Magyar
Toggle navigation
Tudóstér
Magyar
Tudóstér
Keresés
Egyszerű keresés
Összetett keresés
CCL keresés
Egyszerű keresés
Összetett keresés
CCL keresés
Böngészés
Saját polc tartalma
(
0
)
Korábbi keresések
CCL parancs
CCL
Összesen 13 találat.
#/oldal:
12
36
60
120
Rövid
Hosszú
MARC
Részletezés:
Rendezés:
Szerző növekvő
Szerző csökkenő
Cím növekvő
Cím csökkenő
Dátum növekvő
Dátum csökkenő
1.
001-es BibID:
BIBFORM108968
035-os BibID:
(Scopus)85149207862 (WoS)000936466300001
Első szerző:
Bodnár Veronika
Cím:
Species-specific effects of the introduction of Aspergillus nidulans gfdB in osmophilic aspergilli / Veronika Bodnár, Anita Király, Erzsébet Orosz, Márton Miskei, Tamás Emri, Zsolt Karányi, Éva Leiter, Ronald P. de Vries, István Pócsi
Dátum:
2023
ISSN:
0175-7598 1432-0614
Megjegyzések:
Industrial fungi need a strong environmental stress tolerance to ensure acceptable efciency and yields. Previous studies shed light on the important role that Aspergillus nidulans gfdB, putatively encoding a NAD+-dependent glycerol-3-phosphate dehydrogenase, plays in the oxidative and cell wall integrity stress tolerance of this flamentous fungus model organism. The insertion of A. nidulans gfdB into the genome of Aspergillus glaucus strengthened the environmental stress tolerance of this xerophilic/osmophilic fungus, which may facilitate the involvement of this fungus in various industrial and environmental biotechnological processes. On the other hand, the transfer of A. nidulans gfdB to Aspergillus wentii, another promising industrial xerophilic/osmophilic fungus, resulted only in minor and sporadic improvement in environmental stress tolerance and meanwhile partially reversed osmophily. Because A. glaucus and A. wentii are phylogenetically closely related species and both fungi lack a gfdB ortholog, these results warn us that any disturbance of the stress response system of the aspergilli may elicit rather complex and even unforeseeable, species-specifc physiological changes. This should be taken into consideration in any future targeted industrial strain development projects aiming at the fortifcation of the general stress tolerance of these fungi.
Tárgyszavak:
Természettudományok
Biológiai tudományok
idegen nyelvű folyóiratközlemény külföldi lapban
folyóiratcikk
Aspergillus nidulans
Aspergillus wentii
Aspergillus glaucus
Osmophily
Environmental stress
Oxidative stress tolerance
Megjelenés:
Applied Microbiology And Biotechnology. - 107 : (2023), p. 2423-2436. -
További szerzők:
Király Anita (1988-) (biológus)
Orosz Erzsébet (1988-) (biológus)
Miskei Márton (1978-) (molekuláris biológus, genetikus)
Emri Tamás (1969-) (biológus)
Karányi Zsolt (1961-) (biostatisztikus, bioinformatikus)
Leiter Éva (1976-) (biológus)
De Vries, Ronald P.
Pócsi István (1961-) (vegyész)
Pályázati támogatás:
EFOP-3.6.1-16-2016-00022
EFOP
NN125671
Egyéb
K131767
NKFIH
TKP2021-EGA-20
Egyéb
Internet cím:
Szerző által megadott URL
DOI
Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
Borító:
Saját polcon:
2.
001-es BibID:
BIBFORM067436
035-os BibID:
(WoS)000394827800001 (Scopus)85013301401
Első szerző:
De Vries, Ronald P.
Cím:
Comparative genomics reveals high biological diversity and specific adaptations in the industrially and medically important fungal genus Aspergillus / Ronald P. de Vries, Robert Riley, Ad Wiebenga, Guillermo Aguilar-Osorio, Sotiris Amillis, Cristiane Akemi Uchima, Gregor Anderluh, Mojtaba Asadollahi, Marion Askin, Kerrie Barry, Evy Battaglia, Özgür Bayram, Tiziano Benocci, Susanna A. Braus-Stromeyer, Camila Caldana, David Cánovas, Gustavo C. Cerqueira, Fusheng Chen, Wanping Chen, Cindy Choi, Alicia Clum, Renato Augusto Corrêa dos Santos, André Ricardo de Lima Damásio, George Diallinas, Tamás Emri, Erzsébet Fekete, Michel Flipphi, Susanne Freyberg, Antonia Gallo, Christos Gournas, Rob Habgood, Matthieu Hainaut, María Laura Harispe, Bernard Henrissat, Kristiina S. Hildén, Ryan Hope, Abeer Hossain, Eugenia Karabika, Levente Karaffa, Zsolt Karányi, Nada Kraševec, Alan Kuo, Harald Kusch, Kurt LaButti, Ellen L. Lagendijk, Alla Lapidus, Anthony Levasseur, Erika Lindquist, Anna Lipzen, Antonio F. Logrieco, Andrew MacCabe, Miia R. Mäkelä, Iran Malavazi, Petter Melin, Vera Meyer, Natalia Mielnichuk, Márton Miskei, Ákos P. Molnár, Giuseppina Mulé, Chew Yee Ngan, Margarita Orejas, Erzsébet Orosz, Jean Paul Ouedraogo, Karin M. Overkamp, Hee-Soo Park, Giancarlo Perrone, Francois Piumi, Peter J. Punt, Arthur F. J. Ram, Ana Ramón, Stefan Rauscher, Eric Record, Diego Mauricio Riaño-Pachón, Vincent Robert, Julian Röhrig, Roberto Ruller, Asaf Salamov, Nadhira S. Salih, Rob A. Samson, Erzsébet Sándor, Manuel Sanguinetti, Tabea Schütze, Kristina Sepčić, Ekaterina Shelest, Gavin Sherlock, Vicky Sophianopoulou, Fabio M. Squina, Hui Sun, Antonia Susca, Richard B. Todd, Adrian Tsang, Shiela E. Unkles, Nathalie van de Wiele, Diana van Rossen-Uffink, Juliana Velasco de Castro Oliveira, Tammi C. Vesth, Jaap Visser, Jae-Hyuk Yu, Miaomiao Zhou, Mikael R. Andersen, David B. Archer, Scott E. Baker, Isabelle Benoit, Axel A. Brakhage, Gerhard H. Braus, Reinhard Fischer, Jens C. Frisvad, Gustavo H. Goldman, Jos Houbraken, Berl Oakley, István Pócsi, Claudio Scazzocchio, Bernhard Seiboth, Patricia A. van Kuyk, Jennifer Wortman, Paul S. Dyer, Igor V. Grigoriev
Dátum:
2017
ISSN:
1474-760X
Tárgyszavak:
Természettudományok
Biológiai tudományok
idegen nyelvű folyóiratközlemény külföldi lapban
folyóiratcikk
biological diversity
Megjelenés:
Genome Biology. - 18 : 28 (2017), p. 1-45. -
További szerzők:
Riley, Robert
Wiebenga, Ad
Aguilar-Osorio, Guillermo
Amillis, Sotiris
Akemi Uchima, Cristiane
Anderluh, Gregor
Asadollahi, Mojtaba
Askin, Marion
Barry, Kerrie
Battaglia, Evy
Bayram, Özgür
Benocci, Tiziano
Braus-Stromeyer, Susanna A.
Caldana, Camila
Cánovas, David
Cerqueira, Gustavo C.
Chen, Fusheng
Chen, Wanping
Choi, Cindy
Clum, Alicia
Corrêa dos Santos, Renato Augusto
Lima Damásio, André Ricardo de
Diallinas, George
Emri Tamás (1969-) (biológus)
Fekete Erzsébet (1975-) (biotechnológus, egyetemi tanár)
Flipphi, Michel (1964-)
Freyberg, Suzanne
Gallo, Antonia
Gournas, Christos
Habgood, Rob
Hainaut, Matthieu
Harispe, María Laura
Henrissat, Bernard
Hildén, Kristiina S.
Hope, Ryan
Hossain, Abeer
Karabika, Eugenia
Karaffa Levente (1971-) (biotechnológus, egyetemi tanár)
Karányi Zsolt (1961-) (biostatisztikus, bioinformatikus)
Kraševec, Nada
Kuo, Alan
Kusch, Harald
LaButti, Kurt
Lagendijk, Ellen L.
Lapidus, Alla
Levasseur, Anthony
Lindquist, Erika
Lipzen, Anna
Logrieco, Antonio F.
MacCabe, Andrew
Mäkelä, Miia R.
Malavazi, Iran
Melin, Petter
Meyer, Vera
Mielnichuk, Natalia
Miskei Márton (1978-) (molekuláris biológus, genetikus)
Molnár Ákos Péter (1988-) (okleveles biomérnök)
Mulé, Giuseppina
Ngan, Chew Yee
Orejas, Margarita
Orosz Erzsébet (1988-) (biológus)
Ouedraogo, Jean Paul
Overkamp, Karin M.
Park, Hee-Soo
Perrone, Giancarlo
Piumi, Francois
Punt, Peter J.
Ram, Arthur F.J.
Ramón, Ana
Rauscher, Stefan
Record, Eric
Riaño-Pachón, Diego Mauricio
Robert, Vincent
Röhrig, Julian
Ruller, Roberto
Salamov, Asaf
Salih, Nadhira S.
Samson, Robert A.
Karaffa Erzsébet Mónika (1972-) (mikrobiológus, egyetemi tanár)
Sanguinetti, Manuel
Schütze, Tabea
Sepčić, Kristina
Shelest, Ekaterina
Sherlock, Gavin
Sophianopoulou, Vicky
Squina, Fabio M.
Sun, Hui
Susca, Antonia
Todd, Richard B.
Tsang, Adrian
Unkles, Shiela E.
Wiele, Nathalie van de
Rossen-Uffink, Diana van
Velasco de Castro Oliveira, Juliana
Vesth, Tammi C.
Visser, Jaap
Yu Jae-Hyuk
Zhou, Miaomiao
Andersen, Mikael R.
Archer, David
Baker, Scott E.
Benoit, Isabelle
Brakhage, Axel A.
Braus, Gerhard
Fischer, Reinhard
Frisvad, Jens Christian
Goldman, Gustavo
Houbraken, Jos
Oakley, Berl R.
Pócsi István (1961-) (vegyész)
Scazzocchio, Claudio
Seiboth, Bernhard
Kuyk, Patricia A. van
Wortman, Jennifer Russo
Dyer, Paul S.
Grigoriev, Igor V.
Pályázati támogatás:
OTKA-K100464
OTKA
TÁMOP 4.2.1./B-09/1/KONV-2010-0007
TÁMOP
SROP-4.2.2.B-15/1/KONV-2015-0001
Egyéb
Internet cím:
DOI
Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
Borító:
Saját polcon:
3.
001-es BibID:
BIBFORM075758
035-os BibID:
(WoS)000453040700002 (Scopus)85056237684
Első szerző:
Emri Tamás (biológus)
Cím:
Duplications and losses of genes encoding known elements of the stress defence system of the Aspergilli contribute to the evolution of these filamentous fungi but do not directly influence their environmental stress tolerance / T. Emri, K. Antal, R. Riley, Z. Karányi, M. Miskei, E. Orosz, S. E. Baker, A. Wiebenga, R. P. de Vries, I. Pócsi
Dátum:
2018
ISSN:
0166-0616
Tárgyszavak:
Természettudományok
Biológiai tudományok
idegen nyelvű folyóiratközlemény külföldi lapban
folyóiratcikk
Megjelenés:
Studies In Mycology. - 91 (2018), p. 23-36. -
További szerzők:
Antal Károly (neurobiológus)
Riley, Robert
Karányi Zsolt (1961-) (biostatisztikus, bioinformatikus)
Miskei Márton (1978-) (molekuláris biológus, genetikus)
Orosz Erzsébet (1988-) (biológus)
Baker, Scott E.
Wiebenga, Ad
De Vries, Ronald P.
Pócsi István (1961-) (vegyész)
Pályázati támogatás:
EFOP-3.6.1-16-2016-00022
EFOP
Internet cím:
Szerző által megadott URL
DOI
Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
Borító:
Saját polcon:
4.
001-es BibID:
BIBFORM103379
035-os BibID:
(cikkazonosító)5058 (WoS)000846449200018 (Scopus)85137080090
Első szerző:
Karányi Zsolt (biostatisztikus, bioinformatikus)
Cím:
NODULIN HOMEOBOX is required for heterochromatin homeostasis in Arabidopsis / Zsolt Karányi, Ágnes Mosolygó-L., Orsolya Feró, Adrienn Horváth, Beáta Boros-Oláh, Éva Nagy, Szabolcs Hetey, Imre Holb, Henrik Szaker, Marton Miskei, Tibor Csorba, Lóránt Székvölgyi
Dátum:
2022
ISSN:
2041-1723
Megjegyzések:
Arabidopsis NODULIN HOMEOBOX (NDX) is a nuclear protein described as a regulator of specific euchromatic genes within transcriptionally active chromosome arms. Here we show that NDX is primarily a heterochromatin regulator that functions in pericentromeric regions to control siRNA production and non-CG methylation. Most NDX binding sites coincide with pericentromeric het-siRNA loci that mediate transposon silencing, and are antagonistic with R-loop structures that are prevalent in euchromatic chromosomal arms. Inactivation of NDX leads to differential siRNA accumulation and DNA methylation, of which CHH/CHG hypomethylation colocalizes with NDX binding sites. Hi-C analysis shows significant chromatin structural changes in the ndx mutant, with decreased intrachromosomal interactions at pericentromeres where NDX is enriched in wild-type plants, and increased interchromosomal contacts between KNOT-forming regions, similar to those observed in DNA methylation mutants. We conclude that NDX is a key regulator of heterochromatin that is functionally coupled to het-siRNA loci and non-CG DNA methylation pathways.
Tárgyszavak:
Természettudományok
Biológiai tudományok
idegen nyelvű folyóiratközlemény külföldi lapban
folyóiratcikk
Megjelenés:
Nature Communications. - 13 (2022), p. 1-20. -
További szerzők:
Mosolygó Ágnes (1986-) (biológus)
Feró Orsolya
Horváth Adrienn
Boros-Oláh Beáta (1989-) (molekuláris biológus)
Nagy Éva (1980-) (molekuláris biológus)
Hetey Szabolcs
Holb Imre (1973-) (agrármérnök)
Szaker Henrik
Miskei Márton (1978-) (molekuláris biológus, genetikus)
Csorba Tibor
Székvölgyi Lóránt (1977-) (biofizikus, biokémikus, sejtbiológus)
Pályázati támogatás:
MTA-DE Lendület
MTA
Élettudományok - Biológiai tudományok
GINOP-2.3.2-15-2016-00024
GINOP
NNE-130913
OTKA
137678
OTKA
TKP2021-EGA-18
Egyéb
Internet cím:
Szerző által megadott URL
DOI
Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
Borító:
Saját polcon:
5.
001-es BibID:
BIBFORM051706
Első szerző:
Karányi Zsolt (biostatisztikus, bioinformatikus)
Cím:
FSRD: fungal stress response database / Zsolt Karányi, Imre Holb, László Hornok, István Pócsi, Márton Miskei
Dátum:
2013
ISSN:
1758-0463
Tárgyszavak:
Természettudományok
Biológiai tudományok
idegen nyelvű folyóiratközlemény külföldi lapban
Megjelenés:
Database [elektronikus dokumentum]. - 2013 (2013), p. [6]. -
További szerzők:
Holb Imre (1973-) (agrármérnök)
Hornok László
Pócsi István (1961-) (vegyész)
Miskei Márton (1978-) (molekuláris biológus, genetikus)
Internet cím:
Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
Borító:
Saját polcon:
6.
001-es BibID:
BIBFORM095689
035-os BibID:
(WoS)000684852400006 (Scopus)85111011996
Első szerző:
Miskei Márton (molekuláris biológus, genetikus)
Cím:
Genome-wide mapping of binding sites of the transposase-derived SETMAR protein in the human genome / Márton Miskei, Adrienn Horváth, Lívia Viola, Laura Varga, Éva Nagy, Orsolya Feró, Zsolt Karányi, Jason Roszik, Csaba Miskey, Zoltán Ivics, Lóránt Székvölgyi
Dátum:
2021
ISSN:
2001-0370
Megjegyzések:
Throughout evolution, DNA transposons provide a recurrent supply of genetic information to give rise to novel gene functions by fusion of their transposase domain to various domains of host-encoded proteins. One of these "domesticated", transposase-derived factors is SETMAR/Metnase which is a naturally occurring fusion protein that consists of a histone-lysine methyltransferase domain and an HsMar1 transposase. To elucidate the biological role of SETMAR, it is crucial to identify genomic targets to which SETMAR specifically binds and link these sites to the regulation of gene expression. Herein, we mapped the genomic landscape of SETMAR binding in a near-haploid human leukemia cell line (HAP1) in order to identify on-target and off-target binding sites at high resolution and to elucidate their role in terms of gene expression. Our analysis revealed a perfect correlation between SETMAR and inverted terminal repeats (ITRs) of HsMar1 transposon remnants, which are considered as natural target sites for SETMAR binding. However, we did not detect any untargeted events at non-ITR sequences, calling into question previously proposed off-target binding sites. We identified sequence fidelity of the ITR motif as a key factor for determining the binding affinity of SETMAR for chromosomes, as higher conservation of ITR sequences resulted in increased affinity for chromatin and stronger repression of SETMAR-bound gene loci. These associations highlight how SETMAR's chromatin binding fine-tune gene regulatory networks in human tumour cells.
Tárgyszavak:
Orvostudományok
Elméleti orvostudományok
idegen nyelvű folyóiratközlemény külföldi lapban
folyóiratcikk
SETMAR/Metnase
transposase
histone methyltransferase
ChIP-seq
Megjelenés:
Computational and Structural Biotechnology Journal. - 19 (2021), p. 4032-4041. -
További szerzők:
Horváth Adrienn
Viola Lívia
Varga Laura
Nagy Éva (1980-) (molekuláris biológus)
Feró Orsolya
Karányi Zsolt (1961-) (biostatisztikus, bioinformatikus)
Roszik, Jason
Miskey Csaba
Ivics Zoltán (1964-) (biológus)
Székvölgyi Lóránt (1977-) (biofizikus, biokémikus, sejtbiológus)
Pályázati támogatás:
GINOP-2.3.2-15-2016-00024
GINOP
NKFIH-NNE-130913
OTKA
Internet cím:
Szerző által megadott URL
DOI
Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
Borító:
Saját polcon:
7.
001-es BibID:
BIBFORM017978
Első szerző:
Miskei Márton (molekuláris biológus, genetikus)
Cím:
Molecular Evolution of Phosphoprotein Phosphatases in Drosophila / Márton Miskei, Csaba Ádám, László Kovács, Zsolt Karányi, Viktor Dombrádi
Dátum:
2011
Megjegyzések:
Phosphoprotein phosphatases (PPP), these ancient and important regulatory enzymes are present in all eukaryotic organisms. Based on the genome sequences of 12 Drosophila species we traced the evolution of the PPP catalytic subunits and noted a substantial expansion of the gene family. We concluded that the 18?22 PPP genes of Drosophilidae were generated from a core set of 8 indispensable phosphatases that are present in most of the insects. Retropositons followed by tandem gene duplications extended the phosphatase repertoire, and sporadic gene losses contributed to the species specific variations in the PPP complement. During the course of these studies we identified 5, up till now uncharacterized phosphatase retrogenes: PpY+, PpD5+, PpD6+, Pp4+, and Pp6+ which are found only in some ancient Drosophila. We demonstrated that all of these new PPP genes exhibit a distinct male specific expression. In addition to the changes in gene numbers, the intron-exon structure and the chromosomal localization of several PPP genes was also altered during evolution. The G2C content of the coding regions decreased when a gene moved into the heterochromatic region of chromosome Y. Thus the PPP enzymes exemplify the various types of dynamic rearrangements that accompany the molecular evolution of a gene family in Drosophilidae.
Tárgyszavak:
Orvostudományok
Elméleti orvostudományok
idegen nyelvű folyóiratközlemény külföldi lapban
Drosophila
phosphoprotein phosphatase
catalytic subunit
gene duplication
retroposition
novel phosphatase genes
Molekuláris Medicina
Megjelenés:
PLoS One. - 6 : 7 (2011), p. e22218. -
További szerzők:
Ádám Csaba (1980-) (molekuláris biológus)
Kovács László (1982-) (Ph.D. hallgató, molekuláris biológus)
Karányi Zsolt (1961-) (biostatisztikus, bioinformatikus)
Dombrádi Viktor (1953-) (biokémikus)
Pályázati támogatás:
TÁMOP-4.2.1/B-09/1/KONV-2010-0007
TÁMOP
Jelátviteli folyamatok vizsgálata patogén gombákban
Internet cím:
Szerző által megadott URL
DOI
Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
Borító:
Saját polcon:
8.
001-es BibID:
BIBFORM006471
Első szerző:
Miskei Márton (molekuláris biológus, genetikus)
Cím:
Annotation of stress-response proteins in the aspergilli / Márton Miskei, Zsolt Karányi, István Pócsi
Dátum:
2009
Megjegyzések:
Stress-response proteins of Aspergillus nidulans, Aspergillus clavatus, Aspergillus flavus, Aspergillus fumigatus, Aspergillus niger, Aspergillus oryzae, Aspergillus terreus and Neosartorya fischeri (3908 in total) were annotated and grouped according to stress types (http://193.6.155.82/AspergillusStress/). All genomes harboured elements of the SskA-HogA/SakA stress signalling pathway. There are accumulating data pointing at the importance of SskA-HogA/SakA signalling in different types of stress-responses in the aspergilli and, in this regard, these filamentous fungi are closer to fission yeast than to budding yeast. The abundance of annotated stress sensing histidine kinases and transcriptional regulators in each Aspergillus species indicates that the applicability of yeast-based models to fully describe and explain the stress-responses of these fungi is limited. Most excitingly, putative orthologues of both Saccharomyces cerevisiae Msn2p/Msn4p C2H2 zinc finger-type and Schizosaccharomyces pombe Atf1 bZip-type 1general stress' transcription factors were annotated in the aspergilli, foreshadowing complex and robust stress defence systems in these euascomycetes.
Tárgyszavak:
Természettudományok
Biológiai tudományok
idegen nyelvű folyóiratközlemény külföldi lapban
Aspergillus, Stress-response
Mitogen-activated protein kinase
Environmental stress-response
HOG pathway
Osmotic stress
Genome annotation
Comparative genomics
Neurospora crassa
Schizosaccharomyces pombe
Saccharomyces cerevisiae
DNA repair
Starvation stress
Unfolded protein response
Thermal stress
Oxidative stress
Megjelenés:
Fungal Genetics and Biology 46 : 1 Suppl.1 (2009), p. 105-120. -
További szerzők:
Karányi Zsolt (1961-) (biostatisztikus, bioinformatikus)
Pócsi István (1961-) (vegyész)
Internet cím:
elektronikus változat
elektronikus változat
DOI
Borító:
Saját polcon:
9.
001-es BibID:
BIBFORM018108
Első szerző:
Pócsi István (vegyész)
Cím:
Comparison of gene expression signatures of diamide, H2O2 and menadione exposed Aspergillus nidulans cultures - linking genome-wide transcriptional changes to cellular physiology / István Pócsi, Márton Miskei, Zsolt Karányi, Tamás Emri, Patricia Ayoubi, Tünde Pusztahelyi, György Balla, Rolf A. Prade
Dátum:
2005
ISSN:
1471-2164
Megjegyzések:
Background In addition to their cytotoxic nature, reactive oxygen species (ROS) are also signal molecules in diverse cellular processes in eukaryotic organisms. Linking genome-wide transcriptional changes to cellular physiology in oxidative stress-exposed Aspergillus nidulans cultures provides the opportunity to estimate the sizes of peroxide (O22-), superoxide (O2?-) and glutathione/glutathione disulphide (GSH/GSSG) redox imbalance responses. Results Genome-wide transcriptional changes triggered by diamide, H2O2 and menadione in A. nidulans vegetative tissues were recorded using DNA microarrays containing 3533 unique PCR-amplified probes. Evaluation of LOESS-normalized data indicated that 2499 gene probes were affected by at least one stress-inducing agent. The stress induced by diamide and H2O2 were pulse-like, with recovery after 1 h exposure time while no recovery was observed with menadione. The distribution of stress-responsive gene probes among major physiological functional categories was approximately the same for each agent. The gene group sizes solely responsive to changes in intracellular O22-, O2?- concentrations or to GSH/GSSG redox imbalance were estimated at 7.7, 32.6 and 13.0 %, respectively. Gene groups responsive to diamide, H2O2 and menadione treatments and gene groups influenced by GSH/GSSG, O22- and O2?- were only partly overlapping with distinct enrichment profiles within functional categories. Changes in the GSH/GSSG redox state influenced expression of genes coding for PBS2 like MAPK kinase homologue, PSK2 kinase homologue, AtfA transcription factor, and many elements of ubiquitin tagging, cell division cycle regulators, translation machinery proteins, defense and stress proteins, transport proteins as well as many enzymes of the primary and secondary metabolisms. Meanwhile, a separate set of genes encoding transport proteins, CpcA and JlbA amino acid starvation-responsive transcription factors, and some elements of sexual development and sporulation was ROS responsive. Conclusion The existence of separate O22-, O2?- and GSH/GSSG responsive gene groups in a eukaryotic genome has been demonstrated. Oxidant-triggered, genome-wide transcriptional changes should be analyzed considering changes in oxidative stress-responsive physiological conditions and not correlating them directly to the chemistry and concentrations of the oxidative stress-inducing agent.
Tárgyszavak:
Természettudományok
Biológiai tudományok
idegen nyelvű folyóiratközlemény külföldi lapban
Megjelenés:
BMC Genomics. - 6 : 182 (2005), p. 1-18 . -
További szerzők:
Miskei Márton (1978-) (molekuláris biológus, genetikus)
Karányi Zsolt (1961-) (biostatisztikus, bioinformatikus)
Emri Tamás (1969-) (biológus)
Ayoubi, Patricia
Pusztahelyi Tünde (1969-) (biológus, angol-magyar szakfordító)
Balla György (1953-) (csecsemő és gyermekgyógyász, neonatológus)
Prade, Rolf A.
Internet cím:
Szerző által megadott URL
DOI
Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
Borító:
Saját polcon:
10.
001-es BibID:
BIBFORM018733
Első szerző:
Pusztahelyi Tünde (biológus, angol-magyar szakfordító)
Cím:
Comparison of transcriptional and translational changes caused by long-term menadione exposure in Aspergillus nidulans / Tünde Pusztahelyi, Éva Klement, Emilia Szajli, József Klem, Márton Miskei, Zsolt Karányi, Tamás Emri, Szilvia Kovács, Gyula Orosz, Kornél L. Kovács, Katalin F. Medzihradszky, Rolf A. Prade, István Pócsi
Dátum:
2011
ISSN:
1087-1845
Tárgyszavak:
Természettudományok
Biológiai tudományok
idegen nyelvű folyóiratközlemény külföldi lapban
Megjelenés:
Fungal Genetics And Biology. - 48 : 2 (2011), p. 92-103. -
További szerzők:
Klement Éva
Szájli Emília
Klem József
Miskei Márton (1978-) (molekuláris biológus, genetikus)
Karányi Zsolt (1961-) (biostatisztikus, bioinformatikus)
Emri Tamás (1969-) (biológus)
Kovács Szilvia (1982-) (biológus)
Orosz Gyula
Kovács Kornél L.
Medzihradszky-Fölkl Katalin
Prade, Rolf A.
Pócsi István (1961-) (vegyész)
Internet cím:
Szerző által megadott URL
DOI
Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
Borító:
Saját polcon:
11.
001-es BibID:
BIBFORM090571
035-os BibID:
(WoS)000602721400001 (Scopus)85098748016
Első szerző:
Selbmann, Laura
Cím:
Shed Light in the DaRk LineagES of the Fungal Tree of Life-STRES / Laura Selbmann, Zsigmond Benkő, Claudia Coleine, Sybren de Hoog, Claudio Donati, Irina Druzhinina, Tamás Emri, Cassie L. Ettinger, Amy S. Gladfelter, Anna A. Gorbushina, Igor V. Grigoriev, Martin Grube, Nina Gunde-Cimerman, Zsolt Ákos Karányi, Beatrix Kocsis, Tania Kubressoian, Ida Miklós, Márton Miskei, Lucia Muggia, Trent Northen, Monika Novak-Babič, Christa Pennacchio, Walter P. Pfliegler, Istvàn Pòcsi, Valeria Prigione, Meritxell Riquelme, Nicola Segata Julia Schumacher, Ekaterina Shelest, Katja Sterflinger, Donatella Tesei, Jana M. U'Ren, Giovanna C. Varese, Xabier Vázquez-Campos, Vania A. Vicente, Emanuel M. Souza, Polona Zalar, Allison K. Walker, Jason E. Stajich
Dátum:
2020
ISSN:
2075-1729
Tárgyszavak:
Természettudományok
Biológiai tudományok
idegen nyelvű folyóiratközlemény külföldi lapban
folyóiratcikk
Megjelenés:
Life. - 10 : 12 (2020), p. 1-13. -
További szerzők:
Benkő Zsigmond (1961-) (molekuláris biológus, genetikus)
Coleine, Claudia
de Hoog, Sybren
Donati, Claudio
Druzhinina, Irina S.
Emri Tamás (1969-) (biológus)
Ettinger, Cassie L.
Gladfelter, Amy S.
Gorbushina, Anna
Grigoriev, Igor V.
Grube, Martin
Gunde-Cimerman, Nina
Karányi Zsolt (1961-) (biostatisztikus, bioinformatikus)
Kocsis Beatrix (1988-) (molekuláris biológus)
Kubressoian, Tania
Miklós Ida (1962-) (biológus)
Miskei Márton (1978-) (molekuláris biológus, genetikus)
Muggia, Lucia
Northen, Trent
Novak-Babič, Monika
Pennacchio, Christa
Pfliegler Valter Péter (1986-) (molekuláris biológus)
Pócsi István (1961-) (vegyész)
Prigione, Valeria
Riquelme, Meritxell
Segata, Nicola
Schumacher, Julia
Shelest, Ekaterina
Sterflinger, Katja
Tesei, Donatella
U'Ren, Jana M.
Varese, Giovanna C.
Vázquez-Campos, Xabier
Vicente, Vania A.
Souza, Emanuel M.
Zalar, Polona
Walker, Allison K.
Stajich, Jason E.
Pályázati támogatás:
DE-AC02-05CH11231
Egyéb
Internet cím:
Szerző által megadott URL
DOI
Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
Borító:
Saját polcon:
12.
001-es BibID:
BIBFORM048948
Első szerző:
Szilágyi Melinda (biológus)
Cím:
Transcriptome changes initiated by carbon starvation in Aspergillus nidulans / Melinda Szilágyi, Márton Miskei, Zsolt Karányi, Béla Lenkey, István Pócsi, Tamás Emri
Dátum:
2013
ISSN:
1350-0872 1465-2080
Tárgyszavak:
Természettudományok
Biológiai tudományok
idegen nyelvű folyóiratközlemény külföldi lapban
Megjelenés:
Microbiology (Reading, England). - 159 : 1 (2013), p. 176-190. -
További szerzők:
Miskei Márton (1978-) (molekuláris biológus, genetikus)
Karányi Zsolt (1961-) (biostatisztikus, bioinformatikus)
Lenkey Béla (1943-2016) (biokémikus)
Pócsi István (1961-) (vegyész)
Emri Tamás (1969-) (biológus)
Internet cím:
Szerző által megadott URL
DOI
Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
Borító:
Saját polcon:
Rekordok letöltése
1
2
Corvina könyvtári katalógus v8.2.27
© 2023
Monguz kft.
Minden jog fenntartva.