Találati lista | Tudóstér

001-es BibID:	BIBFORM112379
035-os BibID:	(cikkazonosító)364 (WoS)001003037300001 (Scopus)85161068901
Első szerző:	Feró Orsolya
Cím:	Coding and noncoding transcriptomes of NODULIN HOMEOBOX (NDX)-deficient Arabidopsis inflorescence / Feró Orsolya, Karányi Zsolt, Nagy Éva, Mosolygó-L. Ágnes, Szaker Henrik Mihály, Csorba Tibor, Székvölgyi Lóránt
Dátum:	2023
ISSN:	2052-4463
Megjegyzések:	Arabidopsis NODULIN HOMEOBOX (NDX) is a plant-specific transcriptional regulator whose role in small RNA biogenesis and heterochromatin homeostasis has recently been described. Here we extend our previous transcriptomic analysis to the flowering stage of development. We performed mRNA-seq and small RNA-seq measurements on inflorescence samples of wild-type and ndx1-4 mutant (WiscDsLox344A04) Arabidopsis plants. We identified specific groups of differentially expressed genes and noncoding heterochromatic siRNA (hetsiRNA) loci/regions whose transcriptional activity was significantly changed in the absence of NDX. In addition, data obtained from inflorescence were compared with seedling transcriptomics data, which revealed development-specific changes in gene expression profiles. Overall, we provide a comprehensive data source on the coding and noncoding transcriptomes of NDX-deficient Arabidopsis flowers to serve as a basis for further research on NDX function.
Tárgyszavak:	Orvostudományok Elméleti orvostudományok idegen nyelvű folyóiratközlemény külföldi lapban folyóiratcikk kromatinszerkezet big data bioinformatika genomika
Megjelenés:	Scientific Data. - 10 : 1 (2023), p. 1-12. -
További szerzők:	Karányi Zsolt (1961-) (biostatisztikus, bioinformatikus) Nagy Éva (1980-) (molekuláris biológus) Mosolygó Ágnes (1986-) (biológus) Szaker Henrik Csorba Tibor Székvölgyi Lóránt (1977-) (biofizikus, biokémikus, sejtbiológus)
Pályázati támogatás:	NKFIH-K-142137 Egyéb NKFIH-NNE-130913 Egyéb TKP2021-EGA-18 Egyéb UNKP-21-5-DE-11 Egyéb NKFIH-K129283 Egyéb K137722 OTKA K136513 OTKA
Internet cím:	Szerző által megadott URL DOI Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
Borító:
Saját polcon: