CCL

Összesen 10 találat.
#/oldal:
Részletezés:
Rendezés:

1.

001-es BibID:BIBFORM087417
035-os BibID:(Cikkazonosító)6022 (WOS)000549142200022 (Scopus)85083071536
Első szerző:Ág Norbert (okleveles biomérnök)
Cím:Complex intron generation in the yeast genus Lipomyces / Norbert Ág, Napsugár Kavalecz, Fruzsina Pénzes, Levente Karaffa, Claudio Scazzocchio, Michel Flipphi, Erzsébet Fekete
Dátum:2020
ISSN:2045-2322
Tárgyszavak:Természettudományok Biológiai tudományok idegen nyelvű folyóiratközlemény külföldi lapban
folyóiratcikk
Megjelenés:Scientific Reports. - 10 (2020), p. 1-10. -
További szerzők:Kavalecz Napsugár (1992-) (biomérnök) Pénzes Fruzsina (1995-) (okleveles biomérnök) Karaffa Levente (1971-) (biotechnológus, egyetemi tanár) Scazzocchio, Claudio Flipphi, Michel (1964-) Fekete Erzsébet (1975-) (biotechnológus, egyetemi tanár)
Pályázati támogatás:GINOP-2.3.2-15-2016-00008
GINOP
EFOP-3.6.1-16-2016-00022
EFOP
BO/00093/18/8
Egyéb
ÚNKP-19-3
Egyéb
ÚNKP-19-4
Egyéb
KH129602
Egyéb
NN128867
Egyéb
Internet cím:Szerző által megadott URL
DOI
Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
Borító:

2.

001-es BibID:BIBFORM062950
035-os BibID:(Scopus)84945960001 (WoS)000366068300002
Első szerző:Ág Norbert (okleveles biomérnök)
Cím:Alternatively spliced, spliceosomal twin introns in Helminthosporium solani / Norbert Ág, Michel Flipphi, Levente Karaffa, Claudio Scazzocchio, Erzsébet Fekete
Dátum:2015
ISSN:1087-1845
Tárgyszavak:Természettudományok Biológiai tudományok idegen nyelvű folyóiratközlemény külföldi lapban
Megjelenés:Fungal Genetics and Biology. - 85 (2015), p. 7-13. -
További szerzők:Flipphi, Michel (1964-) Karaffa Levente (1971-) (biotechnológus, egyetemi tanár) Scazzocchio, Claudio Fekete Erzsébet (1975-) (biotechnológus, egyetemi tanár)
Internet cím:Szerző által megadott URL
DOI
Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
Borító:

3.

001-es BibID:BIBFORM067436
035-os BibID:(WoS)000394827800001 (Scopus)85013301401
Első szerző:De Vries, Ronald P.
Cím:Comparative genomics reveals high biological diversity and specific adaptations in the industrially and medically important fungal genus Aspergillus / Ronald P. de Vries, Robert Riley, Ad Wiebenga, Guillermo Aguilar-Osorio, Sotiris Amillis, Cristiane Akemi Uchima, Gregor Anderluh, Mojtaba Asadollahi, Marion Askin, Kerrie Barry, Evy Battaglia, Özgür Bayram, Tiziano Benocci, Susanna A. Braus-Stromeyer, Camila Caldana, David Cánovas, Gustavo C. Cerqueira, Fusheng Chen, Wanping Chen, Cindy Choi, Alicia Clum, Renato Augusto Corrêa dos Santos, André Ricardo de Lima Damásio, George Diallinas, Tamás Emri, Erzsébet Fekete, Michel Flipphi, Susanne Freyberg, Antonia Gallo, Christos Gournas, Rob Habgood, Matthieu Hainaut, María Laura Harispe, Bernard Henrissat, Kristiina S. Hildén, Ryan Hope, Abeer Hossain, Eugenia Karabika, Levente Karaffa, Zsolt Karányi, Nada Kraševec, Alan Kuo, Harald Kusch, Kurt LaButti, Ellen L. Lagendijk, Alla Lapidus, Anthony Levasseur, Erika Lindquist, Anna Lipzen, Antonio F. Logrieco, Andrew MacCabe, Miia R. Mäkelä, Iran Malavazi, Petter Melin, Vera Meyer, Natalia Mielnichuk, Márton Miskei, Ákos P. Molnár, Giuseppina Mulé, Chew Yee Ngan, Margarita Orejas, Erzsébet Orosz, Jean Paul Ouedraogo, Karin M. Overkamp, Hee-Soo Park, Giancarlo Perrone, Francois Piumi, Peter J. Punt, Arthur F. J. Ram, Ana Ramón, Stefan Rauscher, Eric Record, Diego Mauricio Riaño-Pachón, Vincent Robert, Julian Röhrig, Roberto Ruller, Asaf Salamov, Nadhira S. Salih, Rob A. Samson, Erzsébet Sándor, Manuel Sanguinetti, Tabea Schütze, Kristina Sepčić, Ekaterina Shelest, Gavin Sherlock, Vicky Sophianopoulou, Fabio M. Squina, Hui Sun, Antonia Susca, Richard B. Todd, Adrian Tsang, Shiela E. Unkles, Nathalie van de Wiele, Diana van Rossen-Uffink, Juliana Velasco de Castro Oliveira, Tammi C. Vesth, Jaap Visser, Jae-Hyuk Yu, Miaomiao Zhou, Mikael R. Andersen, David B. Archer, Scott E. Baker, Isabelle Benoit, Axel A. Brakhage, Gerhard H. Braus, Reinhard Fischer, Jens C. Frisvad, Gustavo H. Goldman, Jos Houbraken, Berl Oakley, István Pócsi, Claudio Scazzocchio, Bernhard Seiboth, Patricia A. van Kuyk, Jennifer Wortman, Paul S. Dyer, Igor V. Grigoriev
Dátum:2017
ISSN:1474-760X
Tárgyszavak:Természettudományok Biológiai tudományok idegen nyelvű folyóiratközlemény külföldi lapban
folyóiratcikk
biological diversity
Megjelenés:Genome Biology. - 18 : 28 (2017), p. 1-45. -
További szerzők:Riley, Robert Wiebenga, Ad Aguilar-Osorio, Guillermo Amillis, Sotiris Akemi Uchima, Cristiane Anderluh, Gregor Asadollahi, Mojtaba Askin, Marion Barry, Kerrie Battaglia, Evy Bayram, Özgür Benocci, Tiziano Braus-Stromeyer, Susanna A. Caldana, Camila Cánovas, David Cerqueira, Gustavo C. Chen, Fusheng Chen, Wanping Choi, Cindy Clum, Alicia Corrêa dos Santos, Renato Augusto Lima Damásio, André Ricardo de Diallinas, George Emri Tamás (1969-) (biológus) Fekete Erzsébet (1975-) (biotechnológus, egyetemi tanár) Flipphi, Michel (1964-) Freyberg, Suzanne Gallo, Antonia Gournas, Christos Habgood, Rob Hainaut, Matthieu Harispe, María Laura Henrissat, Bernard Hildén, Kristiina S. Hope, Ryan Hossain, Abeer Karabika, Eugenia Karaffa Levente (1971-) (biotechnológus, egyetemi tanár) Karányi Zsolt (1961-) (biostatisztikus, bioinformatikus) Kraševec, Nada Kuo, Alan Kusch, Harald LaButti, Kurt Lagendijk, Ellen L. Lapidus, Alla Levasseur, Anthony Lindquist, Erika Lipzen, Anna Logrieco, Antonio F. MacCabe, Andrew Mäkelä, Miia R. Malavazi, Iran Melin, Petter Meyer, Vera Mielnichuk, Natalia Miskei Márton (1978-) (molekuláris biológus, genetikus) Molnár Ákos Péter (1988-) (okleveles biomérnök) Mulé, Giuseppina Ngan, Chew Yee Orejas, Margarita Orosz Erzsébet (1988-) (biológus) Ouedraogo, Jean Paul Overkamp, Karin M. Park, Hee-Soo Perrone, Giancarlo Piumi, Francois Punt, Peter J. Ram, Arthur F.J. Ramón, Ana Rauscher, Stefan Record, Eric Riaño-Pachón, Diego Mauricio Robert, Vincent Röhrig, Julian Ruller, Roberto Salamov, Asaf Salih, Nadhira S. Samson, Robert A. Karaffa Erzsébet Mónika (1972-) (mikrobiológus, egyetemi tanár) Sanguinetti, Manuel Schütze, Tabea Sepčić, Kristina Shelest, Ekaterina Sherlock, Gavin Sophianopoulou, Vicky Squina, Fabio M. Sun, Hui Susca, Antonia Todd, Richard B. Tsang, Adrian Unkles, Shiela E. Wiele, Nathalie van de Rossen-Uffink, Diana van Velasco de Castro Oliveira, Juliana Vesth, Tammi C. Visser, Jaap Yu Jae-Hyuk Zhou, Miaomiao Andersen, Mikael R. Archer, David Baker, Scott E. Benoit, Isabelle Brakhage, Axel A. Braus, Gerhard Fischer, Reinhard Frisvad, Jens Christian Goldman, Gustavo Houbraken, Jos Oakley, Berl R. Pócsi István (1961-) (vegyész) Scazzocchio, Claudio Seiboth, Bernhard Kuyk, Patricia A. van Wortman, Jennifer Russo Dyer, Paul S. Grigoriev, Igor V.
Pályázati támogatás:OTKA-K100464
OTKA
TÁMOP 4.2.1./B-09/1/KONV-2010-0007
TÁMOP
SROP-4.2.2.B-15/1/KONV-2015-0001
Egyéb
Internet cím:DOI
Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
Borító:

4.

001-es BibID:BIBFORM101910
035-os BibID:(cikkazonosító)397 (WoS)000787051700001 (Scopus)85129122957
Első szerző:Fekete Erzsébet (biotechnológus, egyetemi tanár)
Cím:Unique and Repeated Stwintrons (Spliceosomal Twin Introns) in the Hypoxylaceae / Erzsébet Fekete, Fruzsina Pénzes, Norbert Ág, Viktória Ág-Rácz, Erzsébet Sándor, Claudio Scazzocchio, Michel Flipphi, Levente Karaffa
Dátum:2022
ISSN:2309-608X
Megjegyzések:Introns are usually non-coding sequences interrupting open reading frames in pre-mRNAs [D1,2]. Stwintrons are nested spliceosomal introns, where an internal intron splits a second donor sequence into two consecutive splicing reactions leading to mature mRNA. In Hypoxylon sp. CO27-5, 36 highly sequence-similar [D1,2] stwintrons are extant (sister stwintrons). An additional 81 [D1,2] sequence-unrelated stwintrons are described here. Most of them are located at conserved gene positions rooted deep in the Hypoxylaceae. Absence of exonic sequence bias at the exon?stwintron junctions and a very similar phase distribution were noted for both groups. The presence of an underlying sequence symmetry in all 117 stwintrons was striking. This symmetry, more pronounced near the termini of most of the full-length sister stwintrons, may lead to a secondary structure that brings into close proximity the most distal splice sites, the donor of the internal and the acceptor of the external intron. The Hypoxylon stwintrons were overwhelmingly excised by consecutive splicing reactions precisely removing the whole intervening sequence, whereas one excision involving the distal splice sites led to a frameshift. Alternative (mis)splicing took place for both sister and uniquely occurring stwintrons. The extraordinary symmetry of the sister stwintrons thus seems dispensable for the infrequent, direct utilisation of the distal splice sites.
Tárgyszavak:Természettudományok Biológiai tudományok idegen nyelvű folyóiratközlemény külföldi lapban
folyóiratcikk
spliceosomal introns
splicing; stwintrons
comparative genomics
stwintron dissemination
stwintron propagation
internal symmetry
single-stranded RNA secondary structure prediction
Hypoxylon sp. CO27-5
Hypoxylaceae
Megjelenés:Journal of Fungi. - 8 : 4 (2022), p. 1-23. -
További szerzők:Pénzes Fruzsina (1995-) (okleveles biomérnök) Ág Norbert (1987-) (okleveles biomérnök) Ág-Rácz Viktória (1991-) (mikrobiológus) Karaffa Erzsébet Mónika (1972-) (mikrobiológus, egyetemi tanár) Scazzocchio, Claudio Flipphi, Michel (1964-) Karaffa Levente (1971-) (biotechnológus, egyetemi tanár)
Internet cím:Szerző által megadott URL
DOI
Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
Borító:

5.

001-es BibID:BIBFORM096118
035-os BibID:(cikkazonosító)710 (WoS)000699660000001 (Scopus)85114371224
Első szerző:Fekete Erzsébet (biotechnológus, egyetemi tanár)
Cím:Internally Symmetrical Stwintrons and Related Canonical Introns in Hypoxylaceae Species / Erzsébet Fekete, Fruzsina Pénzes, Norbert Ág, Claudio Scazzocchio, Michel Flipphi, Levente Karaffa
Dátum:2021
ISSN:2309-608X
Megjegyzések:Spliceosomal introns are pervasive in eukaryotes. Intron gains and losses have occurred throughout evolution, but the origin of new introns is unclear. Stwintrons are complex intervening sequences where one of the sequence elements (5·?donor, lariat branch point element or 3·?acceptor) necessary for excision of a U2 intron (external intron) is itself interrupted by a second (internal) U2 intron. In Hypoxylaceae, a family of endophytic fungi, we uncovered scores of donor?disrupted stwintrons with striking sequence similarity among themselves and also with canonical introns. Intron-exon structure comparisons suggest that these stwintrons have proliferated within diverging taxa but also give rise to proliferating canonical introns in some genomes. The proliferated (stw)introns have integrated seamlessly at novel gene positions. The recently proliferated (stw)introns appear to originate from a conserved ancestral stwintron characterised by terminal inverted repeats (45-55 nucleotides), a highly symmetrical structure that may allow the formation of a double?stranded intron RNA molecule. No short tandem duplications flank the putatively inserted intervening sequences, which excludes a DNA transposition?based mechanism of proliferation. It is tempting to suggest that this highly symmetrical structure may have a role in intron proliferation by (an)other mechanism(s).
Tárgyszavak:Természettudományok Biológiai tudományok idegen nyelvű folyóiratközlemény külföldi lapban
folyóiratcikk
Megjelenés:Journal of Fungi. - 7 (2021), p. 1-21. -
További szerzők:Pénzes Fruzsina (1995-) (okleveles biomérnök) Ág Norbert (1987-) (okleveles biomérnök) Scazzocchio, Claudio Flipphi, Michel (1964-) Karaffa Levente (1971-) (biotechnológus, egyetemi tanár)
Pályázati támogatás:ÚNKP-20-3-I-DE-40
Egyéb
ÚNKP-20-5-DE-13
Egyéb
Internet cím:Szerző által megadott URL
DOI
Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
Borító:

6.

001-es BibID:BIBFORM069231
035-os BibID:(WoS)000409380900041 (Scopus)85031016310
Első szerző:Fekete Erzsébet (biotechnológus, egyetemi tanár)
Cím:A mechanism for a single nucleotide intron shift / Erzsebet Fekete, Michel Flipphi, Norbert Ag, Napsugar Kavalecz, Gustavo Cerqueira, Claudio Scazzocchio, Levente Karaffa
Dátum:2017
ISSN:0305-1048 1362-4962
Megjegyzések:Spliceosomal introns can occupy nearby rather than identical positions in orthologousgenes (intron sliding or shifting). Stwintrons are complex intervening sequences, wherean "internal" intron interrupts one of the sequences essential for splicing, generatingafter its excision, a newly formed canonical intron defined as "external". In oneexperimentally demonstrated configuration, two alternatively excised internal introns,overlapping by one G, disrupt respectively the donor and the acceptor sequence of anexternal intron, leading to mRNAs encoding identical proteins. In a gene encoding aDHA1 antiporter in Pezizomycotina, we find a variety of predicted intron configurationsinterrupting the DNA stretch encoding a conserved peptidic sequence. Some sport astwintron where the internal intron interrupts the donor of the external intron(experimentally confirmed for Aspergillus nidulans). In others, we found anddemonstrate (for Trichoderma reesei) alternative, overlapping internal introns.Discordant canonical introns, one nt apart, are present in yet other species, exactly aspredicted by the alternative loss of either of the internal introns at the DNA level froman alternatively spliced stwintron. An evolutionary pathway of one nt intron shift,involving an alternatively spliced stwintron intermediate is proposed on the basis of theexperimental and genomic data presented.
Tárgyszavak:Természettudományok Biológiai tudományok idegen nyelvű folyóiratközlemény külföldi lapban
folyóiratcikk
Megjelenés:Nucleic Acids Research. - 45 : 15 (2017), p. 9085-9092. -
További szerzők:Flipphi, Michel (1964-) Ág Norbert (1987-) (okleveles biomérnök) Kavalecz Napsugár (1992-) (biomérnök) Cerqueira, Gustavo C. Scazzocchio, Claudio Karaffa Levente (1971-) (biotechnológus, egyetemi tanár)
Pályázati támogatás:BO/00548/14
Egyéb
OTKA-116519
OTKA
GINOP-2.3.2-15-2016-00008
GINOP
Internet cím:DOI
Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
Szerző által megadott URL
Borító:

7.

001-es BibID:BIBFORM075424
Első szerző:Flipphi, Michel
Cím:Emergence and loss of spliceosomal twin introns / Michel Flipphi, Norbert Ág, Levente Karaffa, Napsugár Kavalecz, Gustavo Cerqueira, Claudio Scazzocchio, Erzsébet Fekete
Dátum:2017
ISSN:2054-3085
Tárgyszavak:Természettudományok Biológiai tudományok idegen nyelvű folyóiratközlemény külföldi lapban
Megjelenés:Fungal Biology and Biotechnology. - 4 : 1 (2017), p. 7. -
További szerzők:Ág Norbert (1987-) (okleveles biomérnök) Karaffa Levente (1971-) (biotechnológus, egyetemi tanár) Kavalecz Napsugár (1992-) (biomérnök) Cerqueira, Gustavo C. Scazzocchio, Claudio Fekete Erzsébet (1975-) (biotechnológus, egyetemi tanár)
Pályázati támogatás:GINOP-2.3.2-15-2016-00008
GINOP
OTKA-116519
OTKA
BO/00548/14
Egyéb
Internet cím:Szerző által megadott URL
DOI
Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
Borító:

8.

001-es BibID:BIBFORM051658
Első szerző:Flipphi, Michel
Cím:Spliceosome twin introns in fungal nuclear transcripts / Michel Flipphi, Erzsébet Fekete, Norbert Ág, Claudio Scazzocchio, Levente Karaffa
Dátum:2013
ISSN:1087-1845
Tárgyszavak:Természettudományok Biológiai tudományok idegen nyelvű folyóiratközlemény külföldi lapban
Megjelenés:Fungal Genetics and Biology. - 57 (2013), p. 48-57. -
További szerzők:Fekete Erzsébet (1975-) (biotechnológus, egyetemi tanár) Ág Norbert (1987-) (okleveles biomérnök) Scazzocchio, Claudio Karaffa Levente (1971-) (biotechnológus, egyetemi tanár)
Internet cím:Szerző által megadott URL
DOI
Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
Borító:

9.

001-es BibID:BIBFORM080574
Első szerző:Kavalecz Napsugár (biomérnök)
Cím:The first instance of a lariat branch point motif-interrupted spliceosomal twin intron in Aspergilius nidulans / Napsugár Kavalecz, Michel Flipphi, Norbert Ág, Levente Karaffa, Claudio Scazzocchio, Erzsébet Fekete
Dátum:2018
ISBN:978 963 429 210 4
Tárgyszavak:Természettudományok Kémiai tudományok előadáskivonat
könyvrészlet
Megjelenés:VII. Interdiszciplináris Doktorandusz Konferencia 2018 absztraktkötet / szerk. Bódog Ferenc. - p. 73. -
További szerzők:Flipphi, Michel (1964-) Ág Norbert (1987-) (okleveles biomérnök) Karaffa Levente (1971-) (biotechnológus, egyetemi tanár) Scazzocchio, Claudio Fekete Erzsébet (1975-) (biotechnológus, egyetemi tanár)
Internet cím:Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
Borító:

10.

001-es BibID:BIBFORM079814
035-os BibID:(cikkazonosító)9940 (PMID)31289343 (WOS)000474505900051 (Scopus)85068776427
Első szerző:Kavalecz Napsugár (biomérnök)
Cím:A spliceosomal twin intron (stwintron) participates in both exon skipping and evolutionary exon loss / Napsugár Kavalecz, Norbert Ág, Levente Karaffa, Claudio Scazzocchio, Michel Flipphi, Erzsébet Fekete
Dátum:2019
ISSN:2045-2322
Megjegyzések:Spliceosomal twin introns (stwintrons) are introns where any of the three consensus sequences involved in splicing is interrupted by another intron (internal intron). In Aspergillus nidulans, a donor-disrupted stwintron (intron-1) is extant in the transcript encoding a reticulon-like protein. The orthologous transcript of Aspergillus niger can be alternatively spliced; the exon downstream the stwintron could be skipped by excising a sequence that comprises this stwintron, the neighbouring intron-2, and the exon bounded by these. This process involves the use of alternative 3? splice sites for the internal intron, the resulting alternative intervening sequence being a longer 3?-extended stwintron. In 29 species of Onygenales, a multi-step splicing process occurs in the orthologous transcript, in which a complex intervening sequence including the stwintron and neigbouring intron-2, generates by three splicing reactions a ?second order intron" which must then be excised with a fourth splicing event. The gene model in two species can be envisaged as one canonical intron (intron-1) evolved from this complex intervening sequence of nested canonical introns found elsewhere in Onygenales. Postulated splicing intermediates were experimentally verified in one or more species. This work illustrates a role of stwintrons in both alternative splicing and the evolution of intron structure.
Tárgyszavak:Természettudományok Biológiai tudományok idegen nyelvű folyóiratközlemény külföldi lapban
folyóiratcikk
Megjelenés:Scientific Reports. - 9 : 1 (2019), p. 1-11. -
További szerzők:Ág Norbert (1987-) (okleveles biomérnök) Karaffa Levente (1971-) (biotechnológus, egyetemi tanár) Scazzocchio, Claudio Flipphi, Michel (1964-) Fekete Erzsébet (1975-) (biotechnológus, egyetemi tanár)
Pályázati támogatás:GINOP-2.3.2-15-2016-00008
GINOP
NKFIH KH 129602
egyéb
NKFIH NN128867
egyéb
NKFIH NN116519
egyéb
BO/00093/18/8
egyéb
ÚNKP-18-3-II-DE-140
egyéb
ÚNKP-18-4-DE-3
egyéb
Internet cím:Szerző által megadott URL
DOI
Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
Borító:
Rekordok letöltése1 
Corvina könyvtári katalógus v8.2.27 © 2023 Monguz kft. Minden jog fenntartva.