CCL

Összesen 5 találat.
#/oldal:
Részletezés:
Rendezés:

1.

001-es BibID:BIBFORM073381
035-os BibID:(cikkazonosító)E-P18.36 (WoS)000489312608202
Első szerző:Keserű Judit (molekuláris genetikus)
Cím:Determination of miR-196a Single Nucleotide Polymorphism (SNP) with melting-curve analysis in the population of patients with ovarian cancer / J. S. Keserű, J. Lukács, B. Soltész, K. Szirák, Z. Birkó, A. Penyige, B. Nagy, R. Póka
Dátum:2018
ISSN:1018-4813 1476-5438
Megjegyzések:Introduction: miRNA molecules are short, non-coding sequences regulating gene expression after transcription. They are important in the development, progression and treatability of tumours. Single Nucleotide Polymorphism (SNP) is the most frequent type of genetic polymorphism. That is true also for miRNAs and their polymorphisms can cause alterations in the gene expression profile. miR-196a was also linked to the genesis of different tumours.Aim: Search for correlation between miR-196a polymorphism and development of ovarian cancer.Materials and Methods: 75 patients with ovarian cancer and 75 healthy persons were investigated. 15-16 mL blood anticoagulated with EDTA was drawn. DNA was isolated with silica absorption method and the melting curve of PCR products generated with LightSnip kit (TibMolbiol, Berlin, Germany) developed for miR-196a (rs11614913) SNP was determined by LightCycler 96 equipment. Allele and genotype frequencies were specified and Student t-test was applied for statistical analysis of data.Results: The Tm of PCR products were 55.5?C for T allele and 62.6?C for C allele with melting-curve analysis. T allele occurred in 32.66% in population of patients and in 40.66% in control group. Genotypes among control persons were 18.66% for TT, 44.0% for TC, and 37.33% CC, while in case of patients these frequencies were 12.0%, 41.33%, and 46.66%, respectively (p=0.3815).Conclusion: miR-196a influences the expression of 684 genes, it requires further complex investigation, whether it is involved in the development of ovarian cancer.
Tárgyszavak:Orvostudományok Klinikai orvostudományok idézhető absztrakt
folyóiratcikk
ovarian cancer
miR-196a
SNP
Megjelenés:European Journal of Human Genetics. - 26 : Suppl. (2018), p. 1. -
További szerzők:Lukács János (1975-) (szülész-nőgyógyász, genetikus) Soltész Beáta (1987-) (molekuláris biológus) Szirák Krisztina (1973-) (molekuláris genetikus) Hádáné Birkó Zsuzsanna (1971-) (molekuláris genetikus) Penyige András (1954-) (molekuláris genetikus) Nagy Bálint (1956-) (molekuláris genetikus) Póka Róbert (1960-) (szülész-nőgyógyász, klinikai onkológus)
Internet cím:Szerző által megadott URL
Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
Borító:

2.

001-es BibID:BIBFORM039004
035-os BibID:PMID:19851727
Első szerző:Penyige András (molekuláris genetikus)
Cím:Analysis and identification of ADP-ribosylated proteins of Streptomyces coelicolor M145 / András Penyige, Judit Keseru, Ferenc Fazakas, Iván Schmelczer, Krisztina Szirák, György Barabás, Sándor Biró
Dátum:2009
ISSN:1225-8873
Megjegyzések:Mono-ADP-ribosylation is the enzymatic transfer of ADP-ribose from NAD(+) to acceptor proteins catalyzed by ADP-ribosyltransferases. Using m-aminophenylboronate affinity chromatography, 2D-gel electrophoresis, in-gel digestion and MALDI-TOF analysis we have identified eight in vitro ADP-ribosylated proteins in Streptomyces coelicolor, which can be classified into three categories: (i) secreted proteins; (ii) metabolic enzymes using NAD(+)/NADH or NADP(+)/NADPH as coenzymes; and (iii) other proteins. The secreted proteins could be classified into two functional categories: SCO2008 and SC05477 encode members of the family of periplasmic extracellular solute-binding proteins, and SCO6108 and SC01968 are secreted hydrolases. Dehydrogenases are encoded by SC04824 and SC04771. The other targets are GlnA (glutamine synthetase I., SC02198) and SpaA (starvation-sensing protein encoded by SC07629). SCO2008 protein and GlnA had been identified as ADP-ribosylated proteins in previous studies. With these results we provided experimental support for a previous suggestion that ADP-ribosylation may regulate membrane transport and localization of periplasmic proteins. Since ADP-ribosylation results in inactivation of the target protein, ADP-ribosylation of dehydrogenases might modulate crucial primary metabolic pathways in Streptomyces. Several of the proteins identified here could provide a strong connection between protein ADP-ribosylation and the regulation of morphological differentiation in S. coelicolor.
Tárgyszavak:Természettudományok Biológiai tudományok idegen nyelvű folyóiratközlemény külföldi lapban
protein ADP-ribosylation
Streptomyces coelicolor
MALDI-TOF
2-D PAGE
egyetemen (Magyarországon) készült közlemény
Megjelenés:Journal Of Microbiology. - 47 : 5 (2009), p. 549-556. -
További szerzők:Fazakas Ferenc (1969-) (molekuláris biológus) Schmelczer Iván Keserű Judit (1976-) (molekuláris genetikus) Szirák Krisztina (1973-) (molekuláris genetikus) Barabás György (1933-) (sejtbiológus, molekuláris genetikus) Biró Sándor (1949-) (molekuláris genetikus)
Internet cím:Szerző által megadott URL
DOI
Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
Borító:

3.

001-es BibID:BIBFORM068987
Első szerző:Soltész Beáta (molekuláris biológus)
Cím:A miR-193b két egynukleotidos polimorfizmusának meghatározása ováriumtumoros betegek mintáiban / Soltész Beáta, Lukács János, Keserű Judit, Szentesiné Szirák Krisztina, Penyige András, Póka Róbert, Nagy Bálint
Dátum:2017
Tárgyszavak:Orvostudományok Klinikai orvostudományok magyar nyelvű folyóiratközlemény hazai lapban
miRNS
génexpresszió
petefészekrák
Megjelenés:Magyar Nőorvosok Lapja. - 80 : 3 (2017), p. 116-120. -
További szerzők:Lukács János (1975-) (szülész-nőgyógyász, genetikus) Keserű Judit (1976-) (molekuláris genetikus) Szirák Krisztina (1973-) (molekuláris genetikus) Penyige András (1954-) (molekuláris genetikus) Póka Róbert (1960-) (szülész-nőgyógyász, klinikai onkológus) Nagy Bálint (1956-) (molekuláris genetikus)
Internet cím:Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
Borító:

4.

001-es BibID:BIBFORM078673
035-os BibID:(Scopus)85064980470 (WoS)000468162100007
Első szerző:Szirák Krisztina (molekuláris genetikus)
Cím:PITX2 and NEURL1 SNP polymorphisms in Hungarian atrial fibrillation patients determined by quantitative real-time PCR and melting curve analysis / Krisztina Szirák, Beáta Soltész, Orsolya Hajas, Réka Urbancsek, Edina Nagy-Baló, András Penyige, Zoltán Csanádi, Bálint Nagy
Dátum:2019
ISSN:0168-1656 1873-4863
Megjegyzések:Atrial fibrillation (AF) is the most common cardiac arrhythmia affecting 1-2% of the general population. Some common variants located in or next to PITX2 and NEURL1 genes are proved to play role in the occurrence of AF. The aim of our study was to investigate whether rs2595104 in the 4q25 chromosome region and rs6584555 SNP in the NEURL1 gene on chromosome 10 is associated with AF in a Caucasian population. We genotyped DNA samples of 76 AF patients and 77 healthy controls using quantitative real-time PCR followed by melting curve analysis. The minor A allele frequency of rs2595104 in PITX2 was 0.38 and 0.44 in the control group and in AF patients, respectively. There was no significant difference in allele and genotype distribution between the two groups (p?=?0.52). The allele frequency based log additive odds ratio is 1.22 (C.I.?=?0.76-1.94; p?=?0.42). The frequency of minor rs6584555 C allele in NEURL1 was 0.22 in the control group and 0.23 in AF patients. Again there were no significant differences in allele and genotype frequencies between AF patients and controls (p?=?0.92). The log additive odds ratio is 1,15 (C.I.?=?0.66-2.01; p?=?0,63). The heterozygous genotype of rs2595104 had the highest frequency compared to the other genotypes in both groups. In case of the rs6584555 SNP the homozygous genotype of the major allele (TT) had the highest frequency in both groups (0.59). The frequency of homozygous genotype for risk allele had the lowest frequency for both SNPs [rs2595104 (AA): 0.19 in patients, 0.12 in controls; rs6584555 (CC): 0.05 in patients, 0.03 in controls]. We did not find significant association between SNP rs2595104 and rs6584555 andAF. We performed a protein-protein network analysis to assess functional connection among the protein products. The proteins coded by PITX2 and NEURL1 are connected indirectly via CTNNB1 and either JAG1 or DLL4 proteins. These interactive proteins are components of two major channels of cell communication pathways, the Wnt and Notch signaling pathways.
Tárgyszavak:Orvostudományok Klinikai orvostudományok idegen nyelvű folyóiratközlemény külföldi lapban
folyóiratcikk
PITX2
NEURL1
atrial
fibrillation
SNP
Megjelenés:Journal of Biotechnology. - 299 (2019), p. 44-49. -
További szerzők:Soltész Beáta (1987-) (molekuláris biológus) Hajas Orsolya (1987-) Urbancsek Réka (1991-) (általános orvos) Nagy-Baló Edina (1985-) (kardiológus) Penyige András (1954-) (molekuláris genetikus) Csanádi Zoltán (1960-) (kardiológus) Nagy Bálint (1956-) (molekuláris genetikus)
Pályázati támogatás:GINOP-2.3.2-15-2016-0043
GINOP
Internet cím:DOI
Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
Borító:

5.

001-es BibID:BIBFORM039003
035-os BibID:PMID:22752904
Első szerző:Szirák Krisztina (molekuláris genetikus)
Cím:Disruption of SCO5461 gene coding for a mono-ADP-ribosyltransferase enzyme produces a conditional pleiotropic phenotype affecting morphological differentiation and antibiotic production in Streptomyces coelicolor / Krisztina Szirák, Judit Keserű, Sándor Biró, Iván Schmelczer, György Barabás, András Penyige
Dátum:2012
ISSN:1225-8873
Megjegyzések:The SCO5461 gene of Streptomyces coelicolor A3(2) codes for an ADP-ribosyltransferase enzyme that is predicted to be a transmembrane protein with an extracellular catalytic domain. PCR-targeted disruption of the gene resulted in a mutant that differentiated normally on complex SFM medium; however, morphological differentiation in minimal medium was significantly delayed and this phenotype was even more pronounced on osmotically enhanced minimal medium. The mutant did not sporulate when it was grown on R5 medium, however the normal morphological differentiation was restored when the strain was cultivated beside the wild-type S. coelicolor M145 strain. Comparison of the pattern of ADP-ribosylated proteins showed a difference between the mutant and the wild type, fewer modified proteins were present in the cellular crude extract of the mutant strain. These results support our previous suggestions that protein ADP-ribosylation is involved in the regulation of differentiation and antibiotic production and secretion in Streptomyces.
Tárgyszavak:Természettudományok Biológiai tudományok idegen nyelvű folyóiratközlemény külföldi lapban
Streptomyces
egyetemen (Magyarországon) készült közlemény
mono-ADP-ribosyltransferase
protein ADP-ribosylation
morphological differentiation
actinorhodin production and secretion
Megjelenés:Journal of Microbiology. - 50 : 3 (2012), p. 409-418. -
További szerzők:Schmelczer Iván Keserű Judit (1976-) (molekuláris genetikus) Biró Sándor (1949-) (molekuláris genetikus) Barabás György (1933-) (sejtbiológus, molekuláris genetikus) Penyige András (1954-) (molekuláris genetikus)
Internet cím:Szerző által megadott URL
DOI
Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
Borító:
Rekordok letöltése1