017

Megjegyzések:

Kolláth István Sándor (biomérnök): Production of itaconic acid from D-xylose by Aspergillus terreus

Tárgyszavak:

Természettudományok Biológiai tudományok előadáskivonat

Megjelenés:

Abstracts of the 5th Central European Forum for Microbiology / ed. K. Márialigeti, O. Dobay. - p. 136. -

További szerzők:

Internet cím:

Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat

Lásd még:

Egyéb kapcsolat (1)

Borító:

Saját polcon:

10.

001-es BibID:	BIBFORM075416
035-os BibID:	(WoS)000445604600016 (Scopus)85052616732
Első szerző:	Molnár Ákos Péter (okleveles biomérnök)
Cím:	High oxygen tension increases itaconic acid accumulation, glucose consumption, and the expression and activity of alternative oxidase in Aspergillus terreus / Ákos P. Molnár, Zoltán Németh, István S. Kolláth, Erzsébet Fekete, Michel Flipphi, Norbert Ág, Áron Soós, Béla Kovács, Erzsébet Sándor, Christian P. Kubicek, Levente Karaffa
Dátum:	2018
ISSN:	0175-7598 1432-0614
Megjegyzések:	Itaconic acid is a five-carbon dicarboxylic acid with an unsaturated alkene bond, frequently used as a building block for the industrial production of a variety of synthetic polymers. It is also one of the major products of fungal "overflow metabolism" which can be produced in submerged fermentations of the filamentous fungus Aspergillus terreus. At the present, molar yields of itaconate are lower than those obtained in citric acid production in Aspergillus niger. Here, we have studied the possibility that the yield may be limited by the oxygen supply during fermentation and hence tested the effect of the dissolved oxygen concentration on the itaconic acid formation rate and yield in lab-scale bioreactors. The data show that a dissolved oxygen concentration of 2% saturation was sufficient for maximal biomass formation. Raising it to 30% saturation had no effect on biomass formation or the growth rate, but the itaconate yield augmented substantially from 0.53 to 0.85 mol itaconate/mol glucose. Furthermore, the volumetric and specific rates of itaconic acid formation ameliorated by as much as 150% concurrent with faster glucose consumption, shortening the fermentation time by 48 h. Further increasing the dissolved oxygen concentration over 30% saturation had no effect. Moreover, we show that this increase in itaconic acid production coincides with an increase in alternative respiration, circumventing the formation of surplus ATP by the cytochrome electron transport chain, as well as with increased levels of alternative oxidase transcript. We conclude that high(er) itaconic acid accumulation requires a dissolved oxygen concentration that is much higher than that needed for maximal biomass formation, and postulate that the induction of alternative respiration allows the necessary NADH reoxidation ratio without surplus ATP production to increase the glucose consumption and the flux through overflow metabolism.
Tárgyszavak:	Természettudományok Biológiai tudományok idegen nyelvű folyóiratközlemény külföldi lapban folyóiratcikk Aspergillus terreus Itaconic acid Alternative oxidase Respiration Submerged fermentation Dissolved oxygen
Megjelenés:	Applied Microbiology and Biotechnology. - 102 : 20 (2018), p. 8799-8808. -
További szerzők:	Németh Zoltán (1987-) (biomérnök) Kolláth István Sándor (biomérnök) Fekete Erzsébet (1975-) (biotechnológus, egyetemi tanár) Flipphi, Michel (1964-) Ág Norbert (1987-) (okleveles biomérnök) Soós Áron (1990-) (élelmiszerbiztonsági és -minőségi mérnök) Kovács Béla (1963-) (okleveles vegyész, angol szakfordító) Karaffa Erzsébet Mónika (1972-) (mikrobiológus, egyetemi tanár) Kubicek, Christian P. Karaffa Levente (1971-) (biotechnológus, egyetemi tanár)
Internet cím:	Szerző által megadott URL DOI Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
Borító:
Saját polcon: