CCL

Összesen 6 találat.
#/oldal:
Részletezés:
Rendezés:

1.

001-es BibID:BIBFORM131531
Első szerző:Fauszt Péter (mikrobiom)
Cím:A rezisztencia átvitele a környezet, illetve bél mikrobiom között az intenzív brojlercsirke és kacsa tenyésztésben / Fauszt Péter, Mikolás Maja, Dávid Péter, Szőke Zsombor, Gashi Njomza, Szilágyi-Tolnai Emese, Szarvas Mária Magdolna, Fazekas Mónika Éva, Kun-nemes Andrea, Gál Ferenc, Stündl László, Czeglédi Levente, Stágel Anikó, Bíró Sándor, Remenyik Judit, Paholcsek Melinda
Dátum:2025
Megjegyzések:Az antibiotikum-rezisztencia (antimicrobial resistance) (AMR) egyre súlyosabb globális probléma, mind gazdasági, mind közegészségügyi szempontból. A rezisztens törzsek kialakulásában nagy szerepe van az állattartásban alkalmazott antibiotikumok túlzott használatának, amely elősegíti a rezisztenciák kialakulását. Az intenzív termelési rendszerek, mint környezet fontos rezervoárként szolgálnak különféle kórokozók számára, így a kórokozók megmaradhatnak a létesítményeken belül. Ezeket a rezisztenciákat később az állatok fel tudják venni, ezzel elősegítve a rezisztenciák terjedését. Bár ez egy fontos terület az AMR elleni harcban, de eddig nem sokan vizsgálták, hogy a biológiai és a környezeti minták között a rezisztencia miként adódik át intenzív állattenyésztésben, így ez egy nagy jelentőségű projekt. A brojlercsirke és a kacsa az Európai Unióban és Magyarországon is a leggyakrabban tenyésztett baromfifajok közé tartozik. A vizsgálatban 2022 és 2024 között 15 tartási cikluson keresztül vizsgáltuk a Ross 308 brojlercsirkék és Cherry Valley kacsák AMR profilját a környezeti és biológiai bélsár mintákban. A begyűjtött mintákból DNS-t izoláltunk, és teljes genom metagenom szekvenálást végeztünk. A szekvencia adatok kielemzéséhez a KneadData programot használtuk, a rezisztencia gének meghatározásához az RGI programot használtuk a CARD adatbázissal. A nagy számítási igény miatt a programok futtatása a Komondor szuperszámítógépen történt. A rezisztenciák feltérképezéséhez a környezeti minták, illetve a biológiai minták AMR szintjét hasonlítjuk össze. A rezisztenciákhoz köthető fajok alfa diverzitásának vizsgálatával a sokszínűség megállapítható. Korábbi vizsgálatok alapján feltételezzük, hogy a top 15 rezisztenciákhoz köthető fajok teszik ki a rezisztens fajok nagy részét, ezért ezekre koncentrálunk az elemzések során. Illetve vizsgáljuk ezek egymáshoz viszonyított arányát kacsában és brojlercsirkében. Számos antibiotikum osztály megtalálható a mintákban, de az olvasatok döntő többsége csupán néhány rezisztenciához köthető, amelyek dominálnak a környezetben. Vizsgáljuk ezen rezisztenciák megoszlását, hogy között mekkora az átfedés, illetve mennyi egyedi rezisztencia van jelen a különféle mintákban. Vizsgáljuk a biofilm képzők, illetve multi rezisztens fajok arányait a környezeti, illetve a biológiai minták között. A kísérleti időszak során egyes nevelési ciklusokban szükség volt antibiotikum használatára, míg más esetben nem, szeretnénk összehasonlítani, hogy ezen minták között milyen AMR profil különbségek vannak.
ISBN:978-615-6457-73-8
Tárgyszavak:Agrártudományok Állattenyésztési tudományok előadáskivonat
könyvrészlet
Brojlercsirke
kacsa
mikrobiom
antibiotikum rezisztencia
környezeti mikrobiom
Megjelenés:XXVIII. Tavaszi Szél Konferencia 2025 : Absztrakt kötet / szerk. Molnár Dániel, Molnár Dóra. - p. 44. -
További szerzők:Mikolás Maja (2000-) (molekuláris biológus) Dávid Péter (1984-) (biológia tanár) Szőke Zsombor (1998-) (Agrármérnök) Gashi Njomza (2001-) (Food Scientist) Szilágyi-Tolnai Emese (1988-) (Molekuláris biológus) Szarvas Mária Magdolna (1989-) (élelmiszeripari mérnök) Fazekas Mónika (1985-) (biotechnológus) Kun-Nemes Andrea (1983-) (okleveles élelmiszermérnök) Gál Ferenc (1986-) (gyógyszerész) Stündl László (1970-) (agrármérnök) Czeglédi Levente (1977-) (agrármérnök) Stágel Anikó (agrár) Biró Sándor (1949-) (molekuláris genetikus) Gálné Remenyik Judit (1965-) (kémia tanár, okleveles vegyész) Paholcsek Melinda (1984-) (molekuláris biológus, genetikus)
Pályázati támogatás:Other
SUPPORT
Internet cím:Szerző által megadott URL
Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
Borító:

2.

001-es BibID:BIBFORM086507
035-os BibID:(WOS)000563230200016 (Scopus)85094851273
Első szerző:Fidler Gábor (molekuláris biológus, genetikus)
Cím:Tendentious effects of automated and manual metagenomic DNA purification protocols on broiler gut microbiome taxonomic profiling / Fidler Gabor, Tolnai Emese, Stagel Aniko, Remenyik Judit, Stundl Laszlo, Gal, Ferenc Biro Sandor, Paholcsek Melinda
Dátum:2020
ISSN:2045-2322
Megjegyzések:Here, we developed protocols to improve sensitivity, rigor and comparability of 16S rRNA gene amplification-based next-generation sequencing (NGS) results. A thorough study was performed by evaluating extraction efficiency with respect to the yield, purity, fragmentation of the purified DNA, and sequencing metrics considering the number of quality reads, amplicon sequence variants (ASVs), community structure and biodiversity. We identified batch-effects that significantly bias broiler gastrointestinal tract (GIT) community compositions and made recommendations to improve sensitivity, consistency, and cross-study comparability. We found that the purity of the extracted nucleic acid had a strong effect on the success rate of downstream library preparations. The preparation of stool bacterial suspensions from feces showed a significant positive influence on community biodiversity by enriching Gram-negative bacteria and cataloguing low abundant taxa with greater success than direct processing of fecal material. Applications relying on the automated Roche MagNa Pure 24 magnetic-bead based method provided results with high consistency therefore it seems to be the optimal choice in large-scale studies for investigating broiler GIT microbiota.
Tárgyszavak:Természettudományok Biológiai tudományok idegen nyelvű folyóiratközlemény külföldi lapban
folyóiratcikk
Megjelenés:Scientific Reports. - 10 : 1 (2020), p. 1-16. -
További szerzők:Szilágyi-Tolnai Emese (1988-) (Molekuláris biológus) Stágel Anikó (agrár) Gálné Remenyik Judit (1965-) (kémia tanár, okleveles vegyész) Stündl László (1970-) (agrármérnök) Gál Ferenc (1986-) (gyógyszerész) Biró Sándor (1949-) (molekuláris genetikus) Paholcsek Melinda (1984-) (molekuláris biológus, genetikus)
Pályázati támogatás:GINOP-2.3.2-15-2016-00042
GINOP
Internet cím:Szerző által megadott URL
DOI
Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
Borító:

3.

001-es BibID:BIBFORM132589
035-os BibID:(WoS)001527609800006
Első szerző:Mikolás Maja (molekuláris biológus)
Cím:Analysis of ICU resistome dynamics in patients, staff and environment for the identification of predictive biomarkers of sepsis and early mortality / Maja Mikolas, Peter Fauszt, Annamaria Petrilla, Peter Nemeth, Peter David, Emese Szilagyi-Tolnai, Anna Szilagyi-Racz, Aniko Stagel, Ferenc Gal, Kristof Gal, Reka Sohajda, Zsombor Szoke, Syed Akib Hossain, Laszlo Stundl, Sandor Biro, Judit Remenyik, Melinda Paholcsek
Dátum:2025
ISSN:2045-2322
Tárgyszavak:Orvostudományok Egészségtudományok idegen nyelvű folyóiratközlemény külföldi lapban
folyóiratcikk
Megjelenés:Scientific Reports. - 15 : 1 (2025), p. 1-23. -
További szerzők:Fauszt Péter (1992-) (mikrobiom) Petrilla Annamária Németh Péter Dávid Péter (1984-) (biológia tanár) Szilágyi-Tolnai Emese (1988-) (Molekuláris biológus) Szilágyi-Rácz Anna Anita (1995-) (molekuláris biológus) Stágel Anikó (genetika) Gál Ferenc (1986-) (gyógyszerész) Gál Kristóf (1994-) (orvos) Siposné Sohajda Réka Szőke Zsombor (1998-) (Agrármérnök) Hossain, Syed Akib Stündl László (1970-) (agrármérnök) Biró Sándor (1949-) (molekuláris genetikus) Gálné Remenyik Judit (1965-) (kémia tanár, okleveles vegyész) Paholcsek Melinda (1984-) (molekuláris biológus, genetikus)
Pályázati támogatás:DE Publikációs Tudománytámogatási Program
Egyéb
Internet cím:Szerző által megadott URL
DOI
Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
Borító:

4.

001-es BibID:BIBFORM125595
035-os BibID:(Scopus)85208724723 (WoS)001248653800001
Első szerző:Petrilla Annamária
Cím:Comparative analysis of the postadmission and antemortem oropharyngeal and rectal swab microbiota of ICU patients / Annamaria Petrilla, Peter Nemeth, Peter Fauszt, Anna Szilagyi-Racz, Maja Mikolas, Emese Szilagyi-Tolnai, Peter David, Aniko Stagel, Ferenc Gal, Kristof Gal, Reka Sohajda, Trinh Pham, Laszlo Stundl, Sandor Biro, Judit Remenyik, Melinda Paholcsek
Dátum:2024
ISSN:2045-2322
Megjegyzések:Shotgun metabarcoding was conducted to examine the microbiota in a total of 48 samples from 12 critically ill patients, analyzing samples from both the oropharynx and rectum. We aimed to compare their postadmission microbiota, characterized as moderately dysbiotic, with the severely dysbiotic antemortem microbiota associated with patients' deaths. We found that, compared with postadmission samples, patient antemortem swab samples presented moderate but not significantly decreased diversity indices. The antemortem oropharyngeal samples presented an increase in biofilm forming bacteria, including Streptococcus oralis, methicillin-resistant Staphylococcus aureus (MRSA), and Enterococcus faecalis. Although the septic shock rate was 67%, no significant differences were detected in the potential pathogen ratios when the microbiota was analyzed. A notable strain sharing rate between the oropharynx and intestine was noted. By comparing postadmission and antemortem samples, microbial biomarkers of severe dysbiosis were pinpointed through the analysis of differentially abundant and uniquely emerging species in both oropharyngeal and rectal swabs. Demonstrating strong interconnectivity along the oral-intestinal axis, these biomarkers could serve as indicators of the progression of dysbiosis. Furthermore, the microbial networks of the oropharyngeal microbiota in deceased patients presented the lowest modularity, suggesting a vulnerable community structure. Our data also highlight the critical importance of introducing treatments aimed at enhancing the resilience of the oral cavity microbiome, thereby contributing to better patient outcomes.
Tárgyszavak:Orvostudományok Elméleti orvostudományok idegen nyelvű folyóiratközlemény külföldi lapban
folyóiratcikk
Megjelenés:Scientific Reports. - 14 : 1 (2024), p. 1-17. -
További szerzők:Németh Péter Fauszt Péter (1992-) (mikrobiom) Szilágyi-Rácz Anna Anita (1995-) (molekuláris biológus) Mikolás Maja (2000-) (molekuláris biológus) Szilágyi-Tolnai Emese (1988-) (Molekuláris biológus) Dávid Péter (1984-) (biológia tanár) Stágel Anikó (agrár) Gál Ferenc (1986-) (gyógyszerész) Gál Kristóf (1994-) (orvos) Siposné Sohajda Réka Pham, Trinh Stündl László (1970-) (agrármérnök) Biró Sándor (1949-) (molekuláris genetikus) Gálné Remenyik Judit (1965-) (kémia tanár, okleveles vegyész) Paholcsek Melinda (1984-) (molekuláris biológus, genetikus)
Internet cím:Szerző által megadott URL
DOI
Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
Borító:

5.

001-es BibID:BIBFORM130236
Első szerző:Szilágyi-Tolnai Emese (Molekuláris biológus)
Cím:Effect of dietary fructooligosaccharide (FOS), carotenoids, anthocyanins and probiotics supplementation on the intestinal microbiome in broiler chickens / Emese Tolnai , Gábor Fidler, Anikó Stágel, Gál Ferenc, Judit Remenyik, Sándor Biró, Melinda Paholcsek
Dátum:2019
ISBN:978 615 5270 52 9
Tárgyszavak:Természettudományok Biológiai tudományok előadáskivonat
könyvrészlet
Megjelenés:Hungarian Molecular Life Sciences 2019: Programme and Books of abstracts / Szerk. László Buday, Miklós Erdélyi, Mihály Kovács, József Mihály, Máté Varga, László Virág, Róbert Hohol. - p. 247-248. -
További szerzők:Fidler Gábor (1987-) (molekuláris biológus, genetikus) Stágel Anikó (genetika) Gál Ferenc (1986-) (gyógyszerész) Gálné Remenyik Judit (1965-) (kémia tanár, okleveles vegyész) Biró Sándor (1949-) (molekuláris genetikus) Paholcsek Melinda (1984-) (molekuláris biológus, genetikus)
Internet cím:Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
Borító:

6.

001-es BibID:BIBFORM127797
035-os BibID:(WoS)001416485500001 (Scopus)85218208832
Első szerző:Szőke Zsombor (Agrármérnök)
Cím:Comprehensive analysis of antimicrobial resistance dynamics among broiler and duck intensive production systems / Zsombor Szoke, Peter Fauszt, Maja Mikolas, Peter David, Emese Szilagyi-Tolnai, Georgina Pesti-Asboth, Judit Rita Homoki, Ildiko Kovacs-Forgacs, Ferenc Gal, Laszlo Stundl, Levente Czegledi, Aniko Stagel, Sandor Biro, Judit Remenyik, Melinda Paholcsek
Dátum:2025
ISSN:2045-2322
Tárgyszavak:Agrártudományok Állattenyésztési tudományok idegen nyelvű folyóiratközlemény külföldi lapban
folyóiratcikk
Megjelenés:Scientific Reports. - 15 : 1 (2025), p. 1-23. -
További szerzők:Fauszt Péter (1992-) (mikrobiom) Mikolás Maja (2000-) (molekuláris biológus) Dávid Péter (1984-) (biológia tanár) Szilágyi-Tolnai Emese (1988-) (Molekuláris biológus) Pesti-Asbóth Georgina (1990-) (élelmiszerbiztonsági és -minőségi mérnök) Homoki Judit (1978-) (biológus) Forgács Ildikó Noémi (1992-) (biológus) Gál Ferenc (1986-) (gyógyszerész) Stündl László (1970-) (agrármérnök) Czeglédi Levente (1977-) (agrármérnök) Stágel Anikó (genetika) Biró Sándor (1949-) (molekuláris genetikus) Gálné Remenyik Judit (1965-) (kémia tanár, okleveles vegyész) Paholcsek Melinda (1984-) (molekuláris biológus, genetikus)
Pályázati támogatás:Gróf Tisza István Debreceni Egyetemért Alapítvány Kiválósági PhD Ösztöndíj
Egyéb
Internet cím:Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
DOI
Borító:
Rekordok letöltése1 
Corvina könyvtári katalógus v10.11.18-SNAPSHOT © 2024 Monguz kft. Minden jog fenntartva.