Találati lista | Tudóstér

001-es BibID:	BIBFORM067436
035-os BibID:	(WoS)000394827800001 (Scopus)85013301401
Első szerző:	De Vries, Ronald P.
Cím:	Comparative genomics reveals high biological diversity and specific adaptations in the industrially and medically important fungal genus Aspergillus / Ronald P. de Vries, Robert Riley, Ad Wiebenga, Guillermo Aguilar-Osorio, Sotiris Amillis, Cristiane Akemi Uchima, Gregor Anderluh, Mojtaba Asadollahi, Marion Askin, Kerrie Barry, Evy Battaglia, Özgür Bayram, Tiziano Benocci, Susanna A. Braus-Stromeyer, Camila Caldana, David Cánovas, Gustavo C. Cerqueira, Fusheng Chen, Wanping Chen, Cindy Choi, Alicia Clum, Renato Augusto Corrêa dos Santos, André Ricardo de Lima Damásio, George Diallinas, Tamás Emri, Erzsébet Fekete, Michel Flipphi, Susanne Freyberg, Antonia Gallo, Christos Gournas, Rob Habgood, Matthieu Hainaut, María Laura Harispe, Bernard Henrissat, Kristiina S. Hildén, Ryan Hope, Abeer Hossain, Eugenia Karabika, Levente Karaffa, Zsolt Karányi, Nada Kraševec, Alan Kuo, Harald Kusch, Kurt LaButti, Ellen L. Lagendijk, Alla Lapidus, Anthony Levasseur, Erika Lindquist, Anna Lipzen, Antonio F. Logrieco, Andrew MacCabe, Miia R. Mäkelä, Iran Malavazi, Petter Melin, Vera Meyer, Natalia Mielnichuk, Márton Miskei, Ákos P. Molnár, Giuseppina Mulé, Chew Yee Ngan, Margarita Orejas, Erzsébet Orosz, Jean Paul Ouedraogo, Karin M. Overkamp, Hee-Soo Park, Giancarlo Perrone, Francois Piumi, Peter J. Punt, Arthur F. J. Ram, Ana Ramón, Stefan Rauscher, Eric Record, Diego Mauricio Riaño-Pachón, Vincent Robert, Julian Röhrig, Roberto Ruller, Asaf Salamov, Nadhira S. Salih, Rob A. Samson, Erzsébet Sándor, Manuel Sanguinetti, Tabea Schütze, Kristina Sepčić, Ekaterina Shelest, Gavin Sherlock, Vicky Sophianopoulou, Fabio M. Squina, Hui Sun, Antonia Susca, Richard B. Todd, Adrian Tsang, Shiela E. Unkles, Nathalie van de Wiele, Diana van Rossen-Uffink, Juliana Velasco de Castro Oliveira, Tammi C. Vesth, Jaap Visser, Jae-Hyuk Yu, Miaomiao Zhou, Mikael R. Andersen, David B. Archer, Scott E. Baker, Isabelle Benoit, Axel A. Brakhage, Gerhard H. Braus, Reinhard Fischer, Jens C. Frisvad, Gustavo H. Goldman, Jos Houbraken, Berl Oakley, István Pócsi, Claudio Scazzocchio, Bernhard Seiboth, Patricia A. van Kuyk, Jennifer Wortman, Paul S. Dyer, Igor V. Grigoriev
Dátum:	2017
ISSN:	1474-760X
Tárgyszavak:	Természettudományok Biológiai tudományok idegen nyelvű folyóiratközlemény külföldi lapban folyóiratcikk biological diversity
Megjelenés:	Genome Biology. - 18 : 28 (2017), p. 1-45. -
További szerzők:	Riley, Robert Wiebenga, Ad Aguilar-Osorio, Guillermo Amillis, Sotiris Akemi Uchima, Cristiane Anderluh, Gregor Asadollahi, Mojtaba Askin, Marion Barry, Kerrie Battaglia, Evy Bayram, Özgür Benocci, Tiziano Braus-Stromeyer, Susanna A. Caldana, Camila Cánovas, David Cerqueira, Gustavo C. Chen, Fusheng Chen, Wanping Choi, Cindy Clum, Alicia Corrêa dos Santos, Renato Augusto Lima Damásio, André Ricardo de Diallinas, George Emri Tamás (1969-) (biológus) Fekete Erzsébet (1975-) (biotechnológus, egyetemi tanár) Flipphi, Michel (1964-) Freyberg, Suzanne Gallo, Antonia Gournas, Christos Habgood, Rob Hainaut, Matthieu Harispe, María Laura Henrissat, Bernard Hildén, Kristiina S. Hope, Ryan Hossain, Abeer Karabika, Eugenia Karaffa Levente (1971-) (biotechnológus, egyetemi tanár) Karányi Zsolt (1961-) (biostatisztikus, bioinformatikus) Kraševec, Nada Kuo, Alan Kusch, Harald LaButti, Kurt Lagendijk, Ellen L. Lapidus, Alla Levasseur, Anthony Lindquist, Erika Lipzen, Anna Logrieco, Antonio F. MacCabe, Andrew Mäkelä, Miia R. Malavazi, Iran Melin, Petter Meyer, Vera Mielnichuk, Natalia Miskei Márton (1978-) (molekuláris biológus, genetikus) Molnár Ákos Péter (1988-) (okleveles biomérnök) Mulé, Giuseppina Ngan, Chew Yee Orejas, Margarita Orosz Erzsébet (1988-) (biológus) Ouedraogo, Jean Paul Overkamp, Karin M. Park, Hee-Soo Perrone, Giancarlo Piumi, Francois Punt, Peter J. Ram, Arthur F.J. Ramón, Ana Rauscher, Stefan Record, Eric Riaño-Pachón, Diego Mauricio Robert, Vincent Röhrig, Julian Ruller, Roberto Salamov, Asaf Salih, Nadhira S. Samson, Robert A. Karaffa Erzsébet Mónika (1972-) (mikrobiológus, egyetemi tanár) Sanguinetti, Manuel Schütze, Tabea Sepčić, Kristina Shelest, Ekaterina Sherlock, Gavin Sophianopoulou, Vicky Squina, Fabio M. Sun, Hui Susca, Antonia Todd, Richard B. Tsang, Adrian Unkles, Shiela E. Wiele, Nathalie van de Rossen-Uffink, Diana van Velasco de Castro Oliveira, Juliana Vesth, Tammi C. Visser, Jaap Yu Jae-Hyuk Zhou, Miaomiao Andersen, Mikael R. Archer, David Baker, Scott E. Benoit, Isabelle Brakhage, Axel A. Braus, Gerhard Fischer, Reinhard Frisvad, Jens Christian Goldman, Gustavo Houbraken, Jos Oakley, Berl R. Pócsi István (1961-) (vegyész) Scazzocchio, Claudio Seiboth, Bernhard Kuyk, Patricia A. van Wortman, Jennifer Russo Dyer, Paul S. Grigoriev, Igor V.
Pályázati támogatás:	OTKA-K100464 OTKA TÁMOP 4.2.1./B-09/1/KONV-2010-0007 TÁMOP SROP-4.2.2.B-15/1/KONV-2015-0001 Egyéb
Internet cím:	DOI Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
Borító:
Saját polcon:

001-es BibID:	BIBFORM018139
Első szerző:	Kubicek, Christian P.
Cím:	Comparative genome sequence analysis underscores mycoparasitism as the ancestral life style of Trichoderma / Christian P Kubicek, Alfredo Herrera-Estrella, Verena Seidl-Seiboth, Diego A Martinez, Irina S Druzhinina, Michael Thon, Susanne Zeilinger, Sergio Casas-Flores, Benjamin A Horwitz, Prasun K Mukherjee, Mala Mukherjee, László Kredics, Luis D Alcaraz, Andrea Aerts, Zsuzsanna Antal, Lea Atanasova, Mayte G Cervantes-Badillo, Jean Challacombe, Olga Chertkov, Kevin McCluskey, Fanny Coulpier, Nandan Deshpande, Hans von Döhren, Daniel J Ebbole, Edgardo U Esquivel-Naranjo, Erzsébet Fekete, Michel Flipphi, Fabian Glaser, Elida Y Gómez-Rodríguez, Sabine Gruber, Cliff Han, Bernard Henrissat, Rosa Hermosa, Miguel Hernández-Oñate, Levente Karaffa, Idit Kosti, Stéphane Le Crom, Erika Lindquist, Susan Lucas, Mette Lübeck, Peter S Lübeck, Antoine Margeot, Benjamin Metz, Monica Misra, Helena Nevalainen, Markus Omann, Nicolle Packer, Giancarlo Perrone, Edith E Uresti-Rivera, Asaf Salamov, Monika Schmoll, Bernhard Seiboth, Harris Shapiro, Serenella Sukno, Juan Antonio Tamayo-Ramos, Doris Tisch, Aric Wiest, Heather H Wilkinson, Michael Zhang, Pedro M Coutinho, Charles M Kenerley, Enrique Monte, Scott E Baker, Igor V Grigoriev
Dátum:	2011
ISSN:	1474-760X
Megjegyzések:	Background Mycoparasitism, a lifestyle where one fungus is parasitic on another fungus, has special relevance when the prey is a plant pathogen, providing a strategy for biological control of pests for plant protection. Probably, the most studied biocontrol agents are species of the genus Hypocrea/Trichoderma. Results Here we report an analysis of the genome sequences of the two biocontrol species Trichoderma atroviride (teleomorph Hypocrea atroviridis) and Trichoderma virens (formerly Gliocladium virens, teleomorph Hypocrea virens), and a comparison with Trichoderma reesei (teleomorph Hypocrea jecorina). These three Trichoderma species display a remarkable conservation of gene order (78 to 96%), and a lack of active mobile elements probably due to repeat-induced point mutation. Several gene families are expanded in the two mycoparasitic species relative to T. reesei or other ascomycetes, and are overrepresented in non-syntenic genome regions. A phylogenetic analysis shows that T. reesei and T. virens are derived relative to T. atroviride. The mycoparasitism-specific genes thus arose in a common Trichoderma ancestor but were subsequently lost in T. reesei. Conclusions The data offer a better understanding of mycoparasitism, and thus enforce the development of improved biocontrol strains for efficient and environmentally friendly protection of plants.
Tárgyszavak:	Természettudományok Biológiai tudományok idegen nyelvű folyóiratközlemény külföldi lapban
Megjelenés:	Genome Biology. - 12 : 4 (2011), p. 1-15. -
További szerzők:	Herrera-Estrella, Alfredo Seidl-Seiboth, Verena Martinez, Diego A. Druzhinina, Irina S. Thon, Michael Zeilinger, Susanne Casas-Flores, Sergio Horwitz, Benjamin A. Mukherjee, Prasun K. Mukherjee, Mala Kredics László Alcaraz, Luis D. Aerts, Andrea Antal Zsuzsanna (Szeged) Atanasova, Lea Cervantes-Badillo, Mayte G. Challacombe, Jean Chertkov, Olga McCluskey, Kevin Coulpier, Fanny Deshpande, Nandan Döhren, Hans Von Ebbole, Daniel J. Esquivel-Naranjo, Edgardo U. Fekete Erzsébet (1975-) (biotechnológus, egyetemi tanár) Flipphi, Michel (1964-) Glaser, Fabian Gómez-Rodríguez, Elida Y Gruber, Sabine Han, Cliff Henrissat, Bernard Hermosa, Rosa Hernández-Oñate, Miguel Karaffa Levente (1971-) (biotechnológus, egyetemi tanár) Kosti, Idit Le Crom, Stéphane Lindquist, Erika Lucas, Susan Lübeck, Mette Lübeck, Peter S. Margeot, Antoine Metz, Benjamin Misra, Monica Nevalainen, Helena Omann, Markus Packer, Nicolle Perrone, Giancarlo Uresti-Rivera, Edith E. Salamov, Asaf Schmoll, Monika Seiboth, Bernhard Shapiro, Harris Sukno, Serenella Tamayo-Ramos, Juan Antonio Tisch, Doris Wiest, Aric Wilkinson, Heather H. Zhang, Michael Coutinho, Pedro M. Kenerley, Charles M. Monte, Enrique Baker, Scott E. Grigoriev, Igor V.
Internet cím:	Szerző által megadott URL DOI Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
Borító:
Saját polcon:

001-es BibID:	BIBFORM119878
035-os BibID:	(Scopus)85125190008 (WOS)000769555600001
Első szerző:	Meng, Jiali
Cím:	GalR, GalX and AraR co-regulate D-galactose and L-arabinose utilization in Aspergillus nidulans / Jiali Meng, Zoltán Németh, Mao Peng, Erzsébet Fekete, Sandra Garrigues, Anna Lipzen, Vivian Ng, Emily Savage, Yu Zhang, Igor V. Grigoriev, Miia R. Mäkelä, Levente Karaffa, Ronald P. de Vries
Dátum:	2022
ISSN:	1751-7915
Megjegyzések:	Filamentous fungi produce a wide variety of enzymes in order to efficiently degrade plant cell wall polysaccharides. The production of these enzymes is controlled by transcriptional regulators, which also control the catabolic pathways that convert the released monosaccharides. Two transcriptional regulators, GalX and GalR, control d-galactose utilization in the model filamentous fungus Aspergillus nidulans, while the arabinanolytic regulator AraR regulates l-arabinose catabolism. d-Galactose and l-arabinose are commonly found together in polysaccharides, such as arabinogalactan, xylan and rhamnogalacturonan I. Therefore, the catabolic pathways that convert d-galactose and l-arabinose are often also likely to be active simultaneously. In this study, we investigated the interaction between GalX, GalR and AraR in d-galactose and l-arabinose catabolism. For this, we generated single, double and triple mutants of the three regulators, and analysed their growth and enzyme and gene expression profiles. Our results clearly demonstrated that GalX, GalR and AraR co-regulate d-galactose catabolism in A. nidulans. GalX has a prominent role on the regulation of genes of d-galactose oxido-reductive pathway, while AraR can compensate for the absence of GalR and/or GalX.
Tárgyszavak:	Természettudományok Biológiai tudományok idegen nyelvű folyóiratközlemény külföldi lapban folyóiratcikk transcriptional activator xlnr primary carbon metabolism d-xylose reductase catabolic pathway beta-galactosidase missing link identification dehydrogenase niger evolution
Megjelenés:	Microbial Biotechnology. - 15 : 6 (2022), p. 1839-1851. -
További szerzők:	Németh Zoltán (1987-) (biomérnök) Peng, Mao Fekete Erzsébet (1975-) (biotechnológus, egyetemi tanár) Garrigues, Sandra Lipzen, Anna Ng, Vivian Savage, Emily Zhang, Yu Grigoriev, Igor V. Mäkelä, Miia R. Karaffa Levente (1971-) (biotechnológus, egyetemi tanár) De Vries, Ronald P.
Pályázati támogatás:	NN128867 Egyéb K138489 Egyéb
Internet cím:	Szerző által megadott URL DOI Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
Borító:
Saját polcon: