Találati lista | Tudóstér

001-es BibID:	BIBFORM086696
035-os BibID:	(WoS)000553333300022 (Scopus)85088493600
Első szerző:	Fadel, Lina (gyógyszerész)
Cím:	Agonist binding directs dynamic competition among nuclear receptors for heterodimerization with retinoid X receptor / Lina Fadel, Bálint Rehó, Julianna Volkó, Dóra Bojcsuk, Zsuzsanna Kolostyák, Gergely Nagy, Gabriele Müller, Zoltán Simándi, Éva Hegedüs, Gábor Szabó, Katalin Tóth, Laszlo Nagy, György Vámosi
Dátum:	2020
ISSN:	0021-9258 1083-351X
Megjegyzések:	Retinoid X receptor (RXR) plays a pivotal role as a transcriptional regulator and serves as an obligatory heterodimerization partner for at least 20 other nuclear receptors (NRs). Given a potentially limiting/sequestered pool of RXR and simultaneous expression of several RXR partners, we hypothesized that NRs compete for binding to RXR and that this competition may be directed by specific agonist treatment. Here, we tested this hypothesis on three NRs: peroxisome proliferator-activated receptor γ (PPARγ), vitamin D receptor (VDR), and retinoic acid receptor α (RARα). Evaluation of competition relied on a nuclear-translocation assay applied in a three-color imaging model system by detecting changes in heterodimerization between RXRα and one of its partners (NR1), in the presence of another competing partner (NR2). Our results indicated dynamic competition between the NRs governed by two mechanisms. First, in the absence of agonist treatment, there is a hierarchy of affinities between RXRα and its partners in the following order: RARα>PPARγ>VDR. Second, upon agonist treatment, RXRα favors the liganded partner. We conclude that recruiting RXRα by the liganded NR not only facilitates a stimulus-specific cellular response, but might also impede other NR pathways involving RXRα.
Tárgyszavak:	Orvostudományok Elméleti orvostudományok idegen nyelvű folyóiratközlemény külföldi lapban folyóiratcikk
Megjelenés:	Journal of Biological Chemistry. - 295 : 29 (2020), p. 10045-10061. -
További szerzők:	Rehó Bálint (1992-) Volkó Julianna (1983-) (biotechnológus) Bojcsuk Dóra (1990-) (klinikai laboratóriumi kutató) Kolostyák Zsuzsanna Nagy Gergely (1986-) (molekuláris biológus) Müller, Gabriele Simándi Zoltán (1984-) (Ph.D. hallgató, molekuláris biológus) Hegedűs Éva (1978-) (biofizikus) Szabó Gábor (1953-) (biofizikus) Tóth Katalin Nagy László (1966-) (molekuláris sejtbiológus, biokémikus) Vámosi György (1967-) (biofizikus)
Pályázati támogatás:	NKFIH NN129371 egyéb NKFIH KKP129909 egyéb NKFIH K124298 egyéb GINOP-2.3.2-15-2016-00050 GINOP GINOP-2.3.3-15-2016-00003 GINOP
Internet cím:	Szerző által megadott URL DOI Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
Borító:
Saját polcon:

001-es BibID:	BIBFORM123984
035-os BibID:	(Scopus)85203513752 (WoS)001317220800001
Első szerző:	Kolostyák Zsuzsanna
Cím:	EGR2 is an epigenomic regulator of phagocytosis and antifungal immunity in alveolar macrophages / Kolostyak Zsuzsanna, Bojcsuk Dora, Baksa Viktoria, Szigeti Zsuzsa Mathene, Bene Krisztian, Czimmerer Zsolt, Boto Pal, Fadel Lina, Poliska Szilard, Halasz Laszlo, Tzerpos Petros, Berger Wilhelm K., Villabona-Rueda Andres, Varga Zsofia, Kovacs Tunde, Patsalos Andreas, Pap Attila, Vamosi Gyorgy, Bai Peter, Dezso Balazs, Spite Matthew, D'Alessio Franco R., Szatmari Istvan, Nagy Laszlo
Dátum:	2024
ISSN:	2379-3708
Megjegyzések:	Alveolar macrophages (AMs) act as gatekeepers of the lung's immune responses, serving essential roles in recognizing and eliminating pathogens. The transcription factor (TF) early growth response 2 (EGR2) has been recently described as required for mature AMs in mice; however, its mechanisms of action have not been explored. Here, we identified EGR2 as an epigenomic regulator and likely direct proximal transcriptional activator in AMs using epigenomic approaches (RNA sequencing, ATAC sequencing, and CUT&RUN). The predicted direct proximal targets of EGR2 included a subset of AM identity genes and ones related to pathogen recognition, phagosome maturation, and adhesion, such as Clec7a, Atp6v0d2, Itgb2, Rhoc, and Tmsb10. We provided evidence that EGR2 deficiency led to impaired zymosan internalization and reduced the capacity to respond to Aspergillus fumigatus. Mechanistically, the lack of EGR2 altered the transcriptional response, secreted cytokines (i.e., CXCL11), and inflammation-resolving lipid mediators (i.e., RvE1) of AMs during in vivo zymosan-induced inflammation, which manifested in impaired resolution. Our findings demonstrated that EGR2 is a key proximal transcriptional activator and epigenomic bookmark in AMs responsible for select, distinct components of cell identity and a protective transcriptional and epigenomic program against fungi.
Tárgyszavak:	Orvostudományok Elméleti orvostudományok idegen nyelvű folyóiratközlemény külföldi lapban folyóiratcikk
Megjelenés:	JCI Insight. - 9 : 17 (2024), p. 1-21. -
További szerzők:	Bojcsuk Dóra (1990-) (klinikai laboratóriumi kutató) Baksa Viktória (1990-) (biomérnök) Máthéné Szigeti Zsuzsa (1976-) (biológus-ökológus) Bene Krisztián (1986-) (Biológus) Czimmerer Zsolt (1981-) (molekuláris biológus) Botó Pál (1986-) (molekuláris biológus) Fadel, Lina (1988-) (gyógyszerész) Póliska Szilárd (1978-) (biológus) Halász László (1989-) (molekuláris biológus) Tzerpos, Petros (1982-) (molekuláris biológus) Berger, Wilhelm K. Villabona-Rueda, Andres Varga Zsófia (1992-) (molekuláris biológus) Kovács Tünde (1990-) (molekuláris biológus) Patsalos, Andreas Pap Attila (1980-) (biológus) Vámosi György (1967-) (biofizikus) Bai Péter (1976-) (biokémikus) Dezső Balázs (1951-) (pathológus) Spite, Matthew D'Alessio, Franco R. Szatmári István (1971-) (biológus) Nagy László (1966-) (molekuláris sejtbiológus, biokémikus)
Pályázati támogatás:	KKP129909 OTKA K147147 OTKA PD137902 OTKA
Internet cím:	Szerző által megadott URL DOI Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
Borító:
Saját polcon:

001-es BibID:	BIBFORM136745
Első szerző:	Mianesaz, Hamidreza (molekuláris biológus, genetikus)
Cím:	Genome-wide chromatin profiling reveals a non-limiting role for RXR in macrophage-like cells stimulated with multiple nuclear receptor agonists / Hamidreza Mianesaz, Loránd Göczi, Dóra Bojcsuk, Safoura Ghalamkari, Lina Fadel, Szilárd Póliska, András Penyige, László Nagy, Gergely Nagy, György Vámosi, Lajos Széles
Dátum:	2026
ISSN:	0021-9258 1083-351X
Tárgyszavak:	Orvostudományok Elméleti orvostudományok idegen nyelvű folyóiratközlemény külföldi lapban folyóiratcikk
Megjelenés:	Journal of Biological Chemistry. - "Accepted by Publisher" (2026). -
További szerzők:	Göczi Loránd (1993-) (PhD Hallgató) Bojcsuk Dóra (1990-) (klinikai laboratóriumi kutató) Ghalamkari, Safoura Fadel, Lina (1988-) (gyógyszerész) Póliska Szilárd (1978-) (biológus) Penyige András (1954-) (molekuláris genetikus) Nagy László (1966-) (molekuláris sejtbiológus, biokémikus) Nagy Gergely (1986-) (molekuláris biológus) Vámosi György (1967-) (biofizikus) Széles Lajos (1971-) (molekuláris biológus)
Internet cím:	Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
Borító:
Saját polcon:

001-es BibID:	BIBFORM131886
035-os BibID:	(scopus)105002543351 (wos)001458817600010
Első szerző:	Mianesaz, Hamidreza (molekuláris biológus, genetikus)
Cím:	Genomic regions occupied by both RARα and VDR are involved in the convergence and cooperation of retinoid and vitamin D signaling pathways / Mianesaz Hamidreza, Göczi Loránd, Nagy Gergely, Póliska Szilárd, Fadel Lina, Bojcsuk Dóra, Penyige András, Szirák Krisztina, AlHaman Farah, Nagy László, Vámosi György, Széles Lajos
Dátum:	2025
ISSN:	0305-1048 1362-4962
Megjegyzések:	Retinoic acid receptors (RARs) and the vitamin D receptor (VDR) regulate distinct but o v erlapping gene sets in multiple cell types. The abun- dance and characteristics of regulatory regions, occupied by both RARs and VDR are largely unexplored. We used global approaches (ChIP-seq, RNA-seq, and A T AC-seq) and bioinformatics tools to map and characterize common binding regions of RAR ?and VDR in differentiated human THP -1 cells. W e f ound that the cistromes of ligand-activ ated RAR ?and VDR largely o v erlapped, and their agonists (AM580 and calcitriol) co- regulated se v eral genes, often cooperativ ely. Common binding regions w ere frequently (but not e x clusiv ely) annotated with co-regulated genes and exhibited increased MED1 occupancy upon ligand stimulation, suggesting their in v olv ement in gene regulation. Chromatin accessibility was typically higher in the common regions than in regions occupied e x clusiv ely b y RAR ?or VDR. DNA response elements f or RAR ?(DR1 / 2 / 5) and VDR (DR3) were enriched in the common regions, albeit the co-occurrence of the two types of canonical motifs w as lo w (8.4%), suggesting that "degenerate"DR1 / 2 / 5 and DR3 motifs or other sequences could mediate the binding. In summary, common binding regions of RAR ?and VDR are at the crossroads of the retinoid and vitamin D pathw a y s, pla ying important roles in their con v ergence and cooperation.
Tárgyszavak:	Orvostudományok Elméleti orvostudományok idegen nyelvű folyóiratközlemény külföldi lapban folyóiratcikk
Megjelenés:	Nucleic Acids Research. - 53 : 6 (2025), p. 1-20. -
További szerzők:	Göczi Loránd (1993-) (PhD Hallgató) Nagy Gergely (1986-) (molekuláris biológus) Póliska Szilárd (1978-) (biológus) Fadel, Lina (1988-) (gyógyszerész) Bojcsuk Dóra (1990-) (klinikai laboratóriumi kutató) Penyige András (1954-) (molekuláris genetikus) Szirák Krisztina (1973-) (molekuláris genetikus) AlHaman, Farah Nagy László (1966-) (molekuláris sejtbiológus, biokémikus) Vámosi György (1967-) (biofizikus) Széles Lajos (1971-) (molekuláris biológus)
Pályázati támogatás:	FK146945 OTKA PD137902 OTKA
Internet cím:	Szerző által megadott URL DOI Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
Borító:
Saját polcon: