CCL

Összesen 12 találat.
#/oldal:
Részletezés:
Rendezés:

1.

001-es BibID:BIBFORM111540
035-os BibID:(cikkazonosító)550 (Scopus)85160562825 (WoS)000997913000001
Első szerző:Ács-Szabó Lajos (biológus)
Cím:Disruption of the Schizosaccharomyces japonicus lig4 Disturbs Several Cellular Processes and Leads to a Pleiotropic Phenotype / Lajos Acs-Szabo, Laszlo Attila Papp, Szonja Takacs, Ida Miklos
Dátum:2023
ISSN:2309-608X
Megjegyzések:Gene targeting is a commonly used method to reveal the function of genes. Although it is an attractive tool for molecular studies, it can frequently be a challenge because its efficiency can be low and it requires the screening of a large number of transformants. Generally, these problems originate from the elevated level of ectopic integration caused by non-homologous DNA end joining (NHEJ). To eliminate this problem, NHEJ-related genes are frequently deleted or disrupted. Although these manipulations can improve gene targeting, the phenotype of the mutant strains raised the question of whether mutations have side effects. The aim of this study was to disrupt the lig4 gene in the dimorphic fission yeast, S. japonicus, and investigate the phenotypic changes of the mutant strain. The mutant cells have shown various phenotypic changes, such as increased sporulation on complete medium, decreased hyphal growth, faster chronological aging, and higher sensitivity to heat shock, UV light, and caffeine. In addition, higher flocculation capacity has been observed, especially at lower sugar concentrations. These changes were supported by transcriptional profiling. Many genes belonging to metabolic and transport processes, cell division, or signaling had altered mRNA levels compared to the control strain. Although the disruption improved the gene targeting, we assume that the lig4 inactivation can cause unexpected physiological side effects, and we have to be very careful with the manipulations of the NHEJ-related genes. To reveal the exact mechanisms behind these changes, further investigations are required.
Tárgyszavak:Természettudományok Biológiai tudományok idegen nyelvű folyóiratközlemény külföldi lapban
folyóiratcikk
Megjelenés:Journal of Fungi. - 9 : 5 (2023), p. 1-16. -
További szerzők:Papp László Attila (1986-) (genetikus) Takács Szonja Miklós Ida (1962-) (biológus)
Pályázati támogatás:OTKA-106172
OTKA
EFOP-3.6.1-16-2016-00022
EFOP
Internet cím:Szerző által megadott URL
DOI
Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
Borító:

2.

001-es BibID:BIBFORM105492
035-os BibID:(cikkazonosító)1023 (WoS)000901230500001 (Scopus)85144728412
Első szerző:Ács-Szabó Lajos (biológus)
Cím:New Strain of Cyphellophora olivacea Exhibits Striking Tolerance to Sodium Bicarbonate / Lajos Acs-Szabo, Laszlo Attila Papp, Hajnalka Csoma, Ida Miklos, Matthias Sipiczki
Dátum:2022
ISSN:1424-2818
Megjegyzések:The cyanobacterium strain Synechococcus cedrorum SAG 88.79 stock culture has fungal contamination stated by the Sammlung von Algenkulturen der Universität Göttingen itself. In this recent work, this particular fungal strain was isolated, identified, and morphologically characterised. The fungal strain AGSC12 belongs to the species Cyphellophora olivacea, with respect to the sequence similarity, phylogeny, and morphology of the strain. Colony morphology and growth capability were examined on SMA, EMMA, PDA, MEA, YEA, and YPA plates. Growth of the colonies was the most successful on YPA plates, followed by PDA and MEA containing plates. Surprisingly, the AGSC12 strain showed extreme tolerance to NaHCO3 , albeit it, is is considered a general fungistatic compound. Moreover, positive association between the AGSC12 and SAG 88.79 strains was revealed, as the SAG 88.79 strain always attained higher cell density in co-cultures with the fungus than in mono-cultures. Besides, a taxonomic note on the SAG 88.79 strain itself was also stated.
Tárgyszavak:Természettudományok Biológiai tudományok idegen nyelvű folyóiratközlemény külföldi lapban
folyóiratcikk
Cyphellophora
Cyanobacterium
Synechococcus
fungal phylogeny
sodium bicarbonate
microbial interaction
Megjelenés:Diversity. - 14 : 12 (2022), p. 1-17. -
További szerzők:Papp László Attila (1986-) (genetikus) Csoma Hajnalka (1979-) (biológus, szőlész-borász) Miklós Ida (1962-) (biológus) Sipiczki Mátyás (1948-) (biológus)
Pályázati támogatás:K-124417
OTKA
GINOP-2.2.1-15-2016-00029
GINOP
EFOP-3.6.1-16-2016-00022
EFOP
20428-3/2018
FIKP
2019-1.1.1-PIACI-KFI-2019-00228
Egyéb
Internet cím:Szerző által megadott URL
DOI
Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
Borító:

3.

001-es BibID:BIBFORM097369
035-os BibID:(cikkazonosító)864 (WoS)000715414500001 (Scopus)85118167505
Első szerző:Ács-Szabó Lajos (biológus)
Cím:Genome Comparisons of the Fission Yeasts Reveal Ancient Collinear Loci Maintained by Natural Selection / Acs-Szabo Lajos, Papp Laszlo Attila, Sipiczki Matthias, Miklos Ida
Dátum:2021
ISSN:2309-608X
Tárgyszavak:Természettudományok Biológiai tudományok idegen nyelvű folyóiratközlemény külföldi lapban
folyóiratcikk
Megjelenés:Journal of Fungi. - 7 : 10 (2021), p. 1-26. -
További szerzők:Papp László Attila (1986-) (genetikus) Sipiczki Mátyás (1948-) (biológus) Miklós Ida (1962-) (biológus)
Pályázati támogatás:EFOP-3.6.1-16-2016-00022
EFOP
20428-3/2018
FIKP
TKP2020-IKA-04
Egyéb
Internet cím:Szerző által megadott URL
DOI
Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
Borító:

4.

001-es BibID:BIBFORM076280
035-os BibID:(cikkazonosító)14629 (WOS)000446034000030 (Scopus)85054179467
Első szerző:Ács-Szabó Lajos (biológus)
Cím:Assembly of Schizosaccharomyces cryophilus chromosomes and their comparative genomic analyses revealed principles of genome evolution of the haploid fission yeasts / Ács-Szabó Lajos, Papp László Attila, Antunovics Zsuzsa, Sipiczki Matthias, Miklós Ida
Dátum:2018
ISSN:2045-2322
Megjegyzések:The fission yeast clade, which has a distinct life history from other yeasts, can provide important clues about evolutionary changes. To reveal these changes the large S. cryophilus supercontigs were assembled into chromosomes using synteny relationships and the conserved pericentromeric, subtelomeric genes. Togetherness of the supercontigs was confirmed by PCR. Investigation of the gene order revealed localisation of the rDNA arrays, more than 300 new conserved orthologues and proved that S. cryophilus supercontigs were mosaics of collinear blocks. PFGE analysis showed that size of the S. cryophilus chromosomes differ from the S. pombe chromosomes. Comparative genomic analyses of the newly assembled chromosomes confirmed that the closest relative of S. cryophilus was S. octosporus not just in sequence similarity but also in a structural way, and revealed that preservation of the conserved regions did not arise from the lower number of chromosomal rearrangements. Translocations were more typical in the closely related species, while the number of inversions increased with the phylogenetic distances. Our data suggested that sites of the chromosomal rearrangements were not random and often associated with repetitive sequences, structural- and nucleotide evolution might correlate. Chromosomal rearrangements of the fission yeasts compared to other lineages were also discussed.
Tárgyszavak:Természettudományok Biológiai tudományok idegen nyelvű folyóiratközlemény külföldi lapban
folyóiratcikk
Megjelenés:Scientific Reports. - 8 : 1 (2018), p. 1-12. -
További szerzők:Papp László Attila (1986-) (genetikus) Antunovics Zsuzsa (1978-) (molekuláris biológus, genetikus) Sipiczki Mátyás (1948-) (biológus) Miklós Ida (1962-) (biológus)
Pályázati támogatás:EFOP-3.6.1-16-2016-00022
EFOP
Internet cím:Szerző által megadott URL
DOI
Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
Borító:

5.

001-es BibID:BIBFORM122300
Első szerző:Batta Gyula (biológus)
Cím:A Schizosaccharomyces japonicus képes a Fusarium graminearum gátlására és olyan enzimek termelésére, amelyek részt vehetnek a mikotoxinok elleni toleranciában és a biológiai detoxifikációban = Schizosaccharomyces japonicus can inhibit the growth of Fusarium grami- nearum and produce proteins that may be involved in mycotoxin tolerance and biological detoxification / Batta Gyula, Papp László Attila, Ács-Szabó Lajos, Adácsi Cintia, Pusztahelyi Tünde, Pócsi István, Miklós Ida
Dátum:2024
ISBN:978-963-623-098-2 (pdf)
Tárgyszavak:Természettudományok Biológiai tudományok előadáskivonat
könyvrészlet
Megjelenés:VII. Magyar Mikológiai Konferencia : Absztraktkötet / szerk.: Dima Bálint; Papp Viktor. - p. 118-119. -
További szerzők:Papp László Attila (1986-) (genetikus) Ács-Szabó Lajos (1985-) (biológus) Adácsi Cintia (1990-) (táplálkozástudományi szakember) Pusztahelyi Tünde (1969-) (biológus, angol-magyar szakfordító) Pócsi István (1961-) (vegyész) Miklós Ida (1962-) (biológus)
Pályázati támogatás:2019-2.1.13-TÉT_IN
Egyéb
Internet cím:Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
Borító:

6.

001-es BibID:BIBFORM122298
Első szerző:Batta Gyula (biológus)
Cím:Élesztőgomba-fuzárium együttes tenyészetek vizsgálata = Examination of yeast-Fusarium co-cultures / Batta Gyula, Papp László Attila, Ács-Szabó Lajos, Adácsi Cintia, Pusztahelyi Tünde, Pócsi István, Miklós Ida
Dátum:2024
ISBN:978-963-623-098-2 (pdf)
Tárgyszavak:Természettudományok Biológiai tudományok előadáskivonat
könyvrészlet
yeast, Fusarium, mycotoxin
Megjelenés:VII. Magyar Mikológiai Konferencia : Absztraktkötet / szerk.: Dima Bálint; Papp Viktor. - p. 120-121. -
További szerzők:Papp László Attila (1986-) (genetikus) Ács-Szabó Lajos (1985-) (biológus) Adácsi Cintia (1990-) (táplálkozástudományi szakember) Pusztahelyi Tünde (1969-) (biológus, angol-magyar szakfordító) Pócsi István (1961-) (vegyész) Miklós Ida (1962-) (biológus)
Pályázati támogatás:2019-2.1.13-TÉT_IN
Egyéb
Internet cím:Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
Borító:

7.

001-es BibID:BIBFORM110207
035-os BibID:(cikkazonosító)852 (Scopus)85156240803 (WoS)000978247400001
Első szerző:Csoma Hajnalka (biológus, szőlész-borász)
Cím:Characterization of Zygosaccharomyces lentus Yeast in Hungarian Botrytized Wines / Hajnalka Csoma, Lajos Acs-Szabo, László Attila Papp, Zoltán Kállai, Ida Miklós, Matthias Sipiczki
Dátum:2023
ISSN:2076-2607
Megjegyzések:Tokaj botrytized sweet wines are traditionally aged for several years in wood barrels or bottles. As they have significant residual sugar content, they are exposed to microbial contamination during ageing. Osmotolerant wine-spoilage yeasts are most commonly found in the Tokaj winegrowing region in the species Starmerella spp. and Zygosaccharomyces spp. For the first time, Z. lentus yeasts were isolated from post-fermented botrytized wines. Our physiological studies confirmed that these yeast strains are osmotolerant, with high sulphur tolerance and 8% v/v alcohol tolerance, and that they grow well at cellar temperature in acidic conditions. Low β-glucosidase and sulphite reductase activities were observed, whereas protease, cellulase, and α-arabinofuranosidase extracellular enzyme activities were not detected. Molecular biology analyses carried out by RFLP analysis of mtDNA revealed no remarkable differences between strains, while microsatellite-primed-PCR fingerprinting of the (GTG)5 microsatellite and examination of chromosomal pattern revealed considerable diversity. The fermentative vigour of the tested Z. lentus strains was found to be significantly lower compared to the control Saccharomyces cerevisiae (Lalvin EC1118). It can be concluded that Z. lentus is a potential spoilage yeast in oenology which may be responsible for the initiation of secondary fermentation of wines during ageing.
Tárgyszavak:Természettudományok Biológiai tudományok idegen nyelvű folyóiratközlemény külföldi lapban
folyóiratcikk
Zygosaccharomyces
spoilage yeast
botrytized wine
post-fermentation
Megjelenés:Microorganisms. - 11 : 4 (2023), p. 1-17. -
További szerzők:Ács-Szabó Lajos (1985-) (biológus) Papp László Attila (1986-) (genetikus) Kállai Zoltán (1986-) (biológus) Miklós Ida (1962-) (biológus) Sipiczki Mátyás (1948-) (biológus)
Pályázati támogatás:K-124417
NKFIH
Internet cím:Szerző által megadott URL
DOI
Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
Borító:

8.

001-es BibID:BIBFORM078528
035-os BibID:(cikkazonosító)foy021
Első szerző:Csoma Hajnalka (biológus, szőlész-borász)
Cím:Application of different markers and data-analysis tools to the examination of biodiversity can lead to different results : a case study with Starmerella bacillaris (synonym Candida zemplinina) strains / Hajnalka Csoma, Lajos Ács-Szabó, László Attila Papp, Matthias Sipiczki
Dátum:2018
ISSN:1567-1364
Megjegyzések:Starmerella bacillaris (Candida zemplinina) is a genetically heterogeneous species. In this work, the diversity of 41 strains of various origins is examined and compared by the analysis of the length polymorphism of nuclear microsatellites and the RFLP of mitochondrial genomes. The band patterns are analysed with UPGMA, neighbor joining, neighbor net, minimum spanning tree and non-metric MDS algorithms. The results and their comparison to previous analyses demonstrate that different markers and different clustering methods can result in very different groupings of the same strains. The observed differences between the topologies of the dendrograms also indicate that the positions of the strains do not necessarily reflect their real genetic relationships and origins. The possibilities that the differences might be partially due to different sensitivity of the markers to environmental factors (selection pressure) and partially to the different grouping criteria of the algorithms are also discussed.
Tárgyszavak:Természettudományok Biológiai tudományok idegen nyelvű folyóiratközlemény külföldi lapban
folyóiratcikk
Candida zemplinina
mtDNA
microsatellite markers
strain biodiversity
RFLP-mtDNA
Megjelenés:FEMS Yeast Research. - 18 : 5 (2018), p. 1-12. -
További szerzők:Ács-Szabó Lajos (1985-) (biológus) Papp László Attila (1986-) (genetikus) Sipiczki Mátyás (1948-) (biológus)
Internet cím:Szerző által megadott URL
DOI
Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
Borító:

9.

001-es BibID:BIBFORM096053
Első szerző:Papp László Attila (genetikus)
Cím:Molecular and comparative genomic analyses reveal evolutionarily conserved and unique features of the Schizosaccharomyces japonicus mycelial growth and the underlying genomic changes / Papp László Attila, Ács-Szabó Lajos, Batta Gyula, Miklós Ida
Dátum:2021
ISSN:0172-8083
Megjegyzések:Fungal pathogens, from phytopathogenic fungus to human pathogens, are able to alternate between the yeast-like form and filamentous forms. This morphological transition (dimorphism) is in close connection with their pathogenic lifestyles and with their responses to changing environmental conditions. The mechanisms governing these morphogenetic conversions are still not fully understood. Therefore, we studied the filamentous growth of the less-known, non-pathogenic dimorphic fission yeast, S. japonicus, which belongs to an ancient and early evolved branch of the Ascomycota. Its RNA sequencing revealed that several hundred genes were up- or down-regulated in the hyphae compared to the yeast-phase cells. These genes belonged to different GO categories, confirming that mycelial growth is a rather complex process. The genes of transport- and metabolic processes appeared especially in high numbers among them. High expression of genes involved in glycolysis and ethanol production was found in the hyphae, while other results pointed to the regulatory role of the protein kinase A (PKA) pathway. The homologues of 49 S. japonicus filament-associated genes were found by sequence alignments also in seven distantly related dimorphic and filamentous species. The comparative genomic analyses between S. japonicus and the closely related but non-dimorphic S. pombe shed some light on the differences in their genomes. All these data can contribute to a better understanding of hyphal growth and those genomic rearrangements that underlie it.
Tárgyszavak:Természettudományok Biológiai tudományok idegen nyelvű folyóiratközlemény külföldi lapban
folyóiratcikk
Bioinformatic analysis
Dimorphism
Hyphae
Mycelial growth
Schizosaccharomyces japonicus
Transcriptional profiling
Megjelenés:Current Genetics. - 67 : 6 (2021), p. 953-968. -
További szerzők:Ács-Szabó Lajos (1985-) (biológus) Batta Gyula (1979-) (biológus) Miklós Ida (1962-) (biológus)
Pályázati támogatás:EFOP-3.6.1-16-2016-00022
EFOP
20428-3/2018
FIKP
K10172
OTKA
Internet cím:Szerző által megadott URL
DOI
Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
Borító:

10.

001-es BibID:BIBFORM093840
Első szerző:Papp László Attila (genetikus)
Cím:A modified culture medium and hyphae isolation method can increase quality of the RNA extracted from mycelia of a dimorphic fungal species / Papp László Attila, Ács-Szabó Lajos, Póliska Szilárd, Miklós Ida
Dátum:2021
ISSN:0172-8083
Tárgyszavak:Természettudományok Biológiai tudományok idegen nyelvű folyóiratközlemény külföldi lapban
folyóiratcikk
Megjelenés:Current Genetics. - 67 : 5 (2021), p. 823-830. -
További szerzők:Ács-Szabó Lajos (1985-) (biológus) Póliska Szilárd (1978-) (biológus) Miklós Ida (1962-) (biológus)
Pályázati támogatás:OTKA-106172
OTKA
EFOP-3.6.1-16-2016-00022
EFOP
20428-3/2018
FIKP
Internet cím:Szerző által megadott URL
DOI
Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
Borító:

11.

001-es BibID:BIBFORM106446
Első szerző:Vig Ildikó (biológus, molekuláris biológus)
Cím:The Schizosaccharomyces pombe cwf14 gene is evolutionarily conserved and involved in the TOR pathway / Ildikó Vig, Lajos Ács-Szabó, Zsigmond Benkő, László Attila Papp, Matthias Sipiczki, Ida Miklós
Dátum:2022
ISBN:978-963-490-468-7
Tárgyszavak:Természettudományok Biológiai tudományok előadáskivonat
könyvrészlet
Megjelenés:Biotechnology at the University of Debr ecen - 2022 International Symposium : Abstract Book. - p. 45. -
További szerzők:Ács-Szabó Lajos (1985-) (biológus) Benkő Zsigmond (1961-) (molekuláris biológus, genetikus) Papp László Attila (1986-) (genetikus) Sipiczki Mátyás (1948-) (biológus) Miklós Ida (1962-) (biológus)
Internet cím:Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
Borító:

12.

001-es BibID:BIBFORM110103
Első szerző:Vig Ildikó (biológus, molekuláris biológus)
Cím:Analysis of the cwf14 gene encoding the G10 protein involved in splicing in Schizosaccharomyces pombe / Idikó Vig, Lajos Ács-Szabó, Zsigmond Benkő, László Attila Papp, Matthias Sipiczki, Ida Miklós
Dátum:2022
Tárgyszavak:Természettudományok Biológiai tudományok előadáskivonat
könyvrészlet
Megjelenés:A Magyar Mikrobiológiai Társaság 2022. évi Nagygyűlése és a XV. Fermentációs Kollokvium : Absztraktfüzet. - p. 53.
További szerzők:Ács-Szabó Lajos (1985-) (biológus) Benkő Zsigmond (1961-) (molekuláris biológus, genetikus) Papp László Attila (1986-) (genetikus) Sipiczki Mátyás (1948-) (biológus) Miklós Ida (1962-) (biológus)
Internet cím:Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
Borító:
Rekordok letöltése1