Találati lista | Tudóstér

001-es BibID:	BIBFORM074760
035-os BibID:	(WoS)000456709700016 (Scopus)85056716023
Első szerző:	Hegedűs Éva (biofizikus)
Cím:	Endogenous single-strand DNA breaks at RNA polymerase II promoters in Saccharomyces cerevisiae / Hegedűs Éva, Kókai Endre, Nánási Péter, Imre László, Halász László, Jossé Rozenn, Antunovics Zsuzsa, Webb Martin R., El Hage Aziz, Pommier Yves, Székvölgyi Lóránt, Dombrádi Viktor, Szabó Gábor
Dátum:	2018
ISSN:	0305-1048 1362-4962
Tárgyszavak:	Orvostudományok Elméleti orvostudományok idegen nyelvű folyóiratközlemény külföldi lapban folyóiratcikk ssDNA breaks
Megjelenés:	Nucleic Acids Research. - 46 : 20 (2018), p. 10649-10668. -
További szerzők:	Kókai Endre (1971-) (biokémikus, biológus) Nánási Péter Pál ifj. (1987-) (sejtbiológus) Imre László (1979-) (biológus) Halász László (1989-) (molekuláris biológus) Jossé, Rozenn Antunovics Zsuzsa (1978-) (molekuláris biológus, genetikus) Webb, Martin R. El Hage, Aziz Pommier, Yves Székvölgyi Lóránt (1977-) (biofizikus, biokémikus, sejtbiológus) Dombrádi Viktor (1953-) (biokémikus) Szabó Gábor (1953-) (biofizikus)
Pályázati támogatás:	K72762 OTKA NK101337 OTKA K128770 OTKA 4.2.2-08/1-2008-0015 TÁMOP 4.2.1/B09/1/KONV-2010-0007 TÁMOP 4.2.2.A-11/1/KONV2012-0023 "VÉD-ELEM" TÁMOP 4.2.4. A/2-11-1-2012-0001 TÁMOP GINOP-2.3.2-15-2016-00044 GINOP GINOP-2.3.2-15-2016-00026 GINOP NKFIH-ERC-HU-117670 NKFIH GINOP-2.3.2-15-2016-00024 GINOP
Internet cím:	Szerző által megadott URL DOI Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
Borító:
Saját polcon:

001-es BibID:	BIBFORM125426
035-os BibID:	(scopus)85207348410 (wos)001342098500008
Első szerző:	Imre László (biológus)
Cím:	Epigenetic modulation via the C-terminal tail of H2A.Z / Imre László, Nánási Péter, Benhamza Ibtissem, Enyedi Kata Nóra, Mocsár Gábor, Bosire Rosevalentine, Hegedüs Éva, Niaki Erfaneh Firouzi, Csóti Ágota, Darula Zsuzsanna, Csősz Éva, Póliska Szilárd, Scholtz Beáta, Mező Gábor, Bacsó Zsolt, Timmers H. T. Marc, Kusakabe Masayuki, Balázs Margit, Vámosi György, Ausio Juan, Cheung Peter, Tóth Katalin, Tremethick David, Harata Masahiko, Szabó Gábor
Dátum:	2024
ISSN:	2041-1723
Megjegyzések:	H2A.Z-nucleosomes are present in both euchromatin and heterochromatin and it has proven difficult to interpret their disparate roles in the context of their stability features. Using an in situ assay of nucleosome stability and DT40 cells expressing engineered forms of the histone variant we show that native H2A.Z, but not C-terminally truncated H2A.Z (H2A.Z?C), is released from nucleosomes of peripheral heterochromatin at unusually high salt concentrations. H2A.Z and H3K9me3 landscapes are reorganized in H2A.Z?C-nuclei and overall sensitivity of chromatin to nucleases is increased. These tail-dependent differences are recapitulated upon treatment of HeLa nuclei with the H2A.Z-tail-peptide (C9), with MNase sensitivity being increased genome-wide. Fluorescence correlation spectroscopy revealed C9 binding to reconstituted nucleosomes. When intro duced into live cells, C9 elicited chromatin reorganization, overall nucleosome destabilization and changes in gene expression. Thus, H2A.Z-nucleosomes influence global chromatin architecture in a tail-dependent manner, what can be modulated by introducing the tail-peptide into live cells.
Tárgyszavak:	Orvostudományok Elméleti orvostudományok idegen nyelvű folyóiratközlemény külföldi lapban folyóiratcikk
Megjelenés:	Nature Communications. - 15 : 1 (2024), p. 1-21. -
További szerzők:	Nánási Péter Pál ifj. (1987-) (sejtbiológus) Benhamza, Ibtissem Enyedi Kata Nóra (1987-) (vegyész) Mocsár Gábor (1981-) (biofizikus) Bosire, Rosevalentine (1988-) (biotechnológus) Hegedűs Éva (1978-) (biofizikus) Niaki, Erfaneh Firouzi Csóti Ágota (1989-) (biológus) Darula Zsuzsanna Csősz Éva (1977-) (biokémikus, molekuláris biológus) Póliska Szilárd (1978-) (biológus) Scholtz Beáta (1967-) (biokémikus, molekuláris biológus) Mező Gábor (1959-) (vegyész) Bacsó Zsolt (1963-) (biofizikus) Timmers, H. T. Marc Kusakabe, Masayuki Balázs Margit (1952-) (sejtbiológus, molekuláris genetikus) Vámosi György (1967-) (biofizikus) Ausio, Juan Cheung, Peter Tóth Katalin (biofizikus) Tremethick, David Harata, Masahiko Szabó Gábor (1953-) (biofizikus)
Pályázati támogatás:	GINOP-2.3.2-15-2016-00044 GINOP GINOP-2.3.3-15-2016-00020 GINOP K138524 OTKA K128770 OTKA COST EuroCellNet CA15214 Egyéb
Internet cím:	Szerző által megadott URL DOI Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
Borító:
Saját polcon:

001-es BibID:	BIBFORM072900
035-os BibID:	(Cikkazonosító)12734 (WOS)000412491500006 (Scopus)85030764085
Első szerző:	Imre László (biológus)
Cím:	Nucleosome stability measured in situ by automated quantitative imaging / László Imre, Zoltán Simándi, Attila Horvath, György Fenyofalvi, Péter Nanasi Jr., Erfaneh Firouzi Niaki, Éva Hegedus, Zsolt Bacso, Urbain Weyemi, Rebekka Mauser, Juan Ausio, Albert Jeltsch, William Bonner, László Nagy, Hiroshi Kimura, Gábor Szabo
Dátum:	2017
ISSN:	2045-2322
Megjegyzések:	Current approaches have limitations in providing insight into the functional properties of particular nucleosomes in their native molecular environment. Here we describe a simple and powerful method involving elution of histones using intercalators or salt, to assess stability features dependent on DNA superhelicity and relying mainly on electrostatic interactions, respectively, and measurement of the fraction of histones remaining chromatin-bound in the individual nuclei using histone type- or posttranslational modification- (PTM-) specific antibodies and automated, quantitative imaging. The method has been validated in H3K4me3 ChIP-seq experiments, by the quantitative assessment of chromatin loop relaxation required for nucleosomal destabilization, and by comparative analyses of the intercalator and salt induced release from the nucleosomes of different histones. The accuracy of the assay allowed us to observe examples of strict association between nucleosome stability and PTMs across cell types, differentiation state and throughout the cell-cycle in close to native chromatin context, and resolve ambiguities regarding the destabilizing effect of H2A.X phosphorylation. The advantages of the in situ measuring scenario are demonstrated via the marked effect of DNA nicking on histone eviction that underscores the powerful potential of topological relaxation in the epigenetic regulation of DNA accessibility.
Tárgyszavak:	Orvostudományok Elméleti orvostudományok idegen nyelvű folyóiratközlemény külföldi lapban folyóiratcikk Fluorescence imaging Nuclear organization Epigenetics Molekuláris Medicina
Megjelenés:	Scientific Reports. - 7 : 1 (2017), p. 1-15. -
További szerzők:	Simándi Zoltán (1984-) (Ph.D. hallgató, molekuláris biológus) Horváth Attila (1988-) (programtervező informatikus) Fenyőfalvi György Nánási Péter Pál ifj. (1987-) (sejtbiológus) Firouzi Niaki, Erfaneh Hegedűs Éva (1978-) (biofizikus) Bacsó Zsolt (1963-) (biofizikus) Weyemi, Urbain Mauser, Rebekka Ausio, Juan Jeltsch, Albert Bonner, William Nagy László (1966-) (molekuláris sejtbiológus, biokémikus) Kimura, Hiroshi Szabó Gábor (1953-) (biofizikus)
Pályázati támogatás:	K72762 OTKA NK101337 OTKA TÁMOP-4.2.2-08/1-2008-0015 TÁMOP TÁMOP-4.2.1/B-09/1/KONV-2010-0007 TÁMOP I. ABC transzporterek; II. Magasabbrendű kromatinszerkezet TÁMOP 4.2.2.A- 11/1/KONV-2012-0023 "VÉD-ELEM TÁMOP TÁMOP 4.2.4. A/2-11-1-2012-0001 TÁMOP GINOP-2.3.2-15-2016-00044 GINOP
Internet cím:	Szerző által megadott URL DOI Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
Borító:
Saját polcon: