CCL

Összesen 43 találat.
#/oldal:
Részletezés:
Rendezés:

1.

001-es BibID:BIBFORM087802
Első szerző:Asadollahi, Mojtaba
Cím:Magyarországi Botrytis cinerea izolátumok citokróm b génjének diverzitása / Mojtaba Asadollahi, Fekete Éva, Fekete Erzsébet, Karaffa Levente, Irinyi László, Sándor Erzsébet
Dátum:2010
ISSN:1587-1282
Megjegyzések:A citokróm b az eukarióták mitokondriumának belső membránjában található III. légzési komplex része, a kódoló gén (CYTB) pedig a mitokondriális genomban található. A QoI csoportba tartozó fungicidek a Qo (külső kinol-oxidációs) helyhez kötődve gátolják a III. légzési komplexet, és így a mitokondriális légzést. A QoI fungicideket (köztük az azoxystrobint) bevezetésük óta széles körben használják, mivel hatékonyak számos, gazdaságilag jelentős növényt megbetegítő gomba, köztük a szürkerothadás kórokozója ellen. A QoI hatású szerekkel szembeni rezisztencia elsősorban a citokróm b fungicid kötő helyén kialakuló változásokhoz köthető. A szürkerothadás elleni védekezésben jelentős szerepet kapnak a különböző kemikáliák, ezért a hatékony védekezés megtervezéséhez elengedhetetlen a kórokozó populáció reisztenciájában szerepet játszó gének diverzitásának megismerése. Munkánk során különböző gazdanövényekről 2008-2009 években gyűjtött magyarországi B. cinerea egyspórás izolátumokat vizsgáltunk. A minták csaknem felében kimutatható volt a egy nagy intron jelenléte a CYTB génben, melyet PCR fragment analízis segítségével határoztunk meg. A CYTB specifikus PCR reakciója, valamint a CYTB fragmentum szekvencia vizsgálata alapján az izolátumok egy részénél kimutatható volt a 143. helyen a G143A kodoncserét okozó, és azoxystrobin rezisztenciát okozó pontmutáció. Hazánkban is számolnunk kell tehát is az azoxystrobinnal szemben rezisztens B. cinerea populációk jelenlétével. A magyarországi B. cinerea izolátumok mitokondriális genomjában található CYTB viszonylag kevés minta vizsgálata alapján is nagyfokú diverzitást mutatott, hasonlóan a korábban vizsgált sejtmagban kódolódó szekvenciákhoz, ami a QoI hatású fungicidek körültekintő felhasználására int.
Tárgyszavak:Agrártudományok Növénytermesztési és kertészeti tudományok magyar nyelvű folyóiratközlemény hazai lapban
folyóiratcikk
Botrytis cinerea
citoktóm b
QoI rezisztencia
cytochrome b
QoI resistance
Megjelenés:Agrártudományi közlemények = Acta agraria Debreceniensis. - 39 (2010), p. 18-21. -
További szerzők:Fekete Éva (1981-) (molekuláris biológus) Fekete Erzsébet (1975-) (biotechnológus, egyetemi tanár) Karaffa Levente (1971-) (biotechnológus, egyetemi tanár) Irinyi László (1980-) (biológus) Karaffa Erzsébet Mónika (1972-) (mikrobiológus, egyetemi tanár)
Pályázati támogatás:NKTH; A2-2006-0017
Egyéb
BO/00519/09/8
Egyéb
Internet cím:Szerző által megadott URL
Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
Borító:

2.

001-es BibID:BIBFORM051653
Első szerző:Asadollahi, Mojtaba
Cím:Comparison of Botrytis cinerea populations isolated from two open-field cultivated host plants / Mojtaba Asadollahi, Erzsébet Fekete, Levente Karaffa, Michel Flipphi, Mariann Árnyasi, Mahdi Esmaeili, Kálmán Zoltán Váczy, Erzsébet Sándor
Dátum:2013
ISSN:0944-5013
Tárgyszavak:Természettudományok Biológiai tudományok idegen nyelvű folyóiratközlemény külföldi lapban
Megjelenés:Microbiological Research. - 168 (2013), p. 379-388. -
További szerzők:Fekete Erzsébet (1975-) (biotechnológus, egyetemi tanár) Karaffa Levente (1971-) (biotechnológus, egyetemi tanár) Flipphi, Michel (1964-) Árnyasi Mariann (1973-) (agrármérnök) Esmaeili, Mahdi Váczy Kálmán Zoltán Karaffa Erzsébet Mónika (1972-) (mikrobiológus, egyetemi tanár)
Internet cím:Szerző által megadott URL
Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
Borító:

3.

001-es BibID:BIBFORM043871
Első szerző:Asadollahi, Mojtaba
Cím:Resistance to QoI Fungicide and Cytochrome b Diversity in the Hungarian Botrytis cinerea Population / M. Asadollahi, A. Szojka, E. Fekete, L. Karaffa, F. Takács, M. Flipphi, E. Sándor
Dátum:2013
ISSN:1680-7073
Tárgyszavak:Természettudományok Biológiai tudományok idegen nyelvű folyóiratközlemény külföldi lapban
Megjelenés:Journal of Agricultural Science and Technology. - 15 (2013), p. 397-407. -
További szerzők:Bérczesné Szojka Anikó (1987-) (biomérnök) Fekete Erzsébet (1975-) (biotechnológus, egyetemi tanár) Karaffa Levente (1971-) (biotechnológus, egyetemi tanár) Takács F. Flipphi, Michel (1964-) Karaffa Erzsébet Mónika (1972-) (mikrobiológus, egyetemi tanár)
Internet cím:Szerző által megadott URL
Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
Borító:

4.

001-es BibID:BIBFORM090176
Első szerző:Bérczesné Szojka Anikó (biomérnök)
Cím:Magyarországi Botrytis cinerea izolátumok azoxystrobin rezisztenciájának vizsgálata real-time PCR technika segítségével / Szojka Anikó, Mojtaba Asadollahi, Fekete Éva, Fekete Erzsébet, Karaffa Levente, Sándor Erzsébet
Dátum:2011
ISSN:1587-1282
Tárgyszavak:Természettudományok Biológiai tudományok idegen nyelvű folyóiratközlemény hazai lapban
folyóiratcikk
Botrytis cinerea
citokróm b
QoI rezisztencia
Megjelenés:Agrártudományi közlemények = Acta agraria Debreceniensis. - 43 (2011), p. 41-44. -
További szerzők:Asadollahi, Mojtaba Fekete Éva (1981-) (molekuláris biológus) Fekete Erzsébet (1975-) (biotechnológus, egyetemi tanár) Karaffa Levente (1971-) (biotechnológus, egyetemi tanár) Karaffa Erzsébet Mónika (1972-) (mikrobiológus, egyetemi tanár)
Internet cím:DOI
Szerző által megadott URL
Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
Borító:

5.

001-es BibID:BIBFORM126420
035-os BibID:(WoS)001385536800001
Első szerző:Csótó András (növényorvos)
Cím:Foliar spraying with endophytic Trichoderma biostimulant increases drought resilience of Maize and Sunflower / András Csótó, György Tóth, Péter Riczu, Andrea Zabiák, Vera Tarjányi, Erzsébet Fekete, Levente Karaffa, Erzsébet Sándor
Dátum:2024
ISSN:2077-0472
Megjegyzések:Microbial biostimulants that promote plant growth and abiotic stress tolerance are promising alternatives to chemical fertilizers and pesticides. Although Trichoderma fungi are known biocontrol agents, their biostimulatory potential has been scarcely studied in field conditions. Here, the mixture of two endophytic Trichoderma strains (Trichoderma afroharzianum TR04 and Trichoderma simmonsii TR05) was tested as biostimulant in the form of foliar spray on young (BBCH 15-16) maize (5.7 ha) and sunflower (5.7 and 11.3 ha) fields in Hungary. The stimulatory effect was characterized by changes in plant height, the number of viable leaves, and the chlorophyll content, combined with yield sensor collected harvest data. In all trials, the foliar treatment with Trichoderma spores increased photosynthetic potential: the number of viable leaves increased by up to 6.7% and the SPAD index by up to 19.1% relative to the control. In extreme drought conditions, maize yield was doubled (from 0.587 to 1.62 t/ha, p < 0.001). The moisture content of the harvested seeds, as well as sunflower height, consistently increased post-treatment. We concluded that foliar spraying of young plants with well-selected endophytic Trichoderma strains can stimulate growth, photosynthesis, and drought tolerance in both monocot maize and dicots sunflower crops in field conditions.
Tárgyszavak:Agrártudományok Növénytermesztési és kertészeti tudományok idegen nyelvű folyóiratközlemény külföldi lapban
folyóiratcikk
Megjelenés:Agriculture-Basel. - 14 : 12 (2024), p. 1-12. -
További szerzők:Tóth György (biológus, Debrecen) Riczu Péter (1986-) (környezetgazdálkodási agrármérnök) Zabiák Andrea (1994-) (élelmiszerbiztonsági és -minőségi mérnök, élelmiszermérnök) Tarjányi Vera (1993-) (orvos) Fekete Erzsébet (1975-) (biotechnológus, egyetemi tanár) Karaffa Levente (1971-) (biotechnológus, egyetemi tanár) Karaffa Erzsébet Mónika (1972-) (mikrobiológus, egyetemi tanár)
Internet cím:Szerző által megadott URL
DOI
Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
Borító:

6.

001-es BibID:BIBFORM112713
035-os BibID:(WoS)001015602900001 (Scopus)85163951854
Első szerző:Csótó András (növényorvos)
Cím:Hybrid Vitis Cultivars with American or Asian Ancestries Show Higher Tolerance towards Grapevine Trunk Diseases / Csótó, András; Nagy, Antal; Laurinyecz, Nóra; Nagy, Zóra Annamária; Németh, Csaba; Németh, Erzsébet Krisztina; Csikász-Krizsics, Anna; Rakonczás, Nándor; Fontaine, Florence; Fekete, Erzsébet; Flipphi, Michel; Karaffa, Levente; Sándor, Erzsébet
Dátum:2023
ISSN:2223-7747
Megjegyzések:Grape production worldwide is increasingly threatened by grapevine trunk diseases (GTDs). No grapevine cultivar is known to be entirely resistant to GTDs, but susceptibility varies greatly. To quantify these differences, four Hungarian grape germplasm collections containing 305 different cultivars were surveyed to determine the ratios of GTDs based on symptom expression and the proportion of plant loss within all GTD symptoms. The cultivars of monophyletic Vitis vinifera L. origin were amongst the most sensitive ones, and their sensitivity was significantly (p < 0.01) higher than that of the interspecific (hybrid) cultivars assessed, which are defined by the presence of Vitis species other than V. vinifera (e.g., V. labrusca L., V. rupestris Scheele, and V. amurensis Rupr.) in their pedigree. We conclude that the ancestral diversity of grapes confers a higher degree of resilience against GTDs.
Tárgyszavak:Agrártudományok Növénytermesztési és kertészeti tudományok idegen nyelvű folyóiratközlemény külföldi lapban
folyóiratcikk
Megjelenés:Plants-Basel. - 12 : 12 (2023), p. 1-16. -
További szerzők:Nagy Antal (1976-) (biológus) Laurinyecz Nóra Nagy Zóra Németh Csaba Németh Erzsébet Krisztina Csikászné Krizsics Anna Rakonczás Nándor (1978-) (agrármérnök, szőlész borász szakmérnök) Fontaine, Florence Fekete Erzsébet (1975-) (biotechnológus, egyetemi tanár) Flipphi, Michel (1964-) Karaffa Levente (1971-) (biotechnológus, egyetemi tanár) Karaffa Erzsébet Mónika (1972-) (mikrobiológus, egyetemi tanár)
Pályázati támogatás:NN 128867
OTKA
K 138489
OTKA
Internet cím:Szerző által megadott URL
DOI
Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
Borító:

7.

001-es BibID:BIBFORM106108
035-os BibID:(Scopus)85146806529 (WoS)000926846300001
Első szerző:Csótó András (növényorvos)
Cím:The Biocontrol Potential of Endophytic Trichoderma Fungi Isolated from Hungarian Grapevines, Part II, Grapevine Stimulation / András Csótó, Csilla Kovács, Károly Pál, Antal Nagy, Ferenc Peles, Erzsébet Fekete, Levente Karaffa, Christian P. Kubicek, Erzsébet Sándor
Dátum:2023
ISSN:2076-0817
Megjegyzések:In the first part of this two-piece publication, the isolation, identification and in vitro characterization of ten endophytic Trichoderma isolates were reported. Here we report the ability of two different mixes of some of these isolates (Trichoderma simmonsii, Trichoderma orientale and Trichoderma gamsii as well as of Trichoderma afroharzianum and T. simmonsii) to colonize and stimulate the growth of grapevines. Two commercial vineyards about 400 km away from the site of isolation were used as experimental fields, from which the strains of three Trichoderma species were re-isolated up to four years after rootstock soaking treatment with conidiospores, performed before planting. The treatments decreased the overall percentage of lost plants of about 30%, although a low number of lost plants (about 5%) were observed also in the control plot. For all cultivars and clones, the Trichoderma treatments significantly increased both the bud burst ratio and bud burst vigor index. In addition, the grape must parameters such as the Brix degrees, as well as the extract, the D-glucose and the D-fructose concentrations all appeared to be improved, suggesting a potentially higher ethanol content of the produced wine. We conclude that grapevine-endophytic Trichoderma isolates promote plant growth, and this feature represent a very interesting aspect to be deepened, because useful for the integrated plant production in the actual contest on the sustainable agriculture.
Tárgyszavak:Agrártudományok Növénytermesztési és kertészeti tudományok idegen nyelvű folyóiratközlemény külföldi lapban
folyóiratcikk
Trichoderma
grapevine
rootstock soaking treatment
fungal colonization of plants
Megjelenés:Pathogens. - 12 : 1 (2023), p. 1-14. -
További szerzők:Kovács Csilla (1990-) (élelmiszerbiztonsági és minőségi mérnök) Pál Károly (1978-) (mikrobiológus) Nagy Antal (1976-) (biológus) Peles Ferenc (1979-) (mikrobiológia, élelmiszer-mikrobiológia, minőségügy) Fekete Erzsébet (1975-) (biotechnológus, egyetemi tanár) Karaffa Levente (1971-) (biotechnológus, egyetemi tanár) Kubicek, Christian P. Karaffa Erzsébet Mónika (1972-) (mikrobiológus, egyetemi tanár)
Pályázati támogatás:NN-128867
Egyéb
K-138489
Egyéb
PoC022
Egyéb
Internet cím:Szerző által megadott URL
DOI
Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
Borító:

8.

001-es BibID:BIBFORM067436
035-os BibID:(WoS)000394827800001 (Scopus)85013301401
Első szerző:De Vries, Ronald P.
Cím:Comparative genomics reveals high biological diversity and specific adaptations in the industrially and medically important fungal genus Aspergillus / Ronald P. de Vries, Robert Riley, Ad Wiebenga, Guillermo Aguilar-Osorio, Sotiris Amillis, Cristiane Akemi Uchima, Gregor Anderluh, Mojtaba Asadollahi, Marion Askin, Kerrie Barry, Evy Battaglia, Özgür Bayram, Tiziano Benocci, Susanna A. Braus-Stromeyer, Camila Caldana, David Cánovas, Gustavo C. Cerqueira, Fusheng Chen, Wanping Chen, Cindy Choi, Alicia Clum, Renato Augusto Corrêa dos Santos, André Ricardo de Lima Damásio, George Diallinas, Tamás Emri, Erzsébet Fekete, Michel Flipphi, Susanne Freyberg, Antonia Gallo, Christos Gournas, Rob Habgood, Matthieu Hainaut, María Laura Harispe, Bernard Henrissat, Kristiina S. Hildén, Ryan Hope, Abeer Hossain, Eugenia Karabika, Levente Karaffa, Zsolt Karányi, Nada Kraševec, Alan Kuo, Harald Kusch, Kurt LaButti, Ellen L. Lagendijk, Alla Lapidus, Anthony Levasseur, Erika Lindquist, Anna Lipzen, Antonio F. Logrieco, Andrew MacCabe, Miia R. Mäkelä, Iran Malavazi, Petter Melin, Vera Meyer, Natalia Mielnichuk, Márton Miskei, Ákos P. Molnár, Giuseppina Mulé, Chew Yee Ngan, Margarita Orejas, Erzsébet Orosz, Jean Paul Ouedraogo, Karin M. Overkamp, Hee-Soo Park, Giancarlo Perrone, Francois Piumi, Peter J. Punt, Arthur F. J. Ram, Ana Ramón, Stefan Rauscher, Eric Record, Diego Mauricio Riaño-Pachón, Vincent Robert, Julian Röhrig, Roberto Ruller, Asaf Salamov, Nadhira S. Salih, Rob A. Samson, Erzsébet Sándor, Manuel Sanguinetti, Tabea Schütze, Kristina Sepčić, Ekaterina Shelest, Gavin Sherlock, Vicky Sophianopoulou, Fabio M. Squina, Hui Sun, Antonia Susca, Richard B. Todd, Adrian Tsang, Shiela E. Unkles, Nathalie van de Wiele, Diana van Rossen-Uffink, Juliana Velasco de Castro Oliveira, Tammi C. Vesth, Jaap Visser, Jae-Hyuk Yu, Miaomiao Zhou, Mikael R. Andersen, David B. Archer, Scott E. Baker, Isabelle Benoit, Axel A. Brakhage, Gerhard H. Braus, Reinhard Fischer, Jens C. Frisvad, Gustavo H. Goldman, Jos Houbraken, Berl Oakley, István Pócsi, Claudio Scazzocchio, Bernhard Seiboth, Patricia A. van Kuyk, Jennifer Wortman, Paul S. Dyer, Igor V. Grigoriev
Dátum:2017
ISSN:1474-760X
Tárgyszavak:Természettudományok Biológiai tudományok idegen nyelvű folyóiratközlemény külföldi lapban
folyóiratcikk
biological diversity
Megjelenés:Genome Biology. - 18 : 28 (2017), p. 1-45. -
További szerzők:Riley, Robert Wiebenga, Ad Aguilar-Osorio, Guillermo Amillis, Sotiris Akemi Uchima, Cristiane Anderluh, Gregor Asadollahi, Mojtaba Askin, Marion Barry, Kerrie Battaglia, Evy Bayram, Özgür Benocci, Tiziano Braus-Stromeyer, Susanna A. Caldana, Camila Cánovas, David Cerqueira, Gustavo C. Chen, Fusheng Chen, Wanping Choi, Cindy Clum, Alicia Corrêa dos Santos, Renato Augusto Lima Damásio, André Ricardo de Diallinas, George Emri Tamás (1969-) (biológus) Fekete Erzsébet (1975-) (biotechnológus, egyetemi tanár) Flipphi, Michel (1964-) Freyberg, Suzanne Gallo, Antonia Gournas, Christos Habgood, Rob Hainaut, Matthieu Harispe, María Laura Henrissat, Bernard Hildén, Kristiina S. Hope, Ryan Hossain, Abeer Karabika, Eugenia Karaffa Levente (1971-) (biotechnológus, egyetemi tanár) Karányi Zsolt (1961-) (biostatisztikus, bioinformatikus) Kraševec, Nada Kuo, Alan Kusch, Harald LaButti, Kurt Lagendijk, Ellen L. Lapidus, Alla Levasseur, Anthony Lindquist, Erika Lipzen, Anna Logrieco, Antonio F. MacCabe, Andrew Mäkelä, Miia R. Malavazi, Iran Melin, Petter Meyer, Vera Mielnichuk, Natalia Miskei Márton (1978-) (molekuláris biológus, genetikus) Molnár Ákos Péter (1988-) (okleveles biomérnök) Mulé, Giuseppina Ngan, Chew Yee Orejas, Margarita Orosz Erzsébet (1988-) (biológus) Ouedraogo, Jean Paul Overkamp, Karin M. Park, Hee-Soo Perrone, Giancarlo Piumi, Francois Punt, Peter J. Ram, Arthur F.J. Ramón, Ana Rauscher, Stefan Record, Eric Riaño-Pachón, Diego Mauricio Robert, Vincent Röhrig, Julian Ruller, Roberto Salamov, Asaf Salih, Nadhira S. Samson, Robert A. Karaffa Erzsébet Mónika (1972-) (mikrobiológus, egyetemi tanár) Sanguinetti, Manuel Schütze, Tabea Sepčić, Kristina Shelest, Ekaterina Sherlock, Gavin Sophianopoulou, Vicky Squina, Fabio M. Sun, Hui Susca, Antonia Todd, Richard B. Tsang, Adrian Unkles, Shiela E. Wiele, Nathalie van de Rossen-Uffink, Diana van Velasco de Castro Oliveira, Juliana Vesth, Tammi C. Visser, Jaap Yu Jae-Hyuk Zhou, Miaomiao Andersen, Mikael R. Archer, David Baker, Scott E. Benoit, Isabelle Brakhage, Axel A. Braus, Gerhard Fischer, Reinhard Frisvad, Jens Christian Goldman, Gustavo Houbraken, Jos Oakley, Berl R. Pócsi István (1961-) (vegyész) Scazzocchio, Claudio Seiboth, Bernhard Kuyk, Patricia A. van Wortman, Jennifer Russo Dyer, Paul S. Grigoriev, Igor V.
Pályázati támogatás:OTKA-K100464
OTKA
TÁMOP 4.2.1./B-09/1/KONV-2010-0007
TÁMOP
SROP-4.2.2.B-15/1/KONV-2015-0001
Egyéb
Internet cím:DOI
Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
Borító:

9.

001-es BibID:BIBFORM087492
035-os BibID:(WoS)000512705600001 (Scopus)85078709498
Első szerző:Fejes Balázs
Cím:The effects of external Mn2+ concentration on hyphal morphology and citric acid production are mediated primarily by the NRAMP-family transporter DmtA in Aspergillus niger / Balázs Fejes, Jean-Paul Ouedraogo, Erzsébet Fekete, Erzsébet Sándor, Michel Flipphi, Áron Soós, Ákos P. Molnár, Béla Kovács, Christian P. Kubicek, Adrian Tsang, Levente Karaffa
Dátum:2020
ISSN:1475-2859
Tárgyszavak:Természettudományok Biológiai tudományok idegen nyelvű folyóiratközlemény külföldi lapban
folyóiratcikk
Megjelenés:Microbial Cell Factories. - 19 : 1 (2020), p. 1-11. -
További szerzők:Ouedraogo, Jean Paul Fekete Erzsébet (1975-) (biotechnológus, egyetemi tanár) Karaffa Erzsébet Mónika (1972-) (mikrobiológus, egyetemi tanár) Flipphi, Michel (1964-) Soós Áron (1990-) (élelmiszerbiztonsági és -minőségi mérnök) Molnár Ákos Péter (1988-) (okleveles biomérnök) Kovács Béla (1963-) (okleveles vegyész, angol szakfordító) Kubicek, Christian P. Tsang, Adrian Karaffa Levente (1971-) (biotechnológus, egyetemi tanár)
Pályázati támogatás:ÚNKP-19-3
Egyéb
ÚNKP-19-4
Egyéb
Internet cím:Szerző által megadott URL
DOI
Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
Borító:

10.

001-es BibID:BIBFORM125016
Első szerző:Fekete Erzsébet (biotechnológus, egyetemi tanár)
Cím:Transcriptomics identify the triggering of citrate export as the key event caused by manganese deficiency in / Erzsébet Fekete, Vivien Bíró, Alexandra Márton, István Bakondi-Kovács, Erzsébet Sándor, Béla Kovács, Nicholas Geoffrion, Adrian Tsang, Christian P. Kubicek, Levente Karaffa1
Dátum:2024
ISSN:2165-0497
Megjegyzések:For over a century, the filamentous Ascomycete fungus Aspergillus niger has played a pivotal role in the industrial production of citric acid. A critical fermentation parameter that sustains high-yield citric acid accumulation is the suboptimal concentration of manganese(II) ions in the culture broth at the early stages of the process. However, the requirement for this deficiency has not been investigated on a functional genomics level. In this study, we compared the transcriptome of the citric acid hyper-producer A. niger NRRL2270 strain grown under citric acid-producing conditions in 6-L scale bioreactors at Mn2+ ion-deficient (5 ppb) and Mn2+ ion-sufficient (100 ppb) conditions at three early time points of cultivation. Of the 11,846 genes in the genome, 963 genes (8.1% of the total) were identified as significantly differentially expressed under these conditions. Disproportionately high number of differentially regulated genes encode predicted extracellular and membrane proteins. The most abundant gene group that was upregulated in Mn2+ ion deficiency condition encodes enzymes acting on polysaccharides. In contrast, six clusters of genes encoding secondary metabolites showed downregulation under manganese deficiency. Mn2+ deficiency also triggers upregulation of the cexA gene, which encodes the citrate exporter. We provide functional evidence that the upregulation of cexA is caused by the intracellular accumulation of citrate or acetyl-CoA and is a major factor in triggering citrate overflow. IMPORTANCE Citric acid is produced on industrial scale by batch fermentation of the filamentous fungus Aspergillus niger. High-yield citric acid production requires a low (<5 ppb) manganese(II) ion concentration in the culture broth. However, the requirement for this deficiency has not been investigated on a functional genomics level. Here, we compared the transcriptome of a citric acid hyper-producer A. niger strain grown under citric acid-producing conditions in 6-L scale bioreactors at Mn2+ ion-deficient (5 ppb) and Mn2+ ion-sufficient (100 ppb) conditions at three early time points of cultivation. We observed that Mn2+ deficiency triggers an upregulation of the citrate exporter gene cexA and provides functional evidence that this event is responsible for citrate overflow. In addition to the industrial relevance, this is the first study that examined the role of Mn2+ ion deficiency in a heterotrophic eukaryotic cell on a genome-wide scale.
Tárgyszavak:Természettudományok Biológiai tudományok idegen nyelvű folyóiratközlemény külföldi lapban
folyóiratcikk
Aspergillus niger
citric acid
manganese ions
citrate exporter
cexA
transcriptomics
gene expression
Megjelenés:Microbiology Spectrum. - - (2024), p.1-18. -
További szerzők:Bíró Vivien (1994-)c(mikrobiológus) Márton Alexandra (1994-) (mikrobiológus) Bakondi-Kovács István (1963-) (mikrobiológus) Karaffa Erzsébet Mónika (1972-) (mikrobiológus, egyetemi tanár) Kovács Béla (1963-) (okleveles vegyész, angol szakfordító) Geoffrion, Nicholas Tsang, Adrian Kubicek, Christian P. Karaffa Levente (1971-) (biotechnológus, egyetemi tanár)
Internet cím:Szerző által megadott URL
DOI
Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
Borító:

11.

001-es BibID:BIBFORM103023
035-os BibID:(cikkazonosító)935902 (WoS)000843102800001 (Scopus)85136210735
Első szerző:Fekete Erzsébet (biotechnológus, egyetemi tanár)
Cím:Bioreactor as the root cause of the "manganese effect" during Aspergillus niger citric acid fermentations / Fekete Erzsébet, Bíró Vivien, Márton Alexandra, Bakondi-Kovács István, Németh Zoltán Sándor Erzsébet, Kovács Béla, Fábián István, Kubicek Christian P., Tsang Adrian, Karaffa Levente
Dátum:2022
ISSN:2296-4185
Megjegyzések:High-yield citric acid production by the filamentous Ascomycete fungus Aspergillus niger requires a combination of extreme nutritional conditions, of which maintaining a low manganese (II) ion concentration (<5 ?g L?1 ) is a key feature. Technical-scale production of citric acid predominantly uses stainless- steel tank fermenters, but glass bioreactors used for strain improvement and manufacturing process development also contain stainless steel components, in which manganese is an essential alloying element. We show here that during citric acid fermentations manganese (II) ions were leaching from the bioreactor into the growth media, resulting in altered fungal physiology and morphology, and significant reduction of citric acid yields. The leaching of manganese (II) ions was dependent on the fermentation time, the acidity of the culture broth and the sterilization protocol applied. Manganese (II) ion leaching was partially mitigated by electrochemical polishing of stainless steel components of the bioreactor. High concentrations of manganese (II) ions during early cultivation led to a reduction in citric acid yield. However, the effect of manganese (II) ions on the reduction of citric acid yield diminished towards the second half of the fermentation. Since maintaining low concentrations of manganese (II) ions is costly, the results of this study can potentially be used to modify protocols to reduce the cost of citric acid production.
Tárgyszavak:Természettudományok Biológiai tudományok idegen nyelvű folyóiratközlemény külföldi lapban
folyóiratcikk
Aspergillus niger
manganese ions
citric acid
stainless steel
metal ions leaching
fungal morphology
Megjelenés:Frontiers in Bioengineering and Biotechnology. - 10 (2022), p. 1-12. -
További szerzők:Bíró Vivien (1994-)c(mikrobiológus) Márton Alexandra (1994-) (mikrobiológus) Bakondi-Kovács István (1963-) (mikrobiológus) Németh Zoltán (1987-) (biomérnök) Karaffa Erzsébet Mónika (1972-) (mikrobiológus, egyetemi tanár) Kovács Béla (1963-) (okleveles vegyész, angol szakfordító) Fábián István (1956-) (vegyész) Kubicek, Christian P. Tsang, Adrian Karaffa Levente (1971-) (biotechnológus, egyetemi tanár)
Internet cím:Szerző által megadott URL
DOI
Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
Borító:

12.

001-es BibID:BIBFORM101910
035-os BibID:(cikkazonosító)397 (WoS)000787051700001 (Scopus)85129122957
Első szerző:Fekete Erzsébet (biotechnológus, egyetemi tanár)
Cím:Unique and Repeated Stwintrons (Spliceosomal Twin Introns) in the Hypoxylaceae / Erzsébet Fekete, Fruzsina Pénzes, Norbert Ág, Viktória Ág-Rácz, Erzsébet Sándor, Claudio Scazzocchio, Michel Flipphi, Levente Karaffa
Dátum:2022
ISSN:2309-608X
Megjegyzések:Introns are usually non-coding sequences interrupting open reading frames in pre-mRNAs [D1,2]. Stwintrons are nested spliceosomal introns, where an internal intron splits a second donor sequence into two consecutive splicing reactions leading to mature mRNA. In Hypoxylon sp. CO27-5, 36 highly sequence-similar [D1,2] stwintrons are extant (sister stwintrons). An additional 81 [D1,2] sequence-unrelated stwintrons are described here. Most of them are located at conserved gene positions rooted deep in the Hypoxylaceae. Absence of exonic sequence bias at the exon?stwintron junctions and a very similar phase distribution were noted for both groups. The presence of an underlying sequence symmetry in all 117 stwintrons was striking. This symmetry, more pronounced near the termini of most of the full-length sister stwintrons, may lead to a secondary structure that brings into close proximity the most distal splice sites, the donor of the internal and the acceptor of the external intron. The Hypoxylon stwintrons were overwhelmingly excised by consecutive splicing reactions precisely removing the whole intervening sequence, whereas one excision involving the distal splice sites led to a frameshift. Alternative (mis)splicing took place for both sister and uniquely occurring stwintrons. The extraordinary symmetry of the sister stwintrons thus seems dispensable for the infrequent, direct utilisation of the distal splice sites.
Tárgyszavak:Természettudományok Biológiai tudományok idegen nyelvű folyóiratközlemény külföldi lapban
folyóiratcikk
spliceosomal introns
splicing; stwintrons
comparative genomics
stwintron dissemination
stwintron propagation
internal symmetry
single-stranded RNA secondary structure prediction
Hypoxylon sp. CO27-5
Hypoxylaceae
Megjelenés:Journal of Fungi. - 8 : 4 (2022), p. 1-23. -
További szerzők:Pénzes Fruzsina (1995-) (okleveles biomérnök) Ág Norbert (1987-) (okleveles biomérnök) Ág-Rácz Viktória (1991-) (mikrobiológus) Karaffa Erzsébet Mónika (1972-) (mikrobiológus, egyetemi tanár) Scazzocchio, Claudio Flipphi, Michel (1964-) Karaffa Levente (1971-) (biotechnológus, egyetemi tanár)
Internet cím:Szerző által megadott URL
DOI
Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
Borító:
Rekordok letöltése1 2 3 4 
Corvina könyvtári katalógus v8.2.27 © 2023 Monguz kft. Minden jog fenntartva.